Khóa luận sử dụng chỉ thị phân tử microsatellite đánh giá đa dạng di truyền các dòng keo lá tràm (acacia auriculiformis)

MỤC LỤCĐỀ MỤC . TRANGTRANG TỰA . iiLỜI CẢM ƠN . iiiTÓM TẮT . ivMỤC LỤC . vDANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT . viiiDANH SÁCH CÁC HÌNH . ixDANH SÁCH CÁC BẢNG VÀ SƠ ĐỒ . xPhần 1. MỞ ĐẦU . 11.1 Đặt vấn đề . 11.2 Yêu cầu và mục đích nghiên cứu của đề tài . 21.4 Giới hạn của đề tài . 2Phần 2. TỔNG QUAN . 42.1 Giới thiệu về đa dạng sinh học . 42.1.1 Định nghĩa . 42.1.2 Ý nghĩa của đa dạng sinh học . 42.1.3 Các phân mức về đa dạng sinh học . 42.1.3.1 Sự đa dạng về hệ sinh thái . 42.1.3.2 Đa dạng loài . 52.1.3.3 Đa dạng về di truyền . 62.2 Một số DNA marker sử dụng nghiên cứu sự đa dạng di truyền . 72.2.1 Phân loại . 72.2.2 Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) . 82.2.3 Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) . 92.2.4 Kỹ thuật RAPD (Random Amplified Polymorphism DNA) . 102.2.5 SSR (Microsatellite) . 102.3 Kỹ thuật Microsatellite . 112.3.1 Khái niệm về Microsatellite . 112.3.2 Tính chất . 122.3.3 Sự phát triển của primer Microsatellite . 132.3.4 Giới hạn của Microsatellite . 142.3.5 Các loại Microsatellite . 152.3.6 Cơ chế hình thành và vai trò của Microsatellite . 152.3.6.1 Cơ chế hình thành Microsatellite . 152.3.6.2 Vai trò của Microsatellite . 172.3.7 Các phƣơng pháp phát hiện Microsatellite . 182.3.7.1 Phƣơng pháp lai . 182.3.7.2 Phƣơng pháp PCR . 192.4 Polymerase Chain Reaction (PCR) . 192.4.1 Khái niệm . 192.4.2 Thành phần và vai trò của các chất trong phản ứng PCR . 202.4.4 Ứng dụng của kỹ thuật PCR. 232.4.5 Ƣu và nhƣợc điểm của kỹ thuật PCR . 232.5 Quy trình ly trích DNA thực vật . 232.5.1 Định lƣợng DNA bằng phƣơng pháp quang phổ . 252.5.2 Định tính DNA ly trích bằng phƣơng pháp điện di . 262.6 Tổng quan về cây Keo lá tràm (Acacia auriculiformis) . 282.6.1 Vài nét về chi Keo (Acacia) . 282.6.1.1 Đặc điểm sinh học của các loài Keo . 282.6.1.2 Công dụng của các loài Keo (Acacia) . 302.6.2 Vài nét về cây Keo lá tràm (Acacia auriculiformis A. Cunn ex Benth) . 322.6.2.1 Các đặc điểm sinh học và sinh thái . 332.6.2.2 Công dụng và tiềm năng gây trồng . 35Phần 3. VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP . 363.1 Thời gian và địa điểm thực hiện . 363.1.1 Thời gian thực hiện . 363.1.2 Địa điểm thực hiện . 363.2 Vật liệu thí nghiệm . 363.3 Phƣơng pháp thí nghiệm . 363.4 Thiết bị và dụng cụ . 373.5 Ly trích DNA . 373.5.1 Hóa chất . 373.5.2 Quy trình ly trích DNA . 383.5.3 Kiểm tra sản phẩm DNA ly trích . 403.6.1 Qui trình phản ứng PCR . 403.6.2 Điện di sản phẩm PCR . 42Phần 4. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN . 444.1 Quá trình ly trích . 444.2 Phản ứng PCR . 44Phần 5. KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ . 485.1 Kết luận . 485.2 Đề nghị . 48TÀI LIỆU THAM KHẢO . 50PHỤ LỤC