XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

82 392 0
XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

Đề tài đƣợc thực hiện từ tháng 01/2007 đến tháng 09/2007 tại Trại thực nghiệm bảo vệ thực vật, Khoa Nông học và Viện Nghiên cứu Công nghệ Sinh Học và Môi Trƣờng thuộc Trƣờng Đại học Nông Lâm Tp. Hồ Chí Minh trên đối tƣợng cây dứa Cayenne. Dựa trên sự bảo tồn những motif trình tự của các họ gene kháng thực vật, thực hiện phản ứng PCR thoái hoá nhằm phân lập vùng gene NBS trên nguồn dứa Cayenne cấy mô đã đƣợc chủng bệnh và nguồn dứa ngoài đồng có và không có biểu hiện bệnh héo đỏ đầu lá. Thực hiện kỹ thuật RFLP đối với sản phẩm PCR thoái hoá với mục đích tìm kiếm những marker liên kết với tính kháng virus PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus – tác nhân gây bệnh wilt, làm cơ sở ban đầu cho những phân tích xa hơn nhằm phục vụ cho mục tiêu tạo ra giống dứa Cayenne chất lƣợng cao, có khả năng kháng mạnh và ổn định đối với dịch bệnh nguy hiểm trên, góp phần bảo vệ năng suất, phẩm chất của cây dứa, mang lại hiệu quả cho nông dân và kinh tế xã hội. Kết quả: Đã nuôi rệp và chủng bệnh thành công với tỉ lệ biểu hiện bệnh là 35,66%. Đã cải tiến đƣợc chu trình nhiệt và nồng độ các thành phần tham gia phản ứng PCR thoái hoá của Z. Deng và cs (2000) cho phép khuếch đại thành công vùng NBS trên cây dứa Cayenne.

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC  KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR) Ngành: Công nghệ sinh học Niên khoá: 2003 - 2007 Sinh viên thực hiện: LÊ MINH THÔNG  09/2007 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HỒ CHÍ MINH BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC *************** KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR) Giáo viên hƣớng dẫn: Sinh viên thực hiện: TS. Trần Thị Dung Lê Minh Thông CN. Lƣu Phúc Lợi  09/2007 iii LỜI CẢM TẠ                        ,                                   HCM t          , .  iv TÓM TẮT Ch Minh. Th 9/2007.  - Pineapple mealybug wilt associated virus -                                PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus       Kết quả:     v MỤC LỤC  iii  . iv  v  viii  x  . xii  xii  1  . 1  3  3  3  4  . 4  4  4 Cayenne . 5  . 7  . 8  . 8  9  . 10  . 10  . 11  11  . 13 vi  13  . 14  . 16  . 18 - for - gene concept) 19  20  . 24  24  . 25  . 27  . 31 t 31  . 32  . 32  32  . 35  36 riction Fragment Length Polymorphism) 37  . 37  37  . 39  . 39  . 39   39  39  . 39  40  . 41  . 41 vii   44  49  . 50  50  50  51 4.1. 54  56  56  56  . 57  64 4.2.5. PC 65  . 66  68  69  . 69  69  70 viii DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT bp base pairs cs.  CC coiled coil cDNA complementary deoxynucleic acid CTAB cetyl trimethyl ammonium bromide DNA deoxyribo nucleic acid dNTP deoxyribonucleotide triphosphate EB extraction buffer EDTA ethylene diamine tetra acetic acid ELISA enzyme-linked immunosorbent assay EST expressed sequence tag GLRaV-3 grape leafroll associated virus KIN kinase LRR leucine rich repeat MAS marker assisted selection MWP mealybug wilt of pineapple NBS nucleotide binding site OD optical density PCR polymerase chain reaction PCV pineapple closterovirus PMWaV pineapple mealybug- wilt associated virus QLT quatity loci trait RFLP restriction fragment length polymorphism RGA resistance gene analogs RT reverse transcription RT-PCR reverse transcription-polymerase chain reaction TAE tris  acetate  EDTA TBIA tissue blot immunoassay TE tris  EDTA ix TIR toll interleukin receptor TMV tobacco mosaic virus Tp. HCM  x DANH SÁCH CÁC HÌNH  5  . 6  8 9  . 10  11  . 20  . 22 c NBS-LRR. 23  . 24   27   . 29  34  . 42  43  . 51  . 52  53  . 53  . 54  55  56  57   58 .  CC coiled coil cDNA complementary deoxynucleic acid CTAB cetyl trimethyl ammonium bromide DNA deoxyribo nucleic acid dNTP deoxyribonucleotide triphosphate. associated virus KIN kinase LRR leucine rich repeat MAS marker assisted selection MWP mealybug wilt of pineapple NBS nucleotide binding site OD optical

