0

phảnứng pcr nhân gen 16s rrna

BÁO CÁO

BÁO CÁO " VỊ TRÍ PHÂN LOẠI CỦA CÁC CHỦNG CLOSTRIDIUM PERFRINGENS PHÂN LẬP TẠI VIỆT NAM DỰA VÀO TRÌNH TỰ GEN 16S rRNA " doc

Báo cáo khoa học

... đoạn gen 16s rRNA (~1500 bp) vùng dị chủng rõ rệt nằm khoảng bp đầu 5’ 500 Đến nay, trình tự gen 16s rRNA hầu hết loai vi khuẩn giải mã GenBank ̀ ngân hàng liệu lớn lưu giữ 20 triệu chuỗi gen, ... tự gen 16S rRNA chủng C.perfringens: Để khẳng định đặc điểm phân loại xác định vị trí phân loại chủng C.perfringens phân lập từ dê, cừu mắc bệnh viêm ruột tiêu chảy, giải trình tự gen 16S rRNA ... C.perfringens chiết tách phương pháp sốc nhiệt: đun vi khuẩn 100oC, 10 phút ; sốc nhiệt nhanh nước đá phút, bảo quản DNA 20oC Đối với gen mã hóa 16S ribosome RNA, sử dụng cặp mồi nhân đoạn gen 714bp 16S...
  • 7
  • 829
  • 4
Nhân đoạn gen mã hóa 16s rRNA và trình tự ITS2 của các loài ốc cối conus bằng kỹ thuật PCR

Nhân đoạn gen mã hóa 16s rRNA và trình tự ITS2 của các loài ốc cối conus bằng kỹ thuật PCR

Nông - Lâm - Ngư

... để nhân đoạn gen mã hóa 16S rRNA (hệ gen ty thể) (Espiritu cs, 2001) đoạn chèn ITS2 (Internal Transcribed Spacer 2) (hệ gen nhân) (Nam cs, 2009) 26 a) Nhân đoạn gen mã hóa16S rRNA  Cặp mồi 16S: ... ATPase; gen nad1-6 nad 4L mã hóa cho tiểu đơn vị 1-6 4L NADH dehydrogenase; gen cob mã hóa cho cytochrome b Các gen khác bao gồm gen mã hóa rRNA (gen rrnS mã hóa 12S rRNA gen rrnL mã hóa cho 16S rRNA) ... -400C -400C 3.2 Nhân đoạn gen mã hóa 16S rRNA trình tự ITS2 mẫu ốc cối kỹ thuật PCR Đoạn gen mã hóa 16S rRNA đoạn chèn ITS2 loài ốc cối khuếch đại sử dụng hai cặp mồi tham khảo 16S (Espiritu cs,...
  • 46
  • 742
  • 0
Bước đầu ứng dụng kỹ thuật PCR   giải trình tự hỗ trợ định danh một số loài ong ký sinh dựa trên các gen đích 16s rRNA và COI

Bước đầu ứng dụng kỹ thuật PCR giải trình tự hỗ trợ định danh một số loài ong ký sinh dựa trên các gen đích 16s rRNA và COI

Ngân hàng - Tín dụng

... từ trình tự dựa gen 16S rRNA 98 Hình III.52 Cây NJ xây dựng từ trình tự dựa gen COI gen 16S rRNA 100 Hình III.53: Cây ML xây dựng trình tự dựa gen COI gen 16S rRNA ... tự gen COI mẫu IS1 GenBank 62 Hình III.22 Kết Blast trình tự gen COI IS2 GenBank 63 Hình III.23 Kết Blast trình tự gen 16S rRNA mẫu IS1 GenBank 64 Hình III.24 Kết Blast trình tự gen 16S ... trình tự gen COI gen 16S rRNA loài ong ký sinh thu thập từ nguồn liệu Genbank (NCBI) 31 Bảng III.2 Bộ trình tự kết hợp gen COI 16S rRNA số loài ong ký thu thập từ nguồn liệu GenBank...
  • 143
  • 336
  • 0
Ứng dụng kỹ thuật PCR tìm gen DYZ1 để xác định NST Y cho các bệnh nhân chưa rõ giới tính docx

Ứng dụng kỹ thuật PCR tìm gen DYZ1 để xác định NST Y cho các bệnh nhân chưa rõ giới tính docx

Báo cáo khoa học

... dơng kü tht PCR víi cỈp måi SY 160 tìm gen DYZ để xác định NST Y cho bệnh nhân cha rõ giới tính Tiến hành kỹ thuật PCR tìm DYZ để khẳng định có mặt hay mặt NST Y trờng hợp phù hợp PCR tìm TDF ... bệnh nhân, sau tiến hành xác định giới tính cho bệnh nhân kỹ thuật PCR xác định gen TDF, kỹ thuật đợc chuẩn cho phản ứng xác 100% trờng hợp [8] Khi có kết TDF đối chiếu với caryotype bệnh nhân ... XX 40 100 ∑ NhËn xÐt: - Thực phản ứng PCR với cặp mồi gen TDF để xác định giới PCR với cặp mồi gen DYZ để xác định NST Y - 15/40 sè tr−êng hỵp chiÕm 37,5 % gen TDF (-) cã kết phù hợp với kết NST...
  • 5
  • 654
  • 1
xây dựng quy trình phát hiện thịt trong thực phẩm chay bằng phương pháp pcr gen 16s ty thể

xây dựng quy trình phát hiện thịt trong thực phẩm chay bằng phương pháp pcr gen 16s ty thể

Sinh học

... 80S 55S 5S, 5.8S, 28S 16S 18S 12S  Cơ sở sử dụng gen 16S phát thịt động vật Trong hệ gen ty thể động vật chứa hai gen rRNA 12S 16S rRNA Gen 16S rRNA mã hóa cho phân tử rRNA tiểu phần lớn ribosome ... gen, rRNA, 22 tRNA 13 mRNA Gen rRNA mã hóa cho RNA ribosome[13] 8 Hình 1.2 Cấu trúc hệ gen ty thể 2.2 Gen 16S rRNA phát thịt động vật[10,19,20,22]  Đặc điểm cấu trúc vai trò ribosome RNA (rRNA) ... tử DNA có chứa 22 tRNA, rRNA 13 gen mã hóa protein (Garder & Snustad, 1984) Như tế bào có chứa 800x2 = 1.600 copies gen 16S rRNA Vì vậy, sử dụng trình tự gen nhạy sử dụng gen khác có copy tế bào...
  • 58
  • 831
  • 4
Báo cáo khoa học:

Báo cáo khoa học: " Identification and prevalence of Ehrlichia chaffeensis infection in Haemaphysalis longicornis ticks from Korea by PCR, sequencing and phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene" docx

Báo cáo khoa học

... chaffeensis-specific 16S rRNA gene fragment For the first round PCR, primer ECC (5'-agaacgaacgctggc ggcaagc-3') and ECB (5'-cgtattaccgcggctgctggca-3') targeting the conserved regions of Ehrlichia spp 16S rRNA gene ... by genus-specific (Ehrlichia spp or Anaplasma spp.) and species-specific (E chaffeensis) PCR based on amplification of 16S rRNA gene fragments In all, 611 (47.4%) ticks tested positive for genus-specific ... Seung-Ok Lee et al Fig Phylogenetic tree of 16S rRNA sequences of Ehrlichia spp inferred using the sequence distance method and the neighbor joining algorithm 16S rRNA gene sequences (396 bp) from...
  • 5
  • 353
  • 0
Báo cáo y học:

Báo cáo y học: "Broad-range PCR, cloning and sequencing of the full 16S rRNA gene for detection of bacterial DNA in synovial fluid samples of Tunisian" pps

Báo cáo khoa học

... puncture, snap frozen in liquid nitrogen, and stored at -80°C until analysis Automated DNA extraction from synovial fluid and broad-range PCR amplification of 16S rRNA genes, cloning and sequencing ... added to the SF cell pellet Bacterial 16S rDNA fragments were amplified from SF extracted DNA by broad-range PCR amplification using universal bacterial 16S rRNA gene-specific oligonucleotide primers ... the bacterial genus but not the identification of the species level This is, to our knowledge, the first study using the full-length 16S rRNA gene as a target for broad-spectrum PCR to detect...
  • 11
  • 461
  • 0
Nghiên cứu phân loại một số loài cá thuộc giống cá bỗng (spinibarbus) ở việt nam dựa trên gen ty thể (COI, 16s rRNA)

