... ADN dùng cột Qiagene: Các cột Qiagene chuẩn bị dễ dàng nhanh để tinh ADN không cần dùng gradient CsCl ADN chuẩn bị theo phương pháp đạt kết tốt cho việc biến nạp giảitrìnhtự gene Có hai ý quan ... QBT 750mM NaCl,50mM MOPS ,15 % ethanol, pH 7,0, Nhiệt 0 ,15 % Triton X -10 0 phòng độ Đệm QC 1M NaCl, 50mM MOPS, 15 % ethanol, pH 7,0 Nhiệt độ phòng Đệm QF 1, 25M NaCl, 50mM MOPS, 15 % ethanol, pH 8,2 Nhiệt ... loại dịch đệm dùng cho cột Qiagene: Đệm P1 50 mM Tris -HCl, 10 mM EDTA, pH 8.0, Rnase A Bảo quản pha trước dùng đệm P1 nồng độ 10 0 4oC µg/ml Đệm P2 200 mM NaOH ,1% SDS Nhiệt độ phòng Đệm P3 2,55M...
... Các độtbiến virus B Nhiều kiểu độtbiến HBV nhận diện Đa số độtbiến thầm lặng khơng có ý nghĩa lâm sàng nào, nhiên có số độtbiến có ý nghĩa q trình diễn tiến bệnh Độtbiếngen S: Một số độtbiến ... biếngen S có ý nghĩa độtbiến “thốt”, ví dụ độtbiến G145A, làm cho việc tiêm ngừa khơng có hiệu bệnh nhân nhiễm bệnh Đột biếnvùng trước lõi (Pre-core) Core promoter: Độtbiến hay gặp độtbiến ... thành vùng đặt tên từ A – G Vì vùng RT đích tác động thuốc Lamivudine nên độtbiếnvùngtrìnhphát triển tự nhiên siêu vi B tác động thuốc điều trị dẫn tới vấn đề độtbiến kháng thuốc Quy trình giải...
... CẤU TẠO BỘ GEN HBV CẤU TẠO GEN P VÀ VÙNG RT 3, QUI TRÌNH THỰC HIỆNGIẢITRÌNHTỰ CHUỖI TRÊN HỆ THỐNG SEQUENCING TRUGENE Để thực kỹthuậtgiảitrìnhtự chuỗi, phải thực bước sau: (1) Thực PCR; ... Polymerase mutations) độtbiến liên quan đến ung thư tế bào gan (X mutants) 1, Độtbiếngen S (S mutants): Một số độtbiếngen S có ý nghĩa độtbiến “thốt”, ví dụ độtbiến G145A, làm cho việc tiêm ... tốt 4, Độtbiếngen X (HBX): Dữ liệu độtbiến vai trò độtbiến hạn chế, nhiên kết nghiên cứu bước đầu cho thấy độtbiến có liên quan đến ung thư tế bào gan Với việc thực kỹthuậtgiảitrìnhtự chuỗi...
... Serine (Đột biến rtM204V/I/S) Những độtbiến khác liên quan đến kháng Lamivudine độtbiến thay Leucine thành Methionine vùng B (Domain B) độtbiến rtL180M; Độtbiến V173L; Độtbiến V207I Trong 12 2 ... immunoassay) Kỹthuật dùng để xác định kiểu gen HBV kỹthuậtgiảitrìnhtự chuỗi bên cạnh việc xác định kiểu gen HBV chúng tơi tìm độtbiến kháng Lamivudine lần thực giảitrìnhtự chuỗi Vai trò kiểu gen ... có độtbiến kháng Lamivudine Bảng Tỷ lệ loại độtbiến kháng Lamivudine tỉ lệ phần trăm Loại L180M, Số 14 L180M, L180M, M204V M204V & M204V V173L độtbiến M204I L180M, M204I M204I, V207I 44 1 15...
... (19 91) Coxiella burneti Stein an Raoult (19 92) Cryptosporidium parvum Laxer et al (19 91) Cytomegalovirus Gozlan et al (19 91) Dengue virus Henchal et al (19 91) Epstein-barr virus Samoszuk (19 91) ... 000 lần Mặt khác dùng kỹthuật miễn dịch với kháng thể phải cần tới ngày có đáp ứng miễn dịch máu, với kỹthuật PCR tồn quy trìnhphát vài (đối với nguồn ADN hay RNA) Lợi kỹthuật PCR tận dụng cho ... et al (19 92) (HIV) Claas et al (19 92) Influenza virus Merien et al (19 92) Leptospira spp Niederhauser et al (19 92) Litsteria monocytogenees Robertson et al (19 91) Luteovirus Hackel et al (19 90)...
... khác (vấn đề bàn luận kỹ tài liệu USB sequenase) b Kỹthuậtgiảitrìnhtự ADN thiết bị giảitrìnhtự ADN tự động: Hình 1. 12 Thiết bị giảitrìnhtự ADN tự độngg ( 310 0-Avant Genetic Analyzer) Trong ... việc giảitrìnhtự ADN plasmid nên tái tinh với Genee-Clean sắc ký trao đổi ion Hình 1. 11 Tra mẫu thiết bị chạy gel Các phần đề cập đến số vấn đề nảy sinh cách giải tiến hành giảitrìnhtự ADN ... bắt cặp với ADN mồi dùng để giảitrìnhtự Phương pháp giảitrìnhtự ADN với sợi đôi cần lượng ADN mồi cao gấp 10 -20 lần so với sợi đơn Việc giảitrìnhtự gồm hai phản ứng: phản ứng đánh dấu phản...
... Serine (Đột biến rtM204V/I/S) Những độtbiến khác liên quan đến kháng Lamivudine độtbiến thay Leucine thành Methionine vùng B (Domain B) độtbiến rtL180M; Độtbiến V173L; Độtbiến V207I3,9 ,12 ,19 ,20, 21, 24 ... loại độtbiến kháng Lamivudine tỉ lệ phần trăm L L1 L1 L1 oại đột 80M, 80M, biến 80M, M M204V M204V M204V M204I 80M, L1 204I M 204I, M 204V V207I & V173L & V207I S 14 44 1 15 T 11 , 36, 0.8 0,8 12 ... immunoassay) Kỹthuật dùng để xác định kiểu gen HBV kỹthuậtgiảitrìnhtự chuỗi bên cạnh việc xác định kiểu gen HBV chúng tơi tìm độtbiến kháng Lamivudine lần thực giảitrìnhtự chuỗi Vai trò kiểu gen...
... giảitrìnhtự DNA tự động 33 4.2 Kỹthuậtgiảitrìnhtự DNA tự động (Dye termination sequencing) 4.2 .1 Chuẩn bị DNA cần giảitrìnhtự * DNA khn DNA khn để giảitrìnhtự đa dạng, gen tế bào (genomic ... di gel phátkỹthuật xạ kýtự ghi Hình 8: Xác định trìnhtự DNA sau đánh dấu mồi dNTP 3.2 Giảitrìnhtự DNA kỹthuật pyrosequencing 454 Kỹthuật sáng tạo Pål Nyrén Mostafa Ronaghi Viện Kỹthuật ... 2.2.3 .1 Các kỹthuật định tính * Kỹthuật PCR Kỹthuật PCR (Polymerase Chain Reaction) kỹthuật tổng hợp DNA nhờ enzym Polymerase nhà bác học người Mỹ có tên Kary Mulis phát minh năm 19 83 Kỹ thuật...
... luận kỹ tài liệu USB sequenase) 28/ 31 Nhân gene kỹthuậtgiảitrìnhtự ADN Kỹthuậtgiảitrìnhtự ADN thiết bị giảitrìnhtự ADN tự động: Hình 1. 12 Thiết bị giảitrìnhtự ADN tự độngg ( 310 0-Avant ... Microbiology Bảng 1. 7 Một số ví dụ ứng dụng kỹthuật PCR xác định vi sinh vât 2/ 31 Nhân gene kỹthuậtgiảitrìnhtự ADN 3/ 31 Nhân gene kỹthuậtgiảitrìnhtự ADN Sau nét chung kỹthuật PCR: Nguyên ... Weish &McClellADN (19 90) Streptococcus uberis Jayarao &ctv (19 92) 10 / 31 Nhân gene kỹthuậtgiảitrìnhtự ADN Hình 1. 9 Minh hoạ kết phân tích sử dụng kỹthuật RADP Giảitrìnhtự ADN Phương pháp...
... 11 .504 -11 .573 11 .574 -11 .582 11 .583 -11 .648 11 .649 11 .650 -13 .236 13 .237 -13 .247 13 .248 -13 .320 13 .3 21- 13.332 13 .323 -15 .032 15 .033 -15 .034 15 035 -15 093 Gen lồng (2 bp) nad5 15 87 tRNA-Glu 73 Vùng lặp AT 17 10 ... 67 10 .847 -11 .305 11 .306 -11 .372 Vùng giao gen (3 bp) ATG TAG Vùng giao gen (13 bp) Vùng giao gen (7 bp) Vùng giao gen (4 bp) ATG TAG Vùng giao gen (1bp) Vùng giao gen (1 bp) ATG TAG ATG TAG Gen ... TAA Vùng giao gen (25bp) Vùng giao gen (4 bp) Vùng giao gen (1 bp) Vùng giao gen (2 bp) GTG TAG Vùng giao gen (2 bp) Vùng giao gen (4 bp) Gen overlap (4 bp) cox1 15 42 tRNA-Thr 16 S rRNA 61 979 619 9-6263...
... dòng vi khuẩn gây bệnh đốm vùng trồng rau thuộc huyện Củ Chi, Hóc Mơn quận 12 , Tp HCM Sử dụng kỹthuật PCR khuyếch đại vùng 16 S – 23S rDNA ITS làm vật liệu giảitrìnhtựgen hrpF đặc trƣng vi khuẩn ... nƣớc 12 2.3 Vùng ITS (rDNA intergenic spacer) gen hrpF (hypersensitive reaction and pathogenicity) 13 2.3 .1 Gen hrpF (hypersensitive reaction and pathogenicity) 13 iii 2.3.2 ... (rDNA) 13 VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP TIẾN HÀNH 15 3 .1 Thời gian địa điểm 15 3 .1. 1 Thời gian 15 3 .1. 2 Địa điểm 15 3.2 Vật liệu 15 3.3 Hóa...
... phản ứng đọc trìnhtự Sản phẩm PCR Lƣợng 10 0-200 bp 1- 3 ng 200-500 bp 3 -10 ng 500 -10 00 bp 5-20 ng 24 10 00-2000 bp 10 -40 ng 3.5.7.2 Phản ứng đọc trìnhtự sử dụng BigDye Terminator v3 .1 Cycle Sequencing ... 355 – 3 61 10 John P Curran, 2002 Automated DNA sequencing (ABI PRISM 310 0) Training Manuals/Protocols 11 Klement, Z., 19 82 Hypersensitivity Phytopathogenic Prokaryotes Pages 14 9 – 17 7 12 M S Krause, ... (rDNA) 13 VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP TIẾN HÀNH 15 3 .1 Thời gian địa điểm 15 3 .1. 1 Thời gian 15 3 .1. 2 Địa điểm 15 3.2 Vật liệu 15 3.3 Hóa...
... 355 – 3 61 10 John P Curran, 2002 Automated DNA sequencing (ABI PRISM 310 0) Training Manuals/Protocols 11 Klement, Z., 19 82 Hypersensitivity Phytopathogenic Prokaryotes Pages 14 9 – 17 7 12 M S Krause, ... 4 .10 Kết khuếch đại đoạn DNA vùng hrpF 1: HM1, 2: HM2, 3: CC1, 4: Ladder 1kb, 5: CC2, 6: Q12 – 1, 7: DC Chƣơng KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 5 .1 Kết luận Kết thúc đề tài, chúng tơi thiết lập đƣợc quy trình ... pháp PCR khuếch đại vùng 16 S – 23S rDNA có kích thƣớc 1, 1 kb sử dụng cặp primer Xan1330 Xan322 làm vật liệu giảitrìnhtự Thực phản ứng với thành phần nêu Bảng 3 .1 theo chu trình nhiệt Bảng 3.2...
... phản ứng đọc trìnhtự Sản phẩm PCR Lƣợng 10 0-200 bp 1- 3 ng 200-500 bp 3 -10 ng 500 -10 00 bp 5-20 ng 24 10 00-2000 bp 10 -40 ng 3.5.7.2 Phản ứng đọc trìnhtự sử dụng BigDye Terminator v3 .1 Cycle Sequencing ... họ thập tự nói chung Việt Nam 2.3 Vùng 16 S – 23S rDNA ITS (rDNA intergenic spacer) gen hrpF (hypersensitive reaction and pathogenicity) 2.3 .1 Gen hrpF (hypersensitive reaction and pathogenicity) ... gốc phát sinh nhƣ quan hệ loài Ngoài ra, vùng ITS đƣợc sử dụng giảitrình tự, đối chiếu với liệu ngân hàng gen để định danh sinh vật 15 Chƣơng VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP 3 .1 Thời gian địa điểm 3 .1. 1.Thời...