Đang tải... (xem toàn văn)
Sinh học phân tử là môn khoa học nghiên cứu giới sinh vật ơ ̉ mức độ phân tử. Sinh học phân tử chủ yếu nghiên cưú tương tác giữa các hê ̣ thôń g câú trúc khác nhau trong tế bào, gồm quan hệ qua lại giữa quá trình tôn̉ g hơp̣ DNA, RNA, Protein và cách thức điêù hoà cać môí tương tác này.
SEMINAR NGUYÊN TẮC PHÂN LOẠI SINH VẬT SEMINAR NGUYÊN TẮC PHÂN LOẠI SINH VẬT LỚP K53A - SINH HỌC PHÂN LOẠI PHÂN LOẠI SINH HỌC PHÂN TỬ SINH HỌC PHÂN TỬ Giáo viên hướng dẫn: Giáo viên hướng dẫn: TS. Nguyễn Trung Thành TS. Nguyễn Trung Thành Sinh viên thực hiện: Sinh viên thực hiện: Đào Trọng Khoa Đào Trọng Khoa Hoàng Thị Xoan Hoàng Thị Xoan Phan Hồng Anh Phan Hồng Anh Trần Văn Hiếu Trần Văn Hiếu NỘI DUNG CHÍNH NỘI DUNG CHÍNH I. Tổng quan về phân loại Sinh học phân tử I. Tổng quan về phân loại Sinh học phân tử II. Các phương pháp cơ bản của phân loại Sinh học phân tử II. Các phương pháp cơ bản của phân loại Sinh học phân tử III. Ứng dụng của phương pháp phân loại Sinh học phân tử III. Ứng dụng của phương pháp phân loại Sinh học phân tử IV. Giá trị phân loại học của các đặc điểm Sinh học phân tử IV. Giá trị phân loại học của các đặc điểm Sinh học phân tử I. TỔNG QUAN VỀ PHÂN LOẠI SINH HỌC PHÂN TỬ 1.1. ĐỊNH NGHĨA SINH HỌC PHÂN TỬ 1.1. ĐỊNH NGHĨA SINH HỌC PHÂN TỬ Sinh học phân tử là môn khoa học nghiên cứu giới sinh vật ở mức độ phân tử. Sinh học phân tử chủ yếu nghiên cứu tương tác giữa các hệ thống cấu trúc khác nhau trong tế bào, gồm quan hệ qua lại giữa quá trình tổng hợp DNA, RNA, Protein và cách thức điều hòa các mối tương tác này. 1.2. PHÂN LOẠI SINH HỌC PHÂN TỬ 1.2. PHÂN LOẠI SINH HỌC PHÂN TỬ Là phương pháp phân loại sinh vật bằng đặc điểm gen ở mức độ phân tử. Tức là phân loại bằng các dẫn liệu so sánh hóa sinh các phân tử lớn như DNA, RNA, protein. Hiện nay phân loại sinh học phân tử đã và đang trở thành khoa học mũi nhọn trong phân loại học, bổ sung cho phân loại học truyền thống những phương pháp nghiên cứu mới và một loại đặc điểm phân loại hoàn toàn khác với những đặc điểm phân loại đã̃ dùng trước đây. II. CÁC PHƯƠNG PHÁP CƠ BẢN CỦA PHÂN LOẠI SINH HỌC PHÂN TỬ 2.1. So sánh Protein 2.2. Kỹ thuật điện di. 2.3. Phân tích và so sánh DNA. 2.5. Phân tích trình tự r-RNA. 2.4. Phân tích trình tự DNA. 2.6. Kỹ thuật PCR (Polymerase Chain Reaction). 2.1. SO SÁNH PROTEIN 2.1. SO SÁNH PROTEIN Số liệu so sánh Protein là một đăc điểm phân loại quan trọng, đáng tin cậy để xác định quan hệ giữa các taxon sinh vật, kể cả sinh vật nhân sơ và sinh vật nhân chuẩn. Có nhiều phương pháp so sánh Protein. Nguyên lý: Protein của một loài sinh vật có phản ứng kháng thể đối với protein của một loài có quan hệ gần mạnh hơn đối với protein của loài có quan hệ xa hơn. Phương pháp này được áp dụng để kiểm tra một số kết quả phân loại theo đặc điểm hình thái và các đặc điểm phân loại khác. Kỹ thuật nghiên cứu định lượng phản ứng kháng thể. VD: phương pháp cố định vi bổ thể lượng (microcomplement faxation) do Champion đề xướng. Hiện nay, phương pháp xác định và so sánh trình tự acid amin của các protein có cùng chức năng là phương pháp trực tiếp và được sử dụng rộng rãi nhất. Số liệu so sánh trình tự cytochrome, các protein vận chuyển điện tử (electron transport protein), trình tự các histone, các protein sốc nhiệt, protein phiên mã, dịch mã được dùng rất phổ biến trong phân loại học. [...]