... giải mã genetừ 4 mẫu của
chủng virus cúm gây bệnh trên gia cầm ở tỉnh Cà Mau và Sóc Trăng có mức độ tương
đồng về nucleotide và amino acid 92 – 98% trong trìnhtựgene H5, và trong trìnhtự ... c
ầm. Và để phân tích trìnhtựgene H5 của virus cúm, chúng tôi
lấy 4 mẫu bệnh phẩm (đầu và cổ, lách, phổi) để xét nghiệm tìm virus cúm gia cầm
và nghiên cứu trìnhtựgene HA (H5).
2.2 Phương ... chuỗi gene H5 và 92 - 99% về thành phần nucleotide, 91 - 99% về amino acid
trong chuỗi gene N1 khi so sánh với các chủng đã phân lập ở Việt Nam trước đây và
1 số nước Châu Á.
Trình tự gene...
... các trìnhtự của các loài đã
tuyệt chủng từ 40.000 năm trước.
Công trình này mở ra khả năng thu
nhận thông tin trìnhtự DNA từ các
loài đã tuyệt chủng khác.
Giải trìnhtự bộ
gene ... Sau đó
chọn dòng ngẫu nhiên từ thư viện
này để giảitrình tự. Trong nghiên
cứu này, các tác giả sử dụng kỹ
thuật kể trên để thu nhận trìnhtự
DNA tách từ răng gấu tiền sử. Mặc
dù vẫn bị ... metagenomic sử
dụng trong nghiên cứu này củng cố
thêm tính khả thi của các chương
trình giảitrình t
ự DNA bộ gene của
sinh vật cổ đại.
Genomic sequencing of
Pleistocene cave bears.
Noonan...
... Hà Nội II.
I. Giảitrìnhtự ADN tự động.
- Nguyên lí: Giảitrìnhtự ADN tự động dựa theo nguyên lí của phương
pháp dideoxy của F.Sanger (1977) được cải tiến dựa vào các thiết bị tự
động hóa ... Phần mềm
máy tính sẽ tự động giảitrìnhtự giữ liệu từ gel điện di và cho hình ảnh
kết quả giảitrình ADN.
- Các bước tiến hành:
+, Giảitrìnhtự ADN tự động bao gồm các thành phần chủ yếu sau:
1
... thể giảitrìnhtự mẫu nghiên cứu
trong 1 phản ứng (1 giếng điện di) thay vì cho 4 phản ứng trong (4
giếng) riêng biệt như phương pháp dideoxy của F.Sanger. Phần mềm
máy tính sẽ tự động giải trình...
...
phương pháp giảitrìnhtự với hệ thống giảitrìnhtự kín của Trugene
(Error! Reference
source not found.)
là hai phương pháp được nhiều nhà lâm sàng chấp nhận để xác định
kiểu gene HCV dùng ... không khác gì kết quả định
genotype bằng kỹ thuật giảitrìnhtự của Trugene vì đoạn trìnhtự đích của phương
pháp của chúng tôi và đoạn trìnhtự đích của phương pháp Trugen gần như phù
hợp nhau ... nguồn khác nhau.
Phương pháp giảitrìnhtự để định genotype HCV do chúng tôi phát triển và trình
bày trong công trình nghiên cứu này được thực hiện trên một trìnhtự dài không
quá 200bp của...
... ng/àl được sử dụng để giảitrìnhtự tại ADN Core, trường đại học tổng hợp
Michigan (Mỹ) theo phương pháp giảitrình của Hultman (6a)
Phân tích trìnhtự đoạn ADN: Chương trình Blast trên trang ... phương pháp
điện di
Kết quả giảitrìnhtự
Sản phẩm PCR, sau khi làm sạch được giảitrìnhtự trực tiếp không qua giai đoạn tạo
dòng phân tử. Kết quả được trình bầy ở hình 2 A và B. Gen ... trìnhtự gel: Sản phảm PCR của gen HP1125 được phân giải trên gel agarose 0.8%
và được làm sạch khỏi các mồi còn thừa sau phản ứng bng Gene clean Kit. ADN vi
nng 10 ng/àl được sử dụng để giải...
