... GIẢITRÌNHTỰ AXIT NUCLEIC TRÊN MÁY TỰ ĐỘNG. Giảng viên hướng dẫn: LÊ XUÂN ĐẮC Sinh viên thực hiện: PHẠM THỊ THOA Lớp: K33C Sinh – KTNN Trường: Đại học sư phạm Hà Nội II.I. Giảitrìnhtự ... ADN tự động.- Nguyên lí: Giảitrìnhtự ADN tự động dựa theo nguyên lí của phương pháp dideoxy của F.Sanger (1977) được cải tiến dựa vào các thiết bị tự động hóa nhanh và chính xác hơn. Sự tự ... Phần mềm máy tính sẽ tự động giảitrìnhtự giữ liệu từ gel điện di và cho hình ảnh kết quả giảitrình ADN.- Các bước tiến hành:+, Giảitrìnhtự ADN tự động bao gồm các thành phần chủ yếu sau:1...
... dùng để đọc trình tự hầu hết các loại rDNA nhưng không đọc được trìnhtựvùng primer. NS2 và NS3, NS4 và NS5, NS6 và NS7 có trìnhtự bổ sung, được thiết kế để đọc được trìnhtự cả vùng primer ... nucleotide 475. Vì trìnhtự với primer ITS4 bị nhiễu nên trìnhtự cuối cùng được chọn dựa trên vùng đáng tin cậy của trìnhtự đọc được với primer ITS5. 4.5.2. Kết quả tìm trìnhtự đáng tin cậy ... (2002) đã giảitrìnhtự hoàn toàn gene mã hóa 5.8 S rDNA và vùng ITS lân cận 2 dòng Beauveria bassiana. Sự giống trên toàn vùngtrìnhtựgiải được của hai dòng này là 96 %. Sự giống nhau ở vùng...
... định được trìnhtựvùng rDNA-ITS của dòng BV-62-03. 4.4.2. Đọc trìnhtựvùng rDNA-ITS của dòng SR-650 Với primer ITS1, vùng rDNA-ITS của dòng SR-650 đã đọc được là 602bp. Trìnhtự như sau: ... thành công vùng rDNA-ITS của nấm R. solani. Bước đầu đã đọc được trìnhtựvùng rDNA-ITS của nấm R. solani . 5.2.Đề nghị Hoàn thiện qui trình đọc trìnhtự để có kết quả đọc trìnhtự tốt hơn. ... vừa li trích trên vùng ITS của rDNA sử dụng hai mồi (primer) ITS4 và ITS5. Đọc trìnhtựvùng rDNA – ITS với hai primer ITS1 và ITS4. 1.4. Giới hạn đề tài Việc đọc trìnhtựvùng rDNA – ITS...
... mềm Seqscape và BioEdit giúp xác định đƣợc trình tự đầy đủ của vùng D-Loop của các mẫu gà.Do mẫu gà Mông đọc trìnhtự gặp phải khó khăn nên trìnhtự D-Loop của gà Mông chƣa đầy đủ. Vì vậy chúng ... so sánh kết quả hai mẫu Da và RI.So sánh trìnhtự Da và RI với nhau và với trìnhtự D-Loop của gà đã đƣợc công bố Galuss galuss gốc Nhật lấy trìnhtự trong trên ngân hàng gen mang mã số AB114078 ... cứu vùng D-Loop của 3 loài gà lôi Việt Nam gồm: gà lôi đuôi trắng, trĩ bạc và gà lôi hông tía. Các kết quả thu đƣợc cho thấy sự sai khác về trìnhtự nhận biết các enzyme trong vùngtrình tự...
... quả giảitrìnhtựvùng ITS-rDNA và vùng Tef 43 4.6.1 So sánh trìnhtự nucleotid giữa vùng ITS – rDNA và vùng Tef 43 4.6.2 Kết quả giảitrìnhtựvùng ITS1 – 5,8S – ITS2 48 4.6.3 Kết quả giảitrình ... dòng Trichoderma trong tự nhiên, nhận diện các dòng nấm thu đƣợc là các dòng Trichoderma, tiến tới đọc trìnhtựvùng rDNA-ITS, trình tự đọc đƣợc này đối chiếu với trìnhtự có trong cơ sở dữ liệu ... 1997). Vùng ITS2 khám phá sau vùng ITS1, vùng ITS2 có tính bảo toàn cao hơn ở một vài vùng 18S (Hershkovitz và ctv., 1999). Chiều dài và trìnhtự của những vùng ITS của rDNA đƣợc cho rằng vùng...
... vùng chức năng chính. Vùng mã hóa chiếm tới 93% hệ gen ty thể, vùng còn lại đƣợc gọi là vùng D-loop (vùng siêu biến hay vùng điều khiển) không đƣợc dịch mã, chứa trìnhtự khởi đầu cho quá trình ... Mỹ. Vùng điều khiển D-loop đƣợc xác định trìnhtự trên máy đọc trìnhtựtự động ABI PRISM 3100 Genetic Analyzer. 2.2.5. Phân tích dữ liệu bằng phần mềm chuyên dụng Dữ liệu về trìnhtựvùng ... sử dụng cả các marker vi vệ tinh và trìnhtựvùng D-loop ty thể gà. Các nhà khoa học cũng đã so sánh trìnhtựvùng D-loop của các loại gà này với 779 trìnhtự thu thập đƣợc từ GenBank. Các kết...
... vùng D-loop bằng kỹ thuật PCR…… …………………… 31 3.2. Xác định và so sánh trìnhtự nucleotide của các mẫu nghiên cứu với trìnhtự chuẩn trên GenBank…… …………… …….… 36 3.3. Sự đồng nhất về trìnhtự ... trong 5 phút ở 4oC, sau đó giữ mẫu DNA tinh sạch ở -20oC. 2.2.4. Giảitrìnhtựvùng D-loop Nguyên tắc chung: Trình tựvùng D-loop đƣợc xác định dựa trên nguyên tắc chung của phƣơng pháp ... thành ba vùng chính là vùng ngoại biên I và III có khả năng biến đổi cao và vùng II là vùng trung tâm ít biến đổi [55]. Vùng I nằm ở đầu 5' vùng điều khiển, kích thƣớc khoảng 400 bp, vùng...
... Nhân đoạn trìnhtự của vùng D-loop của DNA ty thể 36 3.2.3. Tách dòng và xác định trìnhtựvùng D- loop của DNA ty thể 39 3.2.3.1. Tách dòng vùng D-loop 39 3.3.2.2. Xác định trìnhtựvùng D-loop ... tiếp theo. 3.2.3 Tách dòng và xác định trìnhtựvùng D-Loop của DNA ty thể 3.2.3.1. Tách dòng vùng D-Loop Để tạo điều kiện cho việc xác định trìnhtựvùng D-loop, chúng tôi tiến hành tách ... KS (-) để chuẩn bị cho việc đọc và so sánh trìnhtự nucleotide vùng D-Loop. Năm 2006 Địch Thị Kim Hương và cộng sự [3] đã xác định được trìnhtự vùng D-Loop gồm 1227 nucloetide của 2 mẫu giống...
... dạng di truyền 6 giống gà bản địa của trung Quốc. Họ giảitrìnhtự 539 nucleotide vùngtrìnhtự D-Loop của 6 giống gà, so sánh với trìnhtự nucleotide của các giống gà G. gallus, G.sonneratii, ... hoán Chúng tôi so sánh trìnhtựvùng D-Loop của 2 mẫu gà nghiên cứu với một số trìnhtự của các chủng gà đã đƣợc công bố: Giống Galuss galuss Murghi gốc Ấn Độ lấy trìnhtự trong ngân hàng gen ... mềm Seqscape và BioEdit giúp xác định đƣợc trìnhtự đầy đủ của vùng D-Loop của các mẫu gà. Do mẫu gà Mông đọc trìnhtự gặp phải khó khăn nên trìnhtự D-Loop của gà Mông chƣa đầy đủ. Vì vậy...
... đưc vng D-loop. Sn phẩm PCR sẽ đưc sử dụng ở cc thí nghiệm tip theo. 3.2.3 Xc đnh trnh tựvùng điều khiển D-loop của DNA ty thể Sau khi tinh sch sn phẩm PCR (thôi gel sn phẩm PCR), ... khỏe , ngăn ngừ a và hạ n chế cá c bệ nh về tim mạ ch . 3.2 Xc đnh trnh tự nucleotide của vùng D-loop và đnh gi đa dạng di truyền của 3 mẫu gà nghiên cứu Đ xc định trnh t ... trên chng tôi đ tin hnh đ ti : “ Xác định hàm lượng cholesterol trong trứng và so sánh trìnhtự vng điều khiển D-loop DNA ty thể của gà Ri, gà Tre, gà Ác nuôi tại Bắc Giang”. 2. Mục tiêu...
... hóa. Vùng II kích thƣớc khoảng 500 bp, vùng này có tốc độ tiến hóa chậm hơn so với vùng I và vùng III từ 10 - 20 lần [35]. Thông thƣờng, vùng thứ III là vùng biến đổi nhiều nhất và có trìnhtự ... sử dụng cả các marker vi vệ tinh và trìnhtựvùng D-loop ty thể gà. Các nhà khoa học cũng đã so sánh trìnhtựvùng D-loop của các loại gà này với 779 trìnhtự thu thập đƣợc từ GenBank. Các kết ... D-loop của 71 mẫu thuộc 3 giống gà Ri, Đông Tảo và Tre. - Xác định trìnhtựvùng D-loop. - So sánh trìnhtựvùng D-loop với trìnhtự chuẩn đã đƣợc công bố trên GenBank, phát hiện các vị trí đa...
... chính máy giảitrìnhtự của Trugene) vào thư viện này, nhưng không thể lấy thư viện này ra bên ngoài cũng như không thể đăng nhập được một trìnhtự có được từ các máy giảitrìnhtự khác để ... Có một số nhà nghiên cứu cho là nếu định genotype bằng giảitrìnhtựvùng 5’-NC sẽ không cho kết quả chính xác mà phải giảitrìnhtựvùng NS5B trên bộ gen của HCV. Sở dĩ các nhà nghiên cứu ... hữu dụng lâm sàng nhất vẫn là giảitrìnhtựvùng 5’-NC. Mục tiêu nghiên cứu: Thực hiện xét nghiệm giảitrìnhtự trực tiếp sản phẩm PCR khuếch đại một đoạn DNA trên vùng 5’-NC của HCV, phân tích...
... vùng Tef 43 4.6.1 So sánh trìnhtự nucleotid giữa vùng ITS – rDNA và vùng Tef 43 4.6.2 Kết quả giảitrìnhtựvùng ITS1 – 5,8S – ITS2 48 4.6.3 Kết quả giảitrìnhtựvùng Tef1fw – Tef2rev của ... dòng Trichoderma trong tự nhiên, nhận diện các dòng nấm thu đƣợc là các dòng Trichoderma, tiến tới đọc trìnhtựvùng rDNA-ITS, trình tự đọc đƣợc này đối chiếu với trìnhtự có trong cơ sở dữ liệu ... 1997). Vùng ITS2 khám phá sau vùng ITS1, vùng ITS2 có tính bảo toàn cao hơn ở một vài vùng 18S (Hershkovitz và ctv., 1999). Chiều dài và trìnhtự của những vùng ITS của rDNA đƣợc cho rằng vùng...
... ng/µl được sử dụng để giảitrìnhtự tại ADN Core, trường đại học tổng hợp Michigan (Mỹ) theo phương pháp giảitrình của Hultman (6a) Phân tích trìnhtự đoạn ADN: Chương trình Blast trên trang ... phương pháp điện di Kết quả giảitrìnhtự Sản phẩm PCR, sau khi làm sạch được giảitrìnhtự trực tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử. Kết quả được trình bầy ở hình 2 A và B. Gen ... ADN và protein A) Ở mức độ ADN Trình tự của toàn bộ gen HP1125 vừa được giải mã được so sánh với gen tương ứng của các chủng nước ngoài bằng chương trình Blast. Nhìn chung, gen của Việt...