... đặc điểm phân loại đáng tin cậy để kiểm tra kết quả phân loại bằng những loại đặc điểm khác Tỷ lệ G+C cũng là đặc điểm phân loại tin cậy để xác định các chi, thường là các chi sinh vật nhân sơ • Xác định thành phần base hữu cơ của DNA qua nhiệt độ nóng chảy (Tm) của DNA • Tm là nhiệt độ làm 50% sợi kép tách thành sợi đơn 2.3.2 LAI DNA/DNA • Có thể so sánh trực tiếp các nguồn gen khác nhau của sinh vật... phổ biến trong phân loại vi sinh vật nhân thật và sinh vật nhân sơ để xác định các dòng chuẩn cũng như là một trong những kỹ thuật hay dùng trong thực tiễn dịch tễ học để phân biệt và xác định các dòng vi sinh vật như vi khuẩn gây bệnh truyền nhiễm 2.3.5 KỸ THUẬT THẤM TÁCH SOUTHERN • Phương pháp tương tự kỹ thuật REA nhưng không phân tích tất cả các đoạn gen DNA cắt giới hạn mà chỉ phân tích chọn... kết quả phân tích Southern • Kỹ thuật này được áp dụng khá phổ biến trong thực tiễn dịch tễ học để phân biệt và xác định các dòng vi khuẩn gây bệnh, cho phép phân tích phát hiện tất cả các dòng vi khuẩn có locut tương đồng với mẫu dò • Áp dụng để phân tích những gene mã hóa các độc tố và chức năng trao đổi chất để xác định các dòng phân lập 2.4 KỸ THUẬT PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ DNA • Phương pháp phân tích... số phương pháp so sánh gián tiếp: Phương pháp điện di Kỹ thuật miễn dịch học so sánh kháng thể Kỹ thuật điện di enzyme đa locut 2.2 KỸ THUẬT ĐIỆN DI Trước đây, trong kỹ thuật nghiên cứu hóa sinh, kỹ thuật sắc ký (chromatographic mathods) được sử dụng rộng rãi Tuy nhiên hiện nay trong nghiên cứu sinh học phân tử, phương pháp sắc ký được thay thế bằng phương pháp điện di (electrophoresis)... Với ưu điểm vượt trội trên, hiện nay kỹ thuật PFGE được sử dụng rộng rãi trong các phòng thí nghiệm hóa sinh và công nghệ sinh học 2.3 PHÂN TÍCH VÀ SO SÁNH DNA Gồm có các phương pháp chính sau: So sánh thành phần base hữu cơ của nucleic acid Lai DNA/DNA Lai DNA/RNA Phân tích các đoạn DNA cắt giới hạn (REA) Kỹ Southern thuật thấm tách 2.3.1 SO SÁNH THÀNH PHẦN BASE HỮU CƠ CỦA NUCLEIC... có khả năng phân tách vật mẫu có kích thước phân tử lớn • Hạn chế này đã được khắc phục bằng kỹ thuật gel trường điện xung (PFGE = pulssed field gel electrophoresis) là một dạng cải tiến của kỹ thuật điện di • Thủ pháp chính của kỹ thuật PFGE là: đổi chiều dòng điện chạy qua gel điện di, gây xung điện theo chu kỳ • Ưu điểm: kỹ thuật PFGE có khả năng phân tách theo... • Các loại enzyme cắt giới hạn gồm 3 typ: – Typ I và II cắt DNA ở các điểm trình tự nhận biết – Typ III cắt DNA ở vