đề tài nghiên cứu ứng dụng thuật toán trên đồ thị để phân hạng gen,kiểu hình bệnh và ứng dụng trong việc tìm gen gây bệnh mới và mối liên quan mới giữa các bệnh

34 708 1
đề tài nghiên cứu ứng dụng thuật toán trên đồ thị để phân hạng gen,kiểu hình bệnh và ứng dụng trong việc tìm gen gây bệnh mới và mối liên quan mới giữa các bệnh

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

. dụng thuật toán trên đồ thị để phân hạng gien, kiểu hình bệnh và ứng dụng trong việc tìm gien gây bệnh mới và mối liên quan mới giữa các bệnh Mã số : B2014-01-84 Chủ nhiệm đề tài : TS.Đỗ Phan Thuận. CHUYÊN ĐỀ Tên chuyên đề 4.3: Nghiên cứu và khảo sát cơ sở dữ liệu bản đồ ngữ nghĩa gien (GO: Gene Ontology), bản đồ ngữ nghĩa bệnh (DO:Disease Ontology) Tên đề tài: Nghiên cứu ứng dụng thuật toán trên. dụ,như khi ta tìm kiếm các tiến trình mà trong đó có các protein với các chức năng đặc biệt tham gia và đưa ra tất cả các protein liên quan .Việc di chuyển xuống và lên trên mối quan hệ phân cấp ’is

Ngày đăng: 15/03/2015, 21:11

Từ khóa liên quan

Mục lục

  • List of Figures

  • List of Tables

  • Abbreviations

  • 1 Ontology và các khái niệm liên quan

    • 1.1 Ontology và ontology

    • 1.2 Tổ hợp Khái niệm là gì ?

    • 1.3 Vai trò của Ngôn ngữ trong việc mô tả Tổ hợp Khái Niệm

    • 1.4 Định nghĩa Ontology

      • 1.4.1 Các thành phần chính của Ontology

      • 1.4.2 Các loại Ontology và vấn đề Thống nhất thông tin

      • 2 Bản đồ Ngữ nghĩa ứng dụng trong Tin sinh học

        • 2.1 Tại sao ontology lại quan trọng với Sinh học ?

        • 2.2 Khảo sát các Ontology sinh học hiện có

        • 3 Bản Đồ Ngữ nghĩa Gene (Gene Ontology)

          • 3.1 Đề án thiết lập Bản đồ Ngữ nghĩa Gene

          • 3.2 Ontology Consortium

            • 3.2.1 Các Ontology thành phần

            • 3.2.2 Cấu trúc của Gene Ontology

              • 3.2.2.1 Cấu trúc của mỗi Khóa (Term)

                • Các thành tố cơ bản

                  • Các thành tố phụ thêm

                  • 3.2.3 Các quan hệ trong GO

                    • Quan hệ is a :

                      • Quan hệ part of :

                        • Mối quan hệ has part :

                        • Mối quan hệ điều hòa (regulates) :

                        • 3.2.4 Cơ sở Dữ liệu Gene Ontology

                          • 3.2.4.1 Dữ liệu bên trong GO database

                          • 3.2.4.2 Các cách truy cập có hiệu lực

                            • (a) Truy cập trực tuyến :

                              • (b) Cài đặt cục bộ :

                              • 3.2.4.3 Truy vấn GO database

                                • Truy vấn thông qua AmiGO

                                  • Truy vấn trong SQL

                                  • Truy vấn thông qua perl

                                  • Truy vấn thông qua java

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan