... cho giải trìnhtựtrình bày phần phương pháp nghiên cứu Quá trình giải trìnhtự thực máy giải trìnhtựtự động ABI 3100 Sau giải trìnhtự gen mã hóa kháng nguyên HA virus H5N1, trìnhtự phân tích ... tốc độ tối đa phút 27 2.2.10 Xácđịnhtrìnhtự gen máy tự động Nguyên tắc: Dựa nguyên tắc Sanger có sử dụng dideoxynucleotit Trong kỹ thuật xácđịnhtrìnhtự máy tự động, người ta không đánh ... đọc trìnhtự 38 3.5 Kết xácđịnhtrìnhtự Sử dụng DNA plasmit cho phản ứng PCR giải trìnhtự với việc sử dụng sinh phẩm BigDyeR Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit Applied Biosystems, quy trình...
... thap nhit la 228 d vi tri codon thii ba He sd trang binh cua cac cap si (transition) va Sv (ttansversion) la 1,2 He s l ddi vdi vi tri codon thii nhat, thii hai va thii ba tuomg iing la 1,5; 0,6 ... codon thii ba Cac cap TT, CC, AJK va GG chiem uu the d tat ca vi fri codon, dao dpng tir 0,184 cho cap CC thupc vi tri codon thii hai den 0,299 cho cap GG ciing xuat hien d vi tri codon thii hai ... dai hda Cdn loai thii hai, Sa mpc dau gan day mdi dupc phat hien mpc hoang dai d Nghe An (Phan Ke Lpc, Nguyen Tien Hiep, 1999; Farjon, 2005) va mpt sd viing lan can khac, mdi dupc thir frdng rat...
... PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer 3.3 XÁCĐỊNHTRÌNHTỰ NUCLEOTIT CỦA MỘT SỐ ĐOẠNTRONG GENOME CỦA RGSV Cáctrìnhtự RGSV thu đƣợc máy xácđịnhtrìnhtựtự động ABI PRISM® 3100 Avant Genetic ... Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn 41 trìnhtự đem so sánh với trìnhtự phân đoạn RGSV GenBank cao (96- 99%) Kết chứng tỏ hai trìnhtựtrìnhtự phân đoạn RGSV Cáctrìnhtự thu đƣợc đƣợc đăng ký vào GenBank ... thu đƣợc sau xácđịnhtrìnhtự phù hợp với kích thƣớc lý thuyết thi t kế mồi So sánh trìnhtự cách so sánh chƣơng trình Blast (NCBI), hệ số tƣơng đồng trìnhtự đem so sánh với trìnhtự gen CP RGSV...
... giúp công cụ tính toán, nhà nghiên cứu xácđịnh gen nhiều sinh vật cách liên kết trìnhtự nhiều đoạn khác (quá trình gọi "lắp ráp gen" -genome [94] assembly) Những kỹ thuật sử dụng để xácđịnh ... xácđịnh gen người, hoàn thi n Dự án Bản đồ gen Người vào năm [39] 2003 Những kỹ thuật xácđịnhtrìnhtự cao (highthroughput) đột ngột làm giảm chi phí xácđịnhtrìnhtự ADN, đem tới hy vọng ... gián đoạn chuỗi phương pháp sử [93] dụng thường lệ Với kỹ thuật này, nhà khoa học nghiên cứu trìnhtự phân tử liên quan tới nhiều bệnh di truyền người Khi xácđịnhtrìnhtự trở nên đỡ...
... DNA tái tổ hợp 47 2.4.5 Giải trìnhtrìnhtự xử lý số liệu 48 CHƢƠNG 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 51 3.1 Kết thu nhận, giải trìnhtrìnhtựxácđịnh gen E6 HPV-16 L1 HPV-18 ... nhận, giải trìnhtrìnhtựxácđịnh gen EBNA – EBV 60 3.2.1 Kết kiểm tra DNA tổng số từ mẫu bệnh phẩm 60 3.2.2 Kết thực phản ứng PCR 61 3.2.3 Kết giải trìnhtự thu nhận ... ương – Hà Nội 2.2 Dụng cụ, trang thi t bị nghiên cứu hoá chất nghiên cứu 2.2.1 Dụng cụ, trang thi t bị Máy PCR (MJ Thermocycler, USA); Máy xácđịnhtrìnhtự DNA tự động (ABI-3100 Avant Genetic...
