BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM TP HỒ CHÍ MINH Phạm Thị Hoài An KHẢO SÁT SỰ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA KLEBSIELLA PNEUMONIAE TẠI VIỆN PASTEUR TP HỒ CHÍ MINH LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC Thành phố Hồ Chí Minh – 2014 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM TP HỒ CHÍ MINH Phạm Thị Hoài An KHẢO SÁT SỰ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA KLEBSIELLA PNEUMONIAE TẠI VIỆN PASTEUR TP HỒ CHÍ MINH Chuyên ngành: Vi sinh vật học Mã số: 60 42 01 07 LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS CAO HỮU NGHĨA Thành phố Hồ Chí Minh – 2014 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan công trình nghiên cứu riêng Các số liệu kết nêu luận văn trung thực chưa công bố công trình khác Tác giả Phạm Thị Hoài An LỜI CẢM ƠN Để hoàn thành tốt khóa luận tốt nghiệp này, em nhận hướng dẫn, hỗ trợ, giúp đỡ tận tình thầy cô, anh chị, gia đình bạn Xin gửi lời cảm ơn chân thành đến Ban giám hiệu thầy cô Khoa Sinh – Trường Đại học Sư Phạm Thành phố Hồ Chí Minh giúp em có sở lí luận kỹ nghiên cứu khoa học vững Ban Giám đốc Viện Pasteur đặc biệt TS Cao Hữu Nghĩa, Trưởng khoa Xét nghiệm Sinh học Lâm sàng - Viện Pasteur Tp HCM tạo điều kiện sở vật chất tốt nhất, tận tâm hướng dẫn giúp đỡ em suốt thời gian thực khóa luận ThS Vũ Lê Ngọc Lan, ThS Uông Nguyễn Đức Ninh Cô, Anh Chị Phòng Vi sinh Bệnh Phẩm, khoa Xét nghiệm Sinh học Lâm sàng - Viện Pasteur Tp HCM hết lòng dẫn, đóng góp ý kiến đồng hành, tạo điều kiện thuận lợi cho em học tập, làm việc thu thập số liệu phòng để em thực khóa luận Cuối cùng, em muốn gửi lời cảm ơn đến tất người thân gia đình, người bên cạnh ủng hộ em Mong cho điều tốt đẹp đến với người Em xin hết lòng cảm ơn Tác giả Phạm Thị Hoài An MỤC LỤC Trang Lời cam đoan Lời cảm ơn Mục lục Danh mục chữ viết tắt Danh mục bảng Danh mục hình - sơ đồ - biểu đồ MỞ ĐẦU Chương TỔNG QUAN 1.1 Klebsiella pneumoniae .4 1.1.1 Đặc điểm vi sinh học 1.1.1.1 Hình thái cấu trúc 1.1.1.2 Cấu trúc kháng nguyên .4 1.1.1.3 Cấu trúc gen .5 1.1.1.4 Tính chất nuôi cấy 1.1.1.5 Tính chất hóa sinh 1.1.2 Khả gây bệnh 1.1.2.1 Cơ chế gây bệnh .6 1.1.2.2 Biểu lâm sàng 1.1.3 Chẩn đoán vi sinh vật .6 1.1.4 Phòng bệnh điều trị 1.2 Kháng sinh chế tác động kháng sinh 1.2.1 Định nghĩa kháng sinh 1.2.2 Phân loại kháng sinh .7 1.2.2.1 Dựa vào khả tác dụng 1.2.2.2 Dựa vào phổ tác dụng .8 1.2.2.3 Dựa vào nguồn gốc 1.2.2.4 Dựa cấu trúc hóa học .9 1.2.2.5 Dựa vào chế tác dụng kháng sinh .11 1.3 Cơ chế tác động kháng kháng sinh 11 1.4 Cơ chế kháng kháng sinh 14 1.4.1 Bản chất di truyền tính đề kháng phương thức chuyển tải gen 14 1.4.1.1 Đề kháng tự nhiên 15 1.4.1.2 Đề kháng mắc phải 15 1.4.2 Cơ chế kháng kháng sinh 16 1.4.2.1 Tạo enzyme phân hủy kháng sinh làm bất hoạt kháng sinh 17 1.4.2.2 Thay đổi tính thấm tế bào vi khuẩn 20 1.4.2.3 Thay đổi cấu trúc receptor kháng sinh làm giảm gắn kết kháng sinh với điểm tiếp nhận 21 1.4.2.4 Bơm đẩy 22 1.4.3 Cơ chế kháng số nhóm kháng sinh vi khuẩn Gram âm 22 1.4.3.1 Kháng Penicillin Cephalosporin 22 1.4.3.2 Kháng Carbapenemes .23 1.4.3.3 Kháng Aminoglycoside 23 1.4.3.4 Kháng Fuoroquinolones 24 1.4.3.5 Kháng Tetracyclin 24 1.4.3.6 Kháng Sulfonamid 24 1.5 Tình hình kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae giới nước 25 1.5.1 Trên giới 25 1.5.1 Tại Việt Nam 29 Chương ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 32 2.1 Đối tượng nghiên cứu .32 2.1.1 Đối tượng 32 2.1.2 Cỡ mẫu 32 2.1.3 Thời gian nghiên cứu 32 2.1.4 Địa điểm thực đề tài 33 2.2 Phương pháp nghiên cứu 33 2.2.1 Vật liệu 33 2.2.2 Phương pháp thực 36 2.2.2.1 Nuôi cấy vi khuẩn từ bệnh phẩm: đàm, mủ, máu, dịch não tủy, nước tiểu .39 2.2.2.2 Nhuộm Gram: xác định vi khuẩn Gram âm 42 2.2.2.3 Dùng thử nghiệm sinh hóa để định danh Klebsiella pneumoniae 43 2.2.2.4 Làm kháng sinh đồ theo phương pháp Kirby- Bauer .47 2.2.2.5 Thử nghiệm đĩa đôi 50 2.2.2.6 Thử nghiệm Hodge test 51 2.2.2.7 Phương pháp PCR phát gen kháng kháng sinh 52 Chương KẾT QUẢ VÀ BÀN LUẬN .57 3.1 Đặc tính mẫu 57 3.1.1 Đặc tính giới tính bệnh nhân .57 3.1.2 Đặc tính tuổi bệnh nhân 57 3.2 Sự phân bố vi khuẩn Klebsiella pneumoniae loại bệnh phẩm 58 3.3 Khảo sát mức độ kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae 59 3.4 Tỉ lệ Klebsiella pneumoniae sinh β-lactamase phổ rộng 63 3.5 Tỉ lệ Klebsiella pneumoniae sinh carbapenemase 67 3.6 Kết PCR 68 3.6.1 Gen CMY-2 69 3.6.2 Gen bla OXA -1 72 3.6.3 Gen bla NDM-1 75 3.6.4 Gen bla IMP .78 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 81 TÀI LIỆU THAM KHẢO 82 PHỤ LỤC DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT AM Ampicilline AMC Amoxiclline/clavalanic acid AN Amikacine BHI Brain Heart Infusion CA Chocolate Agar + Polyvitex CAZ Caftazidime CDC Centers for Disease Control and Prevention - Trung tâm kiểm soát phòng ngừa dịch bệnh Hoa Kì CFU Colony Forming Unit - Đơn vị tạo khuẩn lạc CIP Ciprofloxacine CN Cephalexine CLSI Clinical and Laboratory Standard Institute - Viện tiêu chuẩn Lâm sàng Xét nghiệm CS Colistin CO Columbia Agar + 5% máu cừu ADN Acid đeoxyribonucleic DNT Dịch não tủy EPM Etapenem ESBL Extended Spectrum Beta Lactamase - β - lactamase phổ rộng EP Nước muối sinh lý vô trùng FT Nitrofurantoin I Intermediate - Trung tâm ISO International Organization for Standardiazation - Tổ chức tiêu chuẩn hóa quốc tế IPM Imipenem KPC Klebsiella pneumoniae Carbapenemase LPS Lipopolysaccharide MHA Mueller Hinton Agar MBL Metallo- β -lactamase MPM Meropenem MEC Mecillinam mARN messenger RNA NET Netilmicine PBP Penicillin-binding protein PIP Piperacilline R Resistant - Đề kháng ARN Acid ribonucleic S Susceptibility - nhạy cảm SXT Trimethoprim+Sulfamethoxazole TE Tetracyline TSA Tryptic Soy Agar UDP Uridindiphosphat WHO World Health Organization - Tổ chức y tế giới DANH MỤC CÁC BẢNG Trang Bảng 1.1 Lớp, phân lớp kháng sinh beta lactam…………………………………… Bảng 1.2 Phân loại enzyme beta-lactamase theo Ambler………………………… 18 Bảng 1.3 Phân loại enzyme β-lactamase theo Karen Bush……………………… 18 Bảng 2.1 Thang điểm Barlett dùng đánh giá mẫu đàm…………………………… 39 Bảng 2.2 Các đoạn mồi dùng PCR phát gen kháng kháng sinh……… 53 Bảng 2.3 Các thành phần phản ứng PCR………………………………… 54 Bảng 2.4 Chu trình nhiệt cho gen mục tiêu………………………………… 55 Bảng 3.1 Tỉ lệ nhiễm Klebsiella pneumoniae theo giới tính……………………… 57 Bảng 3.2 Tỉ lệ nhiễm Klebsiella pneumoniae theo độ tuổi……………………… 58 Bảng 3.3 Tỉ lệ Klebsiella pneumoniae phân lập từ loại bệnh phẩm…………… 59 Bảng 3.4 Tính nhạy cảm kháng sinh Klebsiella pneumoniae………………… 60 Bảng 3.5 So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh với nghiên cứu trước……………… 61 Bảng 3.6 Tỷ lệ đa kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae… 63 Bảng 3.7 Kết số nghiên cứu Klebsiella pneumoniae sinh ESBL……64 Bảng 3.8 Tỉ lệ Klebsiella pneumoniae sinh ESBL theo mẫu bệnh phẩm………… 64 Bảng 3.9 Tỉ lệ Klebsiella pneumoniae sinh ESBL kháng với kháng sinh……….65 Bảng 3.10 Tỉ lệ Klebsiella pneumoniae sinh carbapenemase……………………… 67 Bảng 3.11 Tỉ lệ Klebsiella pneumoniae sinh carbapenemase theo mẫu bệnh phẩm…67 Bảng 3.12 Kết PCR phát gen kháng kháng sinh……………………… 68 Bảng 3.13 Kết điện di gen CMY-2…………………………………………… 70 Bảng 3.14 Kết điện di gen bla OXA-1 ………………………………………………71 Bảng 3.15 Kết điện di gen bla NDM-1 ………………………………………… .74 11 Nitrofurans Phối hợp Nitrofurantoin FT 300µg ≤14 15-16 ≥17 Trimethoprim/sulf SXT 1,25/ - - - amethoxazol 23,75µg 12 PHỤ LỤC Mã số 35 chủng Klebsiella pneumoniae khảo sát Bảng Mã số 35 chủng Klebsiella pneumoniae khảo sát STT Lab code SID Giới Năm sinh Tuổi Bệnh phẩm 278 1514 Nam 1960 52 Đàm 661 6165 Nam 1954 58 Đàm 776 9943 Nam 1966 46 Mủ 815 1597 Nam 1932 80 Đàm 3181 Nam 2012 Nước tiểu 78 5053 Nam 1939 73 Máu 400 4475 Nam 1960 53 Mủ 796 5413 Nam 1963 50 Đàm 309 6699 Nam 1992 21 Mủ 10 334 7348 Nam 1983 30 Đàm 11 391 1459 Nam 1938 75 Đàm 12 24 8854 Nam 1977 36 Mủ 13 268 4365 Nam 1968 45 Mủ 14 363 8908 Nam 1969 44 Nước tiểu 15 364 8909 Nữ 1987 26 Nước tiểu 16 452 6679 Nam 1974 39 Nước tiểu 17 508 8680 Nam 1960 53 Mủ 18 510 8679 Nữ 1942 71 Máu 19 521 9409 Nam 1960 53 Mủ 20 675 5602 Nữ 1942 71 Mủ 21 721 8175 Nam 1948 65 Đàm 22 824 4749 Nam 2013 Nước tiểu 23 189 3257 Nam 1955 58 Đàm 24 982 6655 Nam 1930 84 Đàm 25 19 7931 Nữ 1954 60 Đàm 13 26 80 1401 Nam 1982 32 Đàm 27 513 8819 Nam 1971 43 Nước tiểu 28 784 2744 Nữ 1974 40 Đàm 29 637 5251 Nam 1979 35 Mủ 30 812 5818 Nam 1962 52 Mủ 31 14 5260 Nữ 1991 23 Mủ 32 130 8904 Nữ 1934 80 Nước tiểu 33 208 3079 Nam 1963 51 Mủ 34 217 3117 Nữ 1945 69 Nước tiểu 35 274 5131 Nữ 1945 69 Nước tiểu 14 PHỤ LỤC Kết kháng sinh đồ 35 chủng Klebsiella pneumoniae khảo sát Bảng Kết kháng sinh đồ 35 chủng Klebsiella pneumoniae khảo sát STT Số Lab Giới Năm Bệnh sinh phẩm Kết KSĐ AM:R - AMC:S - AN:S - CAZ:S - 278 Nam 1960 Đàm CIP:R - CN:S - CS:S - FT:S GM:S - MEC:S - NET:S - PIP:S SXT:S - TE:S AM:R - AMC:S - AN:S - ATM:R CAZ:R - CIP:R - CN:R - CS:R - 661 Nam 1954 Đàm FT:R - IPM:S - MEC:S - NET:S PEF:R - PIP:R - S:I - SXT:R TCC:R - TE:R AM:R - AMC:I - AN:S - ATM:R CAZ:I - CIP:I - CN:R - CS:S - 776 Nam 1966 Mủ FT:S - IPM:S - MEC:I - NET:S PEF:S - PIP:R - S:R - SXT:R TCC:R - TE:R AM:R - AMC:I - AN:R - ATM:R CAZ:R - CIP:R - CN:R - CS:S - 815 Nam 1932 Đàm FT:R - IPM:S - MEC:R - NET:R PEF:R - PIP:R - S:R - SXT:R TCC:R - TE:R AM:R - AMC:S - AN:I - CAZ:R - Nam 2012 Nước tiểu CIP:I - CN:R - CS:S - FT:S GM:R - MEC:S - NET:R - PIP:R SXT:S - TE:S - 78 Nam 1939 Máu AM:R - AMC:S - AN:S - ATM:S - 15 CAZ:S - CIP:S - CN:I - CS:S FT:R - GM:S - IPM:S - MEC:S MEM:S - NET:S - PIP:R - SXT:S TCC:R - TE:S AM:R - AMC:I - AN:R - ATM:R CAZ:R - CIP:R - CN:R - CS:S 400 Nam 1960 Mủ FT:R - GM:R - IPM:S - MEC:R MEM:S - NET:R - PIP:R - SXT:R - TE:R AM:R - AMC:S - AN:S - CAZ:S - 796 Nam 1963 Đàm CIP:S - CN:R - CS:S - FT:S GM:S - MEC:R - NET:S - PIP:R SXT:R - TE:S AM:R - AMC:S - AN:S - CAZ:S - 309 Nam 1992 Mủ CIP:S - CN:S - CS:S - FT:S GM:S - MEC:S - NET:S - PIP:I SXT:R - TE:S AM:R - AMC:S - AN:S - CAZ:S - 10 334 Nam 1983 Đàm CIP:S - CN:S - CS:S - FT:R GM:S - MEC:R - NET:S - PIP:S SXT:R - TE:S AM:R - AMC:S - AN:S - CAZ:S - 11 391 Nam 1938 Đàm CIP:S - CN:S - CS:S - FT:S GM:S - MEC:S - NET:S - PIP:S SXT:I - TE:S AM:S - AMC:S - AN:R - CAZ:S - 12 24 Nam 1977 Mủ CIP:S - CN:S - CS:S - FT:R GM:S - MEC:S - NET:S - PIP:S SXT:S - TE:S - 16 AM:R - AMC:R - AN:S - ATM:R CAZ:R - CIP:R - CN:R - CS:S 13 268 Nam 1968 Mủ FT:R - GM:S - IPM:R - MEC:R MEM:R - NET:S - PIP:R - SXT:R - TCC:R - TE:R AM:I - AMC:S - AN:S - CAZ:S - 14 363 Nam 1969 Nước tiểu CIP:S - CN:S - CS:S - FT:R GM:S - MEC:S - NET:S - PIP:S TE:S AM:R - AMC:S - AN:S - CAZ:S - 15 364 Nữ 1987 Nước tiểu CIP:S - CN:I - CS:S - FT:S - GM:S - MEC:S - NET:S - PIP:S - TE:S AM:R - AMC:S - AN:S - CAZ:S - 16 452 Nam 1974 Nước tiểu CIP:S - CN:S - CS:S - FT:S GM:S - MEC:S - NET:S - PIP:S TE:S AM:R - AMC:R - AN:S - ATM:R CAZ:R - CIP:S - CN:R - CS:S - 17 508 Nam 1960 Mủ FT:R - GM:S - IPM:S - MEC:S MEM:S - NET:S - PIP:R - SXT:R TCC:R - TE:S AM: R - AMC: R - AN: R - CAZ: 18 510 Nữ 1942 Máu R - CIP: R - CN: R - CS: S - FT: R - GM: R - MEC: R - NET: R PIP: R - SXT: R - TE: R AM:R - AMC:R - AN:S - ATM:R - 19 521 Nam 1960 Mủ CAZ:R - CIP:S - CN:R - CS:S FT:R - GM:S - IPM:S - MEC:S MEM:I - NET:S - PIP:R - SXT:R - 17 TCC:R - TE:S AM: R - AMC: R - AN: R - ATM: R - CAZ: R - CIP: R - CN: R - CS: 20 675 Nữ 1942 Mủ S - FT: R - GM: R - IPM: S MEC: R - MEM: S - NET: R - PIP: R - SXT: R - TCC: R - TE: R AM: R - AN: R - ATM: R - CAZ: R - CIP: R - CN: R - CS: S - FT: R 21 721 Nam 1948 Đàm - GM: R - IPM: S - MEC: R MEM: S - NET: R - PIP: R - TCC: R - TE: S AM: R - AMC: R - AN: S - CAZ: 22 824 Nam 2013 R - CIP: S - CN: R - CS: S - FT: S Nước tiểu - GM: S - MEC: S - NET: S - PIP: R - SXT: R - TE: S AM: R - AMC: S - AN: S - CAZ: S 23 189 Nam 1955 Đàm - CIP: S - CN: S - CS: S - FT: S GM: S - MEC: S - NET: S - PIP: S - SXT: S - TE: S AM: R - AMC: I - AN: S - ATM: I - CAZ: S - CIP: R - CN: R - CS: S 24 982 Nam 1930 Đàm - FT: S - GM: S - IPM: S - MEC: S - MEM: S - NET: S - PIP: R TCC: R - TE: R AM: R - AMC: S - AN: S - ATM: R - CAZ: R - CIP: S - CN: R - CS: 25 19 Nữ 1954 Đàm S - FT: S - GM: S - IPM: S - MEC: R - MEM: S - NET: R - PIP: R TCC: R - TE: S 18 AM: R - AMC: R - AN: R - ATM: R - CAZ: R - CIP: R - CN: R - CS: 26 80 Nam 1982 Đàm S - FT: R - GM: R - IPM: S MEC: R - MEM: S - NET: R - PIP: R - TCC: R - TE: R AM: R - AMC: S - AN: S - CAZ: S 27 513 Nam 1971 Nước tiểu - CIP: S - CN: S - CS: S - FT: R MEC: R - NET: S - PIP: S - S: S SXT: R - TE: S AM: R - AMC: S - AN: S - CAZ: S 28 784 Nữ 1974 Đàm - CIP: S - CN: S - CS: S - FT: R GM: S - MEC: I - NET: S - PIP: S - SXT: R - TE: S AM: R - AMC: R - AN: S - ATM: R - CAZ: R - CIP: R - CN: R - CS: 29 637 Nam 1979 Mủ S - FT: S - GM: R - IPM: S - MEC: R - MEM: S - NET: S - PIP: R SXT: R - TCC: R - TE: R AM: R - AMC: I - AN: R - ATM: R - CAZ: R - CIP: R - CN: R - CS: 30 812 Nam 1962 Mủ S - FT: I - IPM: S - MEC: R MEM: S - NET: R - PIP: R - S: R SXT: R - TCC: R - TE: R AM: R - AMC: R - AN: S - CAZ: 31 14 Nữ 1991 Mủ R - CIP: S - CN: R - CS: S - FT: S - MEC: S - NET: S - PIP: I - S: S SXT: R - TE: R 32 130 Nữ 1934 Nước tiểu AM: R - AMC: S - AN: S - CAZ: R - CIP: R - CN: R - CS: S - FT: S 19 - MEC: S - NET: S - PIP: R - S: S SXT: R - TE: S AM: R - AMC: S - AN: S - CAZ: S 33 208 Nam 1963 Mủ - CIP: S - CN: S - CS: S - FT: S MEC: S - NET: S - PIP: S - S: S SXT: R - TE: S AM: R - AMC: R - AN: S - CAZ: 34 217 Nữ 1945 Nước tiểu R - CIP: R - CN: R - CS: S - FT: S - MEC: R - NET: S - PIP: R - S: S - SXT: R - TE: R AM: R - AMC: R - AN: S - CAZ: 35 274 Nữ 1945 Nước tiểu R - CIP: R - CN: R - CS: S - FT: R - MEC: I - NET: S - PIP: R - S: S SXT: R - TE: I 20 PHỤ LỤC Kết 35 chủng Klebsiella pneumoniae khảo sát khả sinh ESBL Bảng Kết khả sinh ESBL 35 chủng Klebsiella pneumoniae STT Lab code Bệnh phẩm ESBL 278 Đàm - 661 Đàm + 776 Mủ + 815 Đàm + Nước tiểu + 78 Máu + 400 Mủ + 796 Đàm + 309 Mủ + 10 334 Đàm - 11 391 Đàm + 12 24 Mủ + 13 268 Mủ + 14 363 Nước tiểu - 15 364 Nước tiểu - 16 452 Nước tiểu + 17 508 Mủ + 18 510 Máu + 19 521 Mủ + 20 675 Mủ + 21 721 Đàm + 22 824 Nước tiểu + 23 189 Đàm - 24 982 Đàm + 21 25 19 Đàm - 26 80 Đàm + 27 513 Nước tiểu - 28 784 Đàm - 29 637 Mủ - 30 812 Mủ - 31 14 Mủ + 32 130 Nước tiểu + 33 208 Mủ - 34 217 Nước tiểu + 35 274 Nước tiểu - 22 PHỤ LỤC Kết 35 chủng Klebsiella pneumoniae khảo sát sinh carbapenemase Bảng Kết sinh carbapenemase 35 chủng Klebsiella pneumoniae STT Lab code Bệnh phẩm ESBL Hodge test 278 Đàm - - 661 Đàm + + 776 Mủ + - 815 Đàm + + Nước tiểu + - 78 Máu + - 400 Mủ + - 796 Đàm + + 309 Mủ + - 10 334 Đàm - - 11 391 Đàm + - 12 24 Mủ + - 13 268 Mủ + + 14 363 Nước tiểu - - 15 364 Nước tiểu - - 16 452 Nước tiểu + - 17 508 Mủ + - 18 510 Máu + - 19 521 Mủ + + 20 675 Mủ + + 21 721 Đàm + - 22 824 Nước tiểu + - 23 189 Đàm - - 24 982 Đàm + - 25 19 Đàm - - 23 26 80 Đàm + + 27 513 Nước tiểu - - 28 784 Đàm - - 29 637 Mủ - - 30 812 Mủ - - 31 14 Mủ + - 32 130 Nước tiểu + - 33 208 Mủ - - 34 217 Nước tiểu + - 35 274 Nước tiểu - - 24 PHỤ LỤC Kết phát gen kháng kháng sinh 35 chủng Klebsiella pneumoniae Stt Mã PXN CMY OXA 278 + - - - 661 + - - - 776 815 + - - - + - - - 78 + - - - 400 - - - 796 - - - - 309 - - - - 10 334 + - - - 11 391 + - - - 12 24 + - - - 13 268 + 14 363 15 364 16 452 17 508 18 501 + 19 521 + + 20 675 + + - - 21 721 + + - - 22 824 + + - - 23 189 + - - - 24 982 + - - - 25 19 + - - - 26 80 + - - - NDM + + + + - - - + - - - + - - - - + - + Ghi - + + - IMP + - + - + - 25 27 513 + - - - 28 784 + - - - 29 637 + - - - 30 812 + - - - 31 14 + - - - 32 130 - - 33 208 - - 34 217 35 274 - + + - + + - + - + - [...]... nhanh, chính xác được vi khuẩn Klebsiella pneumoniae sinh β lactamase phổ rộng và carbapenemase càng sớm càng tốt giúp các bác sĩ lựa chọn kháng sinh phù hợp nhất để điều trị cho bệnh nhân Do đó, chúng tôi thực hiện đề tài Khảo sát sự kháng kháng sinh của Klebsiella pneumoniae tại viện Pasteur Tp Hồ Chí Minh 2 Mục đích nghiên cứu Xác định đặc tính kháng kháng sinh của Klebsiella pneumoniae tại Viện Pasteur. .. Viện Pasteur Tp Hồ Chí Minh 3 Đối tượng và phạm vi nghiên cứu Các chủng Klebsiella pneumoniae phân lập được từ các bệnh phẩm tại Viện Pasteur Tp Hồ Chí Minh từ 01-06/2014 4 Nhiệm vụ nghiên cứu - Nuôi cấy, phân lập và định danh chủng Klebsiella pneumoniae - Khảo sát tỷ lệ nhiễm Klebsiella pneumoniae ở giới tính, các lứa tuổi, bệnh phẩm khác nhau - Khảo sát tỷ lệ kháng kháng sinh của Klebsiella pneumoniae. .. 1.4.2 Cơ chế kháng kháng sinh Vi khuẩn phát triển nhiều cơ chế đề kháng để tạo nên sự đề kháng kháng sinh Sự đề kháng này đã được nghiên cứu và ghi nhận với các cơ chế chủ yếu sau [51] [56] 17 [68] [74]: Hình 1.6 Cơ chế kháng kháng sinh của vi khuẩn 1.4.2.1 Tạo enzyme phân hủy kháng sinh làm bất hoạt kháng sinh - Vi khuẩn sản xuất ra enzyme gây phân hủy hoặc làm bất hoạt kháng sinh Sự sản xuất enzyme... Phương pháp nghiên cứu sự kháng kháng sinh của K pneumoniae ……37 Sơ đồ 2.2 Quy trình nuôi cấy Klebsiella pneumoniae từ bệnh phẩm: đàm, mủ, máu, dịch não tủy, nước tiểu……………………………………………………………… 38 Sơ đồ 2.3 Quy trình thử nghiệm tính nhạy cảm kháng sinh bằng kỹ thuật khoanh giấy khuếch tán kháng sinh trên mặt thạch……………………………………………… 48 Biểu đồ 3.1 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh của Klebsiella pneumoniae ……………….61... giảm hoặc ngăn cản sự khuyếch tán của kháng sinh vào đúng vị trí tác dụng Dạng đề kháng này xảy ra đối với nhiều kháng sinh của nhiều nhóm khác nhau, do có khi các kháng sinh khác nhau nhưng có thể dùng chung một loại lỗ Mặt khác, sự đề kháng này là đặc hiệu khi một kháng sinh chỉ dùng riêng một loại lỗ Ví dụ sự đề kháng của 21 Pseudomonas aeruginosa với imipenem là sự đề kháng đặc hiệu gây ra do mất đi... kháng của người bệnh và dự phòng tốt các nhiễm trùng bệnh viện [4] [6] 7 + Điều trị Sử dụng kháng sinh để điều trị nhiễm khuẩn Tuy nhiên Klebsiella pneumoniae thường có sức đề kháng cao với kháng sinh Nên cần cẩn thận, cân nhắc để lựa chọn kháng sinh công hiệu [4] [6] 1.2 Kháng sinh và cơ chế tác động của kháng sinh 1.2.1 Định nghĩa kháng sinh - Năm 1928, nhà khoa học Alexander Flemming người Scotland... nhiễm sắc thể của vi khuẩn Sự đột biến chỉ ảnh hưởng đến một đặc tính là sự đề kháng Nói chung, chỉ liên quan đến một kháng sinh hoặc một họ kháng sinh có cùng cơ chế tác dụng Có thể việc ngăn ngừa sự lây lan các thể biến dị đề kháng này bằng cách dùng phối hợp hai hoặc nhiều kháng sinh - Ví dụ: đề kháng với kháng sinh rifampicine và các quinolone luôn luôn là do đột biến b) Mắc phải các gen kháng thuốc... lọc các chủng Klebsiella pneumoniae sinh ESBL bằng thử nghiệm đĩa đôi, sinh carbapenemase bằng Hodge test - Xác định một số gen mã hóa cho tính kháng kháng sinh của Klebsiella pneumoniae 5 Phương pháp nghiên cứu Phương pháp thu mẫu, nuôi cấy, phân lập, định danh, làm kháng sinh đồ, sàng lọc chủng vi khuẩn Klebsiella pneumoniae sinh carbapenemase, β-lactamases phổ rộng, phát hiện gen kháng thuốc được... Klebsiella pneumoniae ……………………………………………………4 Hình 1.2 Khuẩn lạc Klebsiella pneumoniae trên môi trường CA…………………….5 Hình 1.3 Cấu trúc hóa học của 4 nhóm β-lactam…………………………………… 9 Hình 1.4 Cơ chế tác động của kháng sinh ……………………………………… 12 Hình 1.5 Các phương thức lan truyền gen đề kháng …………………………… 16 Hình 1.6 Cơ chế kháng kháng sinh của vi khuẩn………………………………… 17 Hình 2.1 Klebsiella pneumoniae bắt màu hồng... nhân chính gây nhiễm trùng ở bệnh viện và có sự kháng kháng sinh mạnh, cơ chế đề kháng chính là sinh beta-lactamases đặc biệt là ESBL, đề kháng với tất cả kháng sinh nhóm 23 ß-lactam đặc biệt là kháng cephalosporin thế hệ thứ ba Việc sinh beta-lactamases phổ rộng (ESBL) lây truyền qua plasmide được phát hiện lần đầu tiên ở Đức năm 1983 và sau đó ở Mỹ ESBL lần đầu tiền được xác định ở chủng Klebsiella pneumoniae ... PHẠM TP HỒ CHÍ MINH Phạm Thị Hoài An KHẢO SÁT SỰ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA KLEBSIELLA PNEUMONIAE TẠI VIỆN PASTEUR TP HỒ CHÍ MINH Chuyên ngành: Vi sinh vật học Mã số: 60 42 01 07 LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH. .. chọn kháng sinh phù hợp để điều trị cho bệnh nhân Do đó, thực đề tài Khảo sát kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae viện Pasteur Tp Hồ Chí Minh Mục đích nghiên cứu Xác định đặc tính kháng kháng... tính kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae Viện Pasteur Tp Hồ Chí Minh Đối tượng phạm vi nghiên cứu Các chủng Klebsiella pneumoniae phân lập từ bệnh phẩm Viện Pasteur Tp Hồ Chí Minh từ 01-06/2014