ÔN TẬP BÀI 1: TÌM KIẾM TRÌNH TỰ SINH HỌC Trình tự sinh học: DNA, RNA, protein Tìm kiếm trình tự sinh học 2 Nguyên tắc tìm kiếm trình tự sau khi đã giải trình tự 1.Tìm bằng từ khóa: 2.Công cụ tìm kiếm -Mã số truy cập -Tên (gene hay Protein) -GI -Độ dài trình tự -Trọng lượng phân tử -Tên tác giả giải trình tự 3. Lọc trình tự 3 Tìm kiếm trình tự sinh học Kết quả cần tìm Kết quả cần tìm Tìm kiếm trình tự sinh học 4 Tìm kiếm trình tự sinh học qua NCBI -Gene - Nucleotide - Protein Tìm kiếm trình tự qua mã số truy cập Tìm kiếm trình tự sinh học 5 1. Tìm qua mã số truy cập:  8 ký tự : 2 chữ và 6 số ví dụ như AY690640  6 ký tự : 1 chữ và 5 số ví dụ như U20068 2. Tìm tên gene 3. Tìm tên loài 4. Tìm số GI Kết quả tìm trình tự DNA qua mã số truy cập Giới thiệu môn học 6 Tìm kiếm trình tự sinh học 7 Tìm kiếm trình tự qua tên gene Tìm kiếm trình tự sinh học 8 Cách lấy trình tự theo định dang FASTA Giới thiệu môn học 9 Định dạng FASTA >tên trình tự gattctcacttggtctgctgcaaggacgcggaccattaaaactgttcatggcccttgtggcgtt ctcgtttcctaacaatcccaccaacagcagggatactaaaaagatggggaacgatcaaaaa atcaaaagctatcaatgtcttgagagggttcaggaaagagattggaaggatgctgaacatct tgaacaggagacgcaggacagcaggcgtgattgttatgttgattccacagcgatggcgttcc atttaaccacacgcaatgg Tìm kiếm trình tự sinh học 10 [...]... primer Giới thiệu môn học 20 Độ đặc hiệu của mồi Giới thiệu môn học 21 CÔNG CỤ VÀ CÁCH THỰC HiỆN Tìm ORF finder trong google ORF FINDER (OPEN READING FRAME FINDER) Nhập trình tự DNA vào khung ORF finder Nhập trình tự Khung đọc mở (ORF) F3 F2 F1 Trình tự DNA có thể được đọc trong 6 khung đọc ở các sinh vật có DNA mạch đôi; 3 khung đọc trên mỗi mạch    * * *  * * * Forward DNA strand Reverse DNA strand...Kết quả tìm kiếm bộ gene Giới thiệu môn học 11 Tìm kiếm trình tự protein Tìm kiếm trình tự sinh học 12 Tìm kiếm trình tự qua tên sinh vật Giới thiệu môn học 13 Thiết kế mồi Trình tự DNA khuôn Thiết kế Thông số của phản ứng PCR Primer 1 Lấy các thông số từ phần mềm 2 Kiểm tra đặc hiệu của Primer bằng blast Các... signal * Stop signal   * *   * *   F4 F5 F6 Total ORFs in F1: 3 Total ORFs in F2: 2 Total ORFs in F3: 1 Total ORFs in F4: 1 Total ORFs in F5: 3 Total ORFs in F6: 2 Total ORFs: 12 Chiều dịch mã trong sáu khuôn đọc ORF +1 AATGGCAATCCGCGTAGACTAGGCA +2 AATGGCAATCCGCGTAGACTAGGCA +3 AATGGCAATCCGCGTAGACTAGGCA 5’ 3’ AATGGCAATCCGCGTAGACTAGGCA 3’ TTACCGTTAGGCGCATCTGTATCGT 5’ -1 TTACCGTTAGGCGCATCTGTATCGT . ÔN TẬP BÀI 1: TÌM KIẾM TRÌNH TỰ SINH HỌC Trình tự sinh học: DNA, RNA, protein Tìm kiếm trình tự sinh học 2 Nguyên tắc tìm kiếm trình tự sau khi đã giải trình. trình tự 3. Lọc trình tự 3 Tìm kiếm trình tự sinh học Kết quả cần tìm Kết quả cần tìm Tìm kiếm trình tự sinh học 4 Tìm kiếm trình tự sinh học qua NCBI -Gene - Nucleotide - Protein Tìm. gattctcacttggtctgctgcaaggacgcggaccattaaaactgttcatggcccttgtggcgtt ctcgtttcctaacaatcccaccaacagcagggatactaaaaagatggggaacgatcaaaaa atcaaaagctatcaatgtcttgagagggttcaggaaagagattggaaggatgctgaacatct tgaacaggagacgcaggacagcaggcgtgattgttatgttgattccacagcgatggcgttcc atttaaccacacgcaatgg Tìm kiếm trình tự sinh học 10 Kết quả tìm kiếm bộ gene Giới thiệu môn học 11 Tìm kiếm trình tự protein Tìm kiếm trình tự sinh học 12 Tìm kiếm trình tự qua tên sinh vật Giới thiệu môn