Nghiên cứu dịch tễ học bệnh dịch tả lợn cổ điển (classical swine fever) ở lợn tại miền bắc việt nam giai đoạn 2014 2017

157 79 0
Nghiên cứu dịch tễ học bệnh dịch tả lợn cổ điển (classical swine fever) ở lợn tại miền bắc việt nam giai đoạn 2014 2017

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM ¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯ NGUYỄN PHỤC HƯNG NGHIÊN CỨU DỊCH TỄ HỌC BỆNH DỊCH TẢ LỢN CỔ ĐIỂN (CLASSICAL SWINE FEVER) Ở LỢN TẠI MIỀN BẮC VIỆT NAM GIAI ĐOẠN 2014 - 2017 LUẬN ÁN TIẾN SĨ NHÀ XUẤT BẢN HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP - 2019 HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM ¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯ NGUYỄN PHỤC HƢNG NGHIÊN CỨU DỊCH TỄ HỌC BỆNH DỊCH TẢ LỢN CỔ ĐIỂN (CLASSICAL SWINE FEVER) Ở LỢN TẠI MIỀN BẮC VIỆT NAM GIAI ĐOẠN 2014 - 2017 Chuyên ngành: Dịch tễ học thú y Mã số: Người hướng dẫn khoa học: GS.TS Nguyễn Thị Lan PGS.TS Lê Văn Phan HÀ NỘI, 2019 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi, kết nghiên cứu trình bày luận án trung thực, khách quan chưa dùng để bảo vệ lấy học vị Tôi xin cam đoan giúp đỡ cho việc thực luận án cám ơn, thơng tin trích dẫn luận án rõ nguồn gốc Hà Nội, ngày tháng năm 2019 Tác giả luận án Nguyễn Phục Hƣng i LỜI CẢM ƠN Trong suốt q trình học tập, nghiên cứu hồn thành luận án, nhận hướng dẫn, bảo tận tình thầy giáo, giúp đỡ, động viên bạn bè, đồng nghiệp gia đình Cho phép tơi bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới GS.TS Nguyễn Thị Lan PGS.TS Lê Văn Phan tận tình hướng dẫn, dành nhiều cơng sức, thời gian tạo điều kiện cho suốt trình học tập thực đề tài Xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành tới Ban Giám đốc, Ban Quản lý đào tạo, Bộ môn Bệnh lý thú y, Bệnh viện thú y, Khoa Thú y - Học viện Nơng nghiệp Việt Nam tận tình giúp đỡ, tạo điều kiện cho tơi q trình học tập, thực đề tài hoàn thành luận án Tôi xin chân thành cảm ơn tập thể lãnh đạo, cán Phịng thí nghiệm trọng điểm cơng nghệ sinh học thú y Phịng thí nghiệm mơn bệnh lý, khoa Thú y, Học viện Nông nghiệp Việt Nam giúp đỡ tạo điều kiện cho suốt trình thực đề tài Xin chân thành cảm ơn gia đình, người thân, bạn bè, đồng nghiệp tạo điều kiện thuận lợi giúp đỡ mặt, động viên tơi hồn thành luận án./ Hà Nội, ngày tháng năm 2019 Tác giả luận án Nguyễn Phục Hƣng ii MỤC LỤC Lời cam đoan i Lời cảm ơn ii Mục lục iii Danh mục từ viết tắt vi Danh mục bảng viii Danh mục hình ix Trích yếu luận án .x Thesis abstract .xii Phần Mở đầu 1.1 Tính cấp thiết đề tài .1 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Phạm vi nghiên cứu .3 1.3.1 Địa điểm nghiên cứu 1.3.2 Thời gian nghiên cứu 1.4 Những đóng góp đề tài 1.5 Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài .3 1.5.1 Ý nghĩa khoa học 1.5.2 Ý nghĩa thực tiễn Phần Tổng quan tài liệu .5 2.1 Những nghiên cứu nước bệnh dịch tả lợn .5 2.1.1 Trên giới 2.1.2 Ở Việt Nam 2.2 Bệnh dịch