Đang tải... (xem toàn văn)
Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)Một số đặc tính của các chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM1 kháng carbapenem (luận văn thạc sĩ)
ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN - - Ngô Thị Hà MỘT SỐ DẶC TINH CỦA CAC CHỦNG ACINETOBACTER BAUMANNII GAY NHIỄM KHUẨN BỆNH VIỆN MANG GEN NDM-1 KHANG CARBAPENEM LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC Hà Nội - 2015 MỤC LỤC DANH MỤC CÁC BẢNG Error! Bookmark not defined DANH MỤC CÁC HÌNH .Error! Bookmark not defined DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT Error! Bookmark not defined MỞ ĐẦU CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN 1.1 Nhiễm khuẩn bệnh viện 1.2 Kháng sinh đề kháng kháng sinh vi khuẩn 1.2.1 Lịch sử phát triển kháng sinh 1.2.2 Sự đề kháng kháng sinh vi khuẩn 1.2.2.1 Sự phát triển đặc tính kháng kháng sinh vi khuẩn 1.2.2.2 Phân loại đề kháng 10 1.2.3 Cơ chế kháng kháng sinh vi khuẩn 11 1.2.3.1 Thay đổi đích tác động 11 1.2.3.2 Tạo enzym 12 1.2.3.3 Giảm tính thấm màng nguyên sinh chất 12 1.2.4 Các yếu tố nguy gây kháng kháng sinh 12 1.2.4.1 Lạm dụng sử dụng kháng sinh cộng đồng 12 1.2.4.2 Sử dụng kháng sinh bệnh viện 13 1.2.4.3 Sử dụng kháng sinh chăn nuôi 14 1.2.4.4 Do bác sỹ 14 1.2.4.5 Chất lượng kháng sinh 15 1.2.4.6 Gia tăng lại quốc tế 15 1.2.4.7 Hệ thống giám sát kháng sinh 15 1.3 Kháng sinh nhóm carbapenem 16 1.4 Thực trạng kháng kháng sinh vi khuẩn Gram âm 19 1.5 Đặc điểm vi sinh vật học tình trạng kháng kháng sinh A baumannii 20 1.5.1 Đặc điểm vi sinh vật học A baumannii 20 1.5.1.1 Đặc điểm chung 20 1.5.1.2 Đặc điểm sinh học A baumannii 21 1.5.2 Cơ chế kháng kháng sinh A baumannii 23 1.5.3 Đặc điểm gen kháng kháng sinh nhóm carbapenem A baumannii 24 1.5.4 Tình hình A baumannii kháng carbapenem Thế giới 27 1.5.5 Tình hình A baumannii kháng carbapenem Việt Nam 29 CHƢƠNG 2: ĐỐI TƢỢNG,VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 32 2.1 Đối tượng nghiên cứu 32 2.2 Vật liệu nghiên cứu – trang thiết bị sinh phẩm vật tư tiêu hao 32 2.3 Thiết kế nghiên cứu: nghiên cứu hồi cứu – mô tả cắt ngang 32 2.4 Thời gian địa điểm nghiên cứu 32 2.5 Cỡ mẫu nghiên cứu 32 2.6 Các phương pháp nghiên cứu 32 2.6.1 Các kỹ thuật phát vi khuẩn kháng kháng sinh 32 2.6.1.1 Kỹ thuật khoanh giấy kháng sinh khuếch tán thạch 32 2.6.1.2 Kỹ thuật xác định nồng độ kháng sinh tối thiểu ức chế vi khuẩn (MIC) 33 2.6.2 Các kỹ thuật sinh học phân tử 33 2.6.2.1 Kỹ thuật PCR phát vi khuẩn mang gen NDM-1 33 2.6.2.2 Phân tích đặc điểm dịch tễ học phân tử kỹ thuật multilocus sequence typing (MLST) 34 2.6.2.3 Phân tích mối liên hệ kiểu gen chủng A baumannii kỹ thuật PFGE…… 36 2.6.2.4 Phát plasmid mang gen NDM-1 kỹ thuật SouthernBlotting … 37 2.7 Quản lý phân tích số liệu 38 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 40 3.1 Mô tả thực trạng kháng kháng sinh chủng A baumannii kháng carbapenem phân lập bệnh viện Việt Đức, Thanh Nhàn, Xanh Pôn 40 3.2 Phát tỷ lệ vi khuẩn A baumannii kháng carbapenem mang gen NDM-1 phân lập nghiên cứu 42 3.2.1 Tỷ lệ phân bố vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1 phân lập bệnh viện 44 3.2.2 Tỷ lệ phân bố vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1theo khoa 44 3.2.3 Tỷ lệ phân lập vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1 theo nhóm tuổi theo giới 45 3.2.4 Tỷ lệ phân lập vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1 theo giới 46 3.2.5 Mức độ nhạy cảm kháng sinh chủng A baumannii mang gen NDM-1… 47 3.3 Xác định số đặc tính sinh học phân tử vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1 49 3.3.1 Kiểu gen PFGE chủng vi khuẩn A baumannii kháng carbapenem mang gen NDM-1 49 3.3.2 Phát plasmid mang gen NDM-1 53 3.3.3 Kỹ thuật multilocus sequence typing xác định kiểu gen chủng vi khuẩn A baumannii kháng carbapenem mang gen NDM-1 54 3.4 Hướng