Đang tải... (xem toàn văn)
sinh học phân tử
260 MỤC LỤC Trang LỜI NÓI ĐẦU Chương 1. CÁC ĐẠI PHÂN TỬ SINH HỌC 5 I. Nucleic acid 5 1. Deoxyribonucleic acid 5 2. Ribonucleic acid 9 II. Protein 13 1. Cấu trúc của protein 13 2. Chức năng của protein 19 III. Lipid 22 IV. Polysaccharide 24 Tài liệu tham khảo/đọc thêm 25 Chương 2. CẤU TRÖC GENOME 26 I. Các thành phần và đặc điểm của genome 27 1. Genome của cơ quan tử 28 2. Động học của phản ứng lai DNA 32 3. Kích thước của genome 34 4. Tổng số gen được biết ở một số loài eukaryote 35 II. Tính phức tạp của genome 37 III. Thay đổi trật tự của các đoạn DNA trong genome- Transposons. 40 1. Sự thay đổi trật tự của các đoạn DNA trong genome 40 2. Các transposons 41 IV. Tương tác của T-DNA với genome thực vật 45 1. Ti-plasmid và Ri-plasmid 46 2. T-DNA 46 261 3. Vùng vir 46 4. Quá trình chuyển T-DNA vào tế bào thực vật 47 V. Sắp xếp và khuếch đại các gen trong genome 49 1. Sắp xếp lại các gen 49 2. Khuếch đại các gen 54 3. Biến nạp gen 55 Tài liệu tham khảo/đọc thêm 56 Chương 3. CẤU TRÖC VÀ CHỨC NĂNG CỦA GEN 57 I. Định nghĩa gen 57 II. Lý thuyết trung tâm 59 1. Sự xác định di truyền cấu trúc bậc 1 của protein 59 2. Các enzyme mất hoạt tính do đột biến 59 3. Bản chất các biến đổi di truyền của protein 59 4. Sự tương quan đồng tuyến tính gen-polypeptide 61 5. Lý thuyết trung tâm của sinh học phân tử 65 6. DNA và mã di truyền 67 III. Cấu trúc và chức năng của gen 68 1. Cấu trúc gen 68 2. Sự phân chia nhỏ của gen 71 3. Thử nghiệm chức năng allele 73 4. Gen là đơn vị chức năng nhỏ nhất 74 Tài liệu tham khảo/đọc thêm 75 Chương 4. TÁI BẢN DNA 76 I. Chứng minh tái bản DNA theo cơ chế bán bảo thủ 76 1. Cơ chế tái bản bán bảo thủ 76 2. Thí nghiệm của Meselson và Stahl 77 II. Mô hình tái bản DNA-chạc ba tái bản 78 262 1. Mô hình tái bản 78 2. Chạc ba tái bản 78 3. Tái bản DNA theo vòng tròn quay 81 III. Bản chất xoắn của DNA-Các giai đoạn của sự tái bản 82 1. Mở xoắn 82 2. Kéo dài-Tổng hợp chuỗi Okazaki 83 3. Kết thúc 84 IV. Khái niệm mồi 84 V. Enzyme tái bản 87 1. DNA polymerase 87 2. Các topoisomer và DNA topoisomerase 89 3. Helicase và protein SSB 90 4. DNA ligase 92 Tài liệu tham khảo/đọc thêm 94 Chương 5. PHIÊN MÃ 95 I. Các đặc điểm cơ bản của quá trình phiên mã 95 1. Sự phiên mã tạo ra RNA bổ sung với một sợi DNA 95 2. Sự phiên mã là một phản ứng enzyme 96 3. Sự phiên mã chỉ sao chép chọn lọc một số phần của genome và tạo ra nhiều bản sao 96 4. Chỉ một trong hai sợi đơn của phân tử DNA được dùng làm khuôn mẫu 96 5. Sự phiên mã được khởi phát không cần mồi 97 II. Các giai đoạn của quá trình phiên mã 97 1. Giai đoạn khởi đầu 97 2. Giai đoạn kéo dài 98 3. Giai đoạn kết thúc 98 III. Phiên mã ở prokaryote 98 263 1. Enzyme RNA polymerase ở prokaryote 98 2. Promoter của gen ở prokaryote 99 3. Vai trò của enzyme RNA polymerase và promoter trong quá trình phiên mã 99 4. Tín hiệu kết thúc 101 IV. Quá trình phiên mã ở eukaryote 102 1. Cấu trúc gen ở eukaryote 102 2. Enzyme RNA polymerase của eukaryote 103 3. Các yếu tố giúp RNA polymerase khởi đầu phiên mã 104 4. Các yếu tố kích thích RNA polymerase II hoạt động trong giai đoạn kéo dài 107 5. Quá trình biến đổi các RNA mới được tổng hợp 108 V. Phiên mã ngược 110 Tài liệu tham khảo/đọc thêm 114 Chương 6. DỊCH MÃ 115 I. Mã di truyền 115 1. Các codon 2. Các quy tắc chi phối mã di truyền 115 116 II. Các ribosome 116 1. Thành phần cấu tạo của ribosome 116 2. Khái niệm polyribosome 117 3. Các vị trí gắn tRNA trên ribosome 118 4. Các kênh của ribosome 118 III. Sự hình thành aminoacyl-tRNA 119 1. Bản chất của sự gắn amino acid vào tRNA 119 2. Sự nhận diện và gắn amino acid vào tRNA 119 3. Tính đặc hiệu của aminoacyl-tRNA synthetase 119 4. Phân loại aminoacyl-tRNA synthetase 120 IV. Các giai đoạn của quá trình dịch mã 120 264 1. Giai đoạn khởi đầu 120 2. Giai đoạn kéo dài 125 3. Giai đoạn kết thúc 128 V. Các nhân tố ức chế dịch mã 130 Tài liệu tham khảo/đọc thêm 132 Chương 7. SỬA CHỮA VÀ BẢO VỆ DNA 134 I. Khái quát về các cơ chế sửa sai 135 1. Các biến đổi xảy ra trên phân tử DNA 135 2. Khái quát các cơ chế sửa chữa ở mức phân tử 137 3. Biến đổi làm tăng tần số đột biến 137 II. Các kiểu sửa chữa 138 1. Quang tái hoạt hóa 138 2. Sửa chữa ghép đôi lệch 138 3. Sửa chữa cắt bỏ 141 4. Đọc sửa đối với các base bắt cặp sai 143 5. Các hệ thống sửa chữa tái tổ hợp 143 6. Hệ thống SOS 146 III. Bảo vệ DNA: Hệ thống cắt hạn chế (R)-biến đổi (M) 150 1. Các methylase của R-M 151 2. Adenine và cytosine methyltransferase ở E.coli 152 3. Sự methyl hóa DNA của eukaryote 153 Tài liệu tham khảo/đọc thêm 153 Chương 8. ĐIỀU HÕA BIỂU HIỆN GEN 155 I. Các hiện tượng điều hòa 156 1. Điều hòa thích nghi 156 2. Hoạt động nối tiếp của các gen 156 3. Biệt hóa tế bào 156 265 4. Khái quát về điều hòa ở prokaryote và eukaryote 157 II. Các mức độ điều hòa 160 1. Mức độ chất nhiễm sắc 160 2. Mức độ phiên mã 160 3. Mức độ hậu phiên mã 161 4. Mức độ dịch mã 161 5. Mức độ hậu dịch mã 161 III. Điều hòa biểu hiện gen ở prokaryote 162 1. Cấu trúc của promoter 163 2. Cấu trúc của operon 163 3. Điều hòa thoái dưỡng: Kiểm soát âm-cảm ứng 164 4. Điều hòa biến dưỡng: Kiểm soát âm-ức chế 165 5. Kiểm soát dương và cảm ứng 170 IV. Điều hòa hoạt tính của eukaryote 171 1. Các promoter 172 2. Các enhancer 172 3. Các protein là nhân tố có tác động trans 172 4. Hormone 175 5. Kiểm soát các chất thường gặp trong nhân 175 V. Sự biệt hóa tế bào 176 1. Các tế bào biệt hóa mang thông tin giống nhau 176 2. Các tế bào biệt hóa tổng hợp các nhóm protein khác nhau 177 3. Sự điều hòa ở mức phiên mã là nguồn gốc căn bản của các sai khác giữa những tế bào biệt hóa 179 Tài liệu tham khảo/đọc thêm 180 Chương 9. CÔNG NGHỆ DNA TÁI TỔ HỢP 181 I. Mở đầu 181 1. Tác động của công nghệ DNA tái tổ hợp 181 266 2. Làm việc ở mức độ phân tử 182 II. Endonuclease hạn chế 183 1. Gắn các đầu bị cắt bởi enzyme hạn chế 186 2. Isochizomer 186 III. Phương thức tạo dòng 188 1. Plasmid vector 188 2. Bacteriophage vector 192 3. Cosmid vector 193 4. Thư viện cDNA 195 5. Thư viện genomic DNA 196 IV. Biểu hiện gen ngoại lai trong vi khuẩn 197 1. Các protein nguyên thể tái tổ hợp 198 2. Các protein dung hợp tái tổ hợp 201 3. Xác định mức độ biểu hiện của gen được tạo dòng 203 V. Phương pháp phát hiện dòng vi khuẩn có DNA tái tổ hợp 204 1. Lai khuẩn lạc và vết tan 204 2. Sàng lọc thư viện gen bằng PCR 206 3. Sàng lọc các thư viện cDNA bằng các probe khác nhau 208 4. Phân tích genomic DNA bằng phương pháp lai Southern 209 VI. Các ứng dụng của công nghệ DNA tái tổ hợp 211 1. Ứng dụng trong dược phẩm 211 2. Các vi khuẩn đặc biệt 212 3. Các sản phẩm nông nghiệp 212 4. Thuốc oligonucleotide 213 5. Liệu pháp gen 214 6. Chẩn bệnh để can thiệp sớm 214 7. DNA fingerprinting 215 8. Lập bản đồ gen 216 Tài liệu tham khảo/đọc thêm 217 267 Phụ lục. MỘT SỐ THUẬT NGỮ CƠ BẢN 218 Tài liệu tham khảo 259 MỤC LỤC 260 . 260 MỤC LỤC Trang LỜI NÓI ĐẦU Chương 1. CÁC ĐẠI PHÂN TỬ SINH HỌC 5 I. Nucleic acid 5 1. Deoxyribonucleic. T-DNA với genome thực vật 45 1. Ti-plasmid và Ri-plasmid 46 2. T-DNA 46 261 3. Vùng vir 46 4. Quá trình chuyển T-DNA vào tế bào thực vật 47 V. Sắp