tả lợn 2.2.1 Virus dịch tả lợn 2.2.2 Một số đặc điểm dịch tễ học bệnh dịch tả lợn 19 2.2.3 Triệu chứng bệnh tích bệnh dịch tả lợn 22 2.2.4 Các phương pháp chẩn đoán bệnh dịch tả lợn 25 2.2.5 Phòng chống bệnh dịch tả lợn 26 2.2.6 Xu hướng sản xuất vaccine phòng bệnh Dịch tả lợn 28 2.2.7 Đáp ứng miễn dịch bệnh Dịch tả lợn tượng dung nạp miễn dịch 32 iii Phần Vật liệu phƣơng pháp nghiên cứu 3.1 Nội dung nghiên cứu 3.1.1 Nghiên cứu số đặc điểm dịch tễ học bệnh dị 2014 – 2017 miền Bắc Việt Nam 3.1.2 Hiện tượng mang trùng dung nạp miễn dịch 3.1.3 Một số đặc điểm dịch tễ học phân tử chủng vi 3.2 Vật liệu nghiên cứu 3.2.1 Số liệu nghiên cứu 3.2.2 Động vật thí nghiệm 3.2.3 Thuốc thử vật liệu thử 3.2.4 Thiết bị, dụng cụ 3.3 Phương pháp nghiên cứu 3.3.1 Phương pháp nghiên cứu dịch tễ học 3.3.2 Phương pháp tính tốn 3.3.3 Phương pháp xét nghiệm 3.3.4 Phương pháp giải trình tự gen 3.3.5 Phương pháp xây dựng phả hệ 3.3.6 Phương pháp phân tích đặc điểm dịch tễ học phân tử 3.3.7 Phương pháp xử lý số liệu Phần Kết thảo luận 4.1 Nghiên cứu số đặc điểm dịch tễ học bệnh d 2014-2017 miền Bắc Việt Nam 4.1.1 Xác định vùng nghiên cứu 4.1.2 Xác định ca mắc bệnh dịch tả lợn 4.1.3 Tình hình bệnh dịch tả lợn theo vùng địa lý 4.1.4 Tình hình bệnh dịch tả lợn theo lứa tuổi, theo phươn theo giống lợn nuôi 4.1.5 Hệ số năm dịch hệ số tháng dịch bệnh dịch tả 4.1.6 Tỷ lệ mắc tốc độ mắc bệnh bệnh dịch tả 2014-2017 4.2 Hiện tượng mang trùng dung nạp miễn dịch iv 4.2.1 Kết đánh giá tượng mang trùng lợn nái khả dung nạp miễn dịch lợn 65 4.2.2 Kết đánh giá khả dung nạp miễn dịch lợn sinh từ lợn nái tiêm vaccine dịch tả lợn đầu thai kỳ 68 4.3 Một số đặc điểm dịch tễ học phân tử chủng virus dịch tả lợn phân lập 74 4.3.1 Kết giám định virus dịch tả lợn kỹ thuật RT-PCR 74 4.3.2 Kết phân tích tính đa dạng di truyền CSFV 75 4.3.3 Đặc điểm biến đổi gen E2 chủng CSFV .80 4.3.4 Kết nghiên cứu phân tích phả hệ CSFV Việt Nam 87 4.3.5 Đặc điểm dịch tễ học phân tử virus gây bệnh dịch tả lợn Việt Nam theo không gian thời gian 91 Phần Kết luận đề nghị 95 5.1 Kết luận 95 5.1.1 Một số đặc điểm dịch tễ học bệnh dịch tả lợn giai đoạn 2014-2017 miền Bắc Việt Nam 95 5.1.2 Hiện tượng mang trùng dung nạp miễn dịch 95 5.1.3 Dịch tễ học phân tử virus dịch tả lợn 96 5.2 Đề nghị 96 Danh mục cơng trình cơng bố có liên quan đến luận án 97 Tài liệu tham khảo 98 Phụ lục 116 v DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT Chữ viết tắt Chữ viết đầy đủ 3’ NTR 3' nontranslated region 5’NTR 5' nontranslated region aa Amino acid BD Boder disease BDV Border Disease Virus BNNPTNT Bộ Nông nghiệp Phát triển Nông thôn Bp Base pair BVDV Bovine Viral Diarrhea Virus cDNA Complementary deoxyribonucleic acid CI Confidence Interval CPE Cytophathogenic Effect cs Cộng CSF Classical Swine fever CSFV Classical Swine Fever Virus CSMBTBT Chỉ số mắc bệnh trung bình tháng Ctv Cộng tác viên DNA Deoxyribonucleic Acide dNTP Deoxyribonucleoside triphosphate EC European Community ELISA Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay FAO Food and Agriculture Organization HSTD Hệ số tháng dịch HSND Hệ số năm dịch HT Huyết IHC Immunohistochemistry MB Mắc bệnh M-MLV Moloney murine leukemia virus mRNA Messenger Ribonucleic acid vi Chữ viết tắt Chữ viết đầy đủ NP LA NS nt NX B OI E PC R RN A RTPC R RTnP CR SN NC TC TC ID TC VN TĐ M M TL H M TL TV TT US A US D VN UA WTO N e u t r a l i z a t i o n P e r o x i d a s e L i n k e d A s s a y N o n s t r u c t u r a l Nucleotide Nhà xuất Office Internationa l des Epizooties Vietnam National University of Agriculture World Trade Organization Polymerase Chain Reaction Ribonucleic Acide Reverse transcriptio nPolymerase Chain Reaction Reverse Transcriptio n – nested Polymerase Chain Reaction Số năm nghiên cứu Tổ chức Tissue Culture Infective Dose Tiêu chuẩn Việt Nam Tốc độ mắc Tỷ lệ mắc Tỷ lệ tử vong Thông tư United States of America United States dollar vii PHỤ LỤC Trình tự genome virus CSF dùng nghiên cứu TT Nhóm G2.1 G2.1 G2.1 G2.1 G2.1 G2.1 G2.1 G2.1 G2.1 10 G2.1 11 G2.1 12 G2.1 13 G2.1 14 G2.1 15 G2.1 16 G2.1 17 G2.1 18 G2.1 19 G2.1 20 G2.1 21 G2.1 22 G2.1 23 G2.1 24 G2.1 25 G2.1 26 G2.1 27 G2.1 28 G2.1 29 G2.1 30 G2.1 31 G2.1 GenBa MG387 MG387 LC4258 MF150 MF150 MF150 MF150 MF150 KU556 KX064 MF150 MF150 KT1193 KY290 KX870 LC0866 JQ2687 KC149 FJ5292 KC149 GU592 MF149 MF149 MF149 KP2330 KY132 GQ122 HQ148 MF679 GQ923 KP3436 32 G2.1 33 G2.1 34 G2.1 35 G2.1 36 G2.1 37 G2.2 38 G2.2 39 G2.2 40 G2.2 41 G2.2 116 Trình tự gen E2 dùng nghiên cứu TT Nhóm GenBank JQ411562 2Gx.y JQ411565 3Gx.y KX345847 4Gx.y KY990413 5Gx.y KY990414 6Gx.y KY990415 7Gx.y KX431228 8Gx.y KX431229 9Gx.y KX431230 10Gx.y KX431231 11Gx.y KX431227 12Gx.y KX431232 13Gx.y KX431233 14Gx.y KF233944 15Gx.y KX687717 16Gx.y KF233947 117 1Gx.y TT 17Gx.y KX687718 18Gx.y KF233949 19G2.3 HQ148062 20Gx.y KF233951 21Gx.y KF233952 22Gx.y KF233957 23Gx.y KF233959 24Gx.y FJ456870 Nhóm GenBank 25Gx.y FJ456875 26Gx.y FJ456869 27Gx.y FJ456871 28G1.x EU497410 29G2.1 GQ122383 30Gx.y FJ456867 31Gx.y FJ456872 32Gx.y FJ456873 33Gx.y FJ456874 KX759643 35Gx.y FJ456865 36Gx.y FJ456866 37Gx.y FJ456868 38Gx.y FJ456876 39G2.1 FJ529205 40G1.x HM175885 41Gx.y FJ582642 42Gx.y FJ582643 43Gx.y FJ582644 44Gx.y FJ598609 45Gx.y FJ598610 46Gx.y FJ598611 47Gx.y FJ598612 48Gx.y FJ607779 49Gx.y FJ607780 50Gx.y HQ380235 118 34Gx.y TT Nhóm GenBank HQ380236 52Gx.y HQ380237 53Gx.y HQ697222 54Gx.y HQ697223 55Gx.y KJ661548 56G2.1 GQ923951 57G2.1 GU592790 58G1.x HQ380231 59Gx.y FJ977628 60Gx.y HQ380232 61Gx.y HQ380234 62Gx.y HQ380238 63Gx.y HQ380239 64Gx.y HQ380240 65Gx.y HQ380241 66Gx.y HQ380244 67Gx.y HQ380245 119 51Gx.y TT 68Gx.y HQ697224 69Gx.y HQ697225 70Gx.y HQ697227 71Gx.y HQ697228 72Gx.y KX759642 73G2.1 JQ268754 74Gx.y HQ317681 75Gx.y HQ380233 76Gx.y HQ380242 Nhóm GenBank 77Gx.y HQ380243 78Gx.y HQ697226 