... đoạn gen16srRNA (~1500 bp) vùng dị chủng rõ rệt nằm khoảng bp đầu 5’ 500 Đến nay, trình tự gen16srRNA hầu hết loai vi khuẩn giải mã GenBank ̀ ngân hàng liệu lớn lưu giữ 20 triệu chuỗi gen, ... tự gen16SrRNA chủng C.perfringens: Để khẳng định đặc điểm phân loại xác định vị trí phân loại chủng C.perfringens phân lập từ dê, cừu mắc bệnh viêm ruột tiêu chảy, giải trình tự gen16SrRNA ... C.perfringens chiết tách phương pháp sốc nhiệt: đun vi khuẩn 100oC, 10 phút ; sốc nhiệt nhanh nước đá phút, bảo quản DNA 20oC Đối với gen mã hóa 16S ribosome RNA, sử dụng cặp mồi nhân đoạn gen 714bp 16S...
... để nhân đoạn gen mã hóa 16SrRNA (hệ gen ty thể) (Espiritu cs, 2001) đoạn chèn ITS2 (Internal Transcribed Spacer 2) (hệ gen nhân) (Nam cs, 2009) 26 a) Nhân đoạn gen mã hóa16S rRNA Cặp mồi 16S: ... ATPase; gen nad1-6 nad 4L mã hóa cho tiểu đơn vị 1-6 4L NADH dehydrogenase; gen cob mã hóa cho cytochrome b Các gen khác bao gồm gen mã hóa rRNA (gen rrnS mã hóa 12S rRNAgen rrnL mã hóa cho 16S rRNA) ... -400C -400C 3.2 Nhân đoạn gen mã hóa 16SrRNA trình tự ITS2 mẫu ốc cối kỹ thuật PCR Đoạn gen mã hóa 16SrRNA đoạn chèn ITS2 loài ốc cối khuếch đại sử dụng hai cặp mồi tham khảo 16S (Espiritu cs,...
... từ trình tự dựa gen16SrRNA 98 Hình III.52 Cây NJ xây dựng từ trình tự dựa gen COI gen16SrRNA 100 Hình III.53: Cây ML xây dựng trình tự dựa gen COI gen16SrRNA ... tự gen COI mẫu IS1 GenBank 62 Hình III.22 Kết Blast trình tự gen COI IS2 GenBank 63 Hình III.23 Kết Blast trình tự gen16SrRNA mẫu IS1 GenBank 64 Hình III.24 Kết Blast trình tự gen16S ... trình tự gen COI gen16SrRNA loài ong ký sinh thu thập từ nguồn liệu Genbank (NCBI) 31 Bảng III.2 Bộ trình tự kết hợp gen COI 16SrRNA số loài ong ký thu thập từ nguồn liệu GenBank...
... dơng kü tht PCR víi cỈp måi SY 160 tìm gen DYZ để xác định NST Y cho bệnh nhân cha rõ giới tính Tiến hành kỹ thuật PCR tìm DYZ để khẳng định có mặt hay mặt NST Y trờng hợp phù hợp PCR tìm TDF ... bệnh nhân, sau tiến hành xác định giới tính cho bệnh nhân kỹ thuật PCR xác định gen TDF, kỹ thuật đợc chuẩn cho phản ứng xác 100% trờng hợp [8] Khi có kết TDF đối chiếu với caryotype bệnh nhân ... XX 40 100 ∑ NhËn xÐt: - Thực phản ứng PCR với cặp mồi gen TDF để xác định giới PCR với cặp mồi gen DYZ để xác định NST Y - 15/40 sè tr−êng hỵp chiÕm 37,5 % gen TDF (-) cã kết phù hợp với kết NST...
... 80S 55S 5S, 5.8S, 28S 16S 18S 12S Cơ sở sử dụng gen16S phát thịt động vật Trong hệ gen ty thể động vật chứa hai genrRNA 12S 16SrRNAGen16SrRNA mã hóa cho phân tử rRNA tiểu phần lớn ribosome ... gen, rRNA, 22 tRNA 13 mRNA GenrRNA mã hóa cho RNA ribosome[13] 8 Hình 1.2 Cấu trúc hệ gen ty thể 2.2 Gen16SrRNA phát thịt động vật[10,19,20,22] Đặc điểm cấu trúc vai trò ribosome RNA (rRNA) ... tử DNA có chứa 22 tRNA, rRNA 13 gen mã hóa protein (Garder & Snustad, 1984) Như tế bào có chứa 800x2 = 1.600 copies gen16SrRNA Vì vậy, sử dụng trình tự gen nhạy sử dụng gen khác có copy tế bào...
... chaffeensis-specific 16SrRNA gene fragment For the first round PCR, primer ECC (5'-agaacgaacgctggc ggcaagc-3') and ECB (5'-cgtattaccgcggctgctggca-3') targeting the conserved regions of Ehrlichia spp 16SrRNA gene ... by genus-specific (Ehrlichia spp or Anaplasma spp.) and species-specific (E chaffeensis) PCR based on amplification of 16SrRNA gene fragments In all, 611 (47.4%) ticks tested positive for genus-specific ... Seung-Ok Lee et al Fig Phylogenetic tree of 16SrRNA sequences of Ehrlichia spp inferred using the sequence distance method and the neighbor joining algorithm 16SrRNA gene sequences (396 bp) from...
... puncture, snap frozen in liquid nitrogen, and stored at -80°C until analysis Automated DNA extraction from synovial fluid and broad-range PCR amplification of 16SrRNA genes, cloning and sequencing ... added to the SF cell pellet Bacterial 16S rDNA fragments were amplified from SF extracted DNA by broad-range PCR amplification using universal bacterial 16SrRNA gene-specific oligonucleotide primers ... the bacterial genus but not the identification of the species level This is, to our knowledge, the first study using the full-length 16SrRNA gene as a target for broad-spectrum PCR to detect...
... liệu cho việc khuếch đại hai đoạn gen COI 13 bp 16S rRN 12 bp 3.3 K t uả hu h i gen16SrRNA COI ằng thuật PCR Sản ph m phản ng PCR khuếch đại hai đoạn gen16S rRN COI ki m tra b ng phương pháp ... http://www.lrc.tnu.edu.vn 13 gen tRNA, genrRNA v ng điều n Kết cho thấy có gen tRN , gen N tất gen ty th khác mã hóa chu i n ng Có v ng gen ch ng chéo lên với k ch thước bp có 13 v ng đệm gi a gen với t ng ... trình tự hệ gen ty th cơng bố lồi thuộc giống Spinibarbus GenBank số nghiên c u khác trình bày ảng 2.3: ảng 3: Các c p m i s d ng nghiên c u Đ n gennhân lên Tên i 16S *16Sp1F rRNA *16Sp1R **COI-F1...
... phẩm PCR đoạn gen16SrRNA COI mtDNA .59 viii DANH MỤC BẢNG Bảng 2.1 Thành phần phản ứng PCR 20 Bảng 2.2 Trình tự mồi gen16SrRNA COI mtDNA .20 Bảng 2.3 Trình tự gengen16SrRNA ... Scarus) cách phân tích mảnh gen (trình tự 12S rRNA ti thể (967 bp), 16SrRNA (577 bp), cytochrome b (477 bp) gen nhân, gồm phần trình tự gen RAG2 (715 bp), tmo4c4 (485 bp) gen otx1 (672 bp), bmp4 ... µL H2 O 29,75 µL Tởng 50 µL Bảng 2.2 Trình tự mồi gen16SrRNA COI mtDNA Mồi xuôi Gen 16Sar 16SrRNA 5’CGCCTGTTTATCA AAAACAT-3’ Mồi ngược 16Sbr Kích thước Nguồn 650bp 5’CCGGTCTGAAC Palumbi TCAGATCACGT-...
... mồi, thực PCRgen ITS2, 28S gen cox1 2.4.3.1 Thiết kế mồi Đoạn gen cox1 hệ gen ty thể sán gan Fasciola chứa gen mã hóa protein cox1; gen ITS-2 gen 28S đoạn gen khơng mã hóa hệ gennhân lựa chọn ... ribosome 26 hệ gennhân Ngồi sử dụng cặp mồi thiết kế cho phản ứng PCRnhân vùng gen cox1 hệ gen ty thể gen 28S gennhân nghiên cứu loài sán gan lớn Fasciola sp Gen 28 S: Phản ứng PCR thực theo ... dựa vùng hệ gennhân ITS-2 gen 28S cấu trúc ribosome DNA (rDNA) (Hình 1.5) Vùng gen ITS-2 28S thu nhận phương pháp PCR, giải trình tự nuleotide so sánh với sở liệu có Ngân hàng gen (GenBank) để...
... macronema Bleeker, 1851 15 mm 4.3 Xác định phân tích vùng 16SrRNA mtDNA 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA Trƣớc nhân dòng vùng 16SrRNA mtDNA tất mẫu cá phân tích, chúng tơi thực lần thí ... phản ứng PCRnhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA mtDNA Sản phẩm PCR đƣợc phân tích gel agarose 1% (Hình 4.5) 37 M M 831 bp 630 bp 947 bp 564 bp Hình 4.5.: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16SrRNA mtDNA ... tích DNA .33 4.3 Xác định phân tích vùng 16SrRNA mtDNA .34 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA 34 4.3.2 Phân tích trình tự vùng 16SrRNA mtDNA mẫu cá 38 4.3.2.1 Định danh mẫu...
... macronema Bleeker, 1851 15 mm 4.3 Xác định phân tích vùng 16SrRNA mtDNA 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA Trƣớc nhân dòng vùng 16SrRNA mtDNA tất mẫu cá phân tích, chúng tơi thực lần thí ... phản ứng PCRnhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA mtDNA Sản phẩm PCR đƣợc phân tích gel agarose 1% (Hình 4.5) 37 M M 831 bp 630 bp 947 bp 564 bp Hình 4.5.: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16SrRNA mtDNA ... tích DNA .33 4.3 Xác định phân tích vùng 16SrRNA mtDNA .34 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA 34 4.3.2 Phân tích trình tự vùng 16SrRNA mtDNA mẫu cá 38 4.3.2.1 Định danh mẫu...
... macronema Bleeker, 1851 15 mm 4.3 Xác định phân tích vùng 16SrRNA mtDNA 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA Trƣớc nhân dòng vùng 16SrRNA mtDNA tất mẫu cá phân tích, chúng tơi thực lần thí ... phản ứng PCRnhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA mtDNA Sản phẩm PCR đƣợc phân tích gel agarose 1% (Hình 4.5) 37 M M 831 bp 630 bp 947 bp 564 bp Hình 4.5.: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16SrRNA mtDNA ... tích DNA .33 4.3 Xác định phân tích vùng 16SrRNA mtDNA .34 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA 34 4.3.2 Phân tích trình tự vùng 16SrRNA mtDNA mẫu cá 38 4.3.2.1 Định danh mẫu...
... macronema Bleeker, 1851 15 mm 4.3 Xác định phân tích vùng 16SrRNA mtDNA 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA Trƣớc nhân dòng vùng 16SrRNA mtDNA tất mẫu cá phân tích, chúng tơi thực lần thí ... phản ứng PCRnhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA mtDNA Sản phẩm PCR đƣợc phân tích gel agarose 1% (Hình 4.5) 37 M M 831 bp 630 bp 947 bp 564 bp Hình 4.5.: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16SrRNA mtDNA ... tích DNA .33 4.3 Xác định phân tích vùng 16SrRNA mtDNA .34 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16SrRNA 34 4.3.2 Phân tích trình tự vùng 16SrRNA mtDNA mẫu cá 38 4.3.2.1 Định danh mẫu...
... Kết nhângen mã hóa mảnh kháng thể scFv PCR Để thu gen mã hóa mảnh kháng thể scFv đặc hiệu kháng nguyên EPCA bệnh ung thư tiền liệt tuyến đủ cho việc thiết kế vector biểu hiện, thực phản ứng nhân ... vector gốc chưa gắn thêm đoạn gen ngoại lai sau PCR với mồi Lab thu sản phẩm khoảng 200 bp, vector gắn thêm đoạn gen ngoại lai sản phẩm PCR thu có kích thước kích thước gen ngoại lai cộng với 200 ... hiện, thực phản ứng nhângen kỹ thuật PCR với mồi đặc hiệu: TTLF: 5’GGCCCCATGGCCATTGCGGGCCTG – 3’ TTLR: 5’- GATGTGCGGCCGCACGTTTGATTTC – 3’ Sản phẩm PCR điện di kiểm tra gen agarose hình 1: M 500...
... nucleotit đoạn gen16s ARN riboxom 35 Khi so sánh trình tự đoạn gen với trình tự gen16s ARNr tác giả khác giới công bố, kết nhận đợc cho thấy tơng đồng nucleotit đoạn gen thiết kế so víi gen16s ARNr ... S¶n phÈm PCR chđng 731 Kết ny lần khẳng định đoạn gen16s ARN riboxom đợc gắn vo vector Đọc trình tự đoạn gen16s ARNr v lập phả hệ Plasmid tái tổ hợp đựoc sử dụng để đọc trình tự đoạn gen gắn ... đợc chọn để tách gen16s ARNr phục vụ cho mục đích định loại chủng ny đến loi ảnh Điện di đồ ADN tổng số chủng vi khuẩn phân hủy MP Đoạn gen16s ARN riboxom chủng 731 đợc nhânPCR với cặp mồi...
... khơng 450C 10 phút, hòa tan tủa 30 l nước cất lần khử trùng, trữ -20oC Khuếch đại vùng gen16S rDNA Vùng gen16S rDNA khuyếch cặp mồi tổng 27F 1495R có trình tự 27F: 5’ GAG AGT TTG ATC CTG GCT CAG ... UV 2000 Thang chuẩn 100 bp mua từ công ty Fermentas Cắt vùng gen16S rDNA enzyme cắt giới hạn (RE) Bốn RE sử dụng để cắt vùng gen16S rDNA có trình tự nhận biết nhiệt độ ủ bảng 1, N nucleotide ... chung mẫu PCR với cặp mồi tổng 27F 1495R cho kết tốt mẫu có band với kích thước khoảng 1468 bp 16S rDNA vùng mã hóa RNA ribosome xác định đoạn gen bảo tồn tất tế bào Trình tự đoạn gen sinh vật...