Luận văn : XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP NHẬN DIỆN VÀ PHÂN TÍCH TÍNH ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA 21 DÒNG CACAO (THEOBROMA CACAO L ) BẰNG KỸ THUẬT MICROSATELLITE part 6 docx

Luận văn : XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP NHẬN DIỆN VÀ PHÂN TÍCH TÍNH ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA 21 DÒNG CACAO (THEOBROMA CACAO L.) BẰNG KỸ THUẬT MICROSATELLITE part 8 docx

... Thị Liễu- 2004 - Phân tích mức độ đa dạng di truyền và xây dựng phương pháp nhận di n một số giống cacao trên cơ sở kỹ thật PCR. Luận văn tốt nghiệp Kỹ sư Nông học, Trường Đại Học Nông L m ... http://www.bio.davidson.edu/courses/genomics/method /microsatellite. html Microsatellite DNA methodology 2. http://www.icg.rdg.ac.uk/public_html/ssr-helpfile.htm Microsatellite help file. 3. http://uwadmnweb.uwyo.edu/zoology/mcdonald/molmark/lectures/PopGen/PopGen6/PopGen6.html ... microsatellites- Gemonics 1 2: pp 62 7 – 63 1. 3. Borislav Kobiljski, Steve Quarrie, Jane Kirby- 2002- Genetic diversity of the Novi Sad wheat core collection revealed by microsatellite- Cellular...

Luận văn : XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP NHẬN DIỆN VÀ PHÂN TÍCH TÍNH ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA 21 DÒNG CACAO (THEOBROMA CACAO L.) BẰNG KỸ THUẬT MICROSATELLITE part 7 ppsx

... PBC2 36 3 A6 3 3 0 QH 1213 3 A7 3 3 0 QH22 3 A4 3 3 0 TOTAL: 10 Còn l i ba mẫu mã hóa A2, A3, A14 và 3 dòng cacao l BAL 244, PBC 123 và QH441 chưa được nhận di n. Kết quả phân tích microsatellite ... xuất hiện allel dropping của một số dòng như sau:  Dòng PBC 159 có 1 allele dropping với primer mTcCIR1 5: al 2 46.  Dòng PBC 154 có 1 allele dropping với primer mTcCIR15:al 244.  Dòng PBC ... 1 allele dropping với primer mTcCIR1 5: al 244.  Dòng QH 441 có 1 allele dropping với primer mTcCIR1 1: al 298  Dòng BAL 244 có 1 allele dropping với primer mTcCIR1 1: al 150.  Dòng QH 1213 ...

Luận văn : XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP NHẬN DIỆN VÀ PHÂN TÍCH TÍNH ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA 21 DÒNG CACAO (THEOBROMA CACAO L.) BẰNG KỸ THUẬT MICROSATELLITE part 6 docx

... được 21 dòng cacao khảo sát dựa vào đặc điểm microsatellite của chúng cũng như xây dựng được bảng dữ liệu microsatellite của 21 dòng cacao phục vụ cho công tác định danh và phân tích đa dạng di ... 5 7). Mỗi loci gồm 2 al đồng hợp (VD: al 292- al 29 2) hoặc 2 al dị hợp (VD: al 235- al 24 4), đây cũng chính l đặc tính của codominant-loci. Bảng 3. 7: Dữ liệu microsatellite đưa vào phân tích ... gen của các codominant- loci. Dữ liệu đưa vào phân tích ở dạng bảng trong Excel và kết quả phân tích sẽ được xuất ra dưới dạng file text. Chúng tôi đưa vào dữ liệu di truyền microsatellite...

Luận văn : XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP NHẬN DIỆN VÀ PHÂN TÍCH TÍNH ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA 21 DÒNG CACAO (THEOBROMA CACAO L.) BẰNG KỸ THUẬT MICROSATELLITE part 4 pot

... định các vị trí liên quan đến tính trạng số l ợng (QTL)…Các thông tin về microsatellite đa al của một locus cũng như trên nhiều locus có thể được phân tích bằng các phương pháp thống kê để ... marker microsatellite trong l c l p được đánh giá l công cụ đắc l c trong nghiên cứu sự phát sinh giống, loài và phân loại theo nguồn gốc địa l (Doyle và ctv., 199 8). Microsatellite cũng ... ctv., 199 4) nhưng các trình tự microsatellite có trong DNA l c l p l nguồn marker rất hữu ích trong nghiên cứu tính đa hình, được áp dụng để phân loại 13 dòng Glycine (Powell và ctv., 199 5). Những...

Luận văn : XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP NHẬN DIỆN VÀ PHÂN TÍCH TÍNH ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA 21 DÒNG CACAO (THEOBROMA CACAO L.) BẰNG KỸ THUẬT MICROSATELLITE part 3 pot

... Có 2 phương pháp để phát hiện microsatllite: phương pháp lai và phương pháp PCR. 2.5.5.1 .Phương pháp lai Phương pháp lai ghép phân tử cho phép xác định chính xác kiểu microsatellite bằng ... thước al bị thay đổi bằng cách thêm một nucleotide A vào cuối đoạn hoặc chèn vào vùng l p l i của al (Smith và ctv., 199 6) . Những phân tích gần đây trong số liệu của những đoạn l p l i chỉ ... 199 8). Do vậy microsatellite l một nguồn rất quan trọng trong việc nghiên cứu đa dạng di truyền và l m cơ sở cho sự thay đổi của tiến hóa. 2.5.5. Các phương pháp phát hiện microsatellite...