... 0,5µl dH2O 2.5µl Tổng thể tích 10µl 2.3.8 Phương pháp xácđịnhtrìnhtự nucleotid đoạn gen tách dòng Trìnhtự nucleotid đoạn gen tách dòng xácđịnh theo phương pháp tổng hợp Sanger cs [1], [12], ... Mạch) cácthi t bị thuộc Phòng Di truyền Vi sinh vật Phòng thí nghiệm trọng điểm Công nghệ Gen Viện Công nghệ Sinh học, Viện Khoa học Công nghệ Việt Nam Môi trƣờng: Các loại môi trường sử dụng trình ... aizawai phương pháp PCR 43 3.2 Tách dòng đọc trìnhtự gen cry1C .44 3.2.1 Tách dòng gen cry1C 44 3.2.2 Xácđịnhtrìnhtựđoạn gen cry1C 49 KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ ...
... xácđịnhtrìnhtự DNA Kỹ thuật tạo thư viện genome cDNA BM CNSH TV BM-CNSHTV – Khoa CNSH KỸ THUẬT XÁCĐỊNHTRÌNHTỰ DNA BM-CNSHTV Khái niệm Xácđịnhtrìnhtự DNA phương pháp xácđịnh trật tự xếp ... • Xácđịnhtrìnhtựđoạn gen tương đối dài, khoảng 300 ~ 400 bp BM-CNSHTV Bài tập nhà Giả sử đoạn DNA cần xácđịnhtrìnhtự có trìnhtự sau: 3’ 5’ ATTCTCAATGCTATGCTA Nêu bước tiến hành xácđịnh ... xạ tự ghi bị mờ, không rõ ràng, khó đọc xác • Phản ứng đòi hỏi DNA mẫu hoàn toàn mạch đơn, phải phân tách DNA thành sợi đơn trước tiến hành xácđịnh trỡnh tự • Chỉ áp dụng xácđịnhtrìnhtự đoạn...
... kích thƣớc phân đoạn RGSV gắn vào vectơ ban đầu trìnhtự đem so sánh với trìnhtự phân đoạn RGSV GenBank cao (96- 99%) Kết chứng tỏ hai trìnhtựtrìnhtự phân đoạn RGSV Cáctrìnhtự thu đƣợc đƣợc ... PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer 3.3 XÁCĐỊNHTRÌNHTỰ NUCLEOTIT CỦA MỘT SỐ ĐOẠNTRONG GENOME CỦA RGSV Cáctrìnhtự RGSV thu đƣợc máy xácđịnhtrìnhtựtự động ABI PRISM® 3100 Avant Genetic ... khử ion (3,5µl ) Tổng thể tích 10µl 2.3.10 Xácđịnhtrìnhtự so sánh trìnhtự gen thu đƣợc với trìnhtự tƣơng ứng GenBank Tách dòng xácđịnhtrìnhtự gen: Sản phẩm PCR đƣợc gắn vào vector tách...
... hành thực đề tài nghiên cứu: “Tạo dòng xácđịnhtrìnhtự số đoạn cDNA/EST từ chè trồng Thái Nguyên” 2 Mục tiêu nghiên cứu Tạo dòng xácđịnhtrìnhtự số đoạn cDNA/EST từ chè trồng Thái Nguyên ... Tổng hợp cDNA chè bằng phiên mã ngược 10/2015 Gắn cácđoạn cDNA/EST vào vector tạo dòng 11/2015 Tạo dòng cácđoạn cDNA/EST 12/2015- 1/2016 Xácđịnhtrìnhtựcácđoạn cDNA/EST đã được 2/2016-3/2016 tạo dòng ... kết chính: - Tạo dòng số đoạn cDNA/EST từ chè trồng Thái Nguyên - Xácđịnhtrìnhtựđoạn cDNA/EST tạo dòng từ chè trồng Thái Nguyên 3.2 Tiến độ thực STT Các nội dung công việc thực Thời gian...
... cỏc on cú chiu di khỏc nucleotid Điện di đoạn ADN nhận biết vị trí chúng nhờ đánh dấu phóng xạ Dựa vào để đọc trìnhtự ADN I.Phng phỏp Maxam-Gilbert Các bước tiến hành Chuỗi ADN kép đánh dấu ... riêng rẽ kết phản ứng gel Làm phim phóng xạ tự ghi cho gel điện di đọc trìnhtự nucleotit điện di đồ mẫu từ cực âm gel lên cực dương theo nguyên tắc: đoạn ADN ngắn dịch chuyển xa so với điểm xuất ... method III.Xỏc nh trỡnh t bng phng phỏp t ng Nguyên tắc chung giải trìnhtự gen tự động dựa theo sở phương pháp Sanger Nhưng : Quá trình tổng hợp AND thực nhờ kỳ thuật PCR Mỗi ddNTP đánh dấu loại...
