0
  1. Trang chủ >
  2. Luận Văn - Báo Cáo >
  3. Báo cáo khoa học >

Báo cáo y học: "A statistical framework for modeling gene expression using chromatin features and application to modENCODE datasets" pptx

Báo cáo y học:

Báo cáo y học: "A statistical framework for modeling gene expression using chromatin features and application to modENCODE datasets" pptx

... A statistical framework for modeling gene expression using chromatin features and application to modENCODE datasets. Genome Biology 2011 12:R15.Submit your next manuscript to BioMed Central and ... Biology 2011, 12:R15http://genomebiology.com/2011/12/2/R15Page 3 of 18MET H O D Open AccessA statistical framework for modeling gene expression using chromatin features and application to modENCODE ... predict expression of transcriptsby support vector machine (SVM) or support vector regression (SVR) models. The genome-wide data for chromatin features and gene expression were generated by the modENCODE...
  • 18
  • 398
  • 0
Báo cáo y học:

Báo cáo y học: "The CRIT framework for identifying cross patterns in systems biology and application to chemogenomics" ppt

... in the yeastregulatory network, relationships between gene proper-ties such as expression and binding status and breastcancer type, and finally using chemogenomics, chemoin-formatics, and functional ... CRIT to ide ntify cr oss patternsconnecting small molecule descriptor sensitivities to dis-parate types of systems-wide and transcription factor features to features of those their target genes. ... We used two types of networks:protein-protein interactions and gene regulatory [21](genetic interaction and phosphorylome [22] had toofew nodes to determine significance). All topological sta-tistics...
  • 12
  • 391
  • 0
Báo cáo y học:

Báo cáo y học: "A statistical approach for detecting genomic aberrations in heterogeneous tumor samples from single nucleotide polymorphism genotyping data" pot

... computa-tional tool (OncoSNP) for genomic copy number and LOH pro ling of heterogeneous tumors using SNParrays. Using formal statistical modeling we are able to jointly consider a number of complex factors ... ce, for any particular cancer sample, the ploidy is generallyunknown a priori, maybe a fractional value and variesfrom one cancer to the next. Methods to tackle base-line uncertainty for polyploid ... contributionsCY, CCH, SC and JR conceived the method and generated initial ideas and discussions. CY wrote and developed the OncoSNP algorithm. DM, RJ and OS provided bioinformatics analysis and performed...
  • 15
  • 583
  • 0
Báo cáo y học:

Báo cáo y học: "A web tool for finding gene candidates associated with experimentally induced arthritis in the rat" docx

... obvious gene candidate, (2) likely gene candidate, (3) possible gene candi-date, (4) unlikely gene candidate and (5) gene withoutrelevance.In addition, the genes that were ranked as high by the ... able to rankcandidate genes in fashion similar to human evaluations, gene descriptions for four randomly selected QTL regions (Cia4,Cia10, Cia14 and Cia17) were surveyed manually. For allgenes ... ranked by the CGC tools as less likely gene candidates, as well as genes ranked low, were generallyrated in a similar manner to those done manually. Thus, to findgenes contributing to experimentally...
  • 8
  • 415
  • 0
Báo cáo y học:

Báo cáo y học: " Large scale comparison of global gene expression patterns in human and mous" pot

... computational biology solutions using R and Bioconductor. In Bioinformatics and Computational Biology Solutions Using R and Bioconductor. Edited by: Gentleman R, Carey V, Huber W, Irizarry R,Dudoit ... models using gene expression and tissue microarray analysis. Cancer Res 2007, 67:32-40.13. Nuzhdin SV, Wayne ML, Harmon KL, McIntyre LM: Common pattern ofevolution of gene expression level and ... frompublicly available experiment s deposited to ArrayExpressbefore May 2008. The quality of the CEL files was evalu-ated individually using the R simpleaffy package and fourquality control...
  • 11
  • 419
  • 0
 Báo cáo y học:

Báo cáo y học: "A cyclic-RGD-BioShuttle functionalized with TMZ by DARinv “Click Chemistry” targeted to αvβ3 integrin for therapy"

... individual and not just standardized plan of treatment for every single patient and all available therapy options should be used, such as immunothe-rapy, surgery or chemotherapy sensibly using cytos-tatic ... N-(2-Aminopropyl)-4-(6-(pyrimidine-2-yl)-1,2,4,5-tetrazine-3-yl)benzamide 4 4-(6-(Pyrimidine-2-yl)-1,4-dihydro-1,2,4,5-tetrazine-3-yl)benzoic acid (3) was prepared from 2-cyanopyrimidine 1 a nd 4 -cyano-ben ... doses. How to perform this is exemplarily shown here by targeting and controlling breast cancer cells. Our considerations to overcome these resis-tance-inducing factors led to the application...
  • 14
  • 480
  • 0
Tài liệu Báo cáo khoa học:

Tài liệu Báo cáo khoa học: "A Statistical Model for Unsupervised and Semi-supervised Transliteration Mining" pptx

... probability bythe transliteration submodel and a low probability bythe non-transliteration submodel, and vice versa for non-transliteration pairs. This property is exploited to identify transliterations.In ... They are reduced to 35 and 89 for English/Hindi and English/Arabic respectively.The seed data and the training data used in thesemi-supervised system are from different domains(Wikipedia and ... transliteration information to the systems and help them to avoid problems withdata sparseness. Our semi-supervised system usesthe seed data to identify close transliterations asnon-transliterations and...
  • 9
  • 521
  • 0
Tài liệu Báo cáo khoa học:

Tài liệu Báo cáo khoa học: "A Pipeline Framework for Dependency Parsing" ppt

... of y. x →∗ y: x is an ancestor of y; x ↔ y: x → y or y → x.x < y: x is to the left of y in T .Definition 1 (Projective Language) (Nivre,2003) ∀a, b, c ∈ T, a ↔ b and a < c < b implythat ... in (Yamada and Matsumoto,2003). Our general framework provides insightsthat allow us to improve their algorithm, and to principally justify some of the algorithmic deci-sions. Specifically, ... identify predicates and argu-ments and then classify them to types. In fact,any left to right processing of an English sentencemay be viewed as a pipeline computation as it pro-cesses a token and, ...
  • 8
  • 581
  • 0
Tài liệu Báo cáo khoa học:

Tài liệu Báo cáo khoa học: "A Unified Framework for Automatic Evaluation using N-gram Co-Occurrence Statistics" pptx

... order to improve system performance (Och 2003). Recently, a second proposal for automatic evaluation has come from the Automatic Summarization community (Lin and Hovy, 2003), with an automatic ... by Lin and Hovy (2003) (they only differ in the stop-word list they use), our results also confirm the proposal for such metrics to be used for automatic evaluation by the Automatic Summarization ... a good candidate for performing automatic evaluation of QA systems that go beyond answering factoid questions. 5 Conclusions In this paper, we propose a unified framework for automatic evaluation...
  • 8
  • 462
  • 0
Tài liệu Báo cáo khoa học:

Tài liệu Báo cáo khoa học: "A Syntactic Framework for Speech Repairs and Other Disruptions" doc

... are generally signaled not only by ungrammaticality, but also by pauses, editing terms, parallelism, etc.; thus an approach specific to speech repairs should perform better than just using ... tation to exclude one or more reparanda. For each reparandum skipped, the parser needs to find an interpretation of what the user started to say. In some cases, what the user started to say is ... metarule. 3For instance, a traditional way to accommodate editing terms might be via a metarule, X -> Y Z ==> X -> Y editing-term Z, where X varies over categories and Y and Z vary over...
  • 8
  • 486
  • 0

Xem thêm

Từ khóa: báo cáo khoa học y họcbáo cáo y họca unifying framework for statistical relational learningmarkov logic a unifying framework for statistical relational learningbáo cáo y học cổ truyềnBáo cáo thực tập tại nhà thuốc tại Thành phố Hồ Chí Minh năm 2018Nghiên cứu sự biến đổi một số cytokin ở bệnh nhân xơ cứng bì hệ thốngBáo cáo quy trình mua hàng CT CP Công Nghệ NPVNghiên cứu tổ hợp chất chỉ điểm sinh học vWF, VCAM 1, MCP 1, d dimer trong chẩn đoán và tiên lượng nhồi máu não cấpMột số giải pháp nâng cao chất lượng streaming thích ứng video trên nền giao thức HTTPNghiên cứu tổ chức chạy tàu hàng cố định theo thời gian trên đường sắt việt namGiáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôitĐỒ ÁN NGHIÊN CỨU CÔNG NGHỆ KẾT NỐI VÔ TUYẾN CỰ LY XA, CÔNG SUẤT THẤP LPWANQuản lý hoạt động học tập của học sinh theo hướng phát triển kỹ năng học tập hợp tác tại các trường phổ thông dân tộc bán trú huyện ba chẽ, tỉnh quảng ninhTrả hồ sơ điều tra bổ sung đối với các tội xâm phạm sở hữu có tính chất chiếm đoạt theo pháp luật Tố tụng hình sự Việt Nam từ thực tiễn thành phố Hồ Chí Minh (Luận văn thạc sĩ)Nghiên cứu, xây dựng phần mềm smartscan và ứng dụng trong bảo vệ mạng máy tính chuyên dùngNghiên cứu tổng hợp các oxit hỗn hợp kích thƣớc nanomet ce 0 75 zr0 25o2 , ce 0 5 zr0 5o2 và khảo sát hoạt tính quang xúc tác của chúngChuong 2 nhận dạng rui roKiểm sát việc giải quyết tố giác, tin báo về tội phạm và kiến nghị khởi tố theo pháp luật tố tụng hình sự Việt Nam từ thực tiễn tỉnh Bình Định (Luận văn thạc sĩ)Quản lý nợ xấu tại Agribank chi nhánh huyện Phù Yên, tỉnh Sơn La (Luận văn thạc sĩ)Tăng trưởng tín dụng hộ sản xuất nông nghiệp tại Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển nông thôn Việt Nam chi nhánh tỉnh Bắc Giang (Luận văn thạc sĩ)Giáo án Sinh học 11 bài 15: Tiêu hóa ở động vậtGiáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vậtGiáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vậtMÔN TRUYỀN THÔNG MARKETING TÍCH HỢP