Nghiên cứu chỉ thị phân tử SSR (simple sequence repeats) trong chọn giống lúa

... (phụ lục 1). Các phân đoạn SSR thu đợc phân tích dựa trên sự có mặt hay vắng mặt của chúng ở các mẫu nghiên cứu. Nếu có thì ký hiệu là 1, còn không có thì ký hiệu là 0. Những phân đoạn mà có ... các đoạn cắt giới hạn (Restriction Fragment Lengh Polymorphisms) SSR: Đa hình các đoạn lặp lại đơn giản (Simple Sequence Repeats) TAE: Tris-acetic acid EDTA TBE: Tris- borate - EDTA TL: ... thấy sử dụng 20 cặp mồi SSR để nghiên cứu đa hình ADN ở 15 dòng, giống lúa, cả 20 cặp mồi đều cho băng ADN. Trong đó có 19 cặp mồi (chiếm 95%) cho đa hình sản phẩm SSR khi phản ứng với ADN...

... đào tạo trờng đại học nông nghiệp i phạm thị thuý nghiên cứu sử dụng chỉ thị phân tử SSR (Simple sequence repeats) trong chọn giống lúa Luận văn thạc sĩ nông nghiệp ... nghệ chỉ thị phân tử, Hội nghị khoa học toàn quốc 2005 - Công nghệ Sinh học trong nghiên cứu cơ bản, tr. 245-247. 12. Phạm Ngọc Lơng, Trần Duy Quý (2004), Một số thành tựu trong nghiên cứu ... Nghiên cứu đa dạng di truyền của một số giống lúa thuộc các phân loài phụ khác nhau bằng chỉ thị phân tử SSR, Tạp chí Nông nghiệp và PTNT, Số 17. 2. Phạm Thị Thuý, Phạm Ngọc Lơng (2006), Nghiên...

... lúa mỳ (Devos K. M. và cs, 1992) [37]. 2.5.2.4. SSR (Simple Sequence Repeats) – ða hình các lặp lại ñơn giản Kỹ thuật SSR (Simple Sequence Repeats) là kỹ thụât khuếch ñại các ñoạn lặp lại ... hình thái và chỉ thị phân tử SSR trong phân tích di truyền cây bông nhằm rút ngắn thời gian và mang lại hiệu quả cao trong chọn giống. 68 Trên cơ sở phân tích các kết quả nghiên cứu bằng chỉ ... Amplified Polymorphic DNA), SSR (Simple Sequence Repeats), RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism), AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) Trong ñó, chỉ thị SSR là một loại chỉ thị...

... truyền của các mẫu giống ñậu tương dựa trên chỉ thị phân tử SSR 76 4.7.4. So sánh giữa sự ña dạng dựa vào chỉ thị hình thái và chỉ thị phân tử SSR 79 PHẦN 5. KẾT LUẬN VÀ ðỀ NGHỊ 81 5.1. Kết ... 1.3.1. Ý nghĩa khoa học của ñề tài ðề tài nghiên cứu sử dụng các chỉ thị hình thái và phân tử trên cơ sở phân tích các tính trạng chất lượng và phân tích ADN ñã xác ñịnh ñược khoảng cách ... hình thái 70 4.7. Tính ña hình về chỉ thị phân tử SSR của các mẫu giống ñậu tương 73 4.7.1. Kết quả tách chiết ADN 73 4.7.2. Mức ña hình của 10 cặp mồi SSR 74 4.7.3. ða dạng di truyền của các...

... sớm, trước khi gieo trồng, có thể chọn ngay ở thế hệ phân ly F2 hoặc F3Increased reliabilityKhông bị ảnh hưởng của môi trườngCó thể phân biệt giữa đồng hợp và dị hợp và chọn lcọ từng ... sở của MAS ( chỉ thị phân tử) Molecular Markers•Tất cả cơ quan sống được hình thành từ các tế bào•Các tế bào sống được điều khiển bằng vật liệu di truyền gọi là DNA• Phân tử DNA được tạo ... SECTION 3 IRRI MAS CASE STUDY MARKER-ASSISTED BREEDING-MAS Công cụ mới trong chọn giống cây trồngBert Collard & David MackillPlant Breeding, Genetics and Biotechnology...

... Pentanucleotide SSR 6 Hexamer Hexanucleotide SSR 7 Heptamer Heptanucleotide SSR 8 Octamer Octanucleotide SSR 9 Nonamer Nonanucleotide SSR 10 Decamer Decanucleotide SSR 72 Dodecamer Dodecamer SSR  ... TỐT NGHIỆP KHAI THÁC DỮ LIỆU ESTs (EXPRESSED SEQUENCE TAGs) Ở CHI CAM CHANH (CITRUS) CHO VIỆC PHÁT TRIỂN MARKER PHÂN TỬ SSR (SIMPLE SEQUENCE REPEATS) Ngành học: CÔNG NGHỆ SINH HỌC Niên ...   KHAI THÁC DỮ LIỆU ESTs (EXPRESSED SEQUENCE TAGs) Ở CHI CAM CHANH (CITRUS) CHO VIỆC PHÁT TRIỂN MARKER PHÂN TỬ SSR (SIMPLE SEQUENCE REPEATS) u:...

...

... khác. Trong khoảng 20 năm trở lại đây, với việc ứng dụng chỉ thị phân tử trong chọn giống đã khắc phục được những trở ngại trong phương pháp chọn tạo truyền thống. Chọn giống nhờ chỉ thị phân ... các quần thể chè; của các giống /dòng chè bằng chỉ thị phân tử SSR Kết quả nghiên cứu của đề tài sẽ là cơ sở dữ liệu hữu ích trong phân loại các giống/dòng chè, hỗ trợ đắc lực cho công tác ... truyền các giống/dòng chè bằng chỉ thị phân tử SSR. 3. Phân tính đánh giá sự đa dạng di truyền của các giống/dòng chè dựa trên kết quả đánh giá hình thái. 4. Phân tích đánh giá sự đa dạng di truyền...

... Nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử DNA để chọn lọc gen tms2 tạo ra các dòng TGMS mới”Người hướng dẫn : 1.PGS.TS.Phan Hữu Tôn                                  2.KS.Tống Văn Hải                    Bộ môn : Công nghệ sinh học ứng dụng                    Khoa CNSH­Trường ĐHNN­Hà NộiNgười thực hiện : SV.Nguyễn Thị Hồng HạnhLớp                    :06­02 CNSH   *Nghiên cứu ưu thế lai của các tổ hợp lai F1 so với bố+Bố trí thí nghiệm:   ­Thí nghiệm được bố trí theo phương pháp khảo sát tập đoàn,các con lai F1 trồng cạnh bố tương ứng.Các tổ hợp lai được bố trí tuần tự không nhắc lại.   ­Ô thí nghiệm được bố trí theo hình chữ nhật,mỗi ô là 5m2.+Các biện pháp kỹ thuật:   ­Làm đất cày bừa   ­Thời vụ: Vụ chiêm xuân 2010   ­Ngày gieo mạ :01/2010   ­Ngày cấy: 02/2010   ­Cấy 1 dảnh/khóm,cây x cây 11cm,hàng x hàng 20cm.   ­Mật đọ cấy 45 khóm/m2.   ­Lượng phân bón cho 1 ha:       Phân đạm 120 kg       Phân lân     90kg       Phân kali    60kg+Kỹ thuật bón phân:     ­Bón lót:100%lân + 30%đạm,bón sau khi bừa.    ­Bón thúc lần 1:50% phân đạm +40% phân kali,bón vào thời kì bắt đầu đẻ nhánh.    ­Bón thúc lần 2:bón hết số đạm,kali còn lại,bón khi lúa làm đòng.Thành phần ... CứU3.1. Đối tượng , vật liệu , địa điểm và thời gian nghiên cứu  3.1.1. Đối tượng nghiên cứu             Gồm một số tổ hợp lai F1­­­ , quần thể F2 3.1.2. Vật liệu nghiên cứu  * Thí nghiệm trong phòng:Thiết bị :+ Máy PCR , máy chạy điện di ,  máy chụp ảnh điện di ,  máy li tâm , máy votex ,  tủ lạnh , lò vi sóng .           + Các loại ống effendof , các loại pipet và đầu tiếp đi kèm . Thành phần cho phản ứng  PCR           + Cặp mồi phát hiện gen bất dục đực tms2 theo M.T.Lopez và cộng sự (2003)có trình tự là :              RM11_F:5’­TCTCCTCTTCCCCCGATC­3’            RM11_R:5’­ATAGCGGGCGAGCTTAG­3’Hóa chất chạy PCR : dNTD , MgCl2 , Taq ADN polymerase , PCR mastermix , nước cất Hóa chất dùng để chiết tách ADN hệ gen :Ưu thế lai của các tổ hợp lai  so với bố mẹ : Ưu thế lai trung bình          H(MP%)  =  MP (mit parent) là giá trị trung bình của hai bố mẹ . ƯTL trung bình là sự biểu hiện hơn hẳn ở một tính trạng nào đó ở con lai F1 so với giá trị trung bình dó ở hai bố mẹ.   Ưu thế lai thực                      H(BP%) =  BP(best parent) là bố hoặc mẹ tốt nhất .Ưu thế lại thực là biểu hiện sự hơn hẳnn ở một tính trạng nào đó  của con lai F1 so với giá trị đó của bố hoặc mẹ tốt nhất. Nghiên cứu chỉ thị phân tử nhằm xác định được gen tms2 có  trong các dòng TGMS , các tổ hợp F2. %1001×−MPMPF%1001×−BPBPFThành phần ... ĐƯợC4.1.Kế hoạch:­01/2010,viết đề cương và bảo vệ đề cương­Gieo mạ:06/01/2010­Cấy:       10/02/2010­Từ          21/02/2010 khảo sát các đặc điểm nông sinh học,tiến hành phản ứng PCR và viết báo cáo tốt nghiệp. 4.2.Kết quả:­Phát hiện được tổ hợp chứa gen tms2­Tìm được marker­PCR liên quan đến tính trạng nghiên cứu3.2. Nội dung và phương pháp nghiên cứu * Nội dung nghiên cứu +) Theo dõi đặc điểm nông sinh học : Các chỉ tiêu nông sinh học :+ Thời gian từ cấy đến bắt đầu trổ(10% số bông thoát khỏi lá đòng).+ Thời gian trổ từ khi bắt đầu trỗ(10% số bông thoát khỏi lá đòng) đến khi kết thúc trổ (85% thoát khỏi lá đòng) .+ Thời gian tự cấy đến chín(85% số hạt chắc màu vàng)+ Tổng thời gian sinh trưởng từ gieo đến khi thu hoạch .+ Chiều cao cây (cm) cuối cùng : đo từ mặt đất đến mút đầu bông dài nhất không kể râu .+ Chiều dài lá đòng : đo từ gối lá đến đầu mút lá , đo vào giai đoạn chín sáp. + Chiều rộng lá đòng. + Góc độ lá đòng .+ Chiều dài bông : đo từ cổ bông đến hết bông vào thời kì  chín chắc . Các giống lúa lai hiện nay cho có thể cho năng suất cao hơn 20­30% so với các giống lúa thường.Hiện nay,chúng ta đang sử dụng  hai hệ thống:hệ thống lúa lai hai dòng và hệ thống lúa lai ba dòng.Nhưng lúa lai hai dòng vượt trội hơn hẳn như:cơ hội chọn tạo các dòng bố lớn thuận lợi cho việc cải tạo chất lượng gạo,không có hiệu ứng đồng tế bào chất nên ít bị sâu hại hơn,năng suất cao hơn lúa lai ba dòng từ 5­10%,chỉ cần hai dòng khác nhau về bản chất di truyền(một là dòng TGMS hoặc PGMS,hai là dòng cho phấn) nên giá thành giảm,tính trạng bất dục đực mẫn cảm với điều kiện môi trường(EGMS) chủ yếu do một cặp gen lặn điều khiển thuận lợi cho việc tạo giống mới.Chỉ tiêu các yếu tổ cấu thành năng suất:+ Tổng số nhánh(số nhánh max)+ Số nhánh hữu hiệu /khóm : đến toàn bộ số nhánh trổ thành bông .+ Tổng số hạt/bông. + Số hạt chắc/bông+ Khối lượng 1000 hạt .+ Số bông hữu hiệu/khóm: đến toàn bộ số bông  có từ 10 hạt chắc trở lên + Năng suất lý thuyết được tính theo công thức :NSLT = A x B x C x mật độ/đơn vị diện tích(g)  Trong đó: A: số bông hữu hiệu/khóm                 B: số hạt chắc/bông                 C: khối lượng 1000 hạtPHầN...

... Nghiên cứu ứng dụng chỉ thị phân tử DNA để chọn lọc gen tms2 tạo ra các dòng TGMS mới”Người hướng dẫn : 1.PGS.TS.Phan Hữu Tôn                                  2.KS.Tống Văn Hải                    Bộ môn : Công nghệ sinh học ứng dụng                    Khoa CNSH­Trường ĐHNN­Hà NộiNgười thực hiện : SV.Nguyễn Thị Hồng HạnhLớp                    :06­02 CNSH   *Nghiên cứu ưu thế lai của các tổ hợp lai F1 so với bố+Bố trí thí nghiệm:   ­Thí nghiệm được bố trí theo phương pháp khảo sát tập đoàn,các con lai F1 trồng cạnh bố tương ứng.Các tổ hợp lai được bố trí tuần tự không nhắc lại.   ­Ô thí nghiệm được bố trí theo hình chữ nhật,mỗi ô là 5m2.+Các biện pháp kỹ thuật:   ­Làm đất cày bừa   ­Thời vụ: Vụ chiêm xuân 2010   ­Ngày gieo mạ :01/2010   ­Ngày cấy: 02/2010   ­Cấy 1 dảnh/khóm,cây x cây 11cm,hàng x hàng 20cm.   ­Mật đọ cấy 45 khóm/m2.   ­Lượng phân bón cho 1 ha:       Phân đạm 120 kg       Phân lân     90kg       Phân kali    60kg+Kỹ thuật bón phân:     ­Bón lót:100%lân + 30%đạm,bón sau khi bừa.    ­Bón thúc lần 1:50% phân đạm +40% phân kali,bón vào thời kì bắt đầu đẻ nhánh.    ­Bón thúc lần 2:bón hết số đạm,kali còn lại,bón khi lúa làm đòng.Thành phần ... CứU3.1. Đối tượng , vật liệu , địa điểm và thời gian nghiên cứu  3.1.1. Đối tượng nghiên cứu             Gồm một số tổ hợp lai F1­­­ , quần thể F2 3.1.2. Vật liệu nghiên cứu  * Thí nghiệm trong phòng:Thiết bị :+ Máy PCR , máy chạy điện di ,  máy chụp ảnh điện di ,  máy li tâm , máy votex ,  tủ lạnh , lò vi sóng .           + Các loại ống effendof , các loại pipet và đầu tiếp đi kèm . Thành phần cho phản ứng  PCR           + Cặp mồi phát hiện gen bất dục đực tms2 theo M.T.Lopez và cộng sự (2003)có trình tự là :              RM11_F:5’­TCTCCTCTTCCCCCGATC­3’            RM11_R:5’­ATAGCGGGCGAGCTTAG­3’Hóa chất chạy PCR : dNTD , MgCl2 , Taq ADN polymerase , PCR mastermix , nước cất Hóa chất dùng để chiết tách ADN hệ gen :Ưu thế lai của các tổ hợp lai  so với bố mẹ : Ưu thế lai trung bình          H(MP%)  =  MP (mit parent) là giá trị trung bình của hai bố mẹ . ƯTL trung bình là sự biểu hiện hơn hẳn ở một tính trạng nào đó ở con lai F1 so với giá trị trung bình dó ở hai bố mẹ.   Ưu thế lai thực                      H(BP%) =  BP(best parent) là bố hoặc mẹ tốt nhất .Ưu thế lại thực là biểu hiện sự hơn hẳnn ở một tính trạng nào đó  của con lai F1 so với giá trị đó của bố hoặc mẹ tốt nhất. Nghiên cứu chỉ thị phân tử nhằm xác định được gen tms2 có  trong các dòng TGMS , các tổ hợp F 2. %1001×−MPMPF%1001×−BPBPFThành phần ... ĐƯợC4.1.Kế hoạch:­01/2010,viết đề cương và bảo vệ đề cương­Gieo mạ:06/01/2010­Cấy:       10/02/2010­Từ          21/02/2010 khảo sát các đặc điểm nông sinh học,tiến hành phản ứng PCR và viết báo cáo tốt nghiệp. 4.2.Kết quả:­Phát hiện được tổ hợp chứa gen tms2­Tìm được marker­PCR liên quan đến tính trạng nghiên cứu3.2. Nội dung và phương pháp nghiên cứu * Nội dung nghiên cứu +) Theo dõi đặc điểm nông sinh học : Các chỉ tiêu nông sinh học :+ Thời gian từ cấy đến bắt đầu trổ(10% số bông thoát khỏi lá đòng).+ Thời gian trổ từ khi bắt đầu trỗ(10% số bông thoát khỏi lá đòng) đến khi kết thúc trổ (85% thoát khỏi lá đòng) .+ Thời gian tự cấy đến chín(85% số hạt chắc màu vàng)+ Tổng thời gian sinh trưởng từ gieo đến khi thu hoạch .+ Chiều cao cây (cm) cuối cùng : đo từ mặt đất đến mút đầu bông dài nhất không kể râu .+ Chiều dài lá đòng : đo từ gối lá đến đầu mút lá , đo vào giai đoạn chín sáp. + Chiều rộng lá đòng. + Góc độ lá đòng .+ Chiều dài bông : đo từ cổ bông đến hết bông vào thời kì  chín chắc . Các giống lúa lai hiện nay cho có thể cho năng suất cao hơn 20­30% so với các giống lúa thường.Hiện nay,chúng ta đang sử dụng  hai hệ thống:hệ thống lúa lai hai dòng và hệ thống lúa lai ba dòng.Nhưng lúa lai hai dòng vượt trội hơn hẳn như:cơ hội chọn tạo các dòng bố lớn thuận lợi cho việc cải tạo chất lượng gạo,không có hiệu ứng đồng tế bào chất nên ít bị sâu hại hơn,năng suất cao hơn lúa lai ba dòng từ 5­10%,chỉ cần hai dòng khác nhau về bản chất di truyền(một là dòng TGMS hoặc PGMS,hai là dòng cho phấn) nên giá thành giảm,tính trạng bất dục đực mẫn cảm với điều kiện môi trường(EGMS) chủ yếu do một cặp gen lặn điều khiển thuận lợi cho việc tạo giống mới.Chỉ tiêu các yếu tổ cấu thành năng suất:+ Tổng số nhánh(số nhánh max)+ Số nhánh hữu hiệu /khóm : đến toàn bộ số nhánh trổ thành bông .+ Tổng số hạt/bông. + Số hạt chắc/bông+ Khối lượng 1000 hạt .+ Số bông hữu hiệu/khóm: đến toàn bộ số bông  có từ 10 hạt chắc trở lên + Năng suất lý thuyết được tính theo công thức :NSLT = A x B x C x mật độ/đơn vị diện tích(g)  Trong đó: A: số bông hữu hiệu/khóm                 B: số hạt chắc/bông                 C: khối lượng 1000 hạtPHầN...