PHÂN TíCH TíNH ĐA HìNH ADN CủA 8 CặP LAI NHị NGUYÊN TằM DÂU F1 BằNG CHỉ THị RAPD

8 297 1
PHÂN TíCH TíNH ĐA HìNH ADN CủA 8 CặP LAI NHị NGUYÊN TằM DÂU F1 BằNG CHỉ THị RAPD

Đang tải... (xem toàn văn)

Thông tin tài liệu

Mười lăm đoạn mồi ngẫu nhiên đã được sử dụng để phân tích tính đa hình ADN cho 80 cá thể F1 của 4 cặp lai nhị nguyên trong nước và 4 cặp lai nhị nguyên nhập ngoại thì có 12/15 mồi cho tính đa hình với giá trị PIC dao động từ 0,07 (OPV6) đến 0,51 (OPP19). Số lượng các phân đoạn ADN nhân bản với mỗi mồi xê dịch từ 1 đến 9 phân đoạn. Kích thước các phân đoạn ADN được nhân bản trong khoảng từ 200 bp đến 1600 bp. Trong tổng số 99 phân đoạn ADN thu được, có 83 phân đoạn đa hình (83,84%) và 16 phân đoạn đơn hình (16,16%). Số phân đoạn ADN nhân bản được nhiều nhất là 505 phân đoạn khi phân tích với mồi RA40 và ít nhất là 117 phân đoạn khi phân tích với mồi OPV02. Hệ số tương đồng di truyền giữa các con lai F1 của 8 cặp lai nhị nguyên tằm dâu dao động từ 0,33 đến 1,00 và được phân làm 02 nhóm chính: Nhánh chính I bao gồm toàn bộ 4 cặp lai nhị nguyên trong nước có hệ số tương đồng di truyền khoảng từ 0,74 đến 1,00 và được chia làm 2 nhánh phụ nhỏ. Đối với nhánh chính II bao gồm toàn bộ 4 cặp lai tằm nhị nguyên nhập ngoại và được chia làm 2 nhánh phụ, có hệ số tương đồng di truyền khoảng từ 0,51 đến 1,00. Kết quả này sẽ góp phần cho việc chọn tạo ra giống tằm mới.

