TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM HÀ NỘI KHOA SINH - KTNN ====== TRẦN THỊ THU THỦY TÌM HIỂU ĐẶC TÍNH VÀ PHÂN TÍCH SỰ ĐẶC TRƯNG CỦA TIỂU PHẦN NHÂN TỐ PHIÊN MÃ NUCLEAR FACTOR-YA Ở HỌ ĐẬU KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP Chuyên ngành: Di truyền - Công nghệ sinh học Hà Nội, 2019 TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM HÀ NỘI KHOA SINH - KTNN ====== TRẦN THỊ THU THỦY TÌM HIỂU ĐẶC TÍNH VÀ PHÂN TÍCH SỰ ĐẶC TRƯNG CỦA TIỂU PHẦN NHÂN TỐ PHIÊN MÃ NUCLEAR FACTOR-YA Ở HỌ ĐẬU KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP Chuyên ngành: Di truyền - Công nghệ sinh học Người hướng dẫn: ThS Phạm Phương Thu TS Chu Đức Hà Hà Nội, 2019 LỜI CẢM ƠN Lời đầu tiên, xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến TS Chu Đức Hà người thầy định hướng bước người ln theo sát, tận tình hướng dẫn, giúp đỡ tơi suốt q trình thực luận văn Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn tới ThS Phạm Phương Thu, Khoa Sinh - Kỹ thuật nông nghiệp trường Đại học Sư phạm Hà Nội động viên dẫn, đóng góp ý kiến tạo điều kiện để tơi hồn thành khóa luận Nhân dịp này, xin trân trọng cảm ơn ban chủ nhiệm Khoa Sinh - Kỹ thuật nông nghiệp cán môn Di truyền - Công nghệ sinh học trường Đại học Sư phạm Hà Nội tạo điều kiện hỗ trợ khoa học - kĩ thuật hướng dẫn tơi để tơi hoàn thành tốt nhiệm vụ nghiên cứu Cảm ơn bảo nhiệt tình đầy trách nhiệm tập thể cán nghiên cứu môn Sinh học phân tử - Viện Di truyền Nông nghiệp giúp đỡ tơi q trình thực Cuối cùng, tơi xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành tới gia đình, bạn bè tạo điều kiện thuận lợi cho thời gian, cổ vũ tinh thần để tơi hồn thành tốt luận văn kết thúc chương trình học thời hạn Xin chân thành cảm ơn! Hà Nội, ngày tháng năm 2019 Sinh viên thực Trần Thị Thu Thủy LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan số liệu, kết luận văn hồn tồn trung thực, khơng trùng lặp với đề tài nghiên cứu khác Tôi trực tiếp thực nghiên cứu khóa luận Cơng trình nghiên cứu chưa cơng bố tư liệu Tơi xin cam đoan r ng giúp đỡ, tạo điều kiện cho việc thực luận văn cảm ơn thơng tin, số liệu trích dẫn luận văn rõ nguồn gốc Tôi xin hoàn toàn chịu trách nhiệm với lời cam đoan trên! Hà Nội, ngày tháng năm 2019 Sinh viên thực Trần Thị Thu Thủy DANH MỤC CÁC KÍ HIỆU, VIẾT TẮT Kí hiệu Nghĩa tiếng anh Nghĩa tiếng việt ABA Acid Abscisic Axit Abxixic BLAST Basic Local Alignment Công cụ tìm kiếm trình Search Tool BlastP tự Basic Local Alignment Cơng cụ tìm kiếm trình Search Tool Protein tự protein DNA Deoxyribonucleic acid Axit đêoxyribônucleic JGI Joint Genome Institute Viện genome chung Mb Megabyte Megabit NCBI Nation NF-Y NST TF Center for Trung tâm thông tin biotechnology công nghệ sinh học quốc information gia Nuclear factor Y Yếu tố hạt nhân Y Transcription factor Nhiễm sắc thể Nhân tố phiên mã MỤC LỤC TRANG PHỤ BÌA LỜI CẢM ƠN LỜI CAM ĐOAN DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CHỮ VIẾT TẮT MỤC LỤC DANH MỤC CÁC BẢNG DANH MỤC CÁC HÌNH MỞ ĐẦU 1 Lí chọn đề tài Mục đích nghiên cứu Nội dung nghiên cứu Ý nghĩa khoa học thực tiễn 4.1 Ý nghĩa khoa học 4.2 Ý nghĩa thực tiễn NỘI DUNG Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Lĩnh vực nghiên cứu 1.2 Tổng quan họ Đậu 1.2.1 Tổng quan đậu tương 1.2.2 Tổng quan đậu gà 1.2.3 Tổng quan lạc 1.2.4 Tổng quan đậu côve 10 1.2.5 Tổng quan đậu xanh 12 1.2.6 Tổng quan cỏ linh lăng 15 1.3 Tổng quan yếu tố phiên mã NF-YA 16 1.3.1 Cấu trúc NF-Y tiểu phần NF-YA 16 1.3.2 Vai trò NF-YA thực vật 16 1.4 Tình hình nghiên cứu 17 1.4.1 Tình hình nghiên cứu giới 17 1.4.2 Tình hình nghiên cứu nước 18 Chương 2: DỮ LIỆU, PHẠM VI VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 20 2.1 Dữ liệu nghiên cứu 20 2.2 Phạm vị nghiên cứu, địa điểm thời gian 20 2.1.1 Phạm vị nghiên cứu 20 2.1.2 Địa điểm nghiên cứu 20 2.1.3 Thời gian nghiên cứu 20 2.3 Nội dung nghiên cứu 20 2.4 Phương pháp nghiên cứu 21 2.4.1 Phương pháp xác định NF-YA lạc đậu xanh 21 2.4.2 Phương pháp phân tích đặc tính NF-YA họ Đậu 22 2.4.3 Phương pháp xác định cấu trúc gene mã hóa NF-YA họ Đậu 23 2.4.4 Phương pháp xây dựng phân loại cho NF-YA họ Đậu 24 Chương 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 25 3.1 Kết xác định tiểu phần Nuclear factor-YAở lạc đậu xanh 25 3.2 Kết xây dựng phân loại NF-YA họ Đậu 31 3.3 Kết phân tích đặc tính NF-YA họ Đậu 36 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 41 Kết luận 41 Kiến nghị 41 DANH MỤC C NG TRÌNH Đ C NG B C LI N QUAN ĐẾN LU N VĂN 42 Tài liệu tham khảo 43 PHỤ LỤC DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 1: Thông tin họ gene mã hóa NF-YA lạc 28 Bảng 2: Thơng tin họ gene mã hóa NF-YA đậu xanh 28 Bảng 3: Tóm lược họ NF-YA lồi trồng 30 Bảng 4: Các thành viên thuộc sáu họ NF-YA sáu loài Đậu nghiên cứu 32 Bảng 5: Kết phân nhóm 61 gene NF-YA xét đến nghiên cứu 35 Bảng 6: Đặc tính NF-YA nhánh 38 Bảng 7: Đặc tính NF-YA nhánh 39 DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 2: Vai trò họ Đậu (Nguồn: Wikipedia) Hình 3: Cây đậu tương (Nguồn: Hồ Đình Hải - 4/2/2014) Hình 4: Cây đậu gà (Nguồn: Jovina Cooks - 14/9/2012) Hình 5: Cây lạc (Nguồn: Hồ Đình Hải - 5/2/2014) Hình 6: Cây đậu cơve (Nguồn: Bùi Thụy Đào Nguyên – 20/8/2013) 11 Hình 7: Cây đậu xanh (Nguồn: eminhatban - 2018) 13 Hình 8: Cây cỏ linh lăng (Nguồn: Ninjatacoshell - 14/4/2019) 15 Hình 1: Cơng cụ tìm kiếm BLAST 21 Hình 2: Cơng cụ tìm kiếm BlastP 22 Hình 3: Thơng tin gene 22 Hình 4: Trang GSDS 23 Hình 5: Phần mềm MEGA6.0 24 Hình 1: Cây phân loại gene mã hóa NF-YA loài nghiên cứu 34 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ Kết luận Đã xác định họ gene mã hóa tiểu phần NF-YA lạc đậu xanh gồm thành viên Họ gene mã hóa NF-YA họ Đậu họ đa gene với số lượng gene thành viên không phụ thuộc vào hệ gene loài Họ NF-YA loài họ Đậu nghiên cứu chia thành hai nhóm gồm phân nhóm phụ Trong đó, cấu trúc phổ biến gene NFYA chứa exon/4 intron Hầu hết NF-YA có kích thước 300 acid amin có tính bazơ Kiến nghị Dựa liệu biểu số gene NF-YA biết, vai trò nhóm gene NF-YA dự đốn tham gia vào q trình phát triển nốt sần phận khác họ Đậu Kiến nghị tiếp tục nghiên cứu hệ genome loài họ Đậu khác nh m củng cố kết thu phục vụ cho công tác chọn tạo giống đậu có khả chống chịu tốt với điều kiện bất lợi sinh học phi sinh học để đem lại suất chất lượng cao 41 DANH MỤC C NG TR NH Đ C NG Ố C LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN V N Chu Đức Hà, Trần Thị Thu Thủy, Phạm Phương Thu, Phạm Thị Lý Thu, Phạm Thị Xuân, La Việt Hồng, (2019), “Phân tích tính đặc thù cấu trúc tiểu phần Nuclear factor-YA họ Đậu”, ch h h c n n hệ Đ i h c Thái Nguyên (Chấp nhận đăng) 42 Tài liệu tham khảo Tài liệ u tiế ng Việ t [1] Trần Văn Điền (2007), Giá trình đậu tươn , NXB Nơng nghiệp [2] Chu Đức Hà, La Việt Hồng, Lê Hoàng Thu Phương, Lê Thị Thảo, Hoàng Thị Thao, Phạm Thị Lý Thu (2018), “Nghiên cứu cấu trúc gen mã hóa Nuclear factor-YB sắn liên quan đến tính chống chịu điều kiên bất lợi” T p chí Khoa h c công nghệ nông nghiệp Việt Nam, 5(90), - [3] Chu Đức Hà, Chu Thị Hiền Lương, La Việt Hồng, Thân Thị Hoa, Phạm Thị Lý Thu, Nguyễn Thị Thu Ngà (2018), “Nghiên cứu chế nhân rộng tiến hóa gen mã hóa nhân tố phiên mã Nuclear factor-YB cam (citrus sinensis)” T p chí Khoa h c cơng nghệ, 4(180), 37 - 42 [4] Chu Đức Hà, Nguyễn Thu Trang, Đoàn Thị Hải Dương, Vũ Thị Thu Hiền, Nguyễn Văn Giang, Phạm Thị Lý Thu, Lê Tiến Dũng (2017), “Phân tích in silico họ gen mã hóa yếu tố phiên mã Nuclear factor-YB cam (Citrus sinensis)” T p chí Khoa h c công nghệ nông nghiệp Việt Nam, 3, 22 - 26 [5] Ha, D.C., Dac L.X., Tram D.T.T., Thu P.T.L., (2017), “Genome-wide identffication and annotation of the Nuclear factor-YA gene family in cassava (Manihot esculenta Crantz)”, T p chí khoa h c công nghệ kỹ thuật Việt Nam, 3(59), 39 - 43 Tài liệ u nướ c [6] Al - Atawneh, N., Shehadeh, A., Amri, A and Maxted, N (2009), Conservation field guide to medics ICARDA, Syria [7] Aslam, M., Mahmood, I A., M.B Peoples, G.D Schwenke, D.F Herridge (2003), "Contribution of chickpea nitrogen fixation to increased wheat production and soil organic fertility in rain - fed cropping", Biology and Fertility of Soils, 38(1), 59 - 64 [8] Brink, (2006), Plant resources of tropical Africa, Wageningen, Netherlands 43 [9] Devendra, C., Sevilla, C., Pezo, D., (2001), “Food - feed systems in Asia”, Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, 14(5), 733 - 745 [10] Dillehay, Tom D "Earliest - known evidence of peanut, cotton and squash farming found" Retrieved June 29, 2007 [11] Edwards, D., Murray, J.A., Smith, A.G., (1998), “Multiple genes encoding the conserved CCAAT - box transcription factor complex are expressed in Arabidopsis”, Plant Physiol, 117, 1015 - 1022 [12] Feng, Z.J., He, G.H., Zheng, W.J., Lu, P.P., Chen, M., Gong, Y.M., Ma, Y.Z., Xu, Z.S., (2015), “ Foxtail millet NF-Y families: genome - wide survey and evolution analyses indentified two functional genes important in abiotic stresses”, Front Plant Sci, 6, 1142 [13] Gasteiger, E., Gattiker, A., Hoogland, C., Ivanyi, I., Appel, R D., Bairoch, A., (2003), “ExPASy: the proteomics server for in - depth protein knowledge and analysis” Nucleic Acids Res, 31(13): 3784-3788 [14] Goodstein, D.M., Shu, S., Howson, R., Neupane, R., Hayes, R.D., Fazo, J., Mitros, T., Dirks, W., Hellsten, U., Putnam, N., Rokhsar, D.S., (2012), "Phytozome: a comparative platform for green plant genomics", Nucleic Acids Res, 40(Database issue), D1178 - D1186 [15] Gresshoff, P.M., Hayashi, S., Biswas, B., Mirzaei, S., Indrasumunar, A., Reid, D., Samuel, S., Tollenaere, A., van Hameren, B., Hastwell, A., Scott, P., Ferguson, B.J., (2015), "The value of biodiversity in legume symbiotic nitrogen fixation and nodulation for biofuel and food production", J Plant Physiol, 172, 128 - 136 [16] Ha, D.C., Kien, H.N., Yasuko, W., Dung, T.L., Thu, L.T.P., Keiichi, M., Lam-Son, P.T., (2018), “Identification, structural characterization and gene expression analysis of members of the Nuclear factor-Y family in Chickpea (Cicer arietinum L.) under dehydration and abscisic acid treatments”, Int J Mol Sci, 19(11), E3290 44 [17] Ha, D.C., Oai, L.Q., Giang, N.V., Thu, P.T.L., (2016), Insight into the Nuclear factor-YA transcription factor family in sweet organge (Citrus sinensis) ResearchGate [18] Hahn, S., Pinkham, J., Wei, R., Miller, R., Guarente, L., (1988), “The HAP3 regulatory locus of Saccharomyces cerevisiae encodes divergent overlapping transcripts” Mol Cell Biol, 8, 655 - 663 [19] Hall T A., (1999), "BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT", Nucleic Acids Symp Ser, 41, pp.95 - 98 [20] Hoorman, J.J., Islam, R , Sundermermeier, A., (2009), “Sustainable crop rotations with cover crops”, Fact Sheet Agriculture and Natural Resources, 9, [21] Hu, B., Jin, J., Guo, A.Y., Zhang, H., Luo, J., Gao, G., (2015), "GSDS 2.0: An upgraded gene feature visualization server", Bioinformatics, 31 (8), 1296 - 1297 [22] Jauron, Richard, (February 5, 1997), "Growing Peanuts in the home garden", Horticulture and Home Pest News, Retrieved May 30, 2011 [23] Judd, W.S., Campbell, C S., Kellogg, E A., Stevens P.F., Donoghue, M J., (2002), Plant systematics: a phylogenetic approach, 287 - 292 [24] Krapovickas, Antonio, Gregory, Walton C., (2007), translated by David E Williams and Charles E Simpson "Taxonomy of the genus Arachis (Leguminosae)", IBONE, 16: - 205 [25] Krapovickas, Antonio; Gregory, Walton C., (1994), "Taxonomia del Genero Arachis (Leguminosae)" Bonplandia 8(1 - 4): - 186 [26] Kumar, S., Stecher, G., Tamura, K., (2016), "MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets", Mol Biol Evol, 33(7), 1870 - 1874 45 [27] Laloum, T., De Mita, S., Gamas, P., Baudin, M., Niebel, A., (2013), "CCAAT-box binding transcription factors in plants: Y so many?", Trends Plant Sci, 18(3), 157 - 166 [28] Lambrides, C J., Godwin, (2006), “Mungbean”, Genome mapping and molecular breeding in plants, 3: 69 - 90 [29] Liang, M., Yin, X., Lin, Z., Zheng, Q., Liu, G., Zhao, G., (2014), “Identification and characterization of NF-Y transcription factor families in Canola (Brassica napus L.)”, Planta, 1(239), 107 - 126 [30] Maesen, V.D., (1989), Somaatmadja, S PROSEA, Bogor, Indonesia [31] Marsalis, Mark; Puppala, Naveen; Goldberg, Natalie; Ashigh, Jamshid; Sanogo, Soumaila, Trostle, Calvin, (July 2009), "New Mexico Peanut production", Circular – 645, New Mexico State University, Retrieved 16 Oct 2015 [32] McNabb, D.S., Xing, Y., Guarente, L., (1995), “Cloning of yeast HAP5: a novel subunit of a heterotrimeric complex required for CCAAT binding”, Genes Dev, 9, 47 - 58 [33] Mei, X., Liu, C., Yu, T., Liu, X., Xu, D., Wang, J., Wang, G., Cai, Y., (2015), “Identification and characterization of paternal - preferentially expressed gene NF-YC8 in maize endosperm”, Mol Genet Genomics, 290, 1819 - 1831 [34] [34] Naomy, O., Kazunori, H., Ken-ichi, I., Kazuo, Y., (2003), “Physicochemical properties of Mungbean starch”, Journal of Applied Glycoscience, 4(50), 481 - 485 [35] Pereira, S.L.S., Martins, C.P.S., Sousa, A.O., Camillo, L.R., Araujo, C.P., Alcantara, G.M.; Camargo, D.S.; Cidade, L.C.; de Almeida, A.F.; Costa, (2018), “M.G.C Genome - wide characterization and expression analysis of citrus Nuclear factor-Y (NF-Y) transcription factors identified a novel NF- 46 YA gene involved in drought - stress response and tolerance”, PLoS One, 13(6):e0199187 [36] Petroni, K., Kumimoto, R.W., Gnesutta, N., Calvenzani, V., Fornari, M., Tonelli, C., Mantovani, R., (2012), “The promiscuous life of plant Nuclear factors-Y transcription factors”, Plant Cell, 24(12), 4777-92 [37] Quach, T.N., Nguyen, H.T., Valliyodan, B., Joshi, T., Xu, D., Nguyen, H.T., (2015), “Genome - wide expression analysis of soybean NF-Y genes reveals potential function in development and drought response”, Mol Genet Genom, 290(3), 1095 - 1115 [38] Reckling, M., Bergkvist, G., Watson, C.A., Stoddard, F.L., Zander P.M., Walker, R.L., Pristeri, A., Toncea, I., Bachinger, J., (2016), “Trade-offs between economic and environmental impacts of introducing legumes into cropping systems”, Front Plant Sci, 7:669 [39] Ripodas, C., Castaingts, M., Clua, J., Blanco, F., Zanetti, M.E., (2014), “Annotation, phylogeny and expression analysis of the nuclear factor-Y gene families in common bean (Phaseolus vulgaris)”, Front Plant Sci, 5, 761 [40] Schilling; Robert (5 Feb 2003) “L’arachide histoire et perspectives”, Agropolis Museum Retrieved, 16 Oct 2015 [41] Sekara, A., (2005), Chickpea milkvetch, Dzialkowiec, 12 [42] Shurtleff, Wlliam; Aoyagi, Akiko, (2009), “History of soybeans and soyfoods in Africa (1857 - 2009)”, Soy Info Center [43] Siefers, N., Dang, K.K., Kumimoto, R.W., Bynum, W.E, Tayrose, G., Holt, B.F., (2009), “Tissue-specific expression patterns of Arabidopsis NF-Y transcription factors suggest potential complexity”, Plant Physiol, 149,625 - 641 47 for extensive combinatorial [44] Singh, R.J (ed.), (2009), Genetic resources, chromosome engineering, and crop improvement: forage crops, CRC Press [45] Singh, Ram J., Nelson, Randall L., Chung, Gyuhwa (November 2, 2006), Genetic resources, chromosome engineering, and crop improvement: oilseed crops, Volume 4, London: Taylor & Francis p.15 [46] Small, E., (2011), Alfalfa and relatives: evolution and classification of Medicago”, NRC Research Press, Ottawa, Ontario, Canada [47] Stephenson, T J., McIntyre, C L., Collet, C., Xue, G.P., (2007) "Genomewide identification and expression analysis of the NF-Y family of transcription factors in Triticum aestivum", Plant Mol Biol, 65(1 - 2),77 - 92 [48] Thirumurugan, T., Ito, Y., Kubo, T., Serizawa, A., Kurata, N., (2008) “Identification, characterization and interaction of HAP family genes in rice”, Mol Genet Genom, 279, 279 - 289 [49] Wortmann, c.s., (2006), “Phaseolus vulgaris L.”, Plant resources of tropical Afica, Wageningen, Netherlands [50] Yang, W., Lu, Z., Xiong, Y., Yao, J., (2017), “Genome - wide identification and co - expression network analysis of the OsNF-Y gene family in rice”, Crop J, 5, 21 - 31 [51] Young, N.D., Debellé, F., Oldroyd, G.E., Geurts, R., Cannon, S.B., Udvardi, M.K., Benedito, V.A., Mayer, K.F., Gouzy, J., Schoof, H., Van de Peer Y., Proost S., Cook, D.R., Meyers, B.C., Spannagl, M., Cheung, F., De Mita S., Krishnakumar, V., Gundlach H., Zhou, S., Mudge, J., Bharti, A.K., Murray, J.D., Naoumkina, M.A., Rosen, B., Silverstein, K.A., Tang, H., Rombauts, S., Zhao, P.X., Zhou, P., Barbe, V., Bardou, P., Bechner, M., Bellec, A., Berger, A., Bergès, H., Bidwell, S., Bisseling, T., Choisne, N., Couloux, A., Denny, R., Deshpande, S., Dai, X., Doyle, J.J., Dudez, A.M., Farmer, A.D., Fouteau, S., Franken, C., Gibelin, C., Gish, J., Goldstein, S., González, A.J., Green, P.J., Hallab, A., Hartog, M., Hua, 48 A., Humphray, S.J., Jeong, D.H., Jing, Y., Jöcker, A., Kenton, S.M., Kim, D.J., Klee, K., Lai, G., Matthews, H., Lang, C., Lin, L., McCorrison, F.Z., Nicholson, C., Noirot, S., Macmil, J., Monaghan, C., O'Bleness, S.L., Magdelenat, E.L., Mun, M., Paule, J.H., Najar, C.R., Poulain, J., Prion, F., Qin, B., Qu, C., Retzel, E.F., Riddle, C., Sallet, E., Samain, S., Samson, N., Sanders, I., Saurat, O., Scarpelli, C., Schiex, T., Segurens, B., Severin, A.J., Sherrier, D.J., Shi, R., Sims, S., Singer, S.R., Sinharoy, S., Sterck, L., Viollet, X., Warfsmann, A., Wang, J., Weissenbach, B.B., Wang, J., White, K., Wang, D.D., White, M., Wang, J.D., Wiley, G.B., Wincker, P., Xing, Y., Yang, L., Yao, Z., Ying, F., Zhai, J., Zhou, L., Zuber, A., Dénarié, J., Dixon, R.A., May, G.D., Schwartz, D.C., Rogers, J., Quétier, F., Town, C.D., Roe, B.A., (2011), “ The Medicago genome provides insight into the evolution of rhizobial symbioses”, Nature, 480(7378), 520 - [52] Zhang, Z., Li, X., Zhang, C., Zou, H., Wu, Z., (2016), “Isolation, structural analysis, and expression characteristics of the maize nuclear factor-Y gene families”, Biochem Biophys Res Commun, 478, 752 - 758 Tài liệ internet u [53] "Livestock's long shadow: environmental issues and options" www.fao.org Retrieved 2016 - 01 - 15 [54] "Nutrition facts for peanuts, all types, raw, USDA Nutrient Data" Conde Nast, USDA National Nutrient Database, version SR-21 2014 Retrieved January 15, 2015 [55] http://eminhatban.vn/cay-trong/cay-dau-xanh-cay-do-xanh.Html [56] https://jovinacooksitalian.com/2012/09/14/what-can-i-do-with-chickpeas/ [57] https://sites.google.com/site/kysuhodhinhhai/cay-ho-dhau/cay-dhau-nanh [58] https://sites.google.com/site/kysuhodhinhhai/cay-ho-dhau/cay-dhau-phong 49 [59] https://vi.wikipedia.org/wiki/Medicago_truncatula#/media/File:Medicago_tr uncatula_A17_plant.JPG [60] https://vi.wikipedia.org/wiki/Phaseolus_vulgaris#/medi a/File:%C4%90%E1 %BA%ADu_c%C3%B4_ve.jpg [61] USDA, ARS, National Genetic Resources Program 2014 Germplasm Resources Information Network - (GRIN) Beltsville, Maryland Available at: https://npgsweb.ars-grin.gov/gringlobal/search.aspx February) [62] https://vi.wikipedia.org/wiki/Legume [63] https://www.inaturalist.org/observations/22568301 50 (Accessed: 17 PHỤ LỤC Trình tự protein 61 gene mã hóa NF-YA lồi nghiên cứu Đậ tươ : GmNF-YA1 MAMQTVYLKEHEGLVHSSVGQLSSVTSAPWWSALGSQPVYGEYCGQMKSFSLEISNYVDQFGAGKQAARGVEQLLDKGHTTQFTIFPGISSSDDCKMSGDAQNPQATLSLQSSLAEPHNRFEIGVNQPMICAKYPYMDQFY GLFSAYGPQISGRIMLPINLTSDEGPTYVNAKQYHGIIRRRQSRAKAVLENKMIKRRKPYMHESRHLHATRRPRGCGGRFLNTKSSTDGNGKNESEVIKTSGRQFQSSASQSSEVLQSEVGMLNSSKQTNRSSPNISGSEVTSM YSREGFDGFSVNPLGSSVHSLADMIGSEHGIIRPTKWVAAVPGNCYNLKI* GmNF-YA2 MQSKSETANQLRSDPHSFTPNNAYSEPWWRGIQYNPVPQAMLGVNASNSSSLERPNGDSESSEEDDDATKESQPTAPNQSGNYGQDHQAMQHSSSSAPLVRDDCLTQAPQVELVGHSIGYTPFIGMPHARMALPLEMAQEP VYVNAKQYQGILRRRQARAKAELEKKLIKVRKPYLHESRHQHAIRRARGNGGRFAKKTEVEASNHMNKEKDMGTGQVPLSRSISSSGFGSLPSDSAETWNSPSVQQDARGSQVHERFEERNYANVLQSSSTFCLHSGERVE EGDCSGQQRGSILSEHTSQRRLAIQ* GmNF-YA3 MQTVYLKEHEGNAHNFVGTLSSAASAPWWSAFGSQSVHQGESCGQVKPFSLELPNCIDQLAATKPLARGADQVLGKGHITQFTIFPDDCKMSDDAQKLQTTMSLQSSLTDPQSRFEIGFSLPTICAKYPYTDQFYGLFSAYAP QISGRIMLPLNMTSDDEPIYVNAKQYHGIIRRRQSRAKAVLDHKLTKRRKPYMHESRHLHAMRRPRGCGGRFLNTKNSVDGNGKIGNEVHKTVGEQLQSSGSQSSEFLQSEVGTFNSSKETNGSSPNISGSEVTSMYSRGGLD SFSLNHLGSAVHSFADMIDGGRGMIIPTKWVAAAGNCCNLKV* GmNF-YA4 MVWTVLRASRNMTSAHDLTDNEDDGQQQSESPMQPPSVNGISDPGISTQNVNVQYAAPGQLGTGHAMVPHVYPYPDPYYRSIFAPYDTQPYPPQAYSGQPMVHLQLMGIQQAGVPLPTDAVEEPVFVNAKQYHGILRRRQ YRAKAESENKIIRNRKPYLHESRHKHALTRPRGCGGRFLNSKKDKNQNDDVASADKSQSNININSNKNDQTSSDRAS* GmNF-YA5 MKNLCENGSGPTHLTSYALGCSSWGTSSESDVQQSSMSKSLSLKMSVLPQQCHKTKPLSFQYQDRDSSSTQSTGQSYPEVGSAQSGQISVQCSNSSASSTHNTTGGKSVEGVIGSTVGIQDCTFPPSQLCYNQSLAHTAFHFAE PCFSGLLAAPFVPQSNIHHAQLLGMTPARIPLPLDLSEEPMYVNAKQYHAILRRRQYRAKLEAQNKLIKERKPYLHESRHLHALKRARGSGGRFLNAKKLQELKLTSANRGLDVSGCTQLNLSGNMSESKVQAVENLNYRN GASTTTCSDVISTSNSDDVFQQHESDFRLCGYPSHIGRNMQGYSADIGGGGGGGNQHRLSVLM* GmNF-YA6 MTSAHDLTDNEDDGQQQSESQIQSPSANGISDPDISTQNVNVQYATPGQLGTGHAMVPPVYPYPDPYYRSIFAPYDTQPYPPQAYSGQPMVHLQLMGIQQAGVPLPTDAVEEPVFVNAKQYHGILRRRQSRAKAESENKVIR NRKPYLHESRHKHALRRPRGCGGRFLNSKKDENQHDDVTSADKSQSNINLNSNKNDQTSSDRTS* GmNF-YA7 MQSKSETANRLRSDPHSFQPGGVYSEPWWRGIGYNPMAQTMAGANASNSSSLECPNGDSESNEEGQSLSNSGMNEEDDDATKDSKPAAPNETGNYEQEQQGMQHTASSPPSMREECLTQTPQLELVGHSIACSTNPYQDPY YGGMMAAYGHQQLGYAPFIGMPHARMPLPLEMAQEPVYVNAKQYQGILRRRQARAKAELERKLIKSRKPYLHESRHQHAMRRARGTGGRFAKKTDGEGSNHLGKEKDNGTDSVQSISSSGSEPLHSDSAETWNSPNMQQ DARASKVHNSRFEAPSYQNGSGSYHNHNGLQSSVYHSSSGERVEERDCSGQQLNHN* GmNF-YA8 MCVDWDTVLHVNQEIMTSTHDLSDNEADDQQQSESQMEPLSANGISYAGIATQNVQYATPSQLGTGHAVVPPTYPYPDPYYRSIFAPYDAQTYPPQPYGGNPMVHLQLMGIQQAGVPLPTDTVEEPVFVNAKQYHGILRRR QSRAKAESEKKAARNRKPYLHESRHLHALRRARGCGGRFLNSKKDENQQDEVASTDESQSTINLNSDKNELAPSDRTS* GmNF-YA9 MKPFLFLNLPNTEFNSSQVDCNHSMAHSSYPYGDPIFAYGPQAISHPQMIPPMLGLASTRVALPLDLAEDGPIYVNAKQYHGILRRRQSRAKLEAQNKLIKNRKPYLHESRHRHALNRVRGSGGRFLSTKQLAQSNAEFVTGA HSGSDPTNRYQKEHLSEVESHSSKDGDNSSFITTCSDRPCLSGNNVNFRQQECMFLGNSANMGGSPQFSGGLTFGGAKQRTSVVR* GmNF-YA10 MAMQTVYLKEHEGLVYNSVGQLSSVTSAPWWSALGSQPVYGEYCGQIKPFSFEISNYVDQFPAGKQAVRGVEQLLDKGHTTTQFTIFPDDCKMSGDAENPQATLSLQSSLAEPHNRFEIGFNQPMICAKYPYMDQFYGLFS AFGPQISGRIMLPINLTSDDGPTYVNAKQYHGIIRRRLSRAKAVLENKMIKRRKPYMHESRHLHALRRPRGCGGRFLNTKGSTNGNGRNESKVNKTGGRQLQSSASQSSEVLHSEVGTLNSSKETNRSSPNISGSEVTSMYSRE GFDGFSVNRLGSSVHSLVDMVLSRPLNGLQQYQVTAATLKFD* GmNF-YA11 MPGKPDTDDWRVERGEQIQFQSSIYSHHQPWWRGVGENASKSSSDDQLNGSIVNGITRSETNDKSGGGVAKEYQNIKHAMLSTPFTMEKHLAPNPQMELVGHSVVLTSPYSDAQYGQILTTYGQQVMINPQLYGMHHARM PLPLEMEEEPVYVNAKQYHGILRRRQSRAKAEIEKKVIKNRKPYLHESRHLHAMRRARGNGGRFLNTKKLENNNSNSTSDKGNNTRANASTNSPNTQLLFTNNLNLGSSNVSQATVQHMHTEQSFTIGYHNGNGLTALYRS QANGKKEGNCFGKERDPNGDFK* GmNF-YA12 MKPFLLSHPDTMYNCSQVYCSHSLAHTSYPCGDPYFGSSIVAYGTQAITQQMVPQMLGLASTRIALPVELAEDGPIYVNAKQYHGILRRRQSRAKLKAQNKLIKSRKPYLHESRHRHALKRVRGTGGRFLSAKQLQQFNAEL VTDAHSGPGPVNVYQKKDASEAESHPSRTGKNASITFTAISGLTSMSGNSVSFRRPEHNFLGNSPNIGGSSQCSGGLTFGGGARQCTSVGR* GmNF-YA13 MPGKADTDDWRVERGEQIQFQSSIYSHHQPWRCGVGENASKSSSADQLNGSIVNGITRSETNDKSGEGVAKEYQNIKHAVLSTPFTMDKHLAPNPQMELVGHSVVLTSPYSDAQHGQILTTYGQQVMINPQLYGMYHARM PLPPEMEEEPVYVNAKQYHGILRRRQSRAKAELEKKVIKNRKPYLHESRHLHAMRRARGNGGRFLNKKKLENYNSDATSDIGQNTGANPSTNSPNTQHLFTNNENLGSSNASQATVQDMHRVESFNIGYHNGNGLAELYH SQANGKKEGNCFGKERDPNNGAFK* GmNF-YA14 MQSKSETANQLRSDPRSFAPNQSYSEPWWRGIQCNPVPQAMSGVNISNSSSLERPNGDSESSEEDDDATKEPQPTAPNQPGNYGQDHQALQHSSSSAPLVRDDCLTQAPQLELVGHSIGYAPFIGMPHARMALPLEMAQEPV YVNAKQYQGILRRRQARAKAELEKKLIKVRKPYLHESRHQHAIRRARGNGGRFAKKTEVEASNHMNEEKDMGTGQVPLSRSISSSGFGSLPSDSAETWNSPSVQQGARGSQVHERFEERNYANVLQSSSTSCLHSGERAEE GDCSGQQRGSISSEHTSQRRLAIQ* GmNF-YA15 MSRSLSSKVDVLPQQCHNSKTFNFQFQEQDASSTKSTDQSYPEVGQISVQHSSTDSTLIRNEGKSMGCVIRSFMGSQDFPFPPPLLDHRPILPVETAPVRIPLQLDFAEEPIYVNSKQYHAILRRRQYRAKLEALNKPIKDRKPYL HESRHQHALKRARGAGGRFLNTKKQLQSNHTPGNIAESKMHHIENYRDGADVSYAFNSDARNMQNDAADKGGGTTQQPLFVYM* GmNF-YA16 MTTSTRDISDNEADEQQQSEPQMQHLSANGISHAGIGTQNVQYATPPQLGTGHAVVPPTYPYPDPYYRSIFAPYDAQTYPPQPYGGNPMVHLQLMGIQQAGVPLPTDTVEEPVFVNAKQYHGILRRRQSRAKAESEKKAAR NRKPYLHESRHLHALRRARGCGGRFLNSKKDENQQDEVASTDESQSNINLNSDKNELAPSDRTS* GmNF-YA17 MKQFLFLNLPDTEINCSQVDCNHSMAHSSYPYGDPILAYGPQAISHPQMVPQMLGLASTRVALPLDLAEDGPIYVNAKQYHGILRRRQSRAKLEAQNKLIKSRKPYLHESRHRHALNRVRGSGGRFLSTKQLAQSNAEFVTG AHSGSDPTNIYQKEHPLEVESHSSKDGDNASFITTYSDRPCLSGNNLNFRQQECMFLGNSANMSGAPQCSGGLTFGGAKQRTSVVR* GmNF-YA18 MKNLCEKDSGPTHLTYYALGRTSWGTSSESDVQQSSMSKSLSLKISVLPQQCHKTKLLNFQYQDRDSSSTQSSGQSYPEVGSAQSGQISVQCSNCSACSTLNTTGGKSVEGVISSTVGIQDYTFPLSQLCYNQSLAHTAFHFAE PCFIGLVAAPYAPQPNINDAQLVGMSPARIPLPPDLIEGPMYVNAKQYHAILRRRQYRAKLEAQNKLIKERKPYLHESRHLHALKRARGSGGRFLNAKKLTSANHGDSITTCSDVFQQHESDFRLCGYPSRIGRSVQGYSVEIN IIYQSLCDKLFWHTSKCSIGKSSLAHLHYYV* GmNF-YA19 MKPFLSNHTDSMYNCSQVGCSHPMAHTSYPCGDPYFGSSIVAYGPQAINQQMVPQMLGLASTRIALPVDLAEDGPIYVNAKQYHGILRRRQSRAKLEAQNKLIKSRKPYLHESRHRHALNRVRGSGGRFLSAKQLPQSNAE LVTDAYQKKDASEAENHPSSTGENASITFTAISALTSMSSNSVNFPNMAGSSQCSGGLTFGAGALQCTSVGR* GmNF-YA20 MQSKSETANRLRSDPHSFQPGSVYSEPWWRGIGYNPVAQTMAGANASNSSSLECPNGDSESNEEGQSLSNSGMNEEDDDATKDSQPAAPNGTGNYGQEQQGMQHTASSAPSMREECLTQTPQLELVGHSIACATNPYQDP YYGGMMAAYGHQQLGYAPFIGMPHARMPLPLEMAQEPVYVNAKQYQGILRRRQARAKAELERKLIKSRKPYLHESRHQHAMRRARGTGGRFAKKTDGEGSNHSGKEKDNGTDSVLSSQSISSSGSEPLHSDSAETWNSPN MQQDARASKVHNRFKAPCYQNGSGSYHNHNGLQSSVYHSSSGERLEERDCSGQQLNHN* GmNF-YA21 MAMQTVYLKKHEGNAHNFVGTLSSAASAPWWSAFGSQSVHQGESCGQMKPFALELPNCIDQLAATKLSARGAEQVLGEGHTTQFTIFPDGCKMSDDAQKLQTTISLQSSLTDPHSRFEIGFSQPMLCAKYPYTDQFYGLFS AYAPQISYHGIIRRRQSRAKAVLDHKLTKRCKPYMHESRHLHAMRRPRGSGGRFLNTRSSINGNGKLGNEVHKTVGEQLQSSDSQSSEFLQSEVGTLNSSKETNGSSPNISGSEVTSMYSRGGLDSFSLNHLGSAVHSFANMI DGGRGMIIPPKWVAAAGNCYNLKV* Đậu gà CaNF-YA01 MKCLCEKDSGLCSAHSTSHHVFGCPSWGTSSESEVQQTSMSKTLSLKVDAIPQKCLKSKALSFQFQEHDSSSTQSSGQSYPEVGSPQSGQIPFQHSSSTSSTFKITEGNDMGCLIETSIGSPNLTIHPPPMDHSQSLAHFAFHFADP CYSGLLAASYGPQYKLLGTAAPVRIPLPSDLAEEPIFVNSKQYHAIMRRRQCRAKLEAHNKLIKDRKPYLHESRHVHALKRARGAGGRFLNAKKLQESKLDSPNHGQKSVSNYTCLNLNGNMVESKMHDEVENYRDGASY ASNRNEMLEQQEELEFRLCSYPSSQSGRNMQDYTADKGVGANERRHRLSVLM CaNF-YA02 MTSSTHDPTDNEADGQQQSEESQMQPISANGISHAGIDTQIVQYAAHPPLGTGHAMVPPAYPYPDPYYRSIFAPYDAQPYPPQPYGGHPMANLQLMGIQHAGVPLPTDAVEEPVFVNAKQYHGILRRRQSRAKAESEKKVAR NRKPYLHESRHLHALKRARGCGGRFLNSKKNENQQDEVASADNSQSNINLNSDRNDLAPSDKTS CaNF-YA03 MAMQSVYLKENEGIAHNFVGQLSSANSGAAPWWSSFGSQSLYGESGGCGQIKSFSLEPPISVNQFGATKQLGRGAEHLLGKEHTNHFTIFPDDFKMSADAQKPHTTISLQSSFPDTATRYELGFTQPMICTKYPYADQFYGLIS TYGPQIPGRVMLPLNMTSDDGPIYVNAKQYHGIIRRRQSRAKAVLGHKLIKRRKPYMHESRHLHAMRRPRGCGGRFLNTKKSANGDGKSGSKVHKFGGQQLQCSGSQSSEVLESDVGTLNSSKETNGSSPNISGSEVTSLYS RGNFDGFAVNHLGSSVHSLADMIDGGRGVIMPTKWVTAAGNCCNLKA CaNF-YA04 MAMQNVYLREHEGTFHNSVGQYSSVNSAPWWNNAFGSSQSVYGGDQSCGQMKPFSLELSNYIDQLGPSKHLGRGVEQLLDKGHTNQFTIFPDDCKMLGDAQNHQATLSLQSSFAVTEPHNRFELGFNQSMICAKYPYMD QFYGLFSTYGPQISGRIMLPLSLASDDGPTYVNAKQYHGIIRRRQSRAKAVLQNKLIKRSKPYMHESRHLHAMRRPRGCGGRFLNTKVSAIGNGKSGSEVKQKTGGLQLQSSGSQSSEVLQSEVGTLNSSKETNGGSPNVSGS EVTSMYSQGGLDSFAVNHIRSSVHSLGDMMDTEHGIVMPTKWFAAAGRQLLQP CaNF-YA05 MQSKSETANQLSSDPHSFQPGGVYSEPWWRGVGYNPVAQTMSGANSSSLDCPNGDSESNEEGQSLSNSGMNEEDDDAAKDSQPAAPNQPGNYGQEQQGMQHTASSAPSVREEGLTQTPQLELVGHSIACATNPYQDPYY GGMMAAYGHQPLGYPPFIGMPHARMPLPLEMAQEPVYVNAKQYQGILRRRQARAKAELERKLIKSRKPYLHESRHQHAMRRARGTGGRFAKKTDAEASNNSGKDKDNGSGPVMSSQSISSSGSEPFPSDSAETWNSPNVR QNARASNENGGSGSYHNNNNGMQSSRYHGERVDEGDCSGQLRGSISSKEASQRRLAIQ CaNF-YA06 MHIFWTSSESDVQQSSMSENLTLKMSVLPQQCHKTKPLGFQFQDQDSSSTQSTGQSYLEVGSGQSGPISVQYTNSSACSTLSKTGGKSVQGIIRSTAGSQDFSFPPSQLDHNQSLAHVAFPHAETCFSGLLAAPYGPQNNVHHA QLVGMAPVRIPLPLDLCEEPIYVNAKQYHAIMRRRQYRAKLEAQNKLIKNRKPYLHESRHLHALKRARGSGGRFLNTKKLQDHGLNVSSSTQLNLSENVAGSKVHQVENFRDGASTTACSDVTSTSNSDDMFQQHESDFRS CGYPSHMQGFSADVGGGGRNQHHLSVLM CaNF-YA07 MYHAPLYHLNAIQVLKAKAPNIPRKTCDSMPEKPESDDFGVKHREEVQLPSSIYSHHQPWWLGVGEIENASKSSSADQLTRSIMNGVTYSEANGVDINKQRHPLVSPSLSVTDKSGGDVAKEHRNIKHALSSTAFTLDKCLNP NLQTELDGHSIVLTSPHSNAQFGQILTTYGQQSMMNPQKLYRMHHHARMLLPLEMEEEPVYVNAKQYHGILRRRQSRAKAELEKKAIKVRKPYLHESRHLHALRRARGNGGRFLNTKKLEHNNSNVTFDKGNNEKQGSSN ASQSMHKMQGFNICYHDGNGFTTLCHSQANGKQEGDFFGQERSPNGAIK CaNF-YA08 MWSLRSADVVSYMKSFLFLNHPNSEFNCSPVDRNHSMAHAPYPYGDPIFAGSLVAYAPQAVNQPQMLPQMMGLASTRVALPLDLAQDGPIYVNAKQYHGILRRRQSRAKLEAQNKLIKSRKPYLHESRHKHALNRVRGSG GRFLSTKQLSQSNTEFVTGNQSGSGSINKYQKEDEMESRSSKTGDNASSITTCSDRTCFSGNSFNFRQPEHMFLGNSPNMGGGPPQCSGGLTFGGTKQRASVVR Lạc Ahy001549 MKPFLLLNHPDPVFNFEQVNSTHSMAHAPFPYSEPFFGGSLVAYGPQAVGQPQMLPQVLGLGSPRIALPLDLAEDGPIYVNAKQYHGILRRRQSRAKLEAQNKLIKNRKPYLHESRHRHALKRVRGSGGRFLSAKQLQLSNS ELINSARSGLNPVNVYHKKDASEVESHLSRTGENASSITTCSDLTSFSSNDINFRHPEHNFLGSSPNMGGAHNAVGDTPLVVEPSNVLHMPGERGGTKATELGSPIRAGKSSLA Ahy002194 MTSANDITDNEADGKQQSESEMQSSSANGTSDPDTGSQNVQFEKPAQLGDVLAMAPPGYPYPDPYYRSIFAPYDTQAYAPQPYGYGQMVHFQLMGIQQAGVPLPSDAFEEPVFVNAKQYHGILRRRQSRAKAESEHKAIRN RKPYLHESRHLHALKRARGCGGRFLNAKENENGHNDAASTDKSQCNINPNSDKSDITSSDRTV Ahy009687 MQSKSETANRLRSDPHSFQPSGVCSEPWWHGGGYSAIPQAMPGANASNSSSLECPNGESESNEEGQSLSNSGMNEEDDDAAKDSQPADPNQSGNYGQENQGMQHSAPSMREEGLAQAPQLELVGHSIACATNPYQDPYYG GMMAAYGPQQLGFAPFIGMPHARMPLPLEMAQEPVYVNAKQYQGILRRRQARAKAELEKKLIKSRKPYLHESRHQHAMRRARGTGGRFAKKSEVEGSNKGKEKDGSGPVLSSQSISSSGSEPLPCDSNQTWNSPNVQLNA RGSKVHDKYENGSGSYHSHNGLQSYHLHSGDRVDEGDCSGQQRGSITNEHASARRLAIQ Ahy010248 MAKQSVYPNKEHEGIAHNSSGPWWSLFGSQYGESCGQMKPFSLEIPNYVDQIDTGKQSARGAENISGKGHTTQFTIFPDDCKMPCGAQKPQAAISLQSPLADTNTRFELGFNQPMICAKYPYMDQIYGLFSPYGPQISGRDNA ATYMASDDGPIYVNAKQYHGIIRRRQSRAKAVLDNKLTKRRKPYPYMHESRHLHAMRRPRGCGGRFLNTKNSDDQNDKSGNKVIKALGEQLQSCGSQSSEVLQSEVGTLNSSKETNGSSPNISGSEVTSMYSRGGLDSFAIS HLGSAVTVHSLVDMIDGGRGMNMIMPPKWVAAVGGNCCNLNA Ahy015859 MKCMCEKESALCSVHATPAYVLGCSSSWGNSPESDVVQQSSMSDKLNLNMGVVLPQQCHKSRPLNLQFQEQDSSSTLSTNQSGQISIQHSNSSACSSSLSRNMEKSAGNQISSSMGILDFSFPPSELDRGQSTAPIAFHCAYPC YGGILAAAYDQHSKVIGSAAVRIPLPLDLREEPIYVNSKQYHAILRRRQYRAKLEAHNKLIRDRKPYLHESRHLHALKRARGAGGRFLNTKNLVQSKVTSTTTTSSYQAYIGRDIQDYTADTGGAASHRRLSVLM Ahy016660 MFAPNDTQPYPPQPYGGHPMAHIQLMGTQQAGVPLPANAIEEPVFVNAKQYHGILRRRQSRAKAESENKAIRNRKPYLHESRHQHALRRARGCGGRFLNSKKDENQQDELSPADKSHSNDNHNPDKNNLAPSDRAS Ahy022042 MPGKPESDEWRGGRSQQIQFQASIYAQPWWRGGAGENAPKSSSVDQQLNGSSAMNGGTITTQSETNEVVGFNKQMQSLISQSLPGIDNSGGDVTKEHQNIKHAFSSTPFTMGKHLGPNSENESIGHSIVLTSQAYFDAHYGG GLTPYGQQTMINPQLYGMNHARMLLPLEMEEEPVYVNAKQYHGILRRRQSRAKAELEKKVIKVRKPYLHESRHLHAMRRARGNGGRFLNTKKLEGNNNNSINPSMESGSSLSTATLHSNNDHYVVSQSMVHDMEKMQNF TIGFYGSNGLPQCTIHSLMEEMRDIALVEKGKACLCMEPQMGLLNDISPQVGGSLQHMATLKMKLVSFVSSNFGGDHRYNREFHLRQLILGSVKW Đậu côve PvNF-YA1 MAMQTVYLKEHEGNAPNFVGALSSAASAPWWSAFGSQAVHGGESCVQMKPFSLELPNCIDQHAVNKPSARGAEHVLGKGHTTQFTIFPDDCKMSDEAQTLQTTISLQPSLADSHSRFEIGFSQPMICAKYPYTDQFYGLFSA YAPQISGRIMLPLNMTSDDGPIYVNAKQYHGIIRRRQSRAKAVLHHKLTKRRKPYMHESRHLHAMRRPRGCGGRFLNTRKSANGNGKTGNEVHETVGERLHSSGSQSSEFLQSEAGTLNSSKETNGSSPNISGSEVTSMYSR GGLERFSLNHFGSSVHTLVDMIDGGRGMIIPTKWAAAAGNCCNLKV* PvNF-YA2 MTSAHNLTDNEDDGQHQSESQVQSPSANGISDSGISTQNVNVQYATPGQLGAGHAMVPPVYPYPDPYYRSIFAPYDTQPYPPQAYSGQPMVHLQLMGIQQAGVPLPTDAVEEPVFVNAKQYHGILRRRQSRAKAESENKAI RNRKPYLHESRHMHALRRPRGCGGRFLNSKKEENEHNDVASAEKSQSNINLNSDKNDQTSSDRTS* PvNF-YA3 MKPFLLSNRPDTMYNCSQVDFSHSMAHTPYPCADPYFASSLVAYAPQAINQPQMIPQMLGLASTRIALPVELAEDGPIYVNAKQYHGILRRRQSRAKLEAQNKLIKSRKPYLHESRHRHALKRVRGSGGRFLSAKQLQESNS EHVENTHSGPGPVKVYQKKDASEVESHPSRTVENACITFTAISGLTSMSSNSLNFRQPEHNFLGNSSNKGGSSQCSGGLSFGGGTRQCASVGR* PvNF-YA4 MNCLCEKDCGLFSSHSTSPNVLGCPSWGPSESRSLSLKVDAQPQQCHRTKTLSFQFQELDSSSTHSGQSSTKLGSSQSGQMSVEHSSTDSTHGIRSFMGNQDFTFPPPLLDHSQTLAHIAGHYADPGYSSLMASSYGSQFKHED QKNTDEIPNVQPVETAPIRIPLQLDITEEPIYVNSKQYHAILRRRQNRAKLEVQNKPIKDRKPYLHESRHLHALKRARGAGGRFLNTKKLQQSTRTRGNTAESSMHQMKNYRDGDDNATYASNSDARNMQNHTSDKGGGTT QQHPLFVYM* PvNF-YA5 MPSKSETANQPRSNPHSFAPNNVYSEPWWRGIQYNSVPQAMSGVNASNSSSLERPNGDSESSEDQSLSNNGVNEEDDDATKESQPTAPNQAGNYGQEHQAMLHSSTSAPSRRDDCLTHAPQLELIGHSFGYAPFIGMPHAR MALPLEMAQEPVYVNAKQYQGILRRRQARAKAELEKKLIKVRKPYLHESRHQHAMRRARGNGGRFAKKTEVEASSHTNKEKDMGAGPVPSDSAKTWNSPSVQQDTRESQVHERFGKHNYANVLQSSSAFCLHSGERVEE GVCSGQQRGSISSEQTSQRRLAIQ* PvNF-YA6 MPGKPDTDDWHEQIQFHPWWRAVGENASKSSSADQLNGSSSVPGTDKTGGCAAKEYQNIKHDMSSIPFTMDKHLAPNPHTEFVGHSVVLTSPYLDAQYGQMLTTYGQQVMINPPLYGMHQARMALPLEMEEEPVYVNA KQYHGILRRRQSRAKAELEKKVIRNRKPYLHESRHLHAIRRARGNGGRFLNTKKLENNSSDITSDKGNNGGANPSTNSFHTLHVLSNNENLGSSKTVQDMHRVQSFNNGYHNENGLTALYLPQVNGKKERDPLGAFK* PvNF-YA7 MQSKSETANRLRSDPHSFQPGSVYSEPWWRGIGYNPLAQTMAGANASNSSSLECPNGDSESNEEGQSLSNSGMNEEDDDATKDSQPAAPNEPGNYGQEQQGIQHTASSAPSMREECLTQTPQLELVGHSIACATNPYQDPY YGSMMAVYGHQQLGYPPFIGMPHARMPLPLEMAQEPVYVNAKQYQGILRRRQARAKAELERKLIKSRKPYLHESRHQHALRRARGTGGRFAKKSDAEGSNNSGKEKDNGTDSVLSSQSISSSGSEPLHSDSAETWNSPNM QQDARAAKVHNRFEAPGYQNGSGAYHNHHGLQSSVYHSSSGERVEEGDCSGQQLNHN* PvNF-YA8 MKNLIEKGSGSTHLAAPYALGCTSWGTSSESNVQQSSMSRGLTLKMSVLPQQCHKTKPLNFQYQDRDSSSSQSTGQSYQEVGSAQSGQISVQCSNSSACSTLNTTGRKSVEGAIRSVVRGQDFTFPPSQLCHNQPLAHAAFHL VEPCFSGLLASPYGPQPNIHPAQLIGMATARIPLPLDLSEEPIYVNAKQYHAILRRRQYRAKLEAQNKLIKERKPYLHESRHLHAMKRARGSGGRFLNTKKLEESKPTSANHAADVSSCTRLNLRGNMSESRRVVLVEKLNYR DGASTTTSSDITTASNSGDVFQQHQSEFRLCGYPSHIGRNMQGYSSDMGGGGGNQHRLSVLM* PvNF-YA9 MQTAYLKEHEGIVHNSVGQLSSATSAPWLNGLGSQPVCGDYCGQSKPFSLEFSNYVDQLAGDDCKMLGDGQNPPATLAPQSSVAEPPNHLELGFNQPMICAPYPCMDQFCGLVSAYGPQIPGRIMLPLNMASDDGPTYVNA KQYHGIIRRRQSRAKAVLENKMVKRRKPYMHESRHLHAMRRPRGNGGRFLNTRNSSNENGGNDVEGNQMGGLQFLSSASQSSEMMQSDVGMHSPMETDQYSPNMSSSEVSSMYSREGFDGFSVHPLGSSSVHPLGSSSV HPLGSSSVHPLGSSVHSIADMIGSGNGITMPTRWA* Đậu xanh Vradi02g14460 MREKISKMPGKPDCDDYGEQIQFHPWWRSIGENASKSSSADRLNGSPSLPGTDKTGGKEYQNIKHDLSSISFSMDKYLAPNPHTEFVGHSVVLTSPYSDAQYGQILTTYGQQVMINPPLYGMHQARMPLPLEMEEEPVYVNA KQYHGILRRRQSRAKAELEKKVIRNRKPYLHESRHLHAMRRARGNGGRFLNTKKLENNSSSVTSDEGNNSGANPSANSFNTLHRPTNNENLASSNMVQDMQRVQSFNNGYHNGNCLTALYLSQVNGKKEGGDYFGEGLN LIQLMMLY* Vradi03g05190 MAMQTVYLKEHEGNAHNSVGALSSAASAPWWSAFGSQPVHGVESCGQMKPFSLELPNCINHHAANKPSARGAEQVLGKGHTTQFTIFPDDAQTLQTTISLQPSLADSHSRFEIGFSQPMICAKYPYTDQFYGLFSAFAPQISG RIMLPLNMTSDDGPIYVNAKQYHGIIRRRQSRAKAVLHHKLTKRRKPYMHESRHLHAMRRPRGCGGRFLNTRKSANGNGKTGNEVHETVGERFHSSGSQSSEFLQSEAGTLNSSKETNGSSPNISGSEVTSMYSRGGLDRFS LNHFGPSVHSLADMIDGGRGMIVPPKWAAAAGNCCNLKDRPNIWSRQFIPGSSYFGNPSLAHGNFRQLILGSMYL* Vradi05g21240 MNCSSWGTSESRSLSLKVDFLPQQCHRSKTLSFQFQEQDSSSIHSGQSSTRLGSAKSGEMSVQHSSTGSTLQHRSFMQNQDFTFPPPLLDHGQTLAHYADPGYSNLMASSYGPQSMPVETAPMRIPLQLDVKEEPIYVNSKQY HAILRRRLYRAKLEVQNKPIKDRKVLNMSMFFCLQFLLNQTNNTVAMQPYLHESRHLHAVNRARGAGGRFLNTKKLQQSTRTRGNTAESNMHQIENYRDGDDTTYASNTAARIMQNCISDKGGGTTQQQPLFVYM* Vradi06g00750 MLHSSSSAPSRRDDCLPHAPQLELISHSFECASNPYYGYAPYIGMPHARMALPLEMAQEPVYVNAKQYQGILRRRQARAKAELEKKLIKVRKPYLHESRHQHAMRRARGNGGRFAKKTEVEASKHTNKEKDTGAAGPVSS PQSVSSSGLGPVPSEVHERLEKHNYANVLQSSSAFCLHSGERVEEGDCSGQQRGSISSEQSSQRRLAIQ* Vradi07g19460 MTQLRSGVCVPFMIAVFCILIVSHALENTLLDNEDEGQHQSESQVQSPSANGISDSAIRTQNVNVQYATPGQLGAGHAMVPPVYPYPDPYYRSIFAPYDTQPYPPQAYGGQPMVHLQLMGIQQAGVPLPTDAVEEPVFVNAK QYHGILRRRQSRAKAESENKAIRNRKPYLHESRHMHALRRPRGCGGRFLNSKKEENQHNDVASADKSQSNINLNSDKNDQTSSDRTS* Vradi07g23190 MKPFFLSNHPDTAMYNCSQVDFSHSMAHTPYPCGDPYFASSIVAYGPQAINQPQIIPQMLGLASTRIALPVELAEDGPIYVNAKQYHGILRRRQSRAKLEAQNKLIKSRKPYLHESRHRHALKRVRGSGGRFLSAKQLQESNA EHVDNNSHSGQKKDASEVESHNSRTAENASITFTAISGLTTMSSNSLNFRQPEHNFLGNSSNMGGSSQCSGGLTFGGGTRQCASVGR* Vradi08g01210 MAMRTAYLKEHEGIVHNSVGQLSSGTSAPWWNGLGSQPVYGDYCGQNKPFSLEFSNYIDPFSGGKQAVRGAEPVINRGHATQFSIFPGIKFGFGCISTRGRIMLPRNMASNNGPTYVNAKQYHGIIRRRQSRAKAVLENKYI KRRKPYMHESRHLHAMRRPRGNGGRFLNTRKNNNGNGGNDSDVNKMGGLQFLSSTSQSSEMLQSDVGMNSPMETDECSVNMSSSEVNSMYSREGFDGFPVYPLGSPADSLTNMVGKPFLAKLRQLIHGSPDSARAFHDM DVLYMVMAMQST* Vradi09g02290 MKNLNEKASGSTHLTAPYALGCSSWGASSESDVQQSSMSRGLTLKMGVLPQQCHKTKPLNFQYQDRDSSSSQSTGQSYPEVGSAQSGQFSVQCSNSSACSTLNTTGRKSIEGVIRSSVRGQDFTFPPSQMCQNQPHAHTAFH LAEPCFSGLLASPYGPQPNIHPAQLIGMATARIPLPLDLSEEPIFVNAKQYHAILRRRQYRAKLDAQNKLIKERKPYLHESRHLHALKRARGSGGRFLNTKKHEESKPTSHNHDIDVSRCTNLNLRGNMSESKARLMEKLNYR DGASTATCSDISSASNSGDLFQQHQPDIRLCVYPSHIGRNMQGYSPDINGGGGGGGANQHRLSVLM* Vradi10g03110 MQSKSETANRLRSDPHSFQPGSVYSEPWWRGIGYNPLAQTMAGANASNSSSLECPNGDSESNEEGQSLSNSGRNEEDDDATKEPQPAAPNEPGNYGQEQQGTQHTASSAPSMREECLTQTPQLELVGHSIACATNPYQDPY YGGMMAAYGHQQLGYAPFIGMPHARMPLPLEMAQEPVYVNAKQYQGILRRRQARAKAELERKLIKSRKPYLHESRHQHAMRRARGTGGRFAKKSDAEGSNNSGKEKDNGTDSVLSSQSISSSGSEPLHSDSAETWNSPN MQQDARAAKVQNRFEAPGFQNGSGSYNNHHSLQSSVYHSSSGERVEEGDRSGQQLNHN* Cỏ i h ă MtNF-YA1 MAMQPVYLKEHEGNVHNSVGQFSSVTSAPWWSNAYGSQPVYGGDSCGQMKPFSLELSNYIDQLAPSKNLVRGVEQLFDKGHTNQFTIFPDDCKMSVDTPNHQATLSLQSPFAAEPLNRFELGFNQSMICAKYPYMDQFYG LFSTYGPQISGRIMLPLSMTSDDGPTYVNAKQYHGIIRRRHSRAKAVLQNKLIKRNKPYMHESRHLHAMRRPRGCGGRFLNTKVSANGNGKSGSEENGNIGGLQLQSSGSQSSEVLQSEVGTLNSSKETNGGSPNVSGSEVTS MYTQGVLDSFTVNHIGSTVHSLGDMIDTGHGIVMPTKWFAAAGRQLLEP* MtNF-YA2 MTSSTHDPTDNEADGQQQSESQMQPISANGISHASIDNAQIVQYAAPPQLGTGHAMAPPPAYPYPDPYYRSIFAPYDAQPYPPQPYGGHPMANLQLMGIQHAGVPLPTDAVEEPVFVNAKQYHGILRRRQSRAKAESEKKVT RNRKPYLHESRHLHALKRARGCGGRFLNSKKDENQQDEVGSADNSHSNINLNSDRNDLAQSDKQP* MtNF-YA3 MKPFLSLNHPDTEFNCSQVDHNQSMAQTHAHYPYSDPIFAGSLVAYAPHAVNQPQMLPQMMGLASTRVALPLDLAQDGPIYVNAKQYHGILRRRQSRAKLEAQNKLIKNRKPYLHESRHKHALNRVRGSGGRFLSTKQLS ESNAEFVTGSHSGPGNNYQKEDTSEMESHHSSKTRDNISSITSCSDRTCFSGNSFSFRQPEHMFLGNSPNMGGGAPQCSGGLTFGGTKQRASVVR* MtNF-YA4 MKCLCEKDSAHSTPHHIFGCPSWGTSSESQVQQTSMSKGLSFKVEALPQECHNSKALSFQFQEQDSSSTQSTGSSQSGQIPFQHCSSTGSTFKRTEENNMGCLIGSSSIGSPNLTVHPPLMDHSQSLAHVALHYADPGYNGLLS ASYGQQYKLQAYSIMSSNSDQLLQGQLMETASVRIPLPSDMAEEPIYVNSKQYHAIMRRRQCRAKLEAHNKLIKDRKPYLHESRHVHALKRARGAGGRFLNAKKLQESKLDSPNHGQNVSTGYTCLNLNGNMSEPKMHDQ VENYRDDASDVAYGSNRNEMFQQQQELEFRLCSYPSSQTGRNMQDYTSDKNVGANQRRLSVRM* MtNF-YA5 MWVKGNGFGNLDFVPEGSEDMQPKSETANQPRSGPHSFQPGGVYSEPWWRGVGYNPVAQTMSGANSSSLDCPNGDSESNEEGQSLSNSERNEEDDDAAKDSQPAAPNQSGNYGQEQGMQNTASSAVIREECLTQTPQLE LVGHSIACATNPYQDPYYGGMMAAYPHQPLGYPPFIGVPHARMPLPLEMAQEPVYVNAKQYQGILRRRQARAKAELERKLIKSRKPYLHESRHQHALRRARGTGGRFAKKTDGEASGKDNGSGPVLSSQSISSSGSELLPSD SAETWNSPNMRQDARGSNENGGSSYHNNNNGMQSSRYQGERVEEGDCSGQLRVSISSNEASQRRLAIQ* MtNF-YA6 MAMQTVYLKEHEGIAHNFVGQLSSGTNNSAAAPWWSGFGSQSLYGESGGQIKSFSLEPPMSVVDQLASSKQSARGTEHVFGKGHTNHFTIFPDDFKMSGDAQKPHTAISLQSAVPDTPNRFELGFGQPMICTKYPYADQFY GLISTYGPQIQGRIMLPLNMTSDDGPIYVNAKQYNGIIRRRQSRAKAVLGHKLIKRNKPYMHESRHLHAMRRPRGCGGRFLNTKKSANGDGKTGSKVHKFGGQQLQFSGSQSSELLESDVGTLNSSKETNGSSPNISGSEVTS LYSRGNHDSFTVDHLGSSVLSMADMIDGGRGVIMPTKWVAAGNCCNLKA* MtNF-YA7 MKHSWPWGSSESGVQQSSMSENLTLNMSVLQQECHKSKPLVFQFQDQDSSSTQSTGQSYLEVGSGQSGPISVQYNNSSTCSTLSETGGKSTEGIILSSAGSRDFTLPSSQLDHNQSLAPVAFPHVETYSNGLLAAPYGSRNNV NHAQLAGMPPVRIPLPLNLCEEPIYVNAKQYHAILRRRQYRAKLEAQNKLVKNRKPYLHESRHLHALKRARGSGGRFLNTNKLQDHGFNVSTTTRVNPSGNVPESRVHQVEKYRDGASTTTCSDVTCASNSDDMFQQHES DFRSCGYPSHMQDLSADARGGGGGGGNQHRLSVLM* MtNF-YA8 MPGKPETDDWRIEHSEQVQLPSSIYSHHQPWWLENGSKPSSADQLNGSIMNDVTHSEPLVSPSLSLTDNSGGDVAKEHRNIKHTLSSTTASMDKHLYPNSQRELVGHSIVLTSPYSNAQFGQILNAYGQQAMMNPQLYQMH HARMLLPLKMEEEPVYVNAKQYHGILRRRQSRAKAELEKKVIKVRKPYLHESRHQHALRRARGNGGRFLNTKKPEHNDSNAALEKGNNTGTTSGTNNENQGSSNVSQHMHKMQGFNIGYHDGNGFTALCHSQANGKQE GDFFGKKRESNGAIK ...TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM HÀ NỘI KHOA SINH - KTNN ====== TRẦN THỊ THU THỦY TÌM HIỂU ĐẶC TÍNH VÀ PHÂN TÍCH SỰ ĐẶC TRƯNG CỦA TIỂU PHẦN NHÂN TỐ PHIÊN MÃ NUCLEAR FACTOR- YA Ở HỌ ĐẬU KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP... họ Đậu 24 Chương 3: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 25 3.1 Kết xác định tiểu phần Nuclear factor- YA lạc đậu xanh 25 3.2 Kết xây dựng phân loại NF -YA họ Đậu 31 3.3 Kết phân tích đặc tính NF -YA họ. .. dung 2: Phân tích đặc tính NF -YA họ Đậu Nội dung 3: Xác định cấu trúc gene mã hóa NF -YA họ Đậu Nội dung4: Xây dựng phân loại cho NF -YA họ Đậu Ý nghĩa khoa học thực tiễn 4.1 Ý nghĩa khoa học Kết