Đang tải... (xem toàn văn)
Bài viết Xác định đột biến đảo đoạn Intron 22 trên bệnh nhân Hemophillia A bằng kỹ thuật Inversion PCR trình bày bệnh Hemophilia A là bệnh rối loạn đông máu, di truyền lặn trên nhiễm sắc thể giới tính X, tần suất mắc bệnh là 1/5000 trẻ trai. Ở bệnh nhân Hemophilia A thể nặng, nồng độ protein yếu tố VIII trong máu rất thấp, chỉ ≤ 1% so với người bình thường, gây nên các biến chứng chảy máu nặng nề trong ổ khớp, cơ hay cơ quan nội tạng,... Mời các bạn cùng tham khảo.
TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC XÁC ĐỊNH ĐỘT BIẾN ĐẢO ĐOẠN INTRON 22 TRÊN BỆNH NHÂN HEMOPHILLIA A BẰNG KỸ THUẬT INVERSION PCR Lưu Vũ Dũng1, Trần Vân Khánh1, Nguyễn Trọng Tuệ1, Nguyễn Viết Tiến2, Tạ Thành Văn1 Trường Đại học Y Hà Nội, 2Bệnh viện Phụ sản Trung ương Bệnh Hemophilia A bệnh rối loạn đông máu, di truyền lặn nhiễm sắc thể giới tính X, tần suất mắc bệnh 1/5000 trẻ trai Ở bệnh nhân Hemophilia A thể nặng, nồng độ protein yếu tố VIII máu thấp, ≤ 1% so với người bình thường, gây nên biến chứng chảy máu nặng nề ổ khớp, hay quan nội tạng Đột biến đảo đoạn intron 22 chiếm 45 - 50% bệnh nhân Hemophilia A thể nặng tượng tái tổ hợp hai tương đồng nằm gen F8 Nghiên cứu bước đầu xác định đột biến đảo đoạn intron22 bệnh nhân Hemophilia A người lành mang gen bệnh phương pháp Inversion PCR (I - PCR) Đối tượng phương pháp nghiên cứu: bệnh nhân Hemophilia A thể nặng lựa chọn để tiến hành nghiên cứu Sử dụng kỹ thuật I - PCR để xác định đột biến đảo đoạn intron 22 Kết cho thấy 1/5 bệnh nhân xác định có đột biến đảo đoạn intron 22 Bước đầu xác định đột biến đảo đoạn intron 22 bệnh nhân Hemophilia A Việt Nam kỹ thuật I - PCR Từ khóa: Hemophilia A, đảo đoạn intron 22, inversion - PCR I ĐẶT VẤN ĐỀ Hemophilia A bệnh rối loạn đông máu di hemophilia A nghiên cứu đầy đủ và truyền hay gặp với tần suất mắc 1/5000 công bố năm 1984 Gen F8 gen lớn thể, nằm nhánh dài trẻ trai Bệnh gây nên thiếu khơng có yếu tố VIII, yếu tố tham gia q trình đơng máu Độ nặng bệnh Hemophilia A phụ thuộc vào nồng độ protein yếu tố VIII máu Ở bệnh nhân thể nặng, nồng độ protein yếu tố VIII máu thấp, ≤ 1% so với người bình thường; triệu chứng lâm sàng chảy máu cơ, khớp phận khác thường xảy tự nhiên sau chấn thương nhỏ xuất sớm Về lâu dài, bệnh nhân bị xuất huyết tái phát đặc biệt khớp gây cứng khớp [1] Cấu trúc gen mã hóa yếu tố VIII (gen F8) chế bệnh học phân tử bệnh Địa liên hệ: Trần Vân Khánh, Trung tâm Gen - Protein, trường Đại học Y Hà Nội Email: vankhanh73md@yahoo.com Ngày nhận: 19/4/2013 Ngày chấp thuận: 20/6/2013 14 NST giới tính X (Xq28), kích thước 186 kb gồm 26 exon có chiều dài từ 69 đến 3106 cặp bp intron có kích thước 14kb: intron 1, 6, 13, 14, 22, 25; intron 22 có kích thước lớn 32,8kb [5] Gen F8 có nhiều dạng đột biến công bố Các nghiên cứu khẳng định dạng đột biến khác gen F8 gây kiểu hình đặc trưng khác bệnh