Tài liệu Báo cáo khoa học: Solution structure of hirsutellin A – new insights into the active site and interacting interfaces of ribotoxins docx

... Journal 276 (2009) 238 1–2 390 ª 2009 The Authors Journal compilation ª 2009 FEBS Solution structure of hirsutellin A – new insights into the active site and interacting interfaces of ribotoxins Aldino ... interactions establishedin the active site is also of relevance. The active site: structural and electrostatic basis of HtA function The reaction catalyzed by ribotoxins follows a mecha-nism of ... that HtA is not an evolutionaryintermediate, but has actually evolved furtherthan other ribotoxins to become smaller and moreeconomical.At the same time, the active site of HtA, as revealedby...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Solution structure of crotamine, a Na+ channel affecting toxin from Crotalus durissus terriﬁcus venom docx

... structure and potential surface The characteristic NOE connectivities, reported in Fig. 3A, and the analysis of the / and w angle distribution allowed the identiﬁcation of the type and boundaries ... b, myotoxins and a- neurotoxins[34,35]. The presence of a positive band at approximately 195 nm and of a negative one in the range 21 0–2 15 nm, usuallyindicates a dominant antiparallel b-sheet ... to the mean structure, of 0.91 ± 0.15 A ˚for backbone atoms and 1.47 ± 0.15 A ˚for all heavy atoms. Further details of the statistics of the NMR models are listed in Table 1.Analysis of the...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Solution structure of the matrix attachment region-binding domain of chicken MeCP2 ppt

... of the Ramachandran plotshows that the dihedral angles / and w for the secondary structure elements are all found in the most favored or the additionally allowed region. A selected example of ... analysisNMR data were analysed and processed with the computerprogramsXWINNMR,AURELIA[22], and AUREMOL[23](Bruker, Karlsruhe, Germany). In the ﬁnal part of the assignment of the NOESY spectra, the ... This indicates that the remaining N-terminal and C-terminal regions of the domain are unstructured, asalready predicted by the chemical shift and TALOSanalyses.However, we note that the region...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Solution NMR structure of an immunodominant epitope of myelin basic protein Conformational dependence on environment of an intrinsically unstructured protein doc

... toGH), and by the Natural Sciences and EngineeringResearch Council of Canada (to GH). DSL was the recipient of an Ontario Graduate Scholarship. The authors are grateful to Dr Nam-Chiang Wang of the Peptide ... highrelaxation with 5-DSA have relatively lower relaxationbecause of the presence of Fe3+. The apparent fastrelaxation of V7¢ in the presence of both paramagneticagents suggests that the residue ... Schaffer AA, Zhang J, ZhangZ, Miller W & Lipman DJ (1997) Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein databasesearch programs. Nucleic Acids Res 25, 338 9–3 402.Supplementary materialThe...

Tài liệu Báo cáo khoa học: NMR structure of AII in solution compared with the X-ray structure of AII bound to the mAb Fab131 pptx

... boundto the mAb Fab131Andreas G. Tzakos1, Alexandre M. J. J. Bonvin2, Anasstasios Troganis3, Paul Cordopatis4, Mario L. Amzel5,Ioannis P. Gerothanassis1 and Nico A. J. van Nuland21Department ... interactions, there are threegeneral approaches that can be utilized to extract structuralinformation [4]: a peptide (ligand)-based approach, a receptor-based approach, and approaches that target the ligand–receptor ... 0.05 A ˚ and for all the heavyatoms (C a ,N,C¢, O) the RMSD is 0.32 ± 0.15 A ˚ .The RMSD values of the backbone atoms from the mean valuefor the 4–7 fragment is 0.10 ± 0.04 A ˚ and for all heavyatoms...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Solution NMR structure of ﬁve representative glycosylated polyene macrolide antibiotics with a sterol-dependent antifungal activity doc

... nystatin A1 and rimocidin) and twoheptaenes (candidin and vacidin A) have been calculatedusing geometric restraints derived from1H-NMR data and random searches of their conformational space. ... ergosterol,causing a major disorganization of the membrane structure [5] leading to the leakage of cellular materials and in turn the cellular death.Depending on their molecular structures, polyenemacrolides ... efﬁcient therapiesagainst animals, and human infectious diseases caused bypathogenic fungi. In particular, nystatin A1 , amphotericinB, and pimaricin (natamycin) are the most commonpolyene macrolides...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Crystal structure of an ascomycete fungal laccase from Thielavia arenaria – common structural features of asco-laccases ppt