Tp chớ Khoa hc v Phỏt trin 2010: Tp 8, s 3: 402 - 409 TRNG I HC NễNG NGHIP H NI 402 PHÂN TíCH TíNH ĐA HìNH ADN CủA 8 CặP LAI NHị NGUYÊN TằM DÂU F1 BằNG CHỉ THị RAPD Assesment of the DNA Divirsity of the 8 F1 Single Cross Hybrids of Silk Worm Using RAPD Markers V Th Thu Hin, inh Th Phũng Bo tng Thiờn nhiờn Vit Nam a ch email tỏc gi liờn h: dinhthiphong@hotmail.com Ngy gi ng: 14.04.2010; Ngy chp nhn: 25.04.2010 TểM TT Mi lm on mi ngu nhiờn ó c s dng phõn tớch tớnh a hỡnh ADN cho 80 cỏ th F1 ca 4 cp lai nh nguyờn trong nc v 4 cp lai nh nguyờn nhp ngoi thỡ cú 12/15 mi cho tớnh a hỡnh vi giỏ tr PIC dao ng t 0,07 (OPV6) n 0,51 (OPP19). S lng cỏc phõn on ADN nhõn bn vi mi mi xờ dch t 1 n 9 phõn on. Kớch thc cỏc phõn on ADN c nhõn bn trong khong t 200 bp n 1600 bp. Trong tng s 99 phõn on ADN thu c, cú 83 phõn on a hỡnh (83,84%) v 16 phõn on n hỡnh (16,16%). S phõn on ADN nhõn bn c nhiu nht l 505 phõn on khi phõn tớch vi mi RA40 v ớt nht l 117 phõn on khi phõn tớch vi mi OPV02. H s tng ng di truyn gia cỏc con lai F1 ca 8 cp lai nh nguyờn tm dõu dao ng t 0,33 n 1,00 v c phõn lm 02 nhúm chớnh: Nhỏnh chớnh I bao gm ton b 4 cp lai nh nguyờn trong nc cú h s tng ng di truyn khong t 0,74 n 1,00 v c chia lm 2 nhỏnh ph nh. i vi nhỏnh chớnh II bao gm ton b 4 cp lai tm nh nguyờn nhp ngoi v c chia lm 2 nhỏnh ph, cú h s tng ng di truyn khong t 0,51 n 1,00. Kt qu ny s gúp phn cho vic chn to ra ging tm mi. T khoỏ: Cp lai nh nguyờn, a hỡnh ADN, h s tng ng, RAPD. SUMMARY Fifteen random primers were selected to analyze DNA polymorphism of 80 F 1 -individuals from 4 local and 4 introduced single cross hybrids of silkworms. Twelve primers revealed the Polymorphic Information Content (PIC) with values from 0.07 (OPV6) to 0.51 (OPP19). The number of amplified DNA fragments ranged from 1 to 9 per primer. The size of DNA fragments varied from 200 bp to 1600 bp. The total of amplified DNA fragments were 99 in which 83 fragments were polymorphic (83,84%) and 16 fragments were monomorphic (16,16%). The maximum multiplied fragments were 505 with RA40 primer and the minimum multiplied fragments were 117 with OPV02 primer. Variable genetic similarity coefficients of F 1 individuals varied from 0.33 to 1.00 and could be divided into two main clusters. The first cluster included all individuals of 4 local hybrids with variable genetic similarity coefficients ranging from 0.74 to 1.00 and consists of two sub-groups. The second cluster included all individuals of 4 imported single cross hybrids and also consists of two other sub-groups with variable genetic similarity coefficient ranging from 0.51 to 1.00. The information can serve as bases for silk worm breeding programme. Key words: DNA polymorphism, RAPD, similarity coefficient, single cross hybrids. 1. ĐặT VấN Đề Đến nay, chọn tạo giống tằm (Bombyx mori L.) chủ yếu vẫn bằng phơng pháp truyền thống nên tiêu tốn nhiều thời gian m kết quả tạo giống hạn chế. Công nghệ sinh học hiện đại có thể khắc phục nhợc điểm ny nhờ có các chỉ thị phân tử. Ưu điểm của phơng pháp l không phụ thuộc vo điều kiện môi trờng m lại hiệu quả ở cả khía cạnh thời gian v chất lợng tạo giống. Vì thế cho đến nay đã có khá nhiều Phõn tớch tớnh a hỡnh ADN ca 8 cp lai nh nguyờn tm dõu F1 bng ch th RAPD 403 đối tợng vật nuôi v cây trồng đợc tạo ra có sự hỗ trợ của chỉ thị phân tử (Kim v cs., 2006; Hang v cs., 1997; Carlos v cs., 2000; Đinh Thị Phòng v cs., 2004; Đinh Thị Phòng v cs., 2008; Nguyễn Thị Thanh Bình v cs., 1999). Trong số các chỉ thị ISSR, RFLP, AFLP, RAPD thì chỉ thị RAPD tơng đối dễ sử dụng, giá thnh hạ m vẫn cho kết quả tin cậy (Ferreira v cs., 1997; Powell v cs., 1996). Ưu thế lai trong tạo giống đợc xem nh l lý thuyết kinh điển đúng ở mọi khía cạnh, tuy nhiên hiệu quả của u thế lai tùy