Luận văn : XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP NHẬN DIỆN VÀ PHÂN TÍCH TÍNH ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA 21 DÒNG CACAO (THEOBROMA CACAO L.) BẰNG KỸ THUẬT MICROSATELLITE part 2 ppt

... bằng hỗn hợp phenol/chloroform/isoamyl alcohol (2 5:2 4:1 ). Phenol và chloroform sẽ l m biến tính protein. Ngoài ra chloroform còn l m cho pha nước và pha hữu cơ dễ tách rời nhau. Isoamyl alcohol ... 0.41(%G+C) - (60 0 /l) + [J+] : nồng độ mol các cation hoá trị I + (%G+C) : % nucleotide loại G và C Khi chiều dài primer từ 20 - 35 base Tmp = 22 + 1. 46( [2 x (G+C)] + (A+T )) Tuy nhiên, việc tính ... ethanol 70% để loại bỏ các muối hoặc các dấu vết của isopropanol còn dính l i (Hồ Huỳnh Thùy Dương,199 8).  Phân tích định tính và định l ợng DNA bằng quang phổ kế. Sau khi thu nhận nucleic...

Luận văn : XÂY DỰNG PHƯƠNG PHÁP NHẬN DIỆN VÀ PHÂN TÍCH TÍNH ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA 21 DÒNG CACAO (THEOBROMA CACAO L.) BẰNG KỸ THUẬT MICROSATELLITE part 1 pps

... KHÓA LUẬN   Tên đề tài: Xây dựng phương pháp nhận di n và phân tích tính đa dạng di truyền của 21 dòng cacao (Theobroma cacao L. ) bằng kỹ thuật Microsatellite.  Thời gian nghiên cứu: từ ... để xây dựng phương pháp nhận di n hiệu quả và phân tích tính đa dạng di truyền của một số dòng cacao.  Mục đích nghiên cứu: - Xây dựng phương pháp nhận di n 21 dòng cacao bằng kỹ thuật microsatellite ... đề tài: Xây dựng phương pháp nhận di n và phân tích tính đa dạng di truyền của 21 dòng cacao (Theobroma cacao L. ) bằng kỹ thuật Microsatellite Đề tài được thực hiện dưới sự hướng dẫn của...

Xây dựng phương pháp nhận diện và phân tích tính đa dạng di truyền của 21 dòng cacao băng kỹ thuật Microsatellite 1

... chính xác và tính ổn định của phương pháp nhận di n. 4- Phân tích tính đa dạng di truyền của 21 dòng cacao. 2.2.Yêu cầu- Ly trích DNA từ mẫu l với độ tinh khiết cao.- Xây dựng được qui trình PCR ... 1- Xây dựng phương pháp nhận di n 21 dòng cacao dựa trên 5 cặp primer microsatellite: mTcCIR7, mTcCIR8, mTcCIR11, mTcCIR15 và mTcCIR18.2- Tối ưu hóa phương pháp. 3- Kiểm tra độ chính xác và tính ... biệt di truyền giữa các giống cacao khảo sát qua việc phân tích microsatellite bằng máy giải trình tự.- Định danh chính xác các dòng mã hóa bằng phần mềm Cervus.- Mô tả được quan hệ di truyền...

Xây dựng phương pháp nhận diện và phân tích tính đa dạng di truyền của 21 dòng cacao băng kỹ thuật Microsatellite 2

... Có 2 phương pháp để phát hiện microsatllite: phương pháp lai và phương pháp PCR.2.5.5.1 .Phương pháp lai Phương pháp lai ghép phân tử cho phép xác định chính xác kiểu microsatellite bằng cách ... tiêu: phân tích mức độ dị hợp và tỉ số multiplex (số loci phân tích được trong một l n thí nghiệm). Kết quả l marker microsatellite phân tích được mức độ dị hợp cao nhất (0 .6 0), và marker AFLP ... có đặc tính này.- Powell và ctv., (199 6) đã tiến hành thí nghiệm kiểm tra hiệu quả của các loại marker di truyền RFLP, RAPD, AFLP và Microsatellite trong phân tích di truyền trên cây đậu tương...

Xây dựng phương pháp nhận diện và phân tích tính đa dạng di truyền của 21 dòng cacao băng kỹ thuật Microsatellite 3

... quả phân tích các đoạn microsatellite của mỗi dòng. Ghi nhận dữ liệu microsatellite của 21 dòng cacao với 5 primer.• Giai đoạn 2: Kiểm tra độ chính xác và tính ổn định của phương pháp nhận di n. qua ... Giai đoạn 4: Phân tích tính đa dạng di truyền của 21 dòng cacao bằng phần mềm Genetix dựa trên dữ liệu microsatellite với 5 cặp primer.3.2.3 .Kỹ thuật ly trích DNADNA của l cacao được ly trích ... sau:• Giai đoạn 1: Xây dựng phương pháp nhận di n 21 dòng cacao dựa trên 5 cặp primer microsatellite mTcCIR7, mTcCIR8, mTcCIR11, mTcCIR15 và mTcCIR18. Phương pháp nhận di n gồm 4 bước: 1- L y...

Xem thêm