Nghiên cứu phân loại một số loài cá thuộc giống cá bỗng (spinibarbus) ở việt nam dựa trên gen ty thể (COI, 16s rRNA)

Cao đẳng - Đại học

... liệu cho việc khuếch đại hai đoạn gen COI 13 bp 16S rRN 12 bp 3.3 K t uả hu h i gen 16S rRNA COI ằng thuật PCR Sản ph m phản ng PCR khuếch đại hai đoạn gen 16S rRN COI ki m tra b ng phương pháp ... http://www.lrc.tnu.edu.vn 13 gen tRNA, gen rRNA v ng điều n Kết cho thấy có gen tRN , gen N tất gen ty th khác mã hóa chu i n ng Có v ng gen ch ng chéo lên với k ch thước bp có 13 v ng đệm gi a gen với t ng ... trình tự hệ gen ty th cơng bố lồi thuộc giống Spinibarbus GenBank số nghiên c u khác trình bày ảng 2.3: ảng 3: Các c p m i s d ng nghiên c u Đ n gen nhân lên Tên i 16S *16Sp1F rRNA *16Sp1R **COI-F1...
  • 80
  • 449
  • 0
Ứng dụng gen mã vạch (16s rRNA và COI) của DNA ty thể để phân loại một số loài cá rạn san hô tại tỉnh khánh hòa

Ứng dụng gen mã vạch (16s rRNA và COI) của DNA ty thể để phân loại một số loài cá rạn san hô tại tỉnh khánh hòa

Kỹ thuật - Công nghệ

... phẩm PCR đoạn gen 16S rRNA COI mtDNA .59 viii DANH MỤC BẢNG Bảng 2.1 Thành phần phản ứng PCR 20 Bảng 2.2 Trình tự mồi gen 16S rRNA COI mtDNA .20 Bảng 2.3 Trình tự gen gen 16S rRNA ... Scarus) cách phân tích mảnh gen (trình tự 12S rRNA ti thể (967 bp), 16S rRNA (577 bp), cytochrome b (477 bp) gen nhân, gồm phần trình tự gen RAG2 (715 bp), tmo4c4 (485 bp) gen otx1 (672 bp), bmp4 ... µL H2 O 29,75 µL Tởng 50 µL Bảng 2.2 Trình tự mồi gen 16S rRNA COI mtDNA Mồi xuôi Gen 16Sar 16S rRNA 5’CGCCTGTTTATCA AAAACAT-3’ Mồi ngược 16Sbr Kích thước Nguồn 650bp 5’CCGGTCTGAAC Palumbi TCAGATCACGT-...
  • 100
  • 390
  • 1
Nghiên cứu sự biến đổi thành phần gen nhân ITS2, 28S rRNA và gen ty thể COX1 của loài sán lá gan lớn Fasciola sp dạng thuần và dạng lai gây bệnh trên động vật tại Việt Nam (LV thạc sĩ)

Nghiên cứu sự biến đổi thành phần gen nhân ITS2, 28S rRNAgen ty thể COX1 của loài sán lá gan lớn Fasciola sp dạng thuần và dạng lai gây bệnh trên động vật tại Việt Nam (LV thạc sĩ)

Sinh học

... mồi, thực PCR gen ITS2, 28S gen cox1 2.4.3.1 Thiết kế mồi Đoạn gen cox1 hệ gen ty thể sán gan Fasciola chứa gen mã hóa protein cox1; gen ITS-2 gen 28S đoạn gen khơng mã hóa hệ gen nhân lựa chọn ... ribosome 26 hệ gen nhân Ngồi sử dụng cặp mồi thiết kế cho phản ứng PCR nhân vùng gen cox1 hệ gen ty thể gen 28S gen nhân nghiên cứu loài sán gan lớn Fasciola sp Gen 28 S: Phản ứng PCR thực theo ... dựa vùng hệ gen nhân ITS-2 gen 28S cấu trúc ribosome DNA (rDNA) (Hình 1.5) Vùng gen ITS-2 28S thu nhận phương pháp PCR, giải trình tự nuleotide so sánh với sở liệu có Ngân hàng gen (GenBank) để...
  • 80
  • 594
  • 0
Ứng dụng khóa phân loại hình thái và vùng 16S rRNA trên DNA ty thể trong định danh cá bột thuộc họ

Ứng dụng khóa phân loại hình thái và vùng 16S rRNA trên DNA ty thể trong định danh cá bột thuộc họ

Sinh học

... macronema Bleeker, 1851 15 mm 4.3 Xác định phân tích vùng 16S rRNA mtDNA 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA Trƣớc nhân dòng vùng 16S rRNA mtDNA tất mẫu cá phân tích, chúng tơi thực lần thí ... phản ứng PCR nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA mtDNA Sản phẩm PCR đƣợc phân tích gel agarose 1% (Hình 4.5) 37 M M 831 bp 630 bp 947 bp 564 bp Hình 4.5.: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16S rRNA mtDNA ... tích DNA .33 4.3 Xác định phân tích vùng 16S rRNA mtDNA .34 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA 34 4.3.2 Phân tích trình tự vùng 16S rRNA mtDNA mẫu cá 38 4.3.2.1 Định danh mẫu...
  • 72
  • 831
  • 4
Ứng dụng khóa phân loại hình thái và vùng 16s rRNA trên DNA ty thể trong định danh cá bột thuộc họ Pangasiidae

Ứng dụng khóa phân loại hình thái và vùng 16s rRNA trên DNA ty thể trong định danh cá bột thuộc họ Pangasiidae

Công nghệ - Môi trường

... macronema Bleeker, 1851 15 mm 4.3 Xác định phân tích vùng 16S rRNA mtDNA 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA Trƣớc nhân dòng vùng 16S rRNA mtDNA tất mẫu cá phân tích, chúng tơi thực lần thí ... phản ứng PCR nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA mtDNA Sản phẩm PCR đƣợc phân tích gel agarose 1% (Hình 4.5) 37 M M 831 bp 630 bp 947 bp 564 bp Hình 4.5.: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16S rRNA mtDNA ... tích DNA .33 4.3 Xác định phân tích vùng 16S rRNA mtDNA .34 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA 34 4.3.2 Phân tích trình tự vùng 16S rRNA mtDNA mẫu cá 38 4.3.2.1 Định danh mẫu...
  • 72
  • 524
  • 1
Ứng dụng khóa phân loại hình thái và vùng 16s rRNA trên DNA ty thể

Ứng dụng khóa phân loại hình thái và vùng 16s rRNA trên DNA ty thể

Công nghệ - Môi trường

... macronema Bleeker, 1851 15 mm 4.3 Xác định phân tích vùng 16S rRNA mtDNA 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA Trƣớc nhân dòng vùng 16S rRNA mtDNA tất mẫu cá phân tích, chúng tơi thực lần thí ... phản ứng PCR nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA mtDNA Sản phẩm PCR đƣợc phân tích gel agarose 1% (Hình 4.5) 37 M M 831 bp 630 bp 947 bp 564 bp Hình 4.5.: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16S rRNA mtDNA ... tích DNA .33 4.3 Xác định phân tích vùng 16S rRNA mtDNA .34 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA 34 4.3.2 Phân tích trình tự vùng 16S rRNA mtDNA mẫu cá 38 4.3.2.1 Định danh mẫu...
  • 72
  • 800
  • 0
ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae

ỨNG DỤNG KHÓA PHÂN LOẠI HÌNH THÁI VÀ VÙNG 16S rRNA TRÊN DNA TY THỂ TRONG ĐỊNH DANH CÁ BỘT THUỘC HỌ Pangasiidae

Công nghệ - Môi trường

... macronema Bleeker, 1851 15 mm 4.3 Xác định phân tích vùng 16S rRNA mtDNA 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA Trƣớc nhân dòng vùng 16S rRNA mtDNA tất mẫu cá phân tích, chúng tơi thực lần thí ... phản ứng PCR nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA mtDNA Sản phẩm PCR đƣợc phân tích gel agarose 1% (Hình 4.5) 37 M M 831 bp 630 bp 947 bp 564 bp Hình 4.5.: Sản phẩm PCR khuếch đại vùng 16S rRNA mtDNA ... tích DNA .33 4.3 Xác định phân tích vùng 16S rRNA mtDNA .34 4.3.1 Nhân dòng vùng gen mã hóa 16S rRNA 34 4.3.2 Phân tích trình tự vùng 16S rRNA mtDNA mẫu cá 38 4.3.2.1 Định danh mẫu...
  • 72
  • 410
  • 1
Nghiên cứu thu nhận gen mã hóa kháng thể đặc hiệu kháng nguyên ung thư tiền liệt tuyến EPCA bằng công nghệ gen