nghiên cứu 57 KẾT LUẬN 59 KIẾN NGHỊ 61 Tài Liệu Tham Khảo 62 MỞ ĐẦU Nhiễm khuẩn bệnh viện (NKBV) thách thức lớn bệnh viện việc điều trị tỷ lệ nhiễm khuẩn ngày cao NKBV nguyên nhân hàng đầu đe dọa đến tính mạng người bệnh, nguyên nhân gây tỷ lệ mắc, tử vong cao cho bệnh nhân bệnh viện giới [76] NKBV thường gây nên vi khuẩn kháng đa kháng sinh, gây nhiều khó khăn cho cơng tác điều trị, kéo dài thời gian mắc bệnh, tăng biến chứng, tăng kháng thuốc vi sinh vật qua tăng mức sử dụng kháng sinh, tăng chi phí dùng thuốc gánh nặng bệnh tật cho người bệnh hệ thống y tế Theo báo cáo tổ chức Y tế giới 55 bệnh viện 14 nước giới đại diện cho khu vực đưa tỷ lệ NKBV 8,7% Ước tính thời điểm có 1,4 triệu người bệnh giới mắc NKBV [68] Hàng năm giới có khoảng triệu người mắc NKBV với 90.000 người tử vong, chi phí chăm sóc cho bệnh nhân tăng khoảng 4,5 tỉ đô-la [73] Đây vấn đề y tế nghiêm trọng mang tính tồn cầu quốc gia giới Việt Nam quan tâm cách đặc biệt Hiện Acinetobacter baumannii (A baumannii) tác nhân gây bệnh quan trọng hàng đầu tác động đến sở điều trị giới Tuy nhiên gia tăng nhanh chóng chủng vi khuẩn A baumannii kháng lại kháng sinh thuộc nhóm β-lactam, bao gồm kháng sinh nhóm carbapenem thuộc “nhóm lựa chọn cuối cùng” Đặc biệt xuất chủng Acinetobacter mang gen New Delhi Metallo-beta-lactamase-1 (NDM-1) kháng carbapenem ghi nhận số quốc gia Đức Vương quốc Anh [64] Điều dẫn đến nhiều hậu nghiêm trọng như: khơng cịn kháng sinh để điều trị, tăng nguy thất bại điều trị, giá thành cao, kéo dài thời gian điều trị bệnh nhân có nguy tử vong cao mắc chủng A baumannii kháng kháng sinh [1] Trong nghiên cứu gần số bệnh viện Hà Nội, A baumannii chiếm 53,33% (320/600) tổng số chủng vi khuẩn gram âm gây NKBV 95% số chủng kháng lại cephalosporin hệ 3, với kháng sinh nhóm carbapenem Câu hỏi nghiên cứu đặt liệu chủng A baumannii kháng carbapenem phân lập bệnh viện có mang gen NDM-1 hay không? Do vậynghiên cứu tiến hành nhằm phát vi khuẩn A baumannii kháng carbapenem mang gen NDM-1, đồng thời xác đinh số đặc tính sinh học phân tử chủng A baumannii mang gen NDM-1 Việt Nam cần thiết để từ đưa biện pháp phù hợp phòng chống lây lan đề xuất phác đồ điều trị phù hợp cho bệnh nhân bị mắc chủng A baumannii mang gen NDM-1 Việt Nam Chính cấp thiết ý nghĩa thực tiễn nêu trên, tiến hành đề tài nghiên cứu: “Một số đặc tính chủng Acinetobacter baumannii gây nhiễm khuẩn bệnh viện mang gen NDM-1 kháng carbapenem” với mục tiêu: Mục tiêu chung: Mô tả thực trạng kháng kháng sinh số đặc điểm sinh học phân tử chủng vi khuẩnA baumannii kháng carbapenem bệnh viện Hà Nội bao gồm bệnh viện Việt Đức, Thanh Nhàn, Xanh Pôn Mục tiêu cụ thể: Mô tả thực trạng kháng kháng sinh chủng A baumannii kháng carbapenem phân lập bệnh viện Việt Đức, Thanh Nhàn, Xanh Pôn Phát tỷ lệ vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1 phân lập nghiên cứu Xác định số đặc tính sinh học phân tử vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1 CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN 1.1 Nhiễm khuẩn bệnh viện Theo Tổ chức Y tế Thế giới, nhiễm khuẩn bệnh viện (hospital-acquired infection hay nosocomial infection) “những nhiễm khuẩn người bệnh mắc phải thời gian điều trị bệnh viện mà thời điểm nhập viện khơng thấy có yếu tố nhiễm khuẩn hay ủ bệnh Nhiễm khuẩn bệnh viện thường xuất sau 48 kể từ người bệnh nhập viện” NKBV 48 Thời điểm nhập viện Thời điểm nằm viện Thời điểm viện Hình 1.1 Sơ đồ nhiễm khuẩn bệnh viện Để chẩn đoán nhiễm khuẩn bệnh viện, người ta thường dựa vào định nghĩa tiêu chuẩn chẩn đoán cho vị trí nhiễm khuẩn bệnh viện Ví dụ: nhiễm khuẩn vết mổ sau phẫu thuật, nhiễm khuẩn máu có liên quan đến dụng cụ đặt lịng mạch, nhiễm khuẩn đường tiết niệu Hiện nay, theo hướng dẫn từ Trung tâm Giám sát Phòng bệnh Hoa Kỳ (CDC) hội nghị quốc tế mở rộng định nghĩa ca bệnh cho vị trí nhiễm khuẩn khác áp dụng để giám sát nhiễm khuẩn