... 2295Crystal structure of an ascomycete fungal laccase fromThielavia arenaria – common structural features of asco-laccasesJuha P. Kallio1, Chiara Gasparetti2, Martina Andberg2, Harry Boer2, ... weak homodimer, as observed for MaL, that may determine the properties of these asco-laccases at high protein concentrations.DatabaseStructural data are available in the Protein Data Bank database ... both the size and the shape of the pocket (Fig. 5A, B). Leu297in TaLcc1 (Ala297 in MaL) narrows the cavity ascompared with MaL, whereas Pro195 and Val428(Phe194 and Phe427 in MaL) make the cavity...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Crystal structure of importin-a bound to a peptide bearing the nuclear localisation signal from chloride intracellular channel protein 4 ppt

... atoms) and rjis the standard deviation of Bfactors. The normalized B factors have a zero mean and unitvariance. All atoms that satisfy Bz‡ 4 are treated as outliers and discarded. After ... binding sites, referred to as the major and minor binding sites [1]. These sites arelocated in the concave face of the protein near regions of invariant Trp and Asn arrays. The major binding site ... by the importin -a nuclear import pathway, provided that CLIC4 can undergo a conforma-tional rearrangement that exposes the NLS in an extended conformation.DatabaseStructural data are available...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Crystal structure of the cambialistic superoxide dismutase from Aeropyrum pernix K1 – insights into the enzyme mechanism and stability pdf

... Mn-bound(magenta) and Fe-bound (cyan) structures are superimposed, and the residues around the active site are shown via stick models. The red,magenta and cyan balls represent the active site water ... octahedral coordination around the metalcofactor. The absence of an anomalous Fourier map demon-strated that the active site in apo-ApeSOD did notcontain a metal cofactor (Fig. 3C). However, the ... bound to the metal, in the company of a water oxygen, from the apical positions. The manga-nese was only 0.06 A ˚out of the equatorial plane(Table 3). The angles around the metal cofactor sug-gested...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Crystal structure of Klebsiella sp. ASR1 phytase suggests substrate binding to a preformed active site that meets the requirements of a plant rhizosphere enzyme doc

... phytate with pH optima in the acidic range. They consist of two domains, a large a ⁄ bdomain and a small a domain with the catalytic site at the interface of the two domains [4,5]. HAPs can initi-ate ... substrate-freeAppA the C a atoms are 2.41 A ˚apart, whereas for the substrate-free PhyK and the substrate-loaded AppA the averaged distance is only 1.87 A ˚.Distinct conformational changes ... domains: an a ⁄ bdomain and an a domain (Fig. 1A) . The known active- site motif is found in a cavity between the two domains. The a ⁄ b domain consists of a central six-stranded bsheet of mixed...

Xem thêm

Từ khóa: tài liệu báo cáo nghiên cứu khoa học tài liệu về báo cáo khoa học báo cáo khoa học tài chính công báo cáo khoa học số loài quý hiếm tại vườn quốc gia ba bể tai lieu bao cao thuc tap khoa co khi tai lieu bao cao thuc tap tai khoa duoc benh vien Nghiên cứu tổ chức pha chế, đánh giá chất lượng thuốc tiêm truyền trong điều kiện dã ngoại Nghiên cứu vật liệu biến hóa (metamaterials) hấp thụ sóng điện tử ở vùng tần số THz Nghiên cứu tổ chức chạy tàu hàng cố định theo thời gian trên đường sắt việt nam Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit ĐỒ ÁN NGHIÊN CỨU CÔNG NGHỆ KẾT NỐI VÔ TUYẾN CỰ LY XA, CÔNG SUẤT THẤP LPWAN Phát hiện xâm nhập dựa trên thuật toán k means Thơ nôm tứ tuyệt trào phúng hồ xuân hương Thiết kế và chế tạo mô hình biến tần (inverter) cho máy điều hòa không khí Chuong 2 nhận dạng rui ro Quản lý nợ xấu tại Agribank chi nhánh huyện Phù Yên, tỉnh Sơn La (Luận văn thạc sĩ)BT Tieng anh 6 UNIT 2 Tăng trưởng tín dụng hộ sản xuất nông nghiệp tại Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển nông thôn Việt Nam chi nhánh tỉnh Bắc Giang (Luận văn thạc sĩ)Tranh tụng tại phiên tòa hình sự sơ thẩm theo pháp luật tố tụng hình sự Việt Nam từ thực tiễn xét xử của các Tòa án quân sự Quân khu (Luận văn thạc sĩ)Giáo án Sinh học 11 bài 15: Tiêu hóa ở động vật Trách nhiệm của người sử dụng lao động đối với lao động nữ theo pháp luật lao động Việt Nam từ thực tiễn các khu công nghiệp tại thành phố Hồ Chí Minh (Luận văn thạc sĩ)Chiến lược marketing tại ngân hàng Agribank chi nhánh Sài Gòn từ 2013-2015 MÔN TRUYỀN THÔNG MARKETING TÍCH HỢP TÁI CHẾ NHỰA VÀ QUẢN LÝ CHẤT THẢI Ở HOA KỲ QUẢN LÝ VÀ TÁI CHẾ NHỰA Ở HOA KỲ