hemophilia A Bệnh nhân Hemohilia A thể nặng thường gặp dạng đột biến đảo đoạn intron 22 (chiếm 45 - 50%) Lakich cộng năm 1993 [3] phát đoạn CpG nằm vị trí cách đầu 3’ exon 22 khoảng 10kb hoạt động promoter hai chiều cho hai gen phiên mã, gọi gen F8A F8B; đó, gen F8A phiên mã ngược chiều với gen F8 đoạn F8A tái tổ hợp với tương đồng nằm gen F8 gây nên tượng đột biến đảo đoạn TCNCYH 83 (3) - 2013 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC Hình Cơ chế gây đột biến đảo đoạn intron 22 yếu tố VIII Do đoạn trình tự int22h - intron 22 có độ tương đồng cao với hai vùng int22h - int22h - nằm gen F8 nên tượng tái tổ hợp tương đồng diễn nhiễm sắc thể X vị trí gen F8, phân cắt gen F8 thành đoạn exon 1-22 23 - 26 cách khoảng 400bp Nghiên cứu nhằm bước đầu xác định đột biến đảo đoạn intron22 bệnh nhân Hemophilia A người lành mang gen bệnh phương pháp Inversion PCR (I - PCR) II ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP Đối tượng - Nhóm chứng: người nam bình thường khỏe mạnh - Nhóm nghiên cứu: + 05 bệnh nhân Hemophilia A thể nặng DNA tách chiết phương pháp đo quang máy NanoDrop: nồng độ DNA 300380ng/ml; đánh giá độ tinh tỷ lệ A260nm/A280nm = 1,8 ÷ 2,0 2.2 Kỹ thuật Inversion – PCR xác định đột biến đảo đoạn intron 22 gen F8 chẩn đoán lâm sàng dựa vào Quy trình gồm bước: triệu chứng lâm sàng cận lâm sàng điển hình + Cắt enzym BclI: Thành phần phản ứng gồm 1,5 µg DNA, H2O 25,5 µl, buffer 10X + Người mẹ bệnh nhân để xác định người lành mang gen bệnh giờ; Tinh phenol cloroforrm chlo- Phương pháp 2.1 Kỹ thuật tách chiết DNA 3µl, enzym BclI 1,5 µl (Promega) Ủ 370C/4 roform - isoamilic alcohol (24:1); Tủa cố định DNA alcol, pha loãng DNA thu 20 µl H2O + DNA tách chiết từ bạch cầu máu + Nối T4 ligate: Thành phần phản ngoại vi bệnh nhân, người mẹ bệnh nhân ứng gồm 20 µl DNA, buffer 10X 20µl, enzym T4 ligate 1,0 µl (Promega ) Ủ 41 µl hỗn hợp người bình thường theo phương pháp phenol/chloroform + Kiểm tra nồng độ độ tinh TCNCYH 83 (3) - 2013 160C qua đêm Tinh sản phẩm thu cột GFXTM theo quy trình hãng 15 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC Amersham Pha lỗng sản phẩm DNA đóng dNTPs 1,0 µl , DNA µl , Extaq 0,5 µl, mồi IU vòng 20 µl H2O + Kỹ thuật I - PCR xác định đột biến đảo 0,5 µl, ID 0,5 µl, ED 0,5 µl đoạn intron 22: Phản ứng multiplex I - PCR với trình tự ba 94 C/2 phút; [940C/12 giây, 620C/30 giây, mồi thiết kế dựa vào trình tự hệ gen người vị trí enzym cắt BclI Các mồi IU, ID thiết kế có chứa trình chứng minh phương pháp Southern Blot PCR Thành phần phản ứng PCR: tổng thể tích 20 µl gồm H2O 12,0 µl, buffer 10 X µl, Chu kỳ nhiệt phản ứng multiplex - PCR: 680C/7 phút] x 35 chu kỳ; 720C/5 phút tự enzym cắt giới hạn BclI nằm hai đầu int22h - 1(hình 2.A) Khi đầu DNA nối lại enzym T4 ligate cho sản phẩm DNA vòng có kích thước 21,5 20 kb Hình Các đoạn DNA đóng vòng sau nối T4 ligated Đoạn DNA đóng vòng có kích thước 276110 thấy vị trí BclI int22h-3 base 21,5kb, chứa đoạn int22h-1 vùng BX842559 gen Bank, có vị trí enzym cắt giới hạn 14703 vùng BX 683327 có vị trí BclI int22h-2 base 15265 Đột biến đảo đoạn BclI: base 36204 mồi IU base 14595 mồi ID Ở người bình thường mồi IU khuyếch đại đoạn DNA có kích thước 559bp ID bắt cặp với tạo đoạn DNA có kích thước 487bp gel agarose 1,5% với Marker 100bp nhuộm ethidium bromid để kiểm tra đột Khi tượng đảo đoạn xảy ra, đoạn int22h - nằm gen F8 thay đoạn int22h- int22h - nằm Sản phẩm sau khuếch đại điện di biến đảo đoạn III KẾT QUẢ Kết phản ứng Inversion - ngồi gen F8 cách đầu telomere 500kb, DNA vòng có kích thước 20kb (hình 2.B) PCR (I - PCR) Mồi IU bắt cặp với mồi ED (mồi ED thiết kế nằm cạnh int22h - intron 22h - Tiến hành khuếch đại sản phẩm nối enzym ligase Kết cho thấy 1/5 bệnh nhân có chứa trình tự enzym cắt giới hạn BclI) So phát có đột biến đảo đoạn sánh trình tự mồi ED Genbank vùng BX intron 22 16 TCNCYH 83 (3) - 2013 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC Để xác định xem mẹ bệnh nhân có hành mẫu DNA người mẹ Kết phải người lành mang gen bệnh truyền cho trai, quy trình tương tự tiến cho thấy mẹ bệnh nhân người lành mang gen bệnh truyền cho trai Hình Kết điện di sản phẩm PCR 1: Marker kích thước 100bp 2: Người bình thường 3: Bệnh nhân đột biến đảo đoạn int22 4: Người mẹ mang gen bệnh Người bình thường: giếng số có băng kích thước tương ứng 487 bp, giếng số sản phẩm khuyếch đại bệnh nhân Hemophilia A thể nặng có băng kích thước tương ứng 559 bp, bệnh nhân bị đột biến đảo đoạn intron 22 Giếng số sản phẩm khuyếch đại người mẹ có vạch DNA kích thước tương ứng 487 559bp, người mẹ người mang gen bệnh Kết kiểm tra sản phẩm PCR phương pháp giải trình tự Để đảm bảo xác vạch DNA đoạn DNA cần tìm, gel có chứa đoạn DNA kích thước 559 bp mẫu bệnh nhân đoạn DNA kích thước 487 bp người mẹ cắt để tinh giải trình tự kiểm tra trình tự nucleotid đoạn DNA so với trình tự gen Bank Kết sau: Hình Hình ảnh giải trình tự đoạn DNA kích thước 487bp (mồi IU - ID) đoạn 559bp (mồi IU - ED) Giải trình tự đoạn DNA có kích thước 487 bp so sánh với trình tự GenBank BX 842559 thấy có vị trí mồi IU từ nucleotid 35744 đến nucleotid 35763, mồi ID nằm vị trí từ nucleotid 14622 đến nucleotid 14602 Ở vị trí cách mồi ID 27 nucleotid mồi IU 460 nucleotid có trình tự enzym cắt BclI T/GATCA TCNCYH 83 (3) - 2013 17 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC Giải trình tự đoạn DNA kích thước 559 bp phải - 10 ngày có kết Bên so sánh với trình tự gen Bank BX 842559 thấy có vị trí mồi IU từ nucleotid 35744 đến cạnh đó, sử dụng chất phóng xạ gây nguy hiểm cho người thực kỹ thuật, sử dụng nucleotid 35763, mồi ED từ vị trí nucleotid 15364 đến nucleotid 15347 gen Bank BX chất màu huỳnh quang nguy hiểm lại có độ nhạy thấp 682237 Ở vị trí cách mồi ED 99 nucleotid mồi IU 460 nucleotid có trình tự enzym cắt Kỹ thuật LD - PCR xác định đột biến đảo đoạn intron 22 Phương pháp LD - PCR miêu tả BclI T/GATCA IV BÀN LUẬN Bệnh Hemophilia A di truyền qua hệ liên quan đến NST giới tính X, nên việc xác định xác dạng vị trí đột biến gen F8 bệnh nhân bước quan trọng Kết đột biến gen F8 bệnh nhân sở khoa học cho phân tích phát đột biến gen thành viên gia đình bệnh nhân phát người lành mang gen bệnh Bệnh nhân hemophilia A thể nặng chiếm tỷ lệ cao nguyên nhân đột biến đảo đoạn intron 22 chiếm 45% Việc xác định đảo đoạn intron 22 đòi hỏi kỹ thuật phức tạp Do đó, việc tìm phương pháp xác định đột biến đảo đoạn intron 22 có kết nhanh, xác thuận tiện quan trọng Ba kỹ thuật sử dụng để phát đột biến đảo đoạn intron22 gồm: Liu.Q cộng 1998 Liu.Q cộng thiết kế phản ứng PCR đặc biệt để khuếch đại đoạn gen F8 dài ≥ 10 kb đặt tên phản ứng Long Distance PCR (LD PCR) Sử dụng cặp mồi PQ thiết kế bám đặc hiệu với vùng intron 22 cặp mồi AB thiết kế đặc hiệu cho vùng intron 22h2 intron 22h3 Hình ảnh điện di gel agarose 0,6% - giờ, sản phẩm khuếch đại LD - PCR với mẫu DNA người bình thường cho băng có kích thước 10 kb 12 kb, với người bị đột biến đảo đoạn intron 22 cho băng kích thước 10 11kb, với người lành mang gen cho băng kích thước 10, 11 12 kb [6] Kỹ thuật LD - PCR có ưu điểm đơn giản, dễ thực hiện, cho kết nhanh chóng giá thành rẻ so với kỹ thuật Southern Blot, nhiều phòng thí nghiệm giới sử dụng kỹ thuật Tuy nhiên kỹ Kỹ thuật Southern blot xác định đột thuật LD - PCR có nhược điểm khơng xác biến đảo đoạn intron 22 Phương pháp Southern Blot miêu tả Lakich cộng năm 1993 Thủy phân định đảo đoạn intron týp hay týp khuếch đại đoạn DNA dài (10 - 12kb), DNA enzym BclI, sử dụng mẫu dò đánh dấu phóng xạ P32 để xác định đột biến Ở người bình thường, enzym cắt DNA làm đoạn có kích thước 21,5kb; 16kb 14kb Nếu kết có kích thước 20kb; 17,5kb; 14kb hay 20kb; 16kb; 15,5kb tương ứng với đột biến đảo đoạn intron 22 týp 1(inv 22 - 1) týp (inv 22 - 2) [3] Kỹ thuật phức tạp, tốn công sức 18 chứa đảo GC nên gặp không khó khăn thực kỹ thuật Kỹ thuật I - PCR Phương pháp I - PCR miêu tả Rosetti cộng 2005 [4] Hình cho thấy: bệnh nhân bị đột biến đảo đoạn intron 22, ứng với kiểu hình lâm sàng: bệnh nhân mắc bệnh hemophilia A thể nặng người mẹ bệnh nhân trạng thái dị hợp tử (người lành mang gen bệnh) TCNCYH 83 (3) - 2013 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC Kết khẳng định hình ảnh giải trình tự đoạn DNA 487 559 bp (hình 4): đoạn gen có đầy đủ trình tự vị trí bám mồi, trình tự enzyme BclI vị trí tương ứng với vị trí Rossetti cộng cơng bố [4] Phương pháp I - PCR có ưu điểm dễ tiến hành Enzym BclI tác dụng đặc hiệu nên sản phẩm cắt enzyme có tính đặc hiệu cao Sản phẩm PCR khuếch đại dễ dàng thời gian khoảng 30 phút đoạn DNA có kích thước ngắn (487 559 bp) Như xét nghiệm phân