bệnh viện toàn cầu Dựa tiêu chuẩn lâm sàng sinh học, nhà khoa học xác định có khoảng 50 loại nhiễm khuẩn bệnh viện khác xảy bệnh viện Bảng 1.1 Phân loại số nhiễm khuẩn bệnh viện [76] Loại nhiễm khuẩn Tiêu chuẩn Nhiễm khuẩn vết mổ Có dịch chảy từ vết mổ, abcess viêm mô lan tỏa vết mổ tháng sau phẫu thuật Nhiễm khuẩn tiết niệu Ni cấy dương tính (1 vi khuẩn) với nồng độ >105vk/ml, có khơng có triệu chứng lâm sàng Nhiễm khuẩn đƣờng hơ hấp Có tối thiểu triệu chứng viêm nhiễm đường hô hấp xuất thời gian nhập viện: Ho Có đờm mủ Có hình ảnh viêm phổi phim X-quang Nhiễm khuẩn đặt catheter Có biểu viêm, hạch có mủ chảy từ vị trí đặt catheter Nhiễm khuẩn huyết Sốt rét kết cấy máu dương tính với tác nhân gây bệnh Hiện nhiễm khuẩn bệnh viện vấn đề nghiêm trọng tác động đến sức khoẻ toàn cầu Theo báo cáo tổ chức Y tế giới nhiễm khuẩn bệnh viện từ năm 1995 đến 2010 cho thấy: Tỷ lệ nhiễm khuẩn bệnh viện tính chung cho quốc gia có thu nhập cao nằm khoảng từ 5% đến 12% (Hình 1.2) tỷ lệ chung cho tất quốc gia vào khoảng 7,6% [77] Theo ước tính trung tâm phịng chống kiểm sốt bệnh châu Âu, hàng năm có khoảng 4.100.000 bệnh nhân bị nhiễm khuẩn bệnh viện khoảng 37.000 trường hợp tử vong Phần lớn trường hợp nhiễm khuẩn tiết niệu nhiễm khuẩn đường hô hấp, nhiễm khuẩn sau phẫu thuật, nhiễm khuẩn huyết số nhiễm khuẩn khác (bao gồm tiêu chảy Clostridium difficile) S aureus kháng đa kháng sinh chiếm khoảng 5% trường hợp nhiễm khuẩn bệnh viện liên minh châu Âu [24] Tại Mỹ năm 2002, tỷ lệ nhiễm khuẩn bệnh viện vào khoảng 4,5% tương đương với khoảng 1,7 triệu bệnh nhân bị mắc nhiễm khuẩn Nhiễm khuẩn đường tiết niệu chiếm tỷ lệ cao (36%) nhiễm khuẩn vết mổ (20%), nhiễm trùng huyết viêm phổi (11%) [37] Hình 1.2 Tỷ lệ phân bố nhiễm khuẩn bệnh viện nƣớc có thu nhập cao *(nguồn WHO, 2011, Report on the Burden of Endemic Health Care-Associated Infection Worldwide) [77] Tỷ lệ nhiễm khuẩn bệnh viện quốc gia có thu nhập trung bình thấp dao động từ 5,7% đến 19,9% tỷ lệ tính chung khoảng 10,1/100 bệnh nhân (Hình 1.3) [77] Trong nhiễm khuẩn vết mổ chiếm tỷ lệ cao (29,1%), nhiễm khuẩn tiết niệu (23,9%), nhiễm khuẩn huyết (19,1%), đường hô hấp (14,8%) nhiễm khuẩn khác 13,1% [77] Hình 1.3 Tỷ lệ phân bố nhiễm khuẩn bệnh viện nƣớc có thu nhập thấp trung bình *(nguồn WHO, 2011, Report on the Burden of Endemic Health Care-Associated Infection Worldwide) [77] Có nhiều tác nhân gây nhiễm khuẩn bệnh viện tác động tác nhân khác nhóm bệnh nhân, bệnh viện, khoa điều trị quốc gia bao gồm: vi rút viêm gan B, C (lây qua đường tiêm truyền, chạy thận nhân tạo phẫu thuật nội soi) Vi rút rota vi rút đường ruột (lây truyền qua đường phân-miệng) [8, 77] Một số loại ký sinh trùng Giardia lamblia nhiều loại nấm Candida albicans, Aspergillus spp., Cryptococcus neoformans Cryptosporidium gây nhiễm trùng hội cho bệnh nhân sau điều trị kháng sinh dài ngày bệnh nhân bị suy giảm miễn dịch lây truyền dễ dàng bệnh viện [76] Hiện vi khuẩn nguyên quan trọng hàng đầu gây nhiễm khuẩn bệnh viện bao gồm C perfringen nguyên nhân gây bệnh hoại thư sinh bệnh viện [76] Vi khuẩn Gram dương điển hình S aureus (sống ký sinh da mũi) nguyên nhân gây nhiều loại nhiễm khuẩn bệnh viện viêm phổi, xương, tim nhiễm khuẩn huyết [76] Đặc biệt 10 năm vừa qua vi khuẩn Gram âm Escherichia coli (E coli), Klebsiella pneumoniae (K pneumoniae), Pseudomonas aeruginosa (P aeruginosa) Acinetobacter baumanii (A tạo áp lực chọn lọc cho A baumannii tiến hóa theo hướng riêng không giống với nơi khác giới Nghiên cứu có chủng thuộc nhóm cơng bố giới nhóm CC92 CC109 hai nhóm gây dịch bệnh giới [34] Đây phát quan trọng cho thấy bệnh viện Việt Nam xuất chủng A baumannii có nguy gây dịch đồng thời xuất chủng áp lực việc điều trị nhiễm khuẩn kháng sinh, điều trở thành áp lực lớn ngành y tế cơng tác phịng chống điều trị nhiễm khuẩn bệnh viện Đặc biệt, ta so sánh 12 chủng phân lập mang gen NDM-1 với 11 chủng âm tính với gen này, chủng mang gen NDM-1, số kiểu trình tự phát nhiều hẳn so với chủng âm tính với NDM-1 Quan trọng tất chủng thuộc novel nằm bệnh viện Xanh Pơn tìm thấy allele giống hồn tồn, điều cho thấy có mối liên hệ chủng gây nhiễm trùng bệnh viện với Bên cạnh chủng thuộc ST 302 có chủng phân lập Việt Đức chủng phân lập Xanh Pơn có allele giống nhau, thấy phải chủng có đặc trưng riêng gây nhiễm khuẩn bệnh viện Để đến kết luận xác, chi tiết cần phải tiến hành điều tra thêm yếu tố dịch tễ học lâm sàng nghiên cứu sâu kỹ thuật sinh học phân tử 3.4 Hƣớng nghiên cứu Từ lần phát vi khuẩn mang gen NDM-1, giới có nhiều cơng trình nghiên cứu loại gen kháng siêu kháng thuốc Ở Việt Nam, nhóm nghiên cứu chúng tơi tiến hành số nghiên cứu quan trọng nhóm nghiên cứu đầu tiền phát vi khuẩn mang gen NDM-1 Trong nghiên cứu này, chủng A baumannii thu thập từ năm 2010 đền năm 2014 tiến hành thử nghiệm nhiều phương pháp nghiên cứu truyền thống phương pháp sinh học phân tử đại Nghiên cứu đưa chứng có mặt vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1 kháng carbapenem ba bệnh viện Việt Đức, Thanh Nhàn, Xanh Pôn ba bệnh viện lớn Hà Nội Nghiên cứu đưa mức độ kháng thuốc chủng vi khuẩn cao nhiều nhóm kháng sinh mạnh bao gồm carbapenem, cephalosporin fluoroquinolone Các phương pháp sinh học phân tử (PCR, PFGE, Southern blotting, MLST) áp dụng vào nghiên cứu tỷ lệ A baumannii mang gen NDM-1, tính đa dang mặt kiểu gen qua nêu lên nguy kháng kháng sinh vi khuẩn áp lực ngành y tế việc nghiên cứu tìm phương pháp điều trị hiệu cho vi khuẩn kháng thuốc Tuy nhiên, nghiên cứu số hạn chế giới hạn thời gian nghiên cứu, kinh phí thực khn khổ luận văn thạc sĩ không cho phép thực toàn chuyên sâu nghiên cứu khía cạnh dịch tễ học lâm sàng sinh học phân tử Kết nghiên cứu cho thấy lượng lớn chủng A baumannii nghiên cứu âm tính với gen NDM-1, điều có nghĩa ngồi gen NDM-1 kháng lại kháng sinh nhóm carbapenem mà cịn nhiều gen khác qui định tính kháng thuốc vi khuẩn OXA 23, OXA 51, OXA 58…Do cần có thêm nghiên cứu chế kháng kháng sinh nhiều loại gen khác, qua hiểu chế tính đa dạng vi khuẩn kháng carbapenem KẾT LUẬN Tình trạng kháng kháng sinh chủng A baumannii kháng carbapenem phân lập bệnh viện Việt Đức, Thanh Nhàn, Xanh Pôn Đã phát số lượng lớn chủng vi khuẩn A baumannii (582 chủng) kháng carbapenem tổng số chủng vi khuẩn kháng carbapenem bệnh viện Việt Đức, Thanh Nhàn, Xanh Pôn thu thập năm từ năm 2010 đến 2014 Tỷ lệ bệnh nhân nhiễm A baumannii kháng carbapenem nam giới cao nhiều so với nữ giới (74%, 26%) Tỷ lệ vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1 phân lập đƣợc nghiên cứu 23/582 A baumannii kháng carbapenem có kết dương tính với gen NDM-1 chiếm tỷ lệ 3,95 % Các chủng mang gen NDM-1 phân lập bệnh nhân thuộc nhiều nhóm tuổi, cao trẻ nhỏ 10 tuổi phát bệnh viện Xanh Pôn Tỷ lệ phân lập theo giới có chênh lệch đáng kể nam giới chiếm tới 87% so với 13% nữ giới (tỷ suất chênh 6,67) Kết MIC cho thấy chủng A baumannii mang gen NDM-1 kháng lại kháng sinh với tỷ lệ cao: 95,6% với imipenem (8- 256mg/L) meropenem (8-128mg/L); 100% kháng cefotaxime (>64mg/L) ceftazidime (>32mg/L), 52,5% kháng lại ciprofloxacin (>4mg/L) Tuy nhiên 100% số chủng nhạy cảm với colistin Một số đặc tính sinh học phân tử vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1 Bốn chủng phân lập bệnh viện Xanh Pôn hai chủng phân lập bệnh viện Việt Đức có tương đồng hồn toàn kiểu gen PFGE Chủng A baumannii 1146TN phân lập bệnh viện Thanh Nhàn phát plasmid mang gen NDM-1 có kích thước khoảng 50kb Kết MLST cho thấy có chủng A baumannii mang gen NDM-1 bệnh viện Việt Đức nằm nhóm CC92 gây dịch giới, chủng cịn lại có kiểu trình tự gen khơng giống với kiểu trình tự gen cơng bố hệ thống MLST ngân hàng gen giới KIẾN NGHỊ Đối với bệnh viện Việt Đức, Thanh Nhàn, Xanh Pôn: Cần tiếp tục giám sát tình trạng vi khuẩn A baumannii mang gen NDM-1 kháng carbapenem ba bệnh viện Các bệnh viện cần mở rộng hợp tác nghiên cứu để nghiên cứu sâu đặc điểm lâm sàng, đặc điểm dịch tễ học phân tử chủng vi khuẩn mang gen NDM-1 Tài Liệu Tham Khảo Tiếng Việt GARP-Việt Nam (2010), Phân tích thực trạng: Sử dụng kháng sinh kháng kháng sinh Việt Nam, Global Antibiotic Resistance Partnership (GARP)Vietnam, Hà Nội, Việt Nam Nguyễn Thị Thanh Hà (2015), Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng vi sinh bệnh nhân nhiễm khuẩn huyết Acinetobacter baumannii, Luận án tiến sĩ y học, Viện Nghiên cứu Khoa học Y dược học Lầm sàng 108, Hà Nội Trần Huy Hoàng (2014), Một số đặc điểm dịch tễ học nhiễm khuẩn bệnh viện vi khuẩn kháng carbapenem mang gen NDM-1 bệnh viện Việt Đức-Hà Nội, 2010-2011, Luận án tiến sĩ y tế công cộng, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương, Hà Nội Nguyễn Hữu Hồng, Nguyễn Thị Vinh (2007), Sự đề kháng kháng sinh vi khuẩn, Hướng dẫn sử dụng kháng sinh, Vol 3, Nhà xuất Y học, Hà Nội Nguyễn Vũ Trung (2009), Acinetobacter, Vi khuẩn học, Nhà xuất giáo dục, Đại Học Y Khoa Hà Nội, 319 Tiếng Anh Abellanosa I., Nichter M (1996), "Antibiotic prophylaxis among commercial sex workers in Cebu City, Philippines Patterns of use and perceptions of efficacy", sex transm disease journal 23, pp 407-412 Adjepon Y., K (1980), "Drugs for the tropics their uses and abuses", Africa Health(14-16) Advani S., Reich N G., Sengupta A., Gosey L., Milstone A M (2011), "Central line-associated bloodstream infection in hospitalized children with peripherally inserted central venous catheters: Extending risk analyses outside the intensive care unit", Clinical Infectious diseases 52(9), pp 11081115 Anderson K F., Lonsway D R., Rasheed J K et al (2007), "Evaluation of methods to identify the Klebsiella pneumoniae carbapenemase in Enterobacteriaceae", Journal of Clinical Microbiology 45, pp 2723-2725 10 Andrew P T., Caleb W D., Richard E E (2003), "Attachment to and biofilm formation on abiotic surfaces by Acinetobacter baumannii: involvement of a novel chaperone-usher pili assembly system", Microbios 149, pp 3473-3484 11 Bartual, S G., Seifert H., Hippler C., Luzon M A., Wisplinghoff H., Rodriguez-Valera F (2005), "Development of a multilocus sequence typing scheme for characterization of clinical isolates of Acinetobacter baumannii", Journal of Clinical Microbiology 43, pp 4382-4390 12 Bates J., Jordens J., Griffith D T (1994), "Farm animal as putative reservoir for vancomycin resistant Enterococcal infections in man", Journal Antimicrob Chemother 35, pp 507-516 13 Bergogne-Berezin E., Towner K J (1996), "Acinetobacter spp as nosocomial pathogens: microbiological, clinical, and epidemiological features", Journal of Clinical Microbiology Rev 9, pp 148-165 14 Bojalil R., Galva J J (1994), "Antibiotic misuse in diarrhea A household survey in a Mexican community", Journal Clinical Epidemiology 47, pp 147-156 15 Brown J C., Shanahan P M., Jesudason M V., Thomson C J., Aymes S G (1996), "Mutations responsible for reduced susceptibility to 4-quinolones in clinical isolates of multi-resistant Salmonella typhi in India", Antimicrob Chemother 37, pp 891-900 16 Brown, R C (1996), "Antibiotic sensitivity testing for infections in developing countries: lacking the basics", Jama Journal 276, pp 952-953 17 Bush K., Jacoby G A (2010), "Update functional classification of βlactamases", Antimicrob Agents Chemother 54, pp 969-976 18 Callie C., Owatha L., Tatum (2010), "A Review of Acinetobacter baumannii as a Highly Successful Pathogen in Times of War", Labmedicine 41 (11), pp 650-657 19 Chopra I., Hesse L., O'Neill A (2002), "Discovery and development of new anti-bacterial drugs, in Pharmacochemistry Library", Trends in Drug Research III, ed van der Goot H., editor Amsterdam: Elsevier 32, pp 213225 20 CLSI (2010), Performance