Báo cáo khoa học: Structural basis for substrate recognition by Erwinia chrysanthemi GH30 glucuronoxylanase potx

... 2011 FEBS. No claim to original Slovakian government works Structural basis for substrate recognition by Erwinia chrysanthemi GH30 glucuronoxylanase Lˇubica Urbańikova´1,Ma´ria Vrsˇanska´2, ... struc-ture) for cocrystallization of E. chrysanthemi GH30 xylanase.Fig. S2. Dynamic light scattering profile of E. chry-santhemi GH30 xylanase.Fig. S3. Examples of distinct habits of E. chrysanthemi GH30 ... Thecleavage of the xylan main chain by GH10 xylanasesKeywordscrystal structure with ligand; Erwinia chrysanthemi; GH30; glucuronoxylan-specific xylanase; substrate recognition CorrespondenceP. Biely,...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Structural basis for cyclodextrin recognition by Thermoactinomyces vulgaris cyclo⁄maltodextrin-binding protein ppt

... 905–915.21 Evdokimov AG, Anderson DE, Routzahn KM &Waugh DS (2001) Structural basis for oligosaccharide recognition by Pyrococcus furiosus maltodextrin-bindingprotein. J Mol Biol 305, 891–904.22 ... 274 (2007) 2109–2120 ª 2007 The Authors Journal compilation ª 2007 FEBS Structural basis for cyclodextrin recognition by Thermoactinomyces vulgaris cyclo⁄ maltodextrin-bindingproteinTakashi ... b-sheetsurrounded by a-helices; the domains are joined by a hinge region contain-ing three segments. c-Cyclodextrin is located at a cleft formed by the twodomains. A common functional conformational...

Báo cáo khoa học: Structural basis for the recognition of complex-type biantennary oligosaccharides by Pterocarpus angolensis lectin ppt

... 5.2force ﬁeld. J Comput Chem 10, 982–1012.Carbohydrate recognition by PAL L. Buts et al.2420 FEBS Journal 273 (2006) 2407–2420 ª 2006 The Authors Journal compilation ª 2006 FEBS Structural basis ... are fragments of NA2F. The structural information is complemented by thermody-namic parameters of binding determined by means ofisothermal titration calorimetry for the above-men-tioned complexes ... conformation of theside chain of Glu221, which also adopts twoconformations but not correlated with theanomeric form of the bound mannose isshown in dark green.Carbohydrate recognition by...

Báo cáo khoa học: Molecular basis for substrate recognition and drug ˚ resistance from 1.1 to 1.6 A resolution crystal structures of HIV-1 protease mutants with substrate analogs pptx

... of HIV PRwith natural cleavage substrate analogs provide newmolecular details for understanding the speciﬁcity of substrate recognition and a basic framework for thedesign of new inhibitors ... 946–950.Y. Tie et al. HIV protease complexes with substrate analogsFEBS Journal 272 (2005) 5265–5277 ª 2005 FEBS 5277Molecular basis for substrate recognition and drugresistance from 1.1 to 1.6 ... adoptedtwo conformations, which differed by a rotation of 90°. One conformation of P2 Asn maintained weakerhydrogen bonds with Asp29 and 30, while the otherconformation was surrounded by the hydrophobic...

Báo cáo khoa học: Structural basis for the changed substrate speciﬁcity of Drosophila melanogaster deoxyribonucleoside kinase mutant N64D docx

... trans-formed strain 300-fold for AZT and 11-fold for ddCwhen compared to wildtype Dm-dNK. The puriﬁedrecombinant MuD had increased Kmvalues anddecreased kcatvalues for the four natural substratesbut ... decreasein LD100 for AZT was 300-fold for the double mutantN45D ⁄ N64D and mutant N64D, but only threefold for mutant N45D. Because in human cells AZT ismainly a substrate for TK1 (human TK1; ... Glu172 is boundto the 3¢-OH group of the substrate while there is nodensity for that interaction in the mutant structure(Fig. 2B). Structural basis for altered properties of theN64D mutantThe...

Báo cáo khoa học: Structural basis for the erythro-stereospeciﬁcity of the L-arginine oxygenase VioC in viomycin biosynthesis docx

... different substrate- binding mode results from conformationalcontrol of the enzyme on the side chain rotamer of thebound substrate. For example, in AsnO, a trans con-former is selected for the ... Collaboratory for Structural Bioinformatics protein data bank accessionnumbersCrystal structures and structure factors were deposited inthe Research Collaboratory for Structural Bioinformaticsunder ... conformational control of the bound sub-strate, which enforces a gauche(–) conformer for v1instead of the transconformers observed for the asparagine oxygenase AsnO and other mem-bers of...

Báo cáo khoa học: Structural basis for recognition of Co2+ by RNA aptamers pot

... 878–892. Recognition of Co2+ by RNA aptamers J. Wrzesinski and S. K. Jo´z´wiakowski1662 FEBS Journal 275 (2008) 1651–1662 ª 2008 The Authors Journal compilation ª 2008 FEBS Structural basis for ... Smo´lska for her excellenttechnical assistance. We also thank the reviewers for their comments on the manuscript. This work was sup-ported by grant 6 P04A 081 21, from the Polish Com-mittee for ... buffer.AcknowledgementsWe are very grateful to Professor Jerzy Ciesiolka for critically reading the manuscript and for helpful Recognition of Co2+ by RNA aptamers J. Wrzesinski and S. K. Jo´z´wiakowski1660...

Báo cáo khoa học: Structural basis for stereo-speciﬁc catalysis in NAD+-dependent (R )-2-hydroxyglutarate dehydrogenase from Acidaminococcus fermentans pptx

... col-oured red for arginine, blue for glutamate and aspartate, green for histidine, cyan for polar, orange for aromatic and aliphatic side chains,brown for Thr77–Gly79 and dark red for Gly153-Asp176. ... the substrate stereoselectivity and catalytic requirements for the hydride trans-fer reaction. A model for substrate recognition and turnover is discussed.The HGDH active site architecture is structurally ... explain-ing the structural rigidity observed for the nucleotide-binding domain when compared to the ﬂexibility dis-played by the substrate- binding domain in the openand closed enzyme conformations...

Báo cáo khoa học: Structural basis for the interaction between dynein light chain 1 and the glutamate channel homolog GRINL1A docx

... 735–740.11 Fan J, Zhang Q, Tochio H, Li M & Zhang M (2001) Structural basis of diverse sequence-dependent target recognition by the 8 kDa dynein light chain. J Mol Biol306, 97–108.12 Wang ... lowest-energy conformersfrom the selected cluster modelled using the Haddockdocking calculations. The rmsd values for the 20lowest-energy conformers of the best cluster are0.71 ± 0.11 A˚ for the ... calculated by NMR titrationor isothermal titration calorimetry (ITC) have beenreported for a few DYNLL1–target peptide complexes,ranging from 0.6 to 1 lm for Bim and swallow to 3 lm for dynein...

Báo cáo khoa học: Structural basis for poor uracil excision from hairpin DNA An NMR study pptx

... explana-tion for its poor excision by the enzyme. However, this stilldid not explain why the catalytic rate (Vmax) for U excisionin the U 2-hairpin is poor. For productive enzyme substrate complex formation, ... outÕform. Thereby, U may be spontaneously recognized by UDG. Recently, it has been shown that the excision of Ufrom such hairpin loops by UDG [2,3] is dependent on theU position in the loop. For ... the enzyme. Presumably, the potential energyrequired for these structural changes to occur before aproductive enzyme substrate complex is formed results inlower catalytic rates of U release...

Xem thêm

Từ khóa: báo cáo khoa học mẫu báo cáo khoa học y học báo cáo khoa học sinh học báo cáo khoa học nông nghiệp báo cáo khoa học lâm nghiệp Nghiên cứu sự biến đổi một số cytokin ở bệnh nhân xơ cứng bì hệ thống chuyên đề điện xoay chiều theo dạng Nghiên cứu tổ chức pha chế, đánh giá chất lượng thuốc tiêm truyền trong điều kiện dã ngoại Nghiên cứu tổ hợp chất chỉ điểm sinh học vWF, VCAM 1, MCP 1, d dimer trong chẩn đoán và tiên lượng nhồi máu não cấp Nghiên cứu vật liệu biến hóa (metamaterials) hấp thụ sóng điện tử ở vùng tần số THz Nghiên cứu tổ chức chạy tàu hàng cố định theo thời gian trên đường sắt việt nam Biện pháp quản lý hoạt động dạy hát xoan trong trường trung học cơ sở huyện lâm thao, phú thọ Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit ĐỒ ÁN NGHIÊN CỨU CÔNG NGHỆ KẾT NỐI VÔ TUYẾN CỰ LY XA, CÔNG SUẤT THẤP LPWAN Trả hồ sơ điều tra bổ sung đối với các tội xâm phạm sở hữu có tính chất chiếm đoạt theo pháp luật Tố tụng hình sự Việt Nam từ thực tiễn thành phố Hồ Chí Minh (Luận văn thạc sĩ)Nghiên cứu về mô hình thống kê học sâu và ứng dụng trong nhận dạng chữ viết tay hạn chế Sở hữu ruộng đất và kinh tế nông nghiệp châu ôn (lạng sơn) nửa đầu thế kỷ XIX Tổ chức và hoạt động của Phòng Tư pháp từ thực tiễn tỉnh Phú Thọ (Luận văn thạc sĩ)chuong 1 tong quan quan tri rui ro Nguyên tắc phân hóa trách nhiệm hình sự đối với người dưới 18 tuổi phạm tội trong pháp luật hình sự Việt Nam (Luận văn thạc sĩ)Giáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vật Giáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vật Giáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vật Trách nhiệm của người sử dụng lao động đối với lao động nữ theo pháp luật lao động Việt Nam từ thực tiễn các khu công nghiệp tại thành phố Hồ Chí Minh (Luận văn thạc sĩ)