tích gen tiến hành nhanh chóng, kết thu có độ tin cậy cao, sở để tư vấn di truyền chẩn đoán trước sinh sớm cho người mẹ dị hợp tử mang thai Mặc dù nghiên cứu tiến hành với số lượng bệnh nhân hạn chế, tỷ lệ đột biến đảo đoạn thấp so với nghiên cứu trước (1/5 bệnh nhân), nghiên cứu bước đầu Việc xác định đột biến đảo đoạn thành cơng kỹ thuật khó góp phần quan trọng việc xây dựng tranh hoàn chỉnh dạng đột biến gen F8 bệnh nhân Hemophillia A Việt Nam, đồng thời tiền đề quan trọng phát người lành mang gen bệnh chẩn đoán trước sinh, tư vấn di truyền nhằm giảm tỷ lệ mắc bệnh V KẾT LUẬN Bằng phương pháp I - PCR, nghiên cứu phát đột biến đảo đoạn gen F8 bệnh nhân hemophilia A thể nặng xác định người mẹ bệnh nhân trạng thái dị hợp tử TÀI LIỆU THAM KHẢO Nguyễn Ngọc Minh (2007) Bệnh Hemophilia Bài giảng huyết học truyền máu (Sau đại học) Nhà xuất Y học, 539 - 548 Anne Goodeve (2008) Moleculer Genetic testing of Hemophilia A, Seminar in thrombosis an Hemostasis, 34 (6), 491 - 501 Lakich D., Kazazian H.Jr, Antonarakis S.E., Gitchier J., (1993) Inversions disrupting the factor VIII gene are a common cause of severe Heamophilia A Nature publishing group 5, 236 - 241 Rossetti L.C., Radic C P., Larripa I.B., De Brasi C.D (2005) Genotyping the Hemophilia Inversion Hotspot by Use of Inverse PCR Hemostasis and Thrombosis, 154 - 158 Rossetti L.C., Radic C.P., Abelleyro M.M et al (2011) Eighteen Years of Molecular Genotyping the Hemophilia Inversion Hotspot: From Southern Blot to Inverse Shifting-PCR International Journal of Molecular Sciences 12, 7271 - 7285 Liu, Q., Nozari G., Sommer S.S., (1998) Single-tube polymerase chain reaction for rapid diagnosis of the inversion hotspot of mutation in haemophilia A Blood 92, 1458 -1459 Summary IDENTYFICATION OF INTRON 22 INVERSION IN HEMOPHILIA A PATIENT BY INVERSION – PCR Hemophilia A is an inherited recessive X-linked disease that causes the abnormal blood coagulation, with an incidence of about in 5, 000 males In severe Hemophilia A patient, low blood concentration of protein factors VIII (≤ 1% when compared to normal), triggers severe bleeding in the joints, muscles, or other internal organs Invesion intron 22 accounted for 45-50% of severe Hemophilia A patients due to the recombination of homologous copies outside the F8 gene Objectives of the study were to identify intron 22 inversion in severe Hemophilia A patients TCNCYH 83 (3) - 2013 19 TẠP CHÍ NGHIÊN CỨU Y HỌC by inversion - PCR Five severe Hemophilia A patients were selected for this study; we use Inversion - PCR to analyse intron 22 inversion in F8 gene 1/5 patients were found to have intron 22 inversion In conclusion, intron 22 inversion was successfully identified in Vietnamese severe Hemophilia A patients by I - PCR technique Keywords: Hemophilia A, inversion intron 22, inversion - PCR BẢO QUẢN TẾ BÀO GỐC TỦY RĂNG CHUỘT Tơ Minh Qn1, Lê Thị Ngọc Hương1, Hồng Đạo Bảo Trâm2 Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Thành phố Hồ Chí Minh Trường Đại học Y - Dược Thành phố Hồ Chí Minh Tế bào gốc tủy chuột nhắt trắng Mus musculus var albino bảo quản môi trường DMEM/ F12 bổ sung DMSO 10%, FBS 20% theo quy trình giảm nhiệt: (1) để điều kiện 4oC/20 phút, -20oC/30 phút, sau chuyển sang bảo quản -80oC; (2) để điều kiện -20oC/30 phút bảo quản -80oC Tế bào đông lạnh giải đông môi trường nuôi cấy DMEM/F12 bổ sung FBS 20% 370C Các tế bào tiếp tục nuôi cấy môi trường DMEM/F12, bổ sung FBS 10%, Peniciline 100UI/ml, Streptomycine 100µg/ml, điều kiện 37oC, CO2 5% Tỷ lệ tế bào sống sau q trình bảo quản đơng lạnh thời điểm ngày, tuần, tuần tuần đánh giá phương pháp nhuộm Trypan Blue Sự biểu marker bề mặt tế bào kiểm tra phương pháp Flow Cytometry Thử nghiệm cho thấy tế bào tủy chuột bảo tốt thời gian tuần theo quy trình đơng lạnh -20oC/20 phút bảo quản -80oC Sau giải đơng, tế bào có khả bám, tăng trưởng biểu marker tế bào gốc trung mô CD73, CD90, CD105 không biểu marker tế bào máu CD19, CD34, CD45 Từ khóa: tế bào gốc tủy răng, bảo quản tế bào, nuôi cấy tế bào I ĐẶT VẤN ĐỀ Tế bào gốc tế bào chưa biệt hóa mơ sống, có khả trở thành tế bào chuyên biệt với chức đặc trưng [1] Trong điều kiện in vivo in vitro, tế bào gốc tự làm với tính riêng biệt Ngày nay, tế bào gốc tách thu nhận từ nhiều nguồn (phôi giai đoạn tiền làm tổ, thai, thể trưởng thành, ) Tủy vùng tế bào giúp sống Địa liên hệ: Hoàng Đạo Bảo Trâm, Đại học Y Dược Tp Hồ Chí Minh, 217 Hồng Bàng, Quận 5, TpHCM email: hoangdaobaotram@gmail.com Ngày nhận: 13/03/2013 Ngày chấp thuận: 20/6/2013 20 trì chức Tương tự tủy xương, tủy chứa tế bào gốc trung mơ Ngồi ra, tủy chứa tế bào tiền nguyên bào ngà, tế bào tạo máu Tế bào tủy nguyên liệu quan trọng cho nghiên cứu lĩnh vực tái tạo Sau thành công Gronthos năm 2000 việc phân lập nuôi cấy tế bào gốc tủy người [2], giới có nhiều nghiên cứu tiếp tục phát triển theo hướng Tại Việt Nam, số nghiên cứu cho kết nuôi cấy thành công tế bào từ mảnh mô tủy người [3; 4] Song song với việc phân lập tế bào gốc, kỹ thuật bảo quản tế bào gốc động vật phát triển mở kỷ nguyên công nghệ tế bào động vật Với mục tiêu xuyên suốt TCNCYH 83 (3) - 2013 ... đột biến đảo đoạn intron 22 chiếm 45% Việc xác định đảo đoạn intron 22 đòi hỏi kỹ thuật phức tạp Do đó, việc tìm phương pháp xác định đột biến đảo đoạn intron 22 có kết nhanh, xác thuận tiện quan... đột biến gen F8 bệnh nhân sở khoa học cho phân tích phát đột biến gen thành viên gia đình bệnh nhân phát người lành mang gen bệnh Bệnh nhân hemophilia A thể nặng chiếm tỷ lệ cao nguyên nhân đột. .. thành đoạn exon 1 -22 23 - 26 cách khoảng 400bp Nghiên cứu nhằm bước đầu xác định đột biến đảo đoạn intron2 2 bệnh nhân Hemophilia A người lành mang gen bệnh phương pháp Inversion PCR (I - PCR)