79G2.1 JX262391 80G2.1 KP343640 81G2.1 KU504339 82G2.1 KY132096 83Gx.y JN882005 84Gx.y JN886990 JQ001833 86Gx.y JQ001834 87Gx.y JX898523 88Gx.y KC809979 89Gx.y KC809981 90Gx.y KC809982 91Gx.y KC809983 92Gx.y KC809984 93Gx.y KC809985 94Gx.y KC867687 95Gx.y KT853102 96Gx.y KT853103 97Gx.y KT853104 98Gx.y KT853105 99Gx.y KT853106 100Gx.y KT853107 101Gx.y KT853108 120 85Gx.y 102Gx.y TT Nhóm KT853109 GenBank KT853110 104Gx.y KT853111 105Gx.y KT853112 106Gx.y KT853113 107Gx.y KT853114 108Gx.y KT853115 109Gx.y KT853116 110G2.1 JX218094 111Gx.y JX898524 112Gx.y JX898525 113Gx.y KC597187 114Gx.y KC809980 115Gx.y KC809986 116Gx.y KC867688 117Gx.y KC867689 118Gx.y KU375252 121 103Gx.y 119G2.1 KP233070 120G2.1 KP233071 121G2.1 MF679604 122Gx.y KT953592 123Gx.y KU375253 124G2.1 KT119352 125G2.1 MF149061 126G2.1 MF149062 127G2.1 MF149063 128G2.1 MF150644 TT Nhóm GenBank 129G2.1 MF150645 130Gx.y KT953589 131Gx.y KT953604 132Gx.y KU375249 133Gx.y KU375250 134Gx.y KU375251 135Gx.y KU375256 KU375257 137Gx.y KU375258 138Gx.y KU375259 139Gx.y KU375260 140Gx.y KU375261 141Gx.y KU375262 142Gx.y KX880081 143Gx.y KX880084 144Gx.y KX886279 145Gx.y KX898427 146Gx.y KX898428 147Gx.y KX898429 148Gx.y KX898430 149Gx.y KX898431 150Gx.y KX898432 151Gx.y KX898433 152G2.1 KU556758 122 136Gx.y 153G2.1 KX064281 154G2.1 MF150640 TT Nhóm GenBank MF150641 156G2.1 MF150642 157G2.1 MF150643 158G2.1 MF150646 159Gx.y KT953587 160Gx.y KT953588 161Gx.y KT953590 162Gx.y KT953591 163Gx.y KT953593 164Gx.y KT953594 165Gx.y KT953595 166Gx.y KT953596 167Gx.y KT953597 168Gx.y KT953598 169Gx.y KT953599 123 155G2.1 170Gx.y KT953600 171Gx.y KT953601 172Gx.y KT953602 173Gx.y KT953603 174Gx.y KT953605 175Gx.y KT953606 176Gx.y KT953607 177Gx.y KT953608 178Gx.y KT953609 179Gx.y KT953610 180Gx.y KT953611 TT Nhóm GenBank 181Gx.y KU375254 182Gx.y KU375255 183Gx.y KU375263 184Gx.y KX844724 185Gx.y KX880080 186Gx.y KX880083 KX880088 188Gx.y KX886270 189Gx.y KX886273 190Gx.y KX886274 191Gx.y KX886275 192Gx.y KX886276 193Gx.y KX886278 194Gx.y KX880082 195Gx.y KX880085 196Gx.y KX880086 197Gx.y KX880087 198Gx.y KX880089 199Gx.y KX886271 200Gx.y KX886272 124 187Gx.y ... tổng đại diện đàn lợn ni miền Bắc Việt Nam Vì trước diễn biến phức tạp dịch bệnh, tiến hành nghiên cứu dịch tễ học bệnh dịch tả lợn cổ điển lợn miền Bắc Việt Nam giai đoạn 2014- 2017 Đây việc cần...HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM ¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯¯ NGUYỄN PHỤC HƢNG NGHIÊN CỨU DỊCH TỄ HỌC BỆNH DỊCH TẢ LỢN CỔ ĐIỂN (CLASSICAL SWINE FEVER) Ở LỢN TẠI MIỀN BẮC VIỆT NAM GIAI ĐOẠN... 2.2 Việt Nam .93 ix TRÍCH YẾU LUẬN ÁN Tên tác giả: Nguyễn Phục Hưng Tên luận án: Nghiên cứu dịch tễ học bệnh dịch tả lợn cổ điển (Classical swine fever) lợn miền Bắc Việt Nam giai đoạn 2014

Ngày đăng: 28/10/2019, 11:22

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

  • Đang cập nhật ...

Tài liệu liên quan