thuộc vo việc lựa chọn bố mẹ cặp lai v mấu chốt chính l sự khác biệt di truyền, sự khác biệt di truyền cng lớn thì sẽ sinh ra thế hệ con lai có tỷ lệ dị hợp tử v u thế lai cng cao. Để hiểu biết thêm về tính đa dạng di truyền ở tằm dâu, công trình ny trình by kết quả Phân tích đa dạng di truyền ADN của các con lai F1 của 04 cặp lai dâu tằm nhị nguyên trong nớc v 04 cặp lai dâu tằm nhị nguyên nhập ngoại bằng chỉ thị RAPD lm cơ sở cho nghiên cứu tạo giống mới. 2. NGUYÊN LIệU V PHƯƠNG PHáP NGHIÊN CứU 2.1. Nguyên liệu Các con nhộng F1 của 04 cặp lai tằm nhị nguyên trong nớc v 04 cặp lai tằm nhị nguyên nhập ngoại do Trung tâm Nghiên cứu Dâu tằm tơ cung cấp. Các mẫu nhộng đợc bảo quản ở nhiệt độ - 20 o C cho tới khi sử dụng. Tên các cặp lai v ký hiệu cho trong bảng 1. Các mồi RAPD: Tên v trình tự các nucleotide của 15 mồi ngẫu nhiên sử dụng trong nghiên cứu cho trong bảng 2. Bảng 1. Tên của 8 cặp lai nhị nguyên tằm dâu TT Tờn cỏc cp lai nh nguyờn tm dõu Ni cung cp Ký hiu 1 Q7 Trung tõm Nghiờn cu Dõu tm t NN*1 2 Q9 Trung tõm Nghiờn cu Dõu tm t NN2 3 A1 x 810 Trung tõm Nghiờn cu Dõu tm t NN3 4 A2 x ễ1 Trung tõm Nghiờn cu Dõu tm t NN4 5 A2 x B46 Trung tõm Nghiờn cu Dõu tm t TN*1 6 A2 x VN1 Trung tõm Nghiờn cu Dõu tm t TN2 7 B42 x B46 Trung tõm Nghiờn cu Dõu tm t TN3 8 E38 x A1 Trung tõm Nghiờn cu Dõu tm t TN4 Ghi chỳ: NN*: cp lai tm dõu nhp ngoi, TN*: cp lai tm dõu trong nc Bảng 2. Trình tự các nucleotide của 10 mồi ngẫu nhiên TT Tờn mi Trỡnh t mi TT Tờn mi Trỡnh t mi 1 OPE14 5TGC GGC TGAG3 9 OPB12 5CCT TGA CGCA3 2 RA 40 5'GGC GGA CTGT3' 10 OPP15 5GGA AGC CAAC3 3 OPB18 5CCA CAG CAGT3 11 OPV2 5AGT CAC TCCC3 4 RA 46 5CCA GAC CCTG3 12 RA159 5GTC CAC ACGG3 5 OPA02 5TGCCGAGCTG3 13 OPP19 5GGG AAG GACA3 6 OPB04 5GGA CTG GAGT3 14 OPN11 5TCG CCG CAAA3 7 OPP08 5ACA TCG CCCA3 15 OPP04 5GTG TCT CAGG3 8 OPV6 5ACG CCC AGGT3 V Th Thu Hin, inh Th Phũng 404 2.2. Phơng pháp nghiên cứu 2.2.1. Tách ADN tổng số từ các giống tằm ADN tổng số đợc tách từ 10 cá thể tằm F1 (5 đực v 5 cái cho mỗi một cặp lai) của 04 cặp lai nhị nguyên trong nớc v 04 cặp lai nhị nguyên nhập ngoại theo bộ kít #K0512 của hãng Fermentas, các bớc đợc thực hiện theo protocol chỉ dẫn của nh sản xuất. Kiểm tra độ sạch v hm lợng ADN bằng đo quang phổ hấp thụ kết hợp với điện di trên gel agarose 0,9%. 2.2.2. Phân tích PCR - RAPD Một phản ứng PCR có thể tích 25 l bao gồm dung dịch đệm PCR 1X; 2,5 mM MgCl 2 ; 2 mM dNTPs; 200 nM đoạn mồi; 0,5 đơn vị Taq polymerase v 10 ng DNA khuôn. Phản ứng PCR RAPD thực hiện trong máy PCR Thermal Cycler 9700 theo chu trình nhiệt: 94 0 C trong 1 phút; 45 chu kỳ (92 0 C trong 1 phút; 35 0 C trong 1 phút; 72 0 C trong 1 phút); 72 0 C trong 10 phút; giữ sản phẩm ở 4 0 C. Điện di sản phẩm PCR trên gel agarose 1,5%, nhuộm Ethidium bromide v chụp ảnh trên máy soi gel của Hãng Clever Scientific (Anh). 2.2.3. Phân tích số liệu Dựa trên sự xuất hiện hay không xuất hiện của các phân đoạn ADN khi điện di sản phẩm PCR-RAPD với các đoạn mồi ngẫu nhiên của 04 cặp lai tằm nhị nguyên trong nớc v 04 cặp lai nhị nguyên nhập ngoại lm cơ sở cho việc phân tích số liệu. Tỉ lệ phần trăm tính đa hình các phân đoạn ADN đợc tính bằng số phân đoạn ADN đa hình trên tổng số phân đoạn nhân bản đuợc. Hm lợng thông tin tính đa hình (Polymorphism information content = PIC) của mỗi cặp lai xác định theo công thức: PIC i = 1 - 2 ij P Trong đó: Pij l tần số của allen j của kiểu gen i đợc kiểm tra. Phạm vi giá trị PIC từ 0 (không đa hình) tới 1 (đa hình hon ton). Xác định hệ số tơng đồng di truyền, lập biểu đồ hình cây để so sánh hệ số tơng đồng di truyền giữa 80 cá thể của mỗi cặp lai nhị nguyên theo phơng pháp Nei v Li (1979); Weir (1990). Số liệu đợc xử lý bằng chơng trình NTSYSpc version 2.0 (Rohf, 2001). 3. KếT QUả V THảO LUậN 3.1. Đa hình phân đoạn ADN của các cặp lai nhị nguyên tằm dâu trong nớc v nhập ngoại Kết quả phân tích sản phẩm PCR - RAPD của 80 mẫu nhộng F1 thuộc 8 cặp lai nhị nguyên trong nớc v nhập ngoại đã chỉ ra 12/15 mồi cho tính đa hình với giá trị PIC dao động từ 0,07 (OPV6) đến 0,51 (OPP19). Số lợng các phân đoạn ADN nhân bản với mỗi mồi xê dịch từ 1 đến 9 phân đoạn. Kích thớc các phân đoạn ADN đợc nhân bản trong khoảng từ 200 bp đến 1600 bp. Tổng số phân đoạn ADN nhân bản đợc của 80 mẫu nhộng F1 với 15 mồi RAPD l 4002. Số phân đoạn ADN nhân bản đợc nhiều nhất l 505 phân đoạn khi phân tích với mồi RA40 v ít nhất l 117 phân đoạn khi phân tích với mồi OPV02 (số liệu không chỉ ra ở đây). Tổng số phân đoạn ADN khi phân tích với 15 mồi ngẫu nhiên l 99 phân đoạn. Trong đó có 83 phân đoạn l đa hình (chiếm 83,84%) v 16 phân đoạn đơn hình (chiếm 16,16%) (Bảng 3). Tính đa hình thể hiện ở sự xuất hiện hay không xuất hiện phân đoạn ADN khi so sánh giữa các mẫu với nhau. Chẳng hạn khi phân tích 4 cặp lai trong nớc với mồi OPA02 (Hình 1) có 7 phân đoạn ADN đợc nhân bản thì cả 7 phân đoạn đều chỉ ra tính đa hình, ví dụ ở vị trí 1 kb, mẫu TN3.2 v TN3.9 thuộc cặp TN3 (giếng 23, 29 tơng ứng) đã không xuất hiện phân đoạn ADN, hay tại vị trí 0,2 kb các mẫu nhộng TN1.1, TN1.2, TN1.3, TN1.6, TN1.7, TN1.9, TN1.10 thuộc cặp TN1 (giếng 1, 2, 3, 6, 7, 9, 10 tơng ứng), hay các mẫu nhộng TN2.1, TN2.2, TN2.7 (giếng 11, 12, 17, tơng ứng) thuộc cặp TN2 đã xuất hiện phân đoạn ADN. Phõn tớch tớnh a hỡnh ADN ca 8 cp lai nh nguyờn tm dõu F1 bng ch th RAPD 405 Bảng 3. Giá trị PIC v tỉ lệ phân đoạn đa hình của 80 mẫu nhộng F1 của các cặp lai nhị nguyên tằm dâu trong nớc v nhập ngoại Mi PIC S phõn on a hỡnh S phõn on ng hỡnh Tng s phõn on ADN % phõn on a hỡnh OPE14 0 0 3 3 0,00 RA40 0,27 11 0 11 100,00 OPB18 0,35 9 0 9 100,00 RA46 0,23 2 1 3 66,67 OPA02 0,37 11 0 11 100,00 OPB04 0,41 7 1 8 87,50 OPP08 0,24 5 2 7 71,43 OPV6 0,07 1 2 3 33,33 OPB12 0,36 7 1 8 87,50 OPP15 0,22 6 1 7 85,71 OPV2 0,16 2 0 2 100,00 RA159 0 0 2 2 0,00 OPP19 0,51 13 1 14 92,86 OPN11 0 0 2 2 0,00 OPP04 0,37 9 0 9 100,00 Tng 83 16 99 83,84 0,25k 0,5kb 1kb M 1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 3 35 37 39 Hình 1. Sản phẩm PCR-RAPD của 04 cặp lai nhị nguyên trong nớc với mồi OPA02 (M: thang phân tử 1 kb, giếng 1-10: cặp lai TN1, 11-20: cặp lai TN2, 21-30: cặp lai TN3, 31-40: cặp lai TN4, mỗi cặp lai 5 cá thể đầu đực v 05 cá thể còn lại l cái) M 1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 0,25kb 0,75kb 0,25kb 0,75kb Hình 2. Sản phẩm PCR-RAPD của 04 cặp lai nhị nguyên nhập ngoại với mồi OPB12 (M: thang phân tử 1 kb, giếng 1-10: cặp lai NN1, 11-20: cặp lai NN2, 21-30: cặp lai NN3, 31-40: cặp lai NN4, mỗi cặp lai 5 cá thể đầu đực v 05 cá thể còn lại l cái) V Th Thu Hin, inh Th Phũng 406 Đối với 4 cặp lai nhị nguyên tằm dâu nhập ngoại tính đa hình thể hiện tơng đối rõ ở mồi OPB12. Trong số 7 phân đoạn ADN đợc nhân bản thì có 5 phân đoạn đa hình (chiếm 71,43%). Các phân đoạn có kích thớc khoảng từ 0,3 kb đến 1,2 kb. Chẳng hạn ở vị trí khoảng 1 kb có 20 mẫu nhộng thuộc 2 cặp lai NN3, NN4 đã xuất hiện phân đoạn ADN, trong khi đó các mẫu của 2 cặp lai NN1 v NN2 đã không xuất hiện phân đoạn ADN. Từ kết quả nhận đợc trên đây cho thấy tính đa hình ADN tơng đối rõ v phong phú khi so sánh 8 cặp lai nhị nguyên tằm dâu với nhau. 3.2. Mối quan hệ di truyền của các cặp lai nhị nguyên tằm dâu trong nớc v nhập ngoại Các số liệu phân tích PCR-RAPD đợc xử lý v phân tích trong chơng trình NTSySpc version 2.0 nhằm tìm ra khoảng cách di truyền giữa các giống nghiên cứu thông qua hệ số tơng đồng di truyền v biểu đồ hình cây. Phân nhóm di truyền l phơng pháp phổ biến để đánh giá mức độ đa dạng của đối tợng nghiên cứu. Phơng pháp ny dựa trên những lý thuyết thống kê toán học v sinh học. Phân nhóm di truyền đợc tiến hnh phân tích theo 2 cách: tính trạng kiểu hình v tính trạng kiểu gen. Phơng pháp đánh giá đa dạng kiểu gen mang lại hiệu quả cao hơn vì không lệ thuộc vo điều kiện môi trờng, vì thế sẽ giúp các nh chọn giống có định hớng tơng đối chính xác khi lựa chọn vật liệu lai nhằm tạo ra con laitính trạng mong muốn. Khi so sánh giữa 10 cá thể F1 của một cặp lai đã chỉ ra hệ số tơng đồng di truyền của cặp NN1 dao động từ 0,902 (giữa NN1.4 v NN1.8) đến 1 (giữa NN1.6 v NN1.7), đối với cặp NN2 dao động từ 0,860 (giữa NN2.1 v NN2.2) đến 1 (giữa NN2.7 v NN2.9), cặp NN3 dao động trong khoảng 0,875 (giữa NN3.4 v NN3.5) đến 0,981 (giữa NN3.3 v NN3.4), cặp NN4 dao động trong khoảng 0,893 (giữa NN4.7 v NN4.9) đến 1 (giữa NN4.1 v NN4.2), cặp TN1 có hệ số tơng đồng di truyền dao động từ 0,724 (giữa TN1.4 v TN1.10) đến 0,962 (giữa TN1.2 v TN1.5), đối với cặp TN2 dao động từ 0,750 (giữa TN2.1 v TN2.3) đến 0,981 (giữa TN2.6 v TN2.7); cặp TN3 dao động trong khoảng 0,727 (giữa TN3.7 v TN3.10) đến 0,925 (giữa TN3.5 v TN3.6). Riêng đối với cặp lai TN4 có hệ số tơng đồng di truyền dao động khoảng từ 0,655 (giữa TN4.4 v TN4.5) đến 1 (giữa TN4.9 v TN4.10). Kết quả ny cho thấy độ đồng nhất di truyền tơng đối cao của các con lai F1 ở mỗi cặp lai. Mối quan hệ di truyền giữa các cặp nhị nguyên thể hiện trên sơ đồ hình cây đã phân ra lm 2 nhánh chính v có mức độ tơng đồng di truyền khoảng từ 0,33 đến 1,00. Trong mỗi nhánh chính lại phân ra nhiều nhánh phụ. Nhánh chính I bao gồm ton bộ 04 cặp lai nhị nguyên trong nớc có hệ số tơng đồng di truyền khoảng từ 0,734 đến 1,00 v chia lm 02 nhánh phụ nhỏ riêng biệt. Nhánh phụ thứ nhất gồm 04 cá thể F1 của cặp lai TN2, TN3 có hệ số tơng đồng khoảng từ 0,91 đến 0,82. Nhánh phụ thứ hai gồm 36 cá thể F1 còn lại của cặp lai nhị nguyên trong nớc v có hệ số tơng đồng di truyền trong khoảng từ 0,734 đến 1,00. Đối với nhánh chính II gồm ton bộ 4 cặp lai tằm nhị nguyên nhập ngoại v cũng đợc chia lm 2 nhánh phụ nhỏ, có hệ số tơng đồng di truyền khoảng từ 0,503 đến 1,00. Nhánh phụ thứ nhất bao gồm 20 cá thể F1 của cặp lai tằm NN3, NN4 có hệ số tơng đồng di truyền dao động từ 0,90 đến 1,00. Nhánh phụ thứ hai bao gồm 20 cá thể còn lại của cặp lai nhập ngoại NN1 v NN2 có hệ số tơng đồng di truyền trong khoảng từ 0,87 đến 1,00. Phõn tớch tớnh a hỡnh ADN ca 8 cp lai nh nguyờn tm dõu F1 bng ch th RAPD 407 Hình 3. Biểu đồ hình cây theo hệ số di truyền của Jaccard v kiểu phân nhóm UPGMA của 80 cá thể F1 thuộc 8 cặp lai nhị nguyên Chọn tạo giống tằm có sự hỗ trợ của kỹ thuật sinh học phân tử đã đợc nhiều nh nghiên cứu áp dụng từ năm 1972. Chẳng hạn nh Srivastava v cs. (2005) đã dùng 10 chỉ thị RAPD để đánh giá đa dạng di truyền cho 20 giống tằm, mặc dù hệ số tơng đồng di truyền giữa các giống l 0,754, nhng các tổ hợp lai đơn v lai kép đã đợc thiết lập v cho kết quả rất khả quan. Đối chiếu với kết quả thu nhận trong nghiên cứu ny cho thấy mức độ tơng đồng di truyền dao động từ 0,503 đến 0,734 khi so sánh giữa 4 cặp lai nhị nguyên trong nớc (nhánh I) v 4 cặp lai nhị nguyên nhập ngoại (nhánh II). Với kết quả ny cho thấy việc dự đoán cặp lai tứ nguyên tằm dâu l có thể, tuy nhiên cần kết hợp thêm với đặc điểm hình thái của các con lai F1. Nguyễn Thị Thanh Bình v cs. (2004) cũng đã sử dụng các mồi RAPD để đánh giá đa dạng tập đon 08 giống tằm đang nuôi ở phía Bắc Việt Nam v đã phát hiện ra hai giống tằm ĐS1 v ĐS2 có hệ số di truyền giống nhau tới 98,4%, theo tác giả đây có thể chỉ l 1 giống nhng nuôi ở hai địa phơng khác nhau. Tơng tự Đinh Thị Phòng v cs. (2009) đã dùng các chỉ thị RAPD để đánh giá độ thuần của 10 giống tằm mới chọn tạo, kết quả phân tích ADN nhận đợc cũng hon ton phù hợp với kết quả đánh giá độ thuần thông qua một số chỉ tiêu hình thái (sức sống của tằm, độ đồng đều của kén, trọng lợng ton kén, tỷ lệ vỏ kén .) do Trung tâm Nghiên cứu Dâu tằm tơ nghiên cứu thực hiện. 4. KếT LUậN - Khi phân tích tính đa hình ADN của 80 mẫu nhộng F1 của 04 cặp lai nhị nguyên tằm dâu trong nớc v 04 cặp lai nhị nguyên He so tuong dong 0.33 0.50 0.67 0.83 1.00 NN1.1 NN1.2 NN1.5 NN1.3 NN1.6 NN1.7 NN1.10 NN1.8 NN1.9 NN1.4 NN2.1 NN2.2 NN2.5 NN2.3 NN2.7 NN2.9 NN2.6 NN2.8 NN2.4 NN2.10 NN3.1 NN4.1 NN4.2 NN4.10 NN3.7 NN3.9 NN4.3 NN4.4 NN4.5 NN4.6 NN4.8 NN3.3 NN3.4 NN3.8 NN4.9 NN3.10 NN3.6 NN4.7 NN3.2 NN3.5 TN1.1 TN1.3 TN1.2 TN1.6 TN1.7 TN1.5 TN1.8 TN1.9 TN1.10 TN1.4 TN2.2 TN2.3 TN2.6 TN2.7 TN3.7 TN2.8 TN2.9 TN2.10 TN2.4 TN2.5 TN4.1 TN4.2 TN4.3 TN4.4 TN3.1 TN3.2 TN3.3 TN3.4 TN3.5 TN3.6 TN4.5 TN4.6 TN4.7 TN4.8 TN4.9 TN4.10 TN2.1 TN3.8 TN3.9 TN3.10 He so tuong dong 0.33 0.50 0.67 0.83 1.00 NN1.1 NN1.2 NN1.5 NN1.3 NN1.6 NN1.7 NN1.10 NN1.8 NN1.9 NN1.4 NN2.1 NN2.2 NN2.5 NN2.3 NN2.7 NN2.9 NN2.6 NN2.8 NN2.4 NN2.10 NN3.1 NN4.1 NN4.2 NN4.10 NN3.7 NN3.9 NN4.3 NN4.4 NN4.5 NN4.6 NN4.8 NN3.3 NN3.4 NN3.8 NN4.9 NN3.10 NN3.6 NN4.7 NN3.2 NN3.5 TN1.1 TN1.3 TN1.2 TN1.6 TN1.7 TN1.5 TN1.8 TN1.9 TN1.10 TN1.4 TN2.2 TN2.3 TN2.6 TN2.7 TN3.7 TN2.8 TN2.9 TN2.10 TN2.4 TN2.5 TN4.1 TN4.2 TN4.3 TN4.4 TN3.1 TN3.2 TN3.3 TN3.4 TN3.5 TN3.6 TN4.5 TN4.6 TN4.7 TN4.8 TN4.9 TN4.10 TN2.1 TN3.8 TN3.9 TN3.10 I II He so tuong dong 0.33 0.50 0.67 0.83 1.00 NN1.1 NN1.2 NN1.5 NN1.3 NN1.6 NN1.7 NN1.10 NN1.8 NN1.9 NN1.4 NN2.1 NN2.2 NN2.5 NN2.3 NN2.7 NN2.9 NN2.6 NN2.8 NN2.4 NN2.10 NN3.1 NN4.1 NN4.2 NN4.10 NN3.7 NN3.9 NN4.3 NN4.4 NN4.5 NN4.6 NN4.8 NN3.3 NN3.4 NN3.8 NN4.9 NN3.10 NN3.6 NN4.7 NN3.2 NN3.5 TN1.1 TN1.3 TN1.2 TN1.6 TN1.7 TN1.5 TN1.8 TN1.9 TN1.10 TN1.4 TN2.2 TN2.3 TN2.6 TN2.7 TN3.7 TN2.8 TN2.9 TN2.10 TN2.4 TN2.5 TN4.1 TN4.2 TN4.3 TN4.4 TN3.1 TN3.2 TN3.3 TN3.4 TN3.5 TN3.6 TN4.5 TN4.6 TN4.7 TN4.8 TN4.9 TN4.10 TN2.1 TN3.8 TN3.9 TN3.10 He so tuong dong 0.33 0.50 0.67 0.83 1.00 NN1.1 NN1.2 NN1.5 NN1.3 NN1.6 NN1.7 NN1.10 NN1.8 NN1.9 NN1.4 NN2.1 NN2.2 NN2.5 NN2.3 NN2.7 NN2.9 NN2.6 NN2.8 NN2.4 NN2.10 NN3.1 NN4.1 NN4.2 NN4.10 NN3.7 NN3.9 NN4.3 NN4.4 NN4.5 NN4.6 NN4.8 NN3.3 NN3.4 NN3.8 NN4.9 NN3.10 NN3.6 NN4.7 NN3.2 NN3.5 TN1.1 TN1.3 TN1.2 TN1.6 TN1.7 TN1.5 TN1.8 TN1.9 TN1.10 TN1.4 TN2.2 TN2.3 TN2.6 TN2.7 TN3.7 TN2.8 TN2.9 TN2.10 TN2.4 TN2.5 TN4.1 TN4.2 TN4.3 TN4.4 TN3.1 TN3.2 TN3.3 TN3.4 TN3.5 TN3.6 TN4.5 TN4.6 TN4.7 TN4.8 TN4.9 TN4.10 TN2.1 TN3.8 TN3.9 TN3.10 I II V Th Thu Hin, inh Th Phũng 408 tằm dâu nhập ngoại với 15 mồi ngẫu nhiên thì có 12/15 mồi có tính đa hình với giá trị PIC dao động từ 0,07 (OPV6) đến 0,51 (OPP19). Trong phạm vi vùng phân tích có 99 phân đoạn ADN đợc nhân bản, có 83 phân đoạn đa hình (83,84%) v 16 phân đoạn đơn hình (16,16%), số lợng các phân đoạn ADN dao động từ 1 đến 9 với kích thớc trong khoảng từ 200 bp đến 1600 bp. Mồi RA40 đã nhân bản đợc nhiều phân đoạn nhất (505 phân đoạn) v ít nhất l mồi OPV02 (117 phân đoạn). - Hệ số tơng đồng di truyền của các con lai F1 của 08 cặp lai nhị nguyên trong nớc v nhập ngoại dao động trong khoảng 0,33 đến 1,00 (giống nhau hon ton) v đợc phân lm 02 nhóm chính: Nhánh chính I bao gồm ton bộ các con lai F1 của 04 cặp lai nhị nguyên trong nớc v có hệ số tơng đồng di truyền khoảng từ 0,734 đến 1,00. Nhánh chính II bao gồm ton bộ các con lai F1 của 04 cặp lai nhị nguyên nhập ngoại, có hệ số tơng đồng di truyền khoảng từ 0,503 đến 1,00. Mức độ tơng đồng di truyền giữa 4 cặp lai nhị nguyên trong nớc (nhánh I) v 4 cặp lai nhị nguyên nhập ngoại (nhánh II) khoảng từ 0,503 đến 0,734. Đây l cơ sở cho chọn tạo giống tằm mới. TI LIệU THAM KHảO Carlos R, Breto MP, Asins MJ (2000). A quick methodology to identify sexual seedlings in citrus breeding programs using SSR markers. Euphytica 112: 89-94. Đinh Thị Phòng, Đỗ Tiến Phát, Nguyễn Thị Yến (2008). Đa dạng ADN genome các chủng vi khuẩn (Pseudomonas solanacearum) gây bệnh héo xanh cây lạc bằng kỹ thuật RADP. Tạp chí Khoa học v Công nghệ 6: 75-81. Đinh Thị Phòng, Lê Trần Bình, Lê Thị Muội, Nguyễn Thị Hải H, Lê Duy Thnh, Nguyễn Văn Viết (2004). Nghiên cứu đa dạng tập đon giống lúa có tính kháng khác nhau với bệnh bạc lá lúa vi khuẩn Xanthomonas oryzae bằng kỹ thuật RAPD. Báo cáo khoa học Hội nghị ton quốc về Những vấn đề nghiên cứu cơ bản trong khoa học sự sống định hớng nông lâm nghiệp miền núi. NXB. Đại học Thái Nguyên: 571-574. Đinh Thị Phòng, Vũ Thị Thu Hiền, Trần Thị Việt Thanh, Dơng Văn Tăng, Nguyễn Thị Đảm (2009). Nghiên cứu mối quan hệ di truyền của 10 giống tằm (Bombyx mori) bằng chỉ thị RAPD. Báo cáo khoa học hội nghị công nghệ sinh học ton quốc 2009. NXB. Đại học Thái Nguyên: 127-130. Ferreira AR, Keim P (1997). Genetic Mapping of Soybean [Glycine max (L.) Merr.] using Random Amplified Polymorphic ADN (RAPD). Plant Mol Biol Rep 15(4): 335- 354. Hang N, Angeles ER, Domingo J, Magpantay G, Singh S, Zhang G, Kumaravadivel N, Bennett J, Khush G S (1997). Pyramiding of bacterial blight resistance gens in rice: marker-assisted selection using AFLP and PCR. Theor Appl Genet 95: 313-320. Kim MK, Park MJ, Jeong WH, Nam KC, Chung J (2006). SSR marker tightly linked to the Ti locus in Soybean [Glycine max (L.) Merr.]. Euphytica 152(3): 361 - 366. Li M, Guo M, Hou C, Miao X, Xu A, Guo X, Huang J (2006). Linkage and mapping analyses of the densonucleosis non- susceptible gene nsd-Z in the silkworm Bombyx mori using SSR markers. Genome 49. 397 402. Mace ES, Phong DT, Upadhyaya HD, Chandra ES, Crouch JH (2006). SSR analysis of cultivated groundnut (Arachis hypogaea L.) germplasm resistant to rust and late leaf spot diseases. Euphytica 152: 317-33. Nei M, Li WH (1979). Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction and nucleases, Proc. Natl. Sci. 76: 5269-5273. Phõn tớch tớnh a hỡnh ADN ca 8 cp lai nh nguyờn tm dõu F1 bng ch th RAPD 409 Nguyễn Thị Thanh Bình, Hong Thị Hằng, Nông Văn Hải (1999). Nghiên cứu đa hình phân tử v sng lọc các giống tằm đa hệ Việt Nam. Báo cáo Hội nghị Công nghệ sinh học ton quốc. NXB. Khoa học v Kỹ thuật: 1425 -1429. Nguyễn Thị Thanh Bình, Hong Thị Hằng, Nông Văn Hải (2004). Nghiên cứu đa hình một số giống tằm dâu bằng kỹ thuật RAPD. Tạp chí Di truyền học v ứng dụng 1: 19 - 24. Powell W, Morgante M, Andre C, Hanafey M, Vogel J, Tingey S, Rafalski A (1996). The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR markers for germplasm analysis. Molecular Breeding 2(3): 225 - 238. Rohlf FJ (2001), NTSYS Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, Version 2.0, Exeter Software Publ., Setauket, New York. Srivastava PP, Vijayan K, Awasthi AK, Kar PK, Thangavelu K, Saratchandra B (2005). Genetic analysis of silworms (Bombyx mori) throught RAPD markers. Indian Journal Biotechnology 4. 389 395. Suzuki Y, Gage L, Brown DD (1972). The genes for silk fibroin in Bombyx mori. J. Mol. Biol. 70: 637649. Ueno K, Hui CC, Fukuta M, Suzuki Y (1992). Molecular analysis of the deletion mutants in the E homeotic complex of the silkworm Bombyx mori. Development 114, 555-563. Weir BS (1990). Genetic data analysis - Methods for discrete genetic data, Sinauer Associates, Inc., Sunderland. Williams JGK, Kubelik AR, Livak KJ, Rafalski JA, Tingey SV (1990). DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nucleic Acids Res 18: 6531-6535. . dạng di truyền ADN của các con lai F1 của 04 cặp lai dâu tằm nhị nguyên trong nớc v 04 cặp lai dâu tằm nhị nguyên nhập ngoại bằng chỉ thị RAPD lm cơ sở. Khi phân tích tính đa hình ADN của 80 mẫu nhộng F1 của 04 cặp lai nhị nguyên tằm dâu trong nớc v 04 cặp lai nhị nguyên He so tuong dong 0.33 0.50 0.67 0 .83

Ngày đăng: 28/08/2013, 14:14

Hình ảnh liên quan

Bảng 1. Tên của 8 cặp lai nhị nguyên tằm dâu - PHÂN TíCH TíNH ĐA HìNH ADN CủA 8 CặP LAI NHị NGUYÊN TằM DÂU F1 BằNG CHỉ THị RAPD

Bảng 1..

Tên của 8 cặp lai nhị nguyên tằm dâu Xem tại trang 2 của tài liệu.
Bảng 2. Trình tự các nucleotide của 10 mồi ngẫu nhiên - PHÂN TíCH TíNH ĐA HìNH ADN CủA 8 CặP LAI NHị NGUYÊN TằM DÂU F1 BằNG CHỉ THị RAPD

Bảng 2..

Trình tự các nucleotide của 10 mồi ngẫu nhiên Xem tại trang 2 của tài liệu.
Bảng 3. Giá trị PIC vμ tỉ lệ phân đoạn đa hình của 80 mẫu nhộng F1 của các cặp lai nhị nguyên tằm dâu trong n−ớc vμ nhập ngoại   - PHÂN TíCH TíNH ĐA HìNH ADN CủA 8 CặP LAI NHị NGUYÊN TằM DÂU F1 BằNG CHỉ THị RAPD

Bảng 3..

Giá trị PIC vμ tỉ lệ phân đoạn đa hình của 80 mẫu nhộng F1 của các cặp lai nhị nguyên tằm dâu trong n−ớc vμ nhập ngoại Xem tại trang 4 của tài liệu.
Hình 1. Sản phẩm PCR-RAPD của 04 cặp lai nhị nguyên trong n−ớc với mồi OPA02 (M: thang phân tử 1 kb, giếng 1-10: cặp lai TN1, 11-20: cặp lai TN2, 21-30: cặp lai TN3,  - PHÂN TíCH TíNH ĐA HìNH ADN CủA 8 CặP LAI NHị NGUYÊN TằM DÂU F1 BằNG CHỉ THị RAPD

Hình 1..

Sản phẩm PCR-RAPD của 04 cặp lai nhị nguyên trong n−ớc với mồi OPA02 (M: thang phân tử 1 kb, giếng 1-10: cặp lai TN1, 11-20: cặp lai TN2, 21-30: cặp lai TN3, Xem tại trang 4 của tài liệu.
Hình 3. Biểu đồ hình cây theo hệ số di truyền của Jaccard vμ kiểu phân nhóm UPGMA của 80 cá thể F1 thuộc 8 cặp lai  nhị nguyên  - PHÂN TíCH TíNH ĐA HìNH ADN CủA 8 CặP LAI NHị NGUYÊN TằM DÂU F1 BằNG CHỉ THị RAPD

Hình 3..

Biểu đồ hình cây theo hệ số di truyền của Jaccard vμ kiểu phân nhóm UPGMA của 80 cá thể F1 thuộc 8 cặp lai nhị nguyên Xem tại trang 6 của tài liệu.

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

  • Đang cập nhật ...

Tài liệu liên quan