... quy do đó dễ gây ra hiện tượng tràn miền nhớ khi ta tổchức chương trình trực tiếp bằng đệ quy.2. Tổchứcdữliệu và chương trình: Tổchứcdữliệu tính toán dần theo từng bước, nên tìm cách khử ... giá trị thẩm mỹ sẽ là: T(i,j-1). Tổng hợp lại ta có giá trị tối ưu khi cắm i bó hoa vào j lọ sẽ là: T(i,j)=max {T(i-1,j-1)+v[i,j], T(i,j-1)}.2. Tổchứcdữliệu và chương trình: Nếu dùng mảng ... thenbeginT[i]:=T[i-1]+v[i,j];L[i]:=L[i-1];batbit(i,j);end;end;end;procedure ghi;var i: byte; Tổ chứcdữliệu cho các bài toán quy hoạch độngNguyễn Xuân HuySố trước ta đã bàn về việc tiết kiệm...
... lắp dữ liệu, tổng hợp danh sách tổng hợp 85 II.3.2. Tải trình tự 90 III. Các kết quả thu đƣợc từ quá trình tải trình tự từ Genbank 92 IV. Tổchứcdữliệu 93 IV.1. Cách thức tổchứcdữliệu ... hiểu dữliệu bài báo trên PubMed và dữliệu trình tự GenBank trên NCBI. Tìm hiểu các công cụ sinh học dùng trong Bioinformatics. Giai đoạn 2: Xây dựng và tổchức các dữ liệu. Tìm kiếm dữliệu ... xây dựng CSDL 57 II. TÌM KIẾM DỮLIỆU BÀI BÁO 58 II.1. Tìm kiếm tổng hợp tính trạng 58 II.2. Tổng hợp dữliệu Primer dùng trong phát hiện GMO 64 III. TÌM KIẾM DỮLIỆU TRÌNH TỰ 66 III.1. Tìm...
... DDBJ đã hợp tác với hai ngân hàng dữliệu thông qua trao đổi dữ liệu và thông tin trên Internet và tổchức hai cuộc họp, cuộc họp ban cố vấn ngân hàng dữ liệu DNA quốc tế ( the International ... đổi dữliệu hàng ngày với EMBL/EBI và GenBank/NCBI, nên ba cơ sở dữliệu này chia sẽ cùng dữliệu tại bất kỳ thời điểm nào. DDBJ cũng cung cấp nhiều công cụ cho phân tích và lấy ra các dữliệu ... cứu và tạo ra số Accession number cho dữ liệu trình tự đƣợc gởi tới. DDBJ tập hợp dữliệu chủ yếu từ các nhà khoa học Nhật, tuy nhiên cũng chấp nhận dữliệu và tạo Accession number cho các nhà...
... có thể truy cập cùng một dữ liệu. Điều này nghĩa là nếu một chƣơng trình cần thay đổi cách tổchứcdữ liệu, ta phải tìm tất cả các chức năng hoặc các lệnh truy cập dữliệu đó để có những thay ... Biến mảng giống nhƣ biến vô hƣớng, nó đƣợc tạo ra để lƣu dữ liệu. Tuy nhiên dữ liệu là một danh sách (list) (danh sách là một nhóm dữliệu vô hƣớng đƣợc sắp xếp theo thứ tự). Mở đầu biến mảng ... thiểu sức lực để chuyển đổi giữa tập kết quả cơ sở dữliệu quan hệ và các đối tƣợng Java trừu tƣợng. Hibernate cho phép phục vụ truy vấn và lấy dữliệu trên đối tƣợng Java (hơn là trên các bảng)...
... cơ sở dữliệu khác trên thế giới. - Thông tin trong các cơ sở dữliệu này là rất lớn và luôn đƣợc cập nhật thƣờng xuyên (sau mỗi 24 giờ). - Trong phạm vi đề tài tập hợp và tổchứcdữliệu ... PHƢƠNG PHÁP TIẾN HÀNH – Tìm kiếm dữliệu trình tự NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 72 Choose database: giới hạn phạm vi cơ sở dữliệu tìm kiếm trong các cơ sở dữ liệu của chƣơng trình BLAST. ... TIẾN HÀNH – Tìm kiếm dữliệu bài báo NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 58 II. Tìm kiếm các ấn phẩm, bài báo khoa học về cây trồng biến đổi di truyền II.1. Tổng hợp dữliệu tính trạng liên...
... 93 IV. Tổchứcdữliệu IV.1. Cách thức tổchứcdữliệu Về khía cạnh công nghệ thông tin, nguyên tắc tổchức một hệ thống ứng dụng phần mềm nhƣ sau: Sơ đồ 4.1: Mô hình tổchức một ... TRUNG 94 IV.2. Tiến hành tổ chức, phân loại dữliệu Nhận xét về dữliệu mà ta đang có, sẽ có rất nhiều cách để phân loại dữliệu này, tuy nhiên khi phân tích các dữliệu ta thấy mỗi trình tự ... cách để phân loại dữ liệu, tuy nhiên việc phân loại dữliệu cũng phải phụ thuộc vào việc khảo sát dữliệu có đƣợc. Dữliệu của ta là các record Genbank, ta thấy khi khảo sát dữliệu mỗi record,...
... tử AND, OR, NOT. Theo mặc định keywords đƣợc tìm kiếm trong cơ sở dữliệu NLBI (Nông Lâm Bioinformatics Group). Các cơ sở dữliệu Genbank, EMBL, DDBJ hiện tại chƣa tích hợp đƣợc. Ta thực ... cùng sau khi chƣơng trình phân Division đã chạy xong Dữ liệu của ta đƣợc phân loại theo từng trƣờng riêng biệt, đây là cấu tạo tầng dữ liệu của ta. Thống kê kết quả cuối cùng, tất cả các trình ... VÀ THẢO LUẬN NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 98 V. Java tiến hành xử lý dữliệu Xây dựng ứng dụng tra cứu dữliệu trình tự thông qua các keyword do ngƣời dùng chọn lựa và nhập vào. V.1....
... NGHỊ 1. Có biện pháp lọc dữliệu tốt hơn và tổchứcdữliệu hợp lý hơn Hiện tại chúng tôi chƣa đƣa ra đƣợc phƣơng án hoàn hảo cho việc chọn lọc thông tin, vì thế dữliệu hiện nay của chúng ... xây dựng thêm các cơ sở dữliệu khác cũng liên quan đến cây trồng biến đổi di truyền nhƣ: o Cơ sở dữliệu các vector dùng trong chuyển gene vào thực vật. o Cơ sở dữliệu primer dùng trong chẩn ... các trình tự này. Tài liệu tham khảo NGUYỄN KỲ TRUNG – LÊ THÀNH TRUNG 121 TÀI LIỆU THAM KHẢO TIẾNG VIỆT 1. Cao Thị Ngọc Phƣợng, 2003. Tài liệu cơ sở dữ liệu. Đại học Khoa Học Tự...
... Cách tìm kiếm: Không thể tìm kiếm ở cơ sở dữliệu trình tự nucleotide và protein bởi số MEDLINE UID. Tuy nhiên, bạn có thể tìm kiếm ở cơ sở dữliệu tài liệu (PubMed) của Entrez cho MEDLINE UID, ... Cách tìm kiếm: Không thể tìm kiếm ở cơ sở dữliệu trình tự nucleotide và protein bởi số PubMed ID. Tuy nhiên, bạn có thể tìm kiếm tài liệu ở cơ sở dữliệu PubMed của Entrez cho số PubMed ID, ... đã đƣợc kết nối với cơ sở dữliệu NCBI Taxonomy, nơi chứa những tham khảo giữa tên thông thƣờng, tên đặc biệt và những sinh vật tƣơng đồng đã đƣợc giữ trong cơ sở dữliệu trình tự. Organism...
... %hash); close FH; } } 4) Nhiệm vụ 4: Tổng hợp thành 1 file chƣơng trình hoàn chỉnh, với đầy đủ cả 3 chức năng trên và tạo thành một file kết quả tổng hợp. (lƣu file tên là hashloc.pl) #!usr/bin/perl ... "\n******************\n"; print "OK!!!Da load xong"; 6) Nhiệm vụ 6: Phân loại dữliệu trình tự theo các trƣờng. (lƣu file tên là group_division.pl) Đoạn mã: #!/usr/bin/perl ... "Copy failed: $!"; Chức năng di chuyển hay sao chép một file tới thƣ mục đƣợc chỉ ra. Module File::Path; Cú pháp: mkpath(["$dir/$foldername"],1, 0711); Chức năng tạo một thƣ...
... hiểu dữliệu bài báo trên PubMed và dữliệu trình tự GenBank trên NCBI. Tìm hiểu các công cụ sinh học dùng trong Bioinformatics. Giai đoạn 2: Xây dựng và tổchức các dữ liệu. Tìm kiếm dữliệu ... có thể truy cập cùng một dữ liệu. Điều này nghĩa là nếu một chƣơng trình cần thay đổi cách tổchứcdữ liệu, ta phải tìm tất cả các chức năng hoặc các lệnh truy cập dữliệu đó để có những thay ... sau : Dữliệu không lớn chỉ vài ngàn gene đƣợc xem là thông dụng nhất trong công nghệ chuyển gene hiện nay. Phải thiết lập các mối liên hệ trong dữ liệu, tiến tới quản lý dữliệu một cách...
... sở dữ liệu Vũ Tuyết Trinh, b/m Hệ thống thông tin, Khoa CNTT, ĐHBKHN 4Nội dung9Tổng quan về tổ chứcbộ nhớ ngoài{ Tổ chứctệp đống{ Tổ chứctệpbăm{ Tổ chứctệpchỉ dẫn{Cây cân bằng Tổ chứctệp ... sở dữ liệu Vũ Tuyết Trinh, b/m Hệ thống thông tin, Khoa CNTT, ĐHBKHN 12Các phép toán{Tìm kiếm1 bản ghi{Thêm 1 bản ghi{Xoá 1 bản ghi{Sửa đổimộtbản ghiSo sánh các cách tổchứcdữ liệu {Tệp ... việcsử dụng nhiều trang bộ nhớ cho 1 cụmNhập môn cơ sở dữ liệu Vũ Tuyết Trinh, b/m Hệ thống thông tin, Khoa CNTT, ĐHBKHN 1 Tổ chứcdữ liệuvậtlýệ ậ ýVũ Tuyết Trinhtrinhvt@it-hut.edu.vnBộ môn...
... là 79 Tổ chức tệp băm (Hash File) Tổchức tệp dữ liệu Phân chia các bản ghi vào các cụm Mỗi cụm gồm một hoặc nhiều khối Mỗi khối chứa số lượng bản ghi cố định Tổchức lữu trữ dữliệu ... tệp dữliệu hay một vài trường (đặc biệt là các trường khoá) của các bản ghi dữ liệu. Xác định các yêu cầu này cho phép thiết kế dữliệu vật lý hiệu quả thông qua việc sử dụng các tổchức ... bản ghi Tìm kiếm + đánh dấu xóa hệ thống cần tổchức lại đĩa theo định kỳ Sửa đổi một bản ghi: Tìm kiếm và sửa các trường9 Tổ chứcdữliệu vật lý...
... liên thông, xác định chu trình… sẽ phải vận dụng cách tổ chứcdữliệu tương tự như thuật toán sẽ trình bày dưới đây. Bài này đòi hỏi tổchức các tập quân bài sao cho thực hiện nhanh nhất các ... Như vậy, tập A có phần tử đại diện là 3 và tập B có phần tử đại diện là 2. Dữ liệu của tập A khi đó sẽ được tổchức như sau: A = {3 3, 4 3, 7 3}. Như vậy 3 là phần tử đại diện của tập ... hơn, tuy nhiên ta thực hiện cả hai phương pháp vì hàm Dem là một tiện ích trong loại hình tổchứcdữliệu theo tiếp cận Find-Union. Ta cũng sẽ cài đặt Union(x,y) dưới dạng hàm với giá trị ra...