standards for antimicrobial susceptibility testing twentieth informational supplement M100-S20, Vol 30(1) 21 D’Arezzo S., Capone A., Petrosillo N et al (2009), "Epidemic multidrugresistant Acinetobacter baumannii related to European clonal types I and II in Rome (Italy)", Clinical Microbiology Infection 15, pp 347-57 22 Denis, K B (2009), Mechanisms of Antimicrobial Resistance, Springer New York, New York 23 Dua V., Kunin C M., White L V (1994), "The use of antimicrobial drugs in Nagpur, India A window on medical care in a developing country", Social Science & Medicine - Journal 38, pp 717-724 24 ECDC (2010), "Annual Epidemiological Report on Communicable Diseases in Europe", European Centre for Disease Prevention, pp 174-178 25 Enright, M C., Day N P , Davies C E., Peacock S J., Spratt B G (2000), "Multilocus sequence typing for characterization of methicillin-resistant and methicillin-susceptible clones of Staphylococcus aureus", Journal Clinical Microbiololy 38, pp 1008-1015 26 Esezobo, O E (1986), "In vitro studies on some brands of oxytetracycline capsules available in Nigeria", Nigerian Journal of Pharmacology 17, pp 24-28 27 Feil, E J., Smith J M , Enright M C., Spratt B G (2000), "Estimating recombinational parameters in Streptococcus pneumoniae from multilocus sequence typing data", Genetics 154, pp 1439-1450 28 Fournier, P E., Richet H (2006), "The epidemiology and control of Acinetobacter baumannii in health care facilities", Clinical Infectious Diseases 42, pp 692-699 29 Fu Y., Zhou J., Zhou H et al (2010), "Wide dissemination of OXA-23producing carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii clonal complex 22 in multiple cities of China", Journal Antimicrob Chemother 65, pp 644-50 30 GARP-Vietnam (2010), "Situation Analysis on Antibiotic Use and resistance in Vietnam", Global Antibiotic Resistance Partnership (GARP)-Vietnam, Hanoi, Vietnam 31 Gerischer, Ulrike (2008), "Acinetobacter Mocular Biological, International Microbiology Caister Academic Press Norfolk UK", pp 147-150 32 Giannouli M., Tomasone F., Agodi A et al (2002), "Molecular epidemiology of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii strains in intensive care units of multiple Mediterranean hospitals", Journal of Antimicrobial Chemotherapy 46, pp 2155-2161 33 Goel P., Ross-Degnan D., Berman P., Soumerai S (1996), "Retail pharmacies in developing countries: a behavior and intervention framework", Social Science & Medicine - Journal 42, pp 1155-1161 34 Guyon A B., Barman A., Ahmed J U., Ahmed A U., Alam M S (1994), "A baseline survey on use of drugs at the primary health care level in Bangladesh", Bull World Health Organ 72, pp 265-271 35 Haak, H (1988), "Pharmaceuticals in two Brazilian villages: lay practices and perceptions", Social Science & Medicine - Journal 27, pp 1415-1427 36 Jale Moradi, Farhad B., Abbas Bahador (2015), "Antibiotic Resistance of Acinetobacter baumannii in Iran: A Systemic Review of the Published Literature", Osong Public Health Res Perspect 6(2), pp 79–86 37 Klevens, R.M etal (2007), "Estimating health care associated infections and deaths in U.S hospitals, 2002", Public Health Reports 122, pp 160-166 38 Kulah C., Mooij M J., Comert F et al (2010), "Characterisation of carbapenem- resistant Acinetobacter baumannii outbreak strains producing OXA-58 in Turkey", International Journal of Antimicrobial Agents 36, pp 114-8 39 Kumarasamy K K., Toleman M A., Walsh T R., Bagaria J., Butt F., Balakrishnan R et al (2010), "Emergence of a new antibiotic resistance mechanism in India, Pakistan, and the UK: a molecular, biological, and epidemiological study", Lancet Infectious Diseases 10(9), pp 597-602 40 Kuo S C., Chang S C., Wang H Y et al (2012), "Emergence of extensively drugresistant Acinetobacter baumannii complex over 10 years: Nationwide data from the Taiwan