Ngày đăng: 03/09/2013, 09:59

Hình ảnh liên quan

Hình 2.1. Cây dứa - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 2.1..

Cây dứa Xem tại trang 17 của tài liệu.
Hình 2.3. Ruộng dứa bị nhiễm bệnh héo đỏ đầu lá 2.2.1. Tình hình dịch bệnh và tác hại  - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 2.3..

Ruộng dứa bị nhiễm bệnh héo đỏ đầu lá 2.2.1. Tình hình dịch bệnh và tác hại Xem tại trang 20 của tài liệu.
Hình 2.4. Cây dứa và quả dứa Cayenne bị nhiễm bệnh đỏ đầu lá do virus PMWaV.  - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 2.4..

Cây dứa và quả dứa Cayenne bị nhiễm bệnh đỏ đầu lá do virus PMWaV. Xem tại trang 21 của tài liệu.
Hình 2.5. Hai loại rệp lây truyền PMWaV. - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 2.5..

Hai loại rệp lây truyền PMWaV Xem tại trang 22 của tài liệu.
Hình 2.7. Cơ chế kích hoạt tính kháng bện hở thực vật 2.3.6. Chức năng và cấu trúc gene kháng  - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 2.7..

Cơ chế kích hoạt tính kháng bện hở thực vật 2.3.6. Chức năng và cấu trúc gene kháng Xem tại trang 32 của tài liệu.
Bảng 2.1. Các họ gene kháng chính - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Bảng 2.1..

Các họ gene kháng chính Xem tại trang 34 của tài liệu.
Hình 2.9. Tƣơng quan về sự bảo tồn và biến dị của cấu trúc NBS-LRR. - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 2.9..

Tƣơng quan về sự bảo tồn và biến dị của cấu trúc NBS-LRR Xem tại trang 35 của tài liệu.
Hình 2.10. Sự phân bố và bảo tồn của các motif trong vùng - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 2.10..

Sự phân bố và bảo tồn của các motif trong vùng Xem tại trang 36 của tài liệu.
Hình 2.11. Tiến trình nghiên cứu tính kháng thực vật có sử dụng phƣơng pháp PCR thoái hoá - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 2.11..

Tiến trình nghiên cứu tính kháng thực vật có sử dụng phƣơng pháp PCR thoái hoá Xem tại trang 39 của tài liệu.
Hình 2.12. Sơ đồ các bƣớc thiết kế primer thoái hoá và bảng mã các nucleotide thoái hóa - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 2.12..

Sơ đồ các bƣớc thiết kế primer thoái hoá và bảng mã các nucleotide thoái hóa Xem tại trang 41 của tài liệu.
Hình 2.13. Quá trình của phản ứng PCR. - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 2.13..

Quá trình của phản ứng PCR Xem tại trang 45 của tài liệu.
Bảng 3.1. Các primer thoái hoá sử dụng trong nghiên cứu - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Bảng 3.1..

Các primer thoái hoá sử dụng trong nghiên cứu Xem tại trang 57 của tài liệu.
Bảng 3.3. Một số chỉ tiêu và các mức tiến hành tối ƣu phản ứng PCR thoái hoá - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Bảng 3.3..

Một số chỉ tiêu và các mức tiến hành tối ƣu phản ứng PCR thoái hoá Xem tại trang 58 của tài liệu.
Bảng 3.2. Thành phần và chu trình nhiệt của phản ứng PCR theo Z. Deng và cs (2000).  - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Bảng 3.2..

Thành phần và chu trình nhiệt của phản ứng PCR theo Z. Deng và cs (2000). Xem tại trang 58 của tài liệu.
Kết quả nuôi rệp thể hiện qua Bảng 4.1. - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

t.

quả nuôi rệp thể hiện qua Bảng 4.1 Xem tại trang 61 của tài liệu.
Bảng 4.1. Kết quả nuôi rệp - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Bảng 4.1..

Kết quả nuôi rệp Xem tại trang 61 của tài liệu.
Hình 4.2. Rệp phát triển trên dứa sau 7 ngày 4.1.2.2. Chuyển rệp lên dứa sạch bệnh.  - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 4.2..

Rệp phát triển trên dứa sau 7 ngày 4.1.2.2. Chuyển rệp lên dứa sạch bệnh. Xem tại trang 63 của tài liệu.
Hình 4.4. Rệp phát triển trên dứa sau khi chủng. - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 4.4..

Rệp phát triển trên dứa sau khi chủng Xem tại trang 64 của tài liệu.
Hình 4.3. Chuyển rệp lên dứa sạch bệnh. - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 4.3..

Chuyển rệp lên dứa sạch bệnh Xem tại trang 64 của tài liệu.
Bảng 4.2. Danh sách các mẫu thu thập - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Bảng 4.2..

Danh sách các mẫu thu thập Xem tại trang 66 của tài liệu.
Hình 4.7. Kết quả điện di DNA tổng số theo quy trình cải tiến. - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 4.7..

Kết quả điện di DNA tổng số theo quy trình cải tiến Xem tại trang 67 của tài liệu.
Hình 4.8. Kết quả pha loãng DNA. - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 4.8..

Kết quả pha loãng DNA Xem tại trang 68 của tài liệu.
Bảng 4.3. Thành phần và chu trình nhiệt của phản ứng PCR thoái hoá cải tiến - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Bảng 4.3..

Thành phần và chu trình nhiệt của phản ứng PCR thoái hoá cải tiến Xem tại trang 69 của tài liệu.
Kết quả điện di sản phẩm PCR đƣợc thể hiện qua Hình 4.10. - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

t.

quả điện di sản phẩm PCR đƣợc thể hiện qua Hình 4.10 Xem tại trang 69 của tài liệu.
Kết quả PCR thể hiện trên gel agarose (xem Hình 4.12). - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

t.

quả PCR thể hiện trên gel agarose (xem Hình 4.12) Xem tại trang 71 của tài liệu.
Kết quả tối ƣu nhiệt độ bắt cặp thể hiện qua Hình 4.15. - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

t.

quả tối ƣu nhiệt độ bắt cặp thể hiện qua Hình 4.15 Xem tại trang 73 của tài liệu.
Bảng 4.4. Quy trình PCR thoái hoá tối ƣu cho cây dứa Cayenne - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Bảng 4.4..

Quy trình PCR thoái hoá tối ƣu cho cây dứa Cayenne Xem tại trang 75 của tài liệu.
Hình 4.16. Kết quả khuếch đại lại sản phẩm PCR lần 1 của một số mẫu dứa - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 4.16..

Kết quả khuếch đại lại sản phẩm PCR lần 1 của một số mẫu dứa Xem tại trang 76 của tài liệu.
Hình 4.18. Kết quả PCR thoái hoá trên 9 mẫu dứa Cayenne - XÁC ĐỊNH GENE LIÊN QUAN ĐẾN TÍNH KHÁNG VIRUS PMWaV - Pineapple mealybug wilt associated virus - GÂY BỆNH HÉO ĐỎ ĐẦU LÁ TRÊN CÂY DỨA CAYENNE BẰNG PHƢƠNG PHÁP PCR THOÁI HOÁ (degenerated PCR)

Hình 4.18..

Kết quả PCR thoái hoá trên 9 mẫu dứa Cayenne Xem tại trang 78 của tài liệu.

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan