Báo cáo y học: "Estimating genomic coexpression networks using first-order conditional independence" ppt

... ICL2 (a 2-methylisocitrate lyase).In this combined pathway query the TCA cycle, glycolysis/gluconeogenesis, and glyxoylate cycle are each representedprimarily by a single two-step connected ... pathways. This is par-ticularly evident with respect to the glyoxylate cycle; the onlygenes uniquely assigned to this pathway are ICL1 (encodingan isocitrate lyase) and ICL2 (a 2-methylisocitrate ... pyruvate and methylglyoxal → (R)-S-lac-toyl-glutathione → D-lactaldehyde → D-lactate → pyruvate)[12,13]. In the branch of methylglyoxal metabolism thatinvolves S-lactoyl-glutathione, methyglyoxal...

Báo cáo y học: "Multi-tissue coexpression networks reveal unexpected subnetworks associated with disease" docx

... trend fornodes in the TTC networks having reduced connectivity in thehypothalamus and adipose coexpression networks, withoutany apparent peak at any of the connectivity values. Thisdemonstrates ... Y (Npy) by activating the phos-phatidylinositol 3-kinase pathway, is achieved in a mannerthat is independent of the STAT3 pathway [22]. Alternatively,leptin activates the JAK/STAT3 pathway ... subnetworks are very close to eachother, with C2 appearing to play a more central role (Figure4). Two other highly asymmetric subnetworks emerge fromthe AH analysis: C5, containing the hypothalamus...

Báo cáo y học: "Protein-protein interaction networks in the spinocerebellar ataxias" pptx

... via an intermediary protein. Reproduced with permission from Elsevier [1]. Y2 H bait: ataxia-causing protein Y2 H bait: paralog to or interactorwith ataxia-causing protein Y2 H preyInteraction from ... study by Lim et al. [1] sug-gests that there may be common pathways shared by differ-ent disease proteins. For instance, their screen revealed apossible link between Purkinje cell atrophy associatedprotein-1 ... of ataxia-causing proteinsor known interactors with them. The yellow circles depict prey proteins tested in the yeast two-hybrid screen and come from two sources. Thoseconnected by a purple...

Báo cáo y học: "Ancient genomic architecture for mammalian olfactory receptor clusters" pptx

... theanalysis.Mouse and ratA total of 1,296 mouse ORs were kindly provided by Zhangand Firestein [18] (accession numbers AY072961-AY074256). A total of 17,58 rat ORs [16] were kindly providedby ... amino-terminus and carboxyl-terminus typ-ical lengths were considered automatically as intact ORs; oth-erwise they were translated via FASTY. The typical ORamino- and carboxyl-termini lengths are ... with sim-ilarity that did not share synteny relationship were attributedto inter-chromosomal duplication events. Similarly, the com-bination of synteny data and sequence similarity has beenused...

Báo cáo y học: "Fast genomic μChIP-chip from 1,000 cells" ppt

... of a one-dayμChIP assay that enables genome-wide surveys of epigenetichistone modifications from 1,000 cells using microarrays.Typically, reliable resolution of ChIP location analysis isensured ... Sive HL, Young RA, Smith JC: Zebrafish pro-moter microarrays identify actively transcribed embryonicgenes. Genome Biol 2006, 7:R71.http://genomebiology.com/2009/10/2/R13 Genome Biology 2009, ... ChIP assays has beenlimited by the requirement for large cell numbers (approxi-mately 107 cells per immunoprecipitation) and the length ofthe procedure (typically 3-5 days). To remedy to these...

Báo cáo y học: " Microenvironmental genomic alterations reveal signaling networks for head and neck squamous cell carcinoma" pps

... are similar (Figure 3) in these networks. In essence, we hypothesize that these networks represent the biology in both tissue types, since they arebuilt upo n the genomic a lterations and integrated ... infections. Lakartidningen 2010,107:1702-1704.47. Slebos RJ, Yi Y, Ely K, Carter J, Evjen A, Zhang X, Shyr Y, Murphy BM,Cmelak AJ, Burkey BB, et al: Gene expression differences associated withhuman ... Loss-of-heterozygosity/al lelic imbalance (LOH/ AI) analysis has been widely used to identify genomic alterations in solid tumors and the tumor microenvironment (stroma). We hypothesize that...

Báo cáo y học: "Discovery of biological networks from diverse functional genomic data" ppt

... experimentally confirm the quality of predictionsmade by our method. We have done so by using bioPIXIE togenerate hypotheses about previously uncharacterized pro-teins in yeast and experimentally testing ... Biology 2005, 6:R114ImplementationThe Bayesian network used in integrating genomic data wasimplemented using SMILE, a C++ library developed by theDecision Systems Laboratory at the University ... identify novelpathway components and to study specific interactionsamong them. Predictions made by our system are specificenough to be tested using common molecular biology tech-niques. Using...

Báo cáo y học: "Serum-dependent transcriptional networks identify distinct functional roles for H-Ras and N-Ras during initial stages of the cell cycle" doc

... termocycler (Applied Biosystems). Resultswere analyzed using the software Sequence Detection Sys-tems (SDS) v2.1 (Applied Biosystems).Western blot analysis of cellular extractsProtein lysates ... view of the roles played by the retinoblastoma (Rb)family members in the Rb-E2F pathway. J Cell Biochem 2007,102:1400-1404.49. Irizarry RA, Hobbs B, Collin F, Beazer-Barclay YD, Antonellis KJ,Scherf ... relative activitypZtk-ISRE pZtk***+++(b)N-ras-/-Wild typepCEFL-N-rasN-rasJetPeiN-ras-/-Wild typeStat1p-Stat1 (Y7 01)Wild typeWild typeN-ras-/-PD098059SB203580LY294002GenisteinPD153035(c)Actin***++pZtk-ISRE...

Báo cáo y học: "Mining for coexpression across hundreds of datasets using novel rank aggregation and visualization methods" pptx

... cell cycle-regulated genes of the yeast Saccharomyces cer-evisiae by microarray hybridization. Mol Biol Cell 1998,9:3273-3297.7. Allison DB, Cui X, Page GP, Sabripour M: Microarray data analy-sis: ... tissue type.Dataset selectionIn multi-experiment coexpression analysis, some individualdatasets may produce noisy or even entirely random resultsthat are either caused by poor data quality or ... expressionlevels of the query gene. The quality of the analysis can beimproved considerably by eliminating the datasets that createa noise bias for the query gene. Low dataset-wide variabilityof expression...

Báo cáo y học: "Estimating enrichment of repetitive elements from high-throughput sequence data" ppt

... greedy algorithm, con-structing phylogeny from the bottom up by iterativelygrouping sequences with the highest read set similarity(see Materials and methods). The results of such analy-sis ... respectively). Set4, a cluster of repeats marked by the tri-methylation of H3Lys36 (H3K36me3), a mark typically associated with tran-scriptional elongation, is composed primarily of the SINErepeats ... ‘N’characters. Similarly, the canonical repeat assembly con-tained only canonical repeat sequences, and the instance-only repeat assembly co ntained only sequences identifiedby the RepeatMasker....

Xem thêm

Từ khóa: Nghiên cứu sự biến đổi một số cytokin ở bệnh nhân xơ cứng bì hệ thống Nghiên cứu tổ chức pha chế, đánh giá chất lượng thuốc tiêm truyền trong điều kiện dã ngoại Nghiên cứu tổ hợp chất chỉ điểm sinh học vWF, VCAM 1, MCP 1, d dimer trong chẩn đoán và tiên lượng nhồi máu não cấp đề thi thử THPTQG 2019 toán THPT chuyên thái bình lần 2 có lời giải Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Trả hồ sơ điều tra bổ sung đối với các tội xâm phạm sở hữu có tính chất chiếm đoạt theo pháp luật Tố tụng hình sự Việt Nam từ thực tiễn thành phố Hồ Chí Minh (Luận văn thạc sĩ)Nghiên cứu, xây dựng phần mềm smartscan và ứng dụng trong bảo vệ mạng máy tính chuyên dùng Nghiên cứu tổng hợp các oxit hỗn hợp kích thƣớc nanomet ce 0 75 zr0 25o2 , ce 0 5 zr0 5o2 và khảo sát hoạt tính quang xúc tác của chúng Nghiên cứu khả năng đo năng lượng điện bằng hệ thu thập dữ liệu 16 kênh DEWE 5000 Thiết kế và chế tạo mô hình biến tần (inverter) cho máy điều hòa không khí Chuong 2 nhận dạng rui ro Kiểm sát việc giải quyết tố giác, tin báo về tội phạm và kiến nghị khởi tố theo pháp luật tố tụng hình sự Việt Nam từ thực tiễn tỉnh Bình Định (Luận văn thạc sĩ)Tranh tụng tại phiên tòa hình sự sơ thẩm theo pháp luật tố tụng hình sự Việt Nam từ thực tiễn xét xử của các Tòa án quân sự Quân khu (Luận văn thạc sĩ)Giáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vật Giáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vật Giáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vật Trách nhiệm của người sử dụng lao động đối với lao động nữ theo pháp luật lao động Việt Nam từ thực tiễn các khu công nghiệp tại thành phố Hồ Chí Minh (Luận văn thạc sĩ)Chiến lược marketing tại ngân hàng Agribank chi nhánh Sài Gòn từ 2013-2015