BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM TP. HỒ CHÍ MINH Nguyễn Thị Yến Chi KHẢO SÁT SỰ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA CÁC VI KHUẨN GRAM ÂM ĐƯỜNG RUỘT THƯỜNG GẶP TRONG BỆNH VIỆN SINH ESBL LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC Thành phố Hồ Chí Minh – năm 2011 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM TP. HỒ CHÍ MINH Nguyễn Thị Yến Chi KHẢO SÁT SỰ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA CÁC VI KHUẨN GRAM ÂM ĐƯỜNG RUỘT THƯỜNG GẶP TRONG BỆNH VIỆN SINH ESBL Chuyên ngành: Vi Sinh học Mã số: 60 42 40 LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC PGS – TS CAO MINH NGA ` Thành phố Hồ Chí Minh – năm 2011 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu của riêng tôi. Các số liệu và kết quả nghiên cứu trong luận văn là trung thực và chưa từng được ai công bố trong bất kì công trình nào khác Tác giả LỜI CẢM ƠN Tôi xin chân thành cám ơn sự hướng dẫn tận tình của cô PGS - TS Cao Minh Nga trong suốt quá trình làm luận văn này. Đồng thời, tôi cũng xin chân thành cám ơn Ban chủ nhiệm Bộ môn, các cán bộ phòng thí nghiệm bộ môn Vi sinh trường Đại học Y Dược Thành phố Hồ Chí Minh đã hỗ trợ tích cực cho tôi trong việc thực nghiệm đề tài. MỤC LỤC Chú thích các chữ viết tắt Danh mục các bảng Danh mục các hình, biểu đồ 3TMỞ ĐẦU3T 1 3TChương 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU3T 4 3T1.1. Tổng quan về vi khuẩn3T 4 3T1.1.1. Vi khuẩn3T 4 3T1.1.2. Trực khuẩn Gram âm3T 4 3T1.2. Các kháng sinh thuộc nhóm β-lactam3T 9 3T1.2.1. Phân loại các kháng sinh thuộc nhóm β-lactam3T 10 3T1.2.2. Cơ chế tác dụng3T 12 3T1.3. Hiện tượng kháng kháng sinh3T 13 3T1.3.1. Tổng quan3T 13 3T1.3.2. Bản Chất di truyền và phương thức truyền tải gen3T 14 3T1.3.3. Cơ chế kháng kháng sinh của vi khuẩn3T 15 3T1. 4. Tổng quan về ESBL3T 17 3T1.4.1. Sơ lược về β-lactamase3T 17 3T1.4.2. ESBL3T 20 3TChương 2. ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU3T 33 3T2.1. Đối tượng nghiên cứu3T 33 3T2.2. Phương pháp chọn mẫu3T 33 3T2.3. Phương pháp tiến hành3T 33 3T2.3.1. Vật liệu3T 33 3T2.3.2. Thiết bị và dụng cụ3T 34 3T2.3.3. Quy trình thực hiện3T 34 3T2.4. Xử lý số liệu3T 37 3TChương 3. KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN3T 38 3T3.1. Tỉ lệ vi khuẩn đường ruột sinh ESBL3T 38 3T3.2. Tỷ lệ các chủng vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp sinh ESBL3T 39 3T3.3. Tỉ lệ kháng kháng sinh của vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp sinh ESBL 3T 42 3T3.4. Tỷ lệ kháng kháng sinh của vi khuẩn Gram âm đường ruột không sinh ESBL 3T 54 3TChương 4. KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ3T 72 3TTÀI LIỆU THAM KHẢO3T 75 3TPHỤ LỤC3T DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT AN Amikacin AMC Amox - acid clavulanic AM Ampicillin ASTS Antibiotic Susceptibility Test Surveillance (Chương trình theo dõi sự nhạy cảm kháng sinh) ATM Aztreonam BHI Brain - Heart Infusion Agar (Thạch tim - óc hầm) CZ Cefazolin FEP Cefepime CFP Cefoperazone CCTX Cefotaxime-acid clavulanic FOX Cefoxitin CAZ Ceftazidime CCAZ Ceftazidime – acid clavulanic CTX Ceftotaxime CRO Ceftriaxone CXM Cefuroxime CIP Ciprofloxacin CTI Citrate CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute (Viện các chuẩn mực lâm sàng và xét nghiệm) C Cloramphenicol EMB Eosin Methylene Blue Agar ESBL Extended – Spectrum Beta Lactamase GM Getamicin G Glucose IPM Imipenem IND Indol LVX Levofloxacin LYS Lysine MC Mac Conkey Agar (Thạch Mac Conkey) MEM Meropenem MR Methyl Red MIC Minimum Inhibitory Concentration (Nồng độ ức chế tối thiểu) MOT Motility (Di động) MHA Mueller Hinton Agar (Thạch Mueller Hinton) NCCLS National Committee for Clinical Laboratory Standards NET Neltimicin FT Nitrofurantoin NOR Norffloxacin NA Nutrien Agar (Môi trường dinh dưỡng) PAD Phenylalanine Deaminase TZP Piperacillin-tazobactam Tg Tác giả TE Tetracyline Tp. Thành phố TCC Ticarcilin acid clavuanic TM Tobramycin SXT Trimethoprim –sulfamethoxazole TSI Triple Suger Iron VKDR Vi khuẩn đường ruột VP Voges Proskauer DANH MỤC CÁC BẢNG 3TUBảng 1.1. Tính chất sinh hóa của một số loại vi khuẩn đường ruột thường gặpU3T 5 3TUBảng 1.2. Các nhân cơ bản của kháng sinh thuộc nhóm β-lactamU3T 10 3TUBảng 1.3. Cơ chế kháng thuốc của vi khuẩnU3T 17 3TUBảng 1.4. Xếp loại β-lactamase theo chức năngU3T 18 3TUBảng 1.5. Các lớp ESBL chínhU3T 22 3TUBảng 1.6. Các type ESBLs CTX-MU3T 24 3TUBảng 1.7. Các type ESBL- OXAU3T 25 3TUBảng 1.8. Các loại ESBL khácU3T 25 3TUBảng 1.9. Một số phương pháp phân tử xác định ESBLU3T 29 3TUBảng 3.1. Tỉ lệ các loại vi khuẩn đường ruột phân lập được U3T 38 3TUBảng 3.2. Tỉ lệ các vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp sinh ESBLU3T 39 3TUBảng 3.3. Tỉ lệ kháng kháng sinh của các vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặpU3T 42 3TUBảng 3.4. Tỉ lệ kháng kháng sinh của từng loài vi khuẩn đường ruột thường gặp sinh ESBL U3T 46 3TUBảng 3. 5. So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh của E. coli sinh ESBL với một số tác giả nghiên cứu trước đây U3T 48 3TUBảng 3. 6. So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh của Klebsiella spp. sinh ESBL với một số tác giả nghiên cứu trước đây U3T 53 3TUBảng 3.7. So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh của vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp không sinh ESBL với các tác giả nghiên cứu trước đây U3T 55 3TUBảng 3. 8. Tỉ lệ kháng kháng sinh của từng loài vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp không sinh ESBL U3T 59 3TUBảng 3.9. So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh của E. coli không sinh ESBL với các tác giả nghiên cứu trước đây U3T 62 3TUBảng 3.10. Tỉ lệ kháng kháng sinh của vi khuẩn E. coli sinh ESBL và không sinh ESBL U3T 63 3TUBảng 3. 11. So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh của vi khuẩn Klebsiella spp. với các tác giả nghiên cứu trước đó U3T 68 3TUBảng 3.12. So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh của vi khuẩn Klebsiella spp. sinh ESBL và không sinh ESBL U3T 69 [...]... của các vi khuẩn này Đặc biệc là các vi khuẩn sinh ESBL Vì thế , đề tài Khảo sát sự kháng kháng sinh của các vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp trong bệnh vi n sinh ESBL “ được nghiên cứu với mục tiêu: - Khảo sát tỉ lệ các chủng vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp trong bệnh vi n 175 - Khảo sát tỉ lệ vi khuẩn Gram âm đường ruột sinh ESBL - Khảo sát tình hình kháng kháng sinh của các vi khuẩn. .. khuẩn Gram âm U T 3 đường ruột thường gặp sinh ESBL và không sinh ESBL 57 T 3 U Biểu đồ 3.11 Tỉ lệ kháng kháng sinh khác của vi khuẩn Gram âm đường ruột U T 3 thường gặp không sinh ESBL 58 T 3 U Biểu đồ 3.12 Tỉ lệ kháng kháng sinh khác của vi khuẩn Gram âm đường ruột U T 3 thường gặp sinh và không sinh ESBL 59 T 3 U Biểu đồ 3.13 Tỉ lệ kháng kháng sinh nhóm β – lactam của vi khuẩn. .. Tỉ lệ kháng kháng sinh nhóm β - lactam của các vi khuẩn Gram âm U T 3 đường ruột thường gặp sinh ESBL 43 T 3 U Biểu đồ 3.4 Tỉ lệ kháng kháng sinh khác của các vi khuẩn Gram âm đường ruột U T 3 thường gặp sinh ESBL 46 T 