... ddTTP) điện di khác Các băng ADN xácđịnh nhờ việc gắn đồng vị phóng xạ vào mồi, ddNTP Dựa vào để đọc trìnhtự ADN Các bước tiến hành: - Cắt ADN enzyme cắt giới hạn, tách đoạn ADN cắt thành sợi ... khác - Thu kết phương pháp tự ghi, chụp ảnh, làm phim phóng xạ tự ghi cho gel điện di đọc trìnhtự nucleotid điện di đồ mẫu từ cực âm gel lên cực dương theo nguyên tắc: Đoạn ADN ngắn dịch chuyển ... Chạy điện di để tách đoạn ADN tổng hợp lô phản ứng Điện di riêng rẽ kết phản ứng gel Tức điện di nhóm phản ứng phương pháp điện di gel polyacrylamid điều kiện biến tính để băng đoạn oligonucleotid...
... đọc trìnhtự hầu hết loại rDNA không đọc trìnhtự vùng primer NS2 NS3, NS4 NS5, NS6 NS7 có trìnhtự bổ sung, thi t kế để đọc trìnhtự vùng primer (White cộng sự, 1989) Các primer vùng ITS thi t ... Đọc trìnhtự sản phẩm PCR Có hai phương pháp đọc trìnhtự sản phẩm PCR: Một là, người ta tạo dòng phụ (subclone) sản phẩm PCR sau đọc trìnhtự subclone Hai là, đọc trìnhtự sản phẩm PCR cách ... tự đọc primer ITS4 primer ITS5 so sánh phần mềm Clustal chọn trìnhtự đọc đáng tin cậy So sánh trìnhtự PUL-Q2-4 RN-LA-10 phần mềm Clustal, tìm khác biệt So sánh trìnhtự PUL-Q2-4 với trình tự...
... PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer 3.3 XÁCĐỊNHTRÌNHTỰ NUCLEOTIT CỦA MỘT SỐ ĐOẠNTRONG GENOME CỦA RGSV Cáctrìnhtự RGSV thu đƣợc máy xácđịnhtrìnhtựtự động ABI PRISM® 3100 Avant Genetic ... Nguyên http://www.lrc-tnu.edu.vn 41 trìnhtự đem so sánh với trìnhtự phân đoạn RGSV GenBank cao (96- 99%) Kết chứng tỏ hai trìnhtựtrìnhtự phân đoạn RGSV Cáctrìnhtự thu đƣợc đƣợc đăng ký vào GenBank ... thu đƣợc sau xácđịnhtrìnhtự phù hợp với kích thƣớc lý thuyết thi t kế mồi So sánh trìnhtự cách so sánh chƣơng trình Blast (NCBI), hệ số tƣơng đồng trìnhtự đem so sánh với trìnhtự gen CP RGSV...
... vị trí ( trìnhtự ) xácđịnh Do đặc tính RE khả nhận biết cắt trìnhtựxácđịnh phân tử DNA nên dựa vào khả này, người ta chia chúng làm ba loại: - Loại I: Khi enzyme nhận biết trình tự, di chuyển ... tự nucleic Trìnhtự DNA xácđịnh phương pháp enzyme Sanger Cơ sở phương pháp: dựa vào tổng hợp mạch bổ sung với đoạn DNA mạch đơn cần xácđịnh nhờ enzyme DNA-polmerase Đồng thời, đoạn DNA bổ ... vùng có trìnhtự acid amin thay đổi gọi vùng biến đổi, ký hiệu VL Vùng lại có trìnhtự acid amin không thay đổi gọi vùng cố định, hiệu CL, vùng nằm phía đầu cacboxyl (-COOH) phân tửTrìnhtự acid...
... ADN Xácđịnhtrìnhtựđoạn gen vùng siêu biến I ADN plasmit sau kiểm tra khẳng định gắn sản phẩm PCR gửi cho “BIOSERVICE UNIT”, Bangkok, Thailand để xácđịnhtrìnhtự Kết xácđịnhtrìnhtự nucleotid ... gửi xácđịnhtrình tự) sau: So sánh trìnhtự nucleotid sản phẩm PCR mà thu với trìnhtự vùng siêu biến mtADN Anderson, 1981 công bố thu kết sau: REF: Trìnhtự nucleotid vùng siêu biến I công ... cô đặc ống Microcon-100 (Amicon) Nhân đoạn gen vùng siêu biến xácđịnhtrìnhtự Nhân đoạn gen vùng siêu biến tiến hành với cặp mồi LOOP460F/ LOOP460R chu trình nhiệt sau: 940C-3 phút 35 chu kỳ...