Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 4 pdf

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 1

... BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC    KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP THU THẬP VÀ TỔ CHỨC DỮ LIỆU GENE PHỤC VỤ NGHIÊN CỨU CÂY TRỒNG ... Hồ Chí Minh Tháng 9/2005 ii BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC    THU THẬP VÀ TỔ CHỨC DỮ LIỆU GENE PHỤC VỤ NGHIÊN CỨU CÂY TRỒNG BIẾN ĐỔI ... tập và thực hiện đề tài này. Tp. Hồ Chí Minh tháng 09 năm 2005 Sinh viên thực hiện Nguyễn Kỳ Trung Lê Thành Trung iv TÓM TẮT Tên đề tài: THU THẬP VÀ TỔ CHỨC DỮ LIỆU GENE...

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 2

... tổ chức quản lý và khai thác cơ sở dữ liệu đa dạng và toàn diện trên quy mô toàn cầu liên quan đến sinh học và các ngành khoa học liên quan.  Xây dựng và phát triển các chƣơng trình xử lý dữ ... (Silencing of Endogeneous Genes) Ức chế một phần hay toàn bộ sự biểu hiện gene có thể đạt đƣợc qua kỹ thu t RNA antisense. Kỹ thu t này chuyển gene có chiều ngƣợc lại với gene ban đầu. ... Chuyển gene cho phép trao đổi các gene giữa các sinh vật mà không hòa hợp giới tính. Với kỹ thu t di truyền và chuyển gene có thể cho phép ta chuyển gene giữa vi khuẩn, động vật, thực vật và virus....

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 3.pdf

... và vài phút để sắp xếp trật tự các dòng phù hợp từ nguồn dữ liệu. Để tạo thu n lợi trong sinh học mới, các nhà sinh học phải làm quen với máy tính. Truy xuất dữ liệu từ trang web dữ ... có thể truy cập cùng một dữ liệu. Điều này nghĩa là nếu một chƣơng trình cần thay đổi cách tổ chức dữ liệu, ta phải tìm tất cả các chức năng hoặc các lệnh truy cập dữ liệu đó để có những thay ... của tập tin thu. txt, ta phải dùng vòng lặp: open (THU, “D:/Perl /thu. txt”) or die (“Không mở được tập tin”); $thu = < ;THU& gt;; while ( $thu) { print “ $thu \n”; $thu = < ;THU& gt;; }...

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 4.pdf

... giới. - Thông tin trong các cơ sở dữ liệu này là rất lớn và luôn đƣợc cập nhật thƣờng xuyên (sau mỗi 24 giờ). - Trong phạm vi đề tài tập hợp và tổ chức dữ liệu gene phục vụ nghiên cứu cây trồng ... sự sắp xếp theo ƣu tiên nên chức năng này ít đƣợc sử dụng đối với ngƣời sử dụng. * Xác định nội dung cần tìm kiếm - Liên quan đến đề tài tập hợp và tổ chức dữ liệu gene phục vụ nghiên cứu cây ... tên đƣờng dẫn cụ thể. Nhiều Servlet có thể dễ dàng chia sẻ cơ sở dữ liệu, dễ dàng hiện thực kết nối cơ sở dữ liệu và chia sẽ nguồn tài nguyên. Servlet có khả năng lƣu trữ thông tin từ...

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 5.pdf

... PHẦN D: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 93 IV. Tổ chức dữ liệu IV.1. Cách thức tổ chức dữ liệu Về khía cạnh công nghệ thông tin, nguyên tắc tổ chức một hệ thống ứng ... đồ 4.1: Mô hình tổ chức một hệ thống ứng dụng Việc phân loại dữ liệu phụ thu c vào việc phân tích dữ liệu cho một hệ thống ứng dụng cụ thể. Theo yêu cầu của đề tài, tổ chức các gene phục vụ nghiên ... hành tổ chức, phân loại dữ liệu Nhận xét về dữ liệu mà ta đang có, sẽ có rất nhiều cách để phân loại dữ liệu này, tuy nhiên khi phân tích các dữ liệu ta thấy mỗi trình tự đều có thông tin về nguồn...

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 6.pdf

... Controller đầu tiên sẽ nhận vào cơ sở dữ liệu cần tìm, đọc nội dung trong folder dữ liệu và lần lƣợt lấy hết các tham số cần thiết cho việc tìm kiếm nhƣ: nội dung và trƣờng cần tìm. Tiếp theo ... QUẢ VÀ THẢO LUẬN NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 98 V. Java tiến hành xử lý dữ liệu Xây dựng ứng dụng tra cứu dữ liệu trình tự thông qua các keyword do ngƣời dùng chọn lựa và nhập ... tìm kiếm với dữ liệu tập hợp đƣợc Sau khi xử lý dữ liệu với Java Servlet và thiết kế giao diện cho ngƣời dùng. Ta đƣợc kết quả nhƣ sau: Giao diện của trang tìm kiếm PHẦN D: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN...

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 7.pdf

... PHẦN E: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 119 II. ĐỀ NGHỊ 1. Có biện pháp lọc dữ liệu tốt hơn và tổ chức dữ liệu hợp lý hơn  Hiện tại chúng tôi chƣa ... xây dựng thêm các cơ sở dữ liệu khác cũng liên quan đến cây trồng biến đổi di truyền nhƣ: o Cơ sở dữ liệu các vector dùng trong chuyển gene vào thực vật. o Cơ sở dữ liệu primer dùng trong chẩn ... GMO. o Xây dựng cơ sở dữ liệu cho tất cả các gene chỉ thị (Marker Genes) dùng trong quá trình chuyển gene. 3. Vấn đề quan tâm khác Trong quá trình tìm hiểu các cơ sở dữ liệu trình tự GenBank/EMBL/DDBJ...

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 8.pdf

... kết nối với cơ sở dữ liệu NCBI Taxonomy, nơi chứa những tham khảo giữa tên thông thƣờng, tên đặc biệt và những sinh vật tƣơng đồng đã đƣợc giữ trong cơ sở dữ liệu trình tự. Organism ... tài liệu ở cơ sở dữ liệu PubMed của Entrez cho số PubMed ID, và sau đó liên kết đến những record trình tự có quan hệ. Direct Submission Thông tin liên lạc của ngƣời submit, nhƣ là viện/cơquan và ... source identifier - nguồn xác định thứ cấp) chứa những liên kết ngƣợc lại record trình tự. Cách tìm kiếm: Không thể tìm kiếm ở cơ sở dữ liệu trình tự nucleotide và protein bởi số MEDLINE...

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 9.pdf

... %hash); close FH; } } 4) Nhiệm vụ 4: Tổng hợp thành 1 file chƣơng trình hoàn chỉnh, với đầy đủ cả 3 chức năng trên và tạo thành một file kết quả tổng hợp. (lƣu file tên là hashloc.pl) #!usr/bin/perl ... file text thì cất nó vào mảng @filetext; nếu bên trong thƣ mục là thƣ mục khác thì lặp lại việc mở thƣ mục, xét các phần tử trong thƣ mục, nếu nó là file và là filetext thì cất vào mảng @filetext. ... kí tự đặc biệt "." và ".." @files = grep (!/^\.\.?$/, readdir(DIRECTORY)); closedir(DIRECTORY); # Nếu là file, và là file text cất nó vào mảng @filetext. #...

Thu thập nguồn gene và tổ chức dữ liệu gene 10

... nhƣ cơ sở dữ liệu trình tự và một vài nguồn dựa trên sự cho phép nhƣ các tạp chí full-text, và cơ sở dữ liệu thƣơng mại. Mặc dù nội dung bị giới hạn ở các địa chỉ này, tuy nhiên tài liệu và nội ... web tốt và hay đƣợc dùng nhất trên Internet.  Scirus Sự giới hạn lớn nhất cho các công cụ tìm web là không đƣợc chỉ mục tới đƣợc cơ sở dữ liệu. Vấn đề này xảy ra ở nhiều cơ sở dữ liệu tạo ... tóm tắt vẫn đƣợc liệt kê bởi các công cụ tìm kiếm, nhƣng dữ liệu nằm bên dƣới không có sẵn bởi vì tƣờng lửa (firewalls) của cơ sở dữ liệu khóa sự chỉ mục nội bộ. Trong một nỗ lực để giải quyết...

Xem thêm