Surveillance of Antimicrobial Resistance (TSAR) program", BMC Infectious Diseases 12, p 200 41 Land, T (1992), "Combating counterfeit drugs", Nature 355, p 192 42 Laurent Poirel, Patrice Nordmann (2008), "Acinetobacter baumannii: Mechanisms of Resistance, Multiple ß-Lactamases Acinetobacter Biology and Pathogenesis", Springer, Temple University School of Medicine Philadelphia, pp 129-144 43 Lee Y., Yum J H., Kim C K et al (2010), "Role of OXA-23 and AdeABC Efflux Pump for Acquiring Carbapenem Resistance in an Acinetobacter baumannii Strain Carrying the blaOXA-66 Gene", Annals of Clinical & Laboratory Science 40 (1), pp 43-48 44 Lim S., Mark A T., Janis L W.,Robin A H.,Timothy R W.,Karthikeyan K K (2014), "Plasmid Carriage of blaNDM-1 in Clinical Acinetobacter baumannii Isolates from India", Antimicrob Agents Chemother 58(7), pp 4211–4213 45 McGregor, A (1997), "Counterfeit drugs flood developing world", Lancet 350, p 1690 46 Michelle Lowings, Marthie Magdaleen Ehlers, Andries William Dreyer, Marleen Magdalena Kock (2015), "High prevalence of oxacillinases in clinical multidrug-resistant Acinetobacter baumannii isolates from the Tshwane region, South Africa – an update", BMC Infectious Diseases 15, p 521 47 Mugnier P D., Poirel L., Naas T et al (2010), "Worldwide Dissemination of the blaOXA-23 Carbapenemase Gene of Acinetobacter baumannii", Emerging Infectious Diseases 16 (1), pp 35-40 48 Nemec A., Křížová L., Maixnerová M et al (2009), "Emergence of carbapenem resistance in Acinetobacter baumannii in the Czech Republic is associated with the spread ", Journal Antimicrob Chemother 62, pp 484489 49 Nizami S Q., Khan I A., Bhutta Z A (1996), "Drug prescribing practices of general practitioners and paediatricians for childhood diarrhoea in Karachi, Pakistan", Social Science & Medicine - Journal 42, pp 1133-1139 50 Nordmann P., Dortet L., Poirel L (2012), "Carbapenem resistance in Enterobacteriaceae: here is the storm", Trends in Molecular Medicine 18 (5), pp 263-272 51 Okeke I., Lamikanra A (1995), "Quality and bioavailability of tetracycline capsules in a Nigerian semi-urban community", International Journal of Antimicrobial Agents 5, pp 245-250 52 Paredes P., Pena M., Flores-Guerra E., Diaz J., Trostle J (1996), "Factors influencing physicians’ prescribing behavior in the treatment of childhood diarrhoea: knowledge may not be the clue", Social Science & Medicine Journal 42, pp 1141-1153 53 Park Y K., Lee G H., Baek J Y et al (2010), "A single clone of Acinetobacter baumannii, ST22, is responsible for high antimicrobial resistance rates of Acinetobacter spp isolates that cause bacteremia and urinary tract infections in Korea", Microbial Drug Resistance 16, pp 143-9 54 Peleg A Y., Hooper D C (2010), "Hospital-Acquired Infections Due to Gram-Negative Bacteria", New England Journal of Medicine 362(19), pp 1804-1813 55 Peleg A Y., Hooper D C (2010), "Hospital-Acquired Infections Due to Gram-Negative Bacteria", New England Journal of Medicine 362 (19), pp 1804-1813 56 Peleg A Y., Seifert H., Paterson D L (2008), "Acinetobacter baumannii: Emergence of a Successful Pathogen", Clinical Microbiology Reviews 21 (3), pp 538-582 57 Perez F., Hujer A M., Hujer K M (2007), "Global Challenge of MultidrugResistant Acinetobacter baumannii", Antimicrobiol Agents and Chemotherapy American Society for Microbiology 51 (10), pp 3471-3484 58 Pierre E F., Herve´ Richet (2006), "The Epidemiology and Control of Acinetobacter baumannii in Health Care Facilities", Clinical Infectious Diseases 42, p 692 59 Prashanth K., Vasanth T., Saranathan R (2012), "Antibiotic Resistance, Biofilms and Quorum Sensing in Acinetobacter Species, Antibiotic Resistant Bacteria - A Continuous Challenge in the New Millennium", www.intechopen.com, Acceess on 15 Feb 2012 60 Report, ECDC Technical (2011), "Updated ECDC risk assessment on the spread of New Delhi metallo-β-lactamase (NDM) and its variants within Europe" 61 Rice, L B (2009), "The clinical consequences of antimicrobial resistance", Current Opinion in Microbiology 12, pp 476-481 62 Rustam, I A (2010), "A brief history of the antibiotic era: lessons learned and challenges for the future", Front Microbiology 1(134), pp 1-7 63 Schouten M A., Voss A., Hoogkamp-Korstanje J A A (1997), "VRE and meat", Lancet 349, p 1258 64 Struelens M J., Monnet D L., Magiorakos A P., Santos O'Connor F., Giesecke J (2010), "New Delhi metallo-β-lactamase 1-producing Enterobacteriaceae: emergence and response in Europe", Euro Surveill 15(46), p 19716 65 Taylor R B., Shakoor O., Behrens R H (1995), "Drug quality, a contributor to drug resistance?", Lancet 346, p 122 66 Tenover (2006), "Mechanisms of Antimicrobial Resistance in Bacteria", The American Journal of Medicine 119 (6), pp 3-10 67 Thamarai Schneiders, Jacqueline Findlay et al (2008), "Efflux Pumps in Acinetobacter baumannii, Acinetobacter Biology and Pathogenesis", Springer.com, pp 105 - 128 68 Tikhomirov, E (1987), "Programme for the Control of Hospital Infections", Chemiotherapia 3, pp 148-151 69 Villegas, M V., Hartstein A I (2003), "Acinetobacter outbreaks, 19772000", Infect Control Hosp Epidemiology 24, pp 284-295 70 Wain J., Hoa N T., Chinh N T., Vinh H., Everett M J., Diep T S et al (1997), "Quinolone-resistant Salmonella typhi in Viet Nam: molecular basis of resistance and clinical response to treatment", Clin Infect Dis 25(6), pp 1404-1410 71 Walsh, T R (2003), "Section III: Antibiotic Resistance, In: Antibiotics: Action, Origins, Resistance", American Society for Microbiology, pp 89155 72 Walsh T R., Weeks J., Livermore D M., Toleman M A (2011), "Dissemination of NDM-1 positive bacteria in the New Delhi environment and its implications for human health: an environmental point prevalence study", Lancet 11(5), pp 355-62 73 Wegener H C., Aarestrup F M., Jensen L B et al (1999), "Use of antimicrobial growth promoter in food animals and Enterococcus faecium resistance to therapeutic antimicrobial drugs in Europe", Emerging Infectious Disease 5, pp 329-332 74 Weinberg J., Grimaud O., Newton L (1999), "Establishing priorities for European collaboration in communicable disease surveillance", European Journal of Public Health 9, pp 236-240 75 Willey J., Sherwood L., Woolverton C (2008), Prescott’s Principles of Microbiology, New York: McGraw-Hil 76 World Health Organization (2002), "Prevention of Hospital Acquired Infections A Practical Guide, 2nd ed Geneva: WHO Press" 77 World Health Organization (2011), Report on the Burden of Endemic Health Care-Associated Infection Worldwide 78 Yokoe D S., Mermel L A., Anderson D J et al (2008), " A compendium of strategies to prevent healthcare-associated infections in acute care hospitals", Infection Control & Hospital Epidemiology 29, pp 12-21 79 Yong D., Toleman M A., Giske C G., Cho H S., Sundman K., Lee K., Walsh T R (2009), "Characterization of a new metallo-beta-lactamase gene, bla (NDM-1), and a novel erythromycin esterase gene carried on a unique genetic structure in Klebsiella pneumoniae sequence type 14 from India", Antimicrob Agents Chemother 53 (12), pp 5046-5054 ... bố theo giới chủng A baumannii kháng carbapenem bệnh viện (n=582) Tỷ lệ bệnh nhân nam nhiễm khuẩn bệnh viện vi khuẩn A baumannii kháng carbapenem cao nhiều so với bệnh nhân nữ bệnh viện (Hình 3.3)... khuẩn bệnh viện mang gen NDM-1 kháng carbapenem? ?? với mục tiêu: Mục tiêu chung: Mô tả thực trạng kháng kháng sinh số đặc điểm sinh học phân tử chủng vi khuẩnA baumannii kháng carbapenem bệnh viện. .. sinh bệnh viện Ngoài ra, bệnh nhân điều trị dài ngày bệnh viện có sức đề kháng yếu, thường sử dụng kháng sinh kéo dài dễ bị nhiễm khuẩn chéo với chủng vi khuẩn kháng đa kháng sinh bệnh viện Nhiễm