Đang tải... (xem toàn văn)
Khảo sát và xây dựng cơ sở dữ liệu tần suất các alen của 15 locus gen hệ identifiler từ quần thể người dân tộc Dao ứng dụng trong giám định AND (Luận văn thạc sĩ)Khảo sát và xây dựng cơ sở dữ liệu tần suất các alen của 15 locus gen hệ identifiler từ quần thể người dân tộc Dao ứng dụng trong giám định AND (Luận văn thạc sĩ)Khảo sát và xây dựng cơ sở dữ liệu tần suất các alen của 15 locus gen hệ identifiler từ quần thể người dân tộc Dao ứng dụng trong giám định AND (Luận văn thạc sĩ)Khảo sát và xây dựng cơ sở dữ liệu tần suất các alen của 15 locus gen hệ identifiler từ quần thể người dân tộc Dao ứng dụng trong giám định AND (Luận văn thạc sĩ)Khảo sát và xây dựng cơ sở dữ liệu tần suất các alen của 15 locus gen hệ identifiler từ quần thể người dân tộc Dao ứng dụng trong giám định AND (Luận văn thạc sĩ)Khảo sát và xây dựng cơ sở dữ liệu tần suất các alen của 15 locus gen hệ identifiler từ quần thể người dân tộc Dao ứng dụng trong giám định AND (Luận văn thạc sĩ)Khảo sát và xây dựng cơ sở dữ liệu tần suất các alen của 15 locus gen hệ identifiler từ quần thể người dân tộc Dao ứng dụng trong giám định AND (Luận văn thạc sĩ)
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM VIỆN SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT HÀ ĐẠI DƯƠNG KHẢO SÁT VÀ XÂY DỰNG CƠ SỞ DỮ LIỆU TẦN SUẤT CÁC ALEN CỦA 15 LOCUS GEN HỆ IDENTIFILER TỪ QUẦN THỂ NGƯỜI DÂN TỘC DAO ỨNG DỤNG TRONG GIÁM ĐỊNH ADN LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC Hà Nội - 2017 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM VIỆN SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT HÀ ĐẠI DƯƠNG Tên đề tài: KHẢO SÁT VÀ XÂY DỰNG CƠ SỞ DỮ LIỆU TẦN SUẤT CÁC ALEN CỦA 15 LOCUS GEN HỆ IDENTIFILER TỪ QUẦN THỂ NGƯỜI DÂN TỘC DAO ỨNG DỤNG TRONG GIÁM ĐỊNH ADN Học viên: Hà Đại Dương Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 60.42.01.14 Người hướng dẫn: Đại tá PGS TS Nguyễn Văn Hà Hà Nội - 2017 LỜI CẢM ƠN Để hồn thành tốt luận văn tơi xin gửi tới đồng chí Đại tá.PGS.TS Nguyễn Văn Hà - Phó Giám đốc Trung tâm giám định Sinh học pháp lý - Viện Khoa học hình - Bộ Cơng an với lịng biết ơn sâu sắc lời cảm ơn chân thành, người nhiệt tình hướng dẫn, dạy bảo, động viên tạo điều kiện thuận lợi để tơi hồn thành tốt luận văn Xin chân thành cảm ơn Lãnh đạo tập thể cán chiến sỹ Trung tâm giám định sinh học pháp lý - Viện Khoa học hình tạo điều kiện cho tham gia học tập thực nghiệm phịng thí nghiệm để hồn thành luận văn Tơi xin chân thành cảm ơn thầy cô giáo cán Viện Hàn lâm khoa học công nghệ Việt nam nói chung, Viện Sinh thái Tài nguyên sinh vật nói riêng tham gia tổ chức, quản lý, giảng dạy lớp cao học K19 hướng dẫn, trang bị kiến thức cho sở tạo tiền đề giúp tơi hồn thành luận văn Cuối cùng, muốn gửi lời cảm ơn sâu sắc đến gia đình, bạn bè đồng nghiệp ln ủng hộ động viên tinh thần, giúp vượt qua khó khăn, trở ngại q trình học tập nghiên cứu Một lần nữa, xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc với giúp đỡ nhiệt tình, q báu đó! Hà Nội, ngày tháng năm 2017 Học viên Hà Đại Dương MỤC LỤC MỞ ĐẦU 1 Tính cấp thiết đề tài Mục tiêu đề tài 3 Bố cục luận văn CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Tổng quan người dân tộc Dao Việt Nam 1.2 Giám định gen khoa học hình 1.2.1 Lịch sử đời giám định gen 1.2.2 Khái quát trình tự STR (Sort Tandem Repeats) 1.2.3 Phân loại thị STR sử dụng STR giám định gen 1.2.4 Các locus STR kit Identifler 1.2.5 Ưu điểm hạn chế kit Identifiler công tác giám định 11 1.3 Xây dựng sở liệu gen người phục vụ công tác giám định 11 1.3.1 Mục đích xây dựng sở liệu gen 11 1.3.2 Quy trình xây dựng sở liệu gen 12 1.3.3 Số lượng mẫu tính tốn tần suất alen 13 1.4 Tình hình nghiên cứu ngồi nước khảo sát tần suất alen locus gen sử dụng giám định gen 13 1.4.1 Tình hình nghiên cứu giới 13 1.4.2 Tình hình nghiên cứu nước 14 CHƯƠNG NỘI DUNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 16 2.1 Nội dung nghiên cứu 16 2.2 Phương pháp nghiên cứu 16 2.2.1 Thu mẫu 16 2.2.2 Phân tích mẫu 17 2.2.3 Xử lý số liệu thống kê tính tần suất locus gen 19 CHƯƠNG KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ BÀN LUẬN 22 3.1 Kết thu, bảo quản mẫu tách chiết ADN 22 3.2 Kết thực phản ứng PCR, điện di phân tích kiểu gen 22 3.3 Kết xử lý số liệu thống kê 25 3.3.1 Kết tính tốn tần suất alen 25 3.3.2 Kết quan sát kiểu gen locus tính tốn số kiểm định 2 28 3.3.3 So sánh số kiểm định 2 tính toán (2tt) với lý thuyết (2lt) đánh giá phù hợp với định luật Hardy - Weinberg 35 3.3.4 So sánh tần suất alen người Dao với số dân tộc 36 3.4 Một số ví dụ ứng dụng kết đề tài công tác giám định ADN Viện Khoa học hình - Bộ Cơng an 48 KẾT LUẬN 51 KIẾN NGHỊ 52 TÀI LIỆU THAM KHẢO 53 PHỤ LỤC 56 DANH MỤC MỘT SỐ KÝ HIỆU, CHỮ VIẾT TẮT TRONG LUẬN VĂN ADN - Axit Deoxyribo Nucleic ARN - Axít ribonucleic A - Adenine T - Thymine G - Guanine C - Cytosine NST - Nhiễm sắc thể VNTR - Variable Number of Tandem Repeat - Các trình tự lặp ngắn STR - Short Tandem Repeat - Các trình tự lặp ngắn ID - Identifiler/Identify definition PCR - Polymerase Chain Reaction - Phản ứng chuỗi trùng hợp FTA - Giấy thu mẫu máu phục vụ giám định ADN bp - Base pair ANTT - An ninh trật tự KHHS - Khoa học hình BCA - Bộ Cơng an CE - Điện di mao dẫn DANH MỤC HÌNH VẼ Hình 1.1 Sơ đồ bước xây dựng sở liệu gen 12 Hình 3.1 Hình ảnh kiểu gen dạng peak từ mẫu ký hiệu D96 23 Hình 3.2 Hình ảnh kiểu gen dạng peak từ mẫu ký hiệu D39 24 Hình 3.3 Hình ảnh kiểu gen dạng peak từ mẫu ký hiệu D68 25 DANH MỤC BẢNG BIỂU Bảng 1.1 Các locus STR đơn vị lặp kit Identifiler 10 Bảng 3.1: Kết định lượng ADN 22 Bảng 3.2: Tần suất xuất alen 15 locus hệ Identifiler với quần thể người dân tộc Dao………………………………………………………….27 Bảng 3.3: Số lượng kiểu gen quan sát locus D8S1179 28 Bảng 3.4: Số lượng kiểu gen quan sát locus D21S11 28 Bảng 3.5: Số lượng kiểu gen quan sát locus D7S820 29 Bảng 3.6: Số lượng kiểu gen quan sát locus CSF1PO 29 Bảng 3.7: Số lượng kiểu gen quan sát locus D3S1358 30 Bảng 3.8: Số lượng kiểu gen quan sát locus TH01 30 Bảng 3.9: Số lượng kiểu gen quan sát locus D13S317 30 Bảng 3.10: Số lượng kiểu gen quan sát locus D16S539 31 Bảng 3.11: Số lượng kiểu gen quan sát locus TPOX 31 Bảng 3.12: Số lượng kiểu gen quan sát locus D16S539 32 Bảng 3.13: Số lượng kiểu gen quan sát locus vWA 32 Bảng 3.14: Số lượng kiểu gen quan sát locus D19S433 33 Bảng 3.15: Số lượng kiểu gen quan sát locus D18S51 33 Bảng 3.16: Số lượng kiểu gen quan sát locus FGA 34 Bảng 3.17: Số lượng kiểu gen quan sát locus D18S51 34 Bảng 3.18: So sánh 2TT 2LT 35 Bảng 3.19: Tần suất alen (%) locus gen hệ Identifiler dân tộc Dao, Kinh người gốc Mỹ [17] 36 MỞ ĐẦU Tính cấp thiết đề tài Viện Khoa học hình thành lập vào ngày 19 tháng năm 1978 theo Quyết định 78/QĐ-BNV Bộ trưởng Bộ Nội vụ Trần Quốc Hoàn ký Trải qua gần 40 năm xây dựng trưởng thành, Viện trở thành quan đầu ngành lực lượng kỹ thuật hình nước Cho đến nay, Viện Khoa học hình hình thành đội ngũ giám định viên có chun mơn nghiệp vụ, làm chủ nhiều trang thiết bị máy móc đại, đảm bảo cơng tác giám định xác khách quan Trong lĩnh vực giám định kỹ thuật hình pháp y Viện Khoa học hình sự, giám định gen lĩnh vực giám định tạo dựng nhiều “tiếng vang” cơng tác phịng, chống tội phạm giữ gìn an ninh trị, trật tự an tồn xã hội Từ tháng năm 1999, Viện Khoa học hình triển khai lĩnh vực giám định gen với tồn quy trình chuyển giao từ Viện Khoa học hình bang Victoria - Úc, ban đầu sử dụng hệ NinePlex II (gồm 09 locus) Đến năm 2006 Viện Khoa học hình đưa vào ứng dụng hệ Identifiler (gồm 15 locus STR) giám định gen Với phát triển khoa học kỹ thuật nói chung, giám định gen nói riêng, kết luận giám định gen từ dấu vết sinh vật như: máu, tinh dịch, lơng tóc… dấu vết quan trọng thường xuất hầu hết vụ án, vụ án hình nghiêm trọng giết người, hiếp dâm…trở thành nguồn chứng vật chất vô quan trọng để đấu tranh với tội phạm Tuy nhiên, từ thực tiễn cho thấy, kết luận giám định gen thường so sánh kiểu gen phân tích từ dấu vết trường với đối tượng hay nạn nhân xác định quan hệ huyết thống cha, mẹ đẻ - đẻ Nếu kiểu gen phân tích từ dấu vết trường khơng trùng với đối tượng hay nạn nhân, kiểu gen người không phù hợp di truyền với bố mẹ giả định kết luận loại trừ Nhưng kiểu gen phân tích đưa so sánh hồn tồn phù hợp, tốn đặt khả có người khác quần thể có kiểu gen có phù hợp di truyền với người khơng? Thực tế, khơng thể có sở liệu gen đầy đủ người quần thể, việc khảo sát số lượng người định đại diện cho quần thể sở khoa học để ước lượng tần suất kiểu gen Nhận quan tâm, đạo Chính phủ, Bộ Cơng an, Viện Khoa học hình xây dựng sở liệu gen quần thể dân tộc người khắp nước, đặc biệt nơi có nhiều tội phạm nguy hiểm, diễn biến phạm tội phức tạp để phục vụ công tác giám định xây dựng Tàng thư gen Đến nay, Viện xây dựng trung tâm liệu gen với số lượng hàng chục nghìn mẫu, với quần thể người: Kinh, Khmer, Mông, Tày Tuy nhiên, chưa có liệu người Dao Người Dao Việt Nam có dân số 751.067 người, cư trú 61 tổng số 63 tỉnh, thành phố Người Dao cư trú tập trung tỉnh miền núi phía Bắc nước ta Thời gian gần khu vực người Dao sinh sống thường điểm phức tạp an ninh trị, trật tự an tồn xã hội, thường xun có đối tượng phạm tội trị, tội phạm người nước ngoài, tội phạm ma túy kết cấu với người dân tộc Dao để thực hành vi phạm tội gây rối trật tự, buôn bán phụ nữ trẻ em, buôn bán sử dụng ma túy Số vụ việc cần giám định ADN liên quan tới người dân tộc Dao có chiều hướng gia tăng Nên việc thu thập thông tin dân số có liệu gen phục vụ quản lý nhân khẩu, phịng chống tội phạm cơng việc cần thiết Hiện chưa có đề tài nghiên cứu ADN người Dao phục vụ giám định gen Chính lí trên, tơi chọn đề tài nghiên cứu “Khảo sát xây dựng sở liệu tần suất alen 15 locus gen hệ Identifiler từ quần thể người dân tộc Dao ứng dụng giám định ADN” làm đề tài luận văn Thạc sỹ Đề tài hoàn thiện đóng góp sở khoa học vào cơng tác giám định gen bổ sung liệu người Dao vào sở liệu gen mà Viện Khoa học hình xây dựng Mục tiêu đề tài Đề tài hướng tới mục tiêu: - Khảo sát tần suất alen 15 locus gen (hệ Identifiler) từ 120 người thuộc dân tộc Dao khỏe mạnh, quan hệ huyết thống với nhau, sinh sống khu vực tỉnh vùng núi phía bắc Việt Nam Các tần suất kiểm định phù hợp ngẫu nhiên theo định luật cân Hardy - Weinberg, đảm bảo tính xác, khách quan để sử dụng kết luận giám định Ngồi ra, đề tài cịn hướng tới mục tiêu bổ sung liệu gen người Dao vào hệ thống liệu gen dân tộc Viện Khoa học hình - Ứng dụng bảng tần suất xây dựng vào việc tính tốn tần suất alen vụ án cụ thể mà mẫu thu từ người Dao Bố cục luận văn Luận văn trình bày theo quy định tiêu chuẩn luận văn Thạc sỹ Bộ Giáo dục đào tạo Ngoài phần mở đầu, kết luận, danh mục tài liệu tham khảo phụ lục, luận văn cấu trúc gồm chương: - Chương 1: Tổng quan tài liệu - Chương 2: Nội dung phương pháp nghiên cứu - Chương 3: Kết nghiên cứu bàn luận ... ADN người Dao phục vụ giám định gen Chính lí trên, chọn đề tài nghiên cứu ? ?Khảo sát xây dựng sở liệu tần suất alen 15 locus gen hệ Identifiler từ quần thể người dân tộc Dao ứng dụng giám định. .. DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM VIỆN SINH THÁI VÀ TÀI NGUYÊN SINH VẬT HÀ ĐẠI DƯƠNG Tên đề tài: KHẢO SÁT VÀ XÂY DỰNG CƠ SỞ DỮ LIỆU TẦN SUẤT CÁC ALEN CỦA 15 LOCUS GEN HỆ... thống liệu gen dân tộc Viện Khoa học hình - Ứng dụng bảng tần suất xây dựng vào việc tính tốn tần suất alen vụ án cụ thể mà mẫu thu từ người Dao Bố cục luận văn Luận văn trình bày theo quy định