3 U Biểu đồ 3 5 Tỉ lệ kháng kháng sinh nhóm β – lactam của E coli sinh ESBL 47 U T 3 T 3 U Biểu đồ 3.6 Tỉ lệ kháng kháng sinh khác của vi khuẩn E coli sinh ESBL. .. lệ kháng kháng sinh nhóm β – lactam của Klebsiella spp sinh ESBL U T 3 T 3 U 51 Biểu đồ 3.8 Tỉ lệ kháng các kháng sinh khác của vi khuẩn Klebsiella spp sinh U T 3 ESBL 52 T 3 U Biểu đồ 3.9 Tỉ lệ kháng kháng sinh nhóm β – lactam của các vi khuẩn Gram âm U T 3 đường ruột thường gặp không sinh ESBL 55 T 3 U Biểu đồ 3.10 Tỉ lệ kháng kháng sinh nhóm β – lactam của vi. .. kháng kháng sinh nhóm β – lactam của vi khuẩn Klebsiella spp U T 3 không sinh ESBL 66 T 3 U Biểu đồ 3.18 Tỉ lệ kháng kháng sinh khác của Klebsiella spp không sinh ESBL 67 U T 3 T 3 U Biểu đồ 3.19 So sánh tỉ lệ kháng các kháng sinh nhóm β – lactam của vi khuẩn U T 3 Klebsiella spp Sinh ESBL và không sinh ESBL 70 T 3 U Biểu đồ 3.20 So sánh tỉ lệ kháng các kháng sinh khác của vi khuẩn. .. không U T 3 sinh ESBL 61 T 3 U Biểu đồ 3 14 Tỉ lệ kháng các kháng sinh khác của vi khuẩn E coli không sinh U T 3 ESBL 62 T 3 U Biểu đồ 3.15 So sánh tỉ lệ kháng kháng sinh nhóm β – lactam của vi khuẩn E coli U T 3 sinh ESBL và không sinh ESBL 65 T 3 U Biểu đồ 3.16 So sánh tỉ lệ kháng các kháng sinh khác của vi khuẩn E coli sinh U T 3 ESBL và không sinh ESBL ... các tác nhân gây bệnh Sau khi có kết quả kháng sinh đồ sẽ điều chỉnh lại cho phù hợp, đảm bảo tính hiệu quả, ít tốn kém và giảm sự phơi nhiễm của các kháng sinh Hiện nay, tại bệnh vi n 175 vẫn chưa có một nghiên cứu nào thật đầy đủ về sự kháng kháng sinh của các vi khuẩn gây nhiễm khuẩn bệnh vi n, từ đó đưa ra phác đồ điều trị kháng sinh thích hợp, giúp kiểm soát và làm giảm tỉ lệ kháng thuốc của các. .. 7,7(n = 548) Bệnh vi n Chợ Rẫy (2005) 61,7 (87/141) 51,6 (145/281) Bệnh vi n Vi t Đức (2005) 39,3 (55/140) 34,2(66/193) Bệnh vi n Bình Định (2005) 19,6 (29/148) 36,2(51/141) Bệnh vi n Vi t Tiệp (2005) 25,7 (09/35) 36,1(22/61) Bệnh vi n Bạch Mai (2005) 20,1 (37/184) 18,5(28/151) Bệnh vi n Bạch Mai (2006) 28,7 (99/347) 21,5(77/359) Bệnh vi n Bạch Mai (2007) 32,5 (105/323) 41,2(136/330) Bệnh vi n Bạch Mai... lại các vi khuẩn sinh β-lactamase mạnh Đặc biệt là chống lại các vi khuẩn kháng penicillin và cephalosporin Sulbactam và tazobactam tương tự cũng là những chất kháng sinh được dùng kết hợp với các kháng sinh khác trong vi c chống lại các vi khuẩn kháng thuốc [4][18][14] R 1.2.1.2 Cephalosporin Các Cephalosporin là nhóm thuốc quan trọng nhất trong các thuốc kháng sinh hiện nay Nhóm này đứng thứ 7 trong. .. hiện ESBLs 27 U T 3 T 3 U Hình 1.7 Phương pháp đĩa kết hợp phát hiện ESBLs 28 U T 3 T 3 U Hình 1.8 Phương pháp E – test phát hiện ESBLs 29 U T 3 T 3 U Biểu đồ 1.1 Tỉ lệ vi khuẩn tiết ESBLs tại vùng Châu Á Thái Bình Dương 31 U T 3 T 3 U Biểu đồ 3.1 Tỉ lệ vi khuẩn đường ruột sinh ESBL 38 U T 3 T 3 U Biểu đồ 3.2 Tỉ lệ các chủng vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp sinh ESBL . sát tỉ lệ các chủng vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp trong bệnh vi n 175. - Khảo sát tỉ lệ vi khuẩn Gram âm đường ruột sinh ESBL - Khảo sát tình hình kháng kháng sinh của các vi khuẩn trên lệ vi khuẩn đường ruột sinh ESBL3 T 38 3T3.2. Tỷ lệ các chủng vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp sinh ESBL3 T 39 3T3.3. Tỉ lệ kháng kháng sinh của vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp sinh. là các vi khuẩn sinh ESBL Vì thế , đề tài Khảo sát sự kháng kháng sinh của các vi khuẩn Gram âm đường ruột thường gặp trong bệnh vi n sinh ESBL “ được nghiên cứu với mục tiêu: - Khảo sát