... trên một số trìnhtự của gen HP1125 đã được
Kết quả giảitrìnhtự
Sản phẩm PCR, sau khi làm sạch được giảitrìnhtự trực
tiếp không qua giai đoạn tạo dòng phân tử. Kết quả được
trình bầy ... thuốc [3].
Hai trong những giải pháp tốt nhất để chống vi khuẩn dạ
Phân tích trìnhtự đoạn ADN: Chương trình Blast trên trang
Web được sử dụng để phân tích trìnhtự cũng như protein
cuar gen. ... để giảitrìnhtự tại ADN
Core, trường đại học tổng hợp Michigan (Mỹ) theo phương
pháp giảitrình của Hultman (6a)
hiệu.
Phân tích gen ở mức độ ADN và protein
A) Ở mức độ ADN
Trình...
...
và giảitrìnhtự
34
4.4 Kết quả giảitrìnhtự trực tiếp sản phẩm RT-PCR
Kết quả giảitrìnhtự sẽ cho ta trìnhtự dạng chữ (A, G, T, C) và trìnhtự dạng peak.
Trình tựgiải ... quả giảitrìnhtự sẽ ở dạng peak (mỗi peak đại diện cho 1 nucleotide) và dạng
ký tự (A, T, G, C).
Sau khi có trìnhtự ta tiến hành kiểm tra bằng cách so sánh trìnhtựgiải đƣợc với
trình tự ...
*: Trìnhtự tƣơng đồng
-: Trìnhtự không tƣơng đồng
anti: Trìnhtựgiải đƣợc nhờ Antisense primer
Sens: Trìnhtựgiải đƣợc nhờ Sense primer
Trình tự hoàn chỉnh của đoạn gen mong muốn...
... tôi chỉ trình bày phần tách dòng và xác định trìnhtự nucleotid của gene mã
hoá kháng thể tái tổ hợp kháng lại lympho bào tách từ bệnh nhân ung thư vú.
Để tách dòng và xác định trìnhtựgene mã ... bình
thường.
- Nhóm gene sửa chữa: là nhóm gene chịu trách nhiệm điều chỉnh những sai
sót trong hoạt động của hai loại gene trên. Nếu loại gene này bị tổn thương
thì những biến dị của hai loại gene trên ... để phát hiện dideoxynucleotid đánh dấu
- Xử lý kết quả bằng các chương trình phần mềm máy tính.( máy xác định
trình tựgenetự động ABI PRISM 3100 – Avant)
32
Website: http://www.docs.vn Email...
... Reaction Mix
SANGER DIDEOXY SEQUENCING
Phóng xạ tự ghi sợi AND đơn tổng
hợp trong mỗi ống phản ứng.
Đoạn ADN cần giảitrình tự
Đoạn ADN cần giảitrình tự
3 CCTATGGAATGC-
3 CCTATGGAATGC-
5
5
.
.
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
*
ống ... định trìnhtự các nucleotide.
Ưu điểm của phơng pháp cải tiến
Tạo điều kiện thuận lợi cho việc tự động hoá.
Giảm giá thành phản ứng
Tăng tốc độ phản ứng
=> Nhiều trung tâm giảitrìnhtự ... Sanger
Fred Sanger
Các phơng pháp giảitrìnhtự gen
Có 2 phơng pháp chính:
Phơng pháp hoá học Maxam Gilbert: đây là
phơng pháp đợc sử dụng đầu tiên để xác định
trình tự gen nhng hiện nay không còn...
... máy giải
trình tự gen và chạy máy giảitrìnhtự gen.
Bước 4: Phân tích kết quả từ các dữ
liệu do máy tính cung cấp
2.3 Phương pháp giảitrìnhtự gen tự động
2.3 Phương pháp giảitrìnhtự gen tự ... Phương pháp giảitrìnhtự gen tự động
2.3 Phương pháp giảitrìnhtự gen tự động
Capillary
Máy sắc ký khối phổ
2.1 Phương pháp Maxam - Gibert
2.1 Phương pháp Maxam - Gibert
Giảitrìnhtự gen (DNA ... DUNG
1. Khái niệm giảitrìnhtự gen và ý nghĩa của GTTG
2. Phương pháp giảitrìnhtự gen:
2.1 Phương pháp Maxam – Gilbert
2.2 Phương pháp Sanger
2.3 Phương pháp giảitrìnhtự gen tự động
3. So...