Nghiên cứu thu nhận gen mã hóa kháng thể đặc hiệu kháng nguyên ung thư tiền liệt tuyến EPCA bằng công nghệ gen

Thạc sĩ - Cao học

... Kết nhân gen mã hóa mảnh kháng thể scFv PCR Để thu gen mã hóa mảnh kháng thể scFv đặc hiệu kháng nguyên EPCA bệnh ung thư tiền liệt tuyến đủ cho việc thiết kế vector biểu hiện, thực phản ứng nhân ... vector gốc chưa gắn thêm đoạn gen ngoại lai sau PCR với mồi Lab thu sản phẩm khoảng 200 bp, vector gắn thêm đoạn gen ngoại lai sản phẩm PCR thu có kích thước kích thước gen ngoại lai cộng với 200 ... hiện, thực phản ứng nhân gen kỹ thuật PCR với mồi đặc hiệu: TTLF: 5’GGCCCCATGGCCATTGCGGGCCTG – 3’ TTLR: 5’- GATGTGCGGCCGCACGTTTGATTTC – 3’ Sản phẩm PCR điện di kiểm tra gen agarose hình 1: M 500...
  • 15
  • 526
  • 0
Tách dòng gen 16s arn riboxom từ vi khuẩn phân hủy thuốc bảo vệ thực vật methyl parathion

Tách dòng gen 16s arn riboxom từ vi khuẩn phân hủy thuốc bảo vệ thực vật methyl parathion

Sinh học

... nucleotit đoạn gen 16s ARN riboxom 35 Khi so sánh trình tự đoạn gen với trình tự gen 16s ARNr tác giả khác giới công bố, kết nhận đợc cho thấy tơng đồng nucleotit đoạn gen thiết kế so víi gen 16s ARNr ... S¶n phÈm PCR chđng 731 Kết ny lần khẳng định đoạn gen 16s ARN riboxom đợc gắn vo vector Đọc trình tự đoạn gen 16s ARNr v lập phả hệ Plasmid tái tổ hợp đựoc sử dụng để đọc trình tự đoạn gen gắn ... đợc chọn để tách gen 16s ARNr phục vụ cho mục đích định loại chủng ny đến loi ảnh Điện di đồ ADN tổng số chủng vi khuẩn phân hủy MP Đoạn gen 16s ARN riboxom chủng 731 đợc nhân PCR với cặp mồi...
  • 6
  • 626
  • 0
KHẢO SÁT VÙNG GEN 16S rDNA CỦA MỘT SỐ DÒNG VI KHUẨN CÓ KHẢ NĂNG CỐ ĐỊNH ĐẠM Ở ĐẤT VÙNG RỄ LÚA TỈNH ĐỒNG THÁP potx

KHẢO SÁT VÙNG GEN 16S rDNA CỦA MỘT SỐ DÒNG VI KHUẨN CÓ KHẢ NĂNG CỐ ĐỊNH ĐẠM Ở ĐẤT VÙNG RỄ LÚA TỈNH ĐỒNG THÁP potx

Báo cáo khoa học

... khơng 450C 10 phút, hòa tan tủa 30 l nước cất lần khử trùng, trữ -20oC Khuếch đại vùng gen 16S rDNA Vùng gen 16S rDNA khuyếch cặp mồi tổng 27F 1495R có trình tự 27F: 5’ GAG AGT TTG ATC CTG GCT CAG ... UV 2000 Thang chuẩn 100 bp mua từ công ty Fermentas Cắt vùng gen 16S rDNA enzyme cắt giới hạn (RE) Bốn RE sử dụng để cắt vùng gen 16S rDNA có trình tự nhận biết nhiệt độ ủ bảng 1, N nucleotide ... chung mẫu PCR với cặp mồi tổng 27F 1495R cho kết tốt mẫu có band với kích thước khoảng 1468 bp 16S rDNA vùng mã hóa RNA ribosome xác định đoạn gen bảo tồn tất tế bào Trình tự đoạn gen sinh vật...
  • 9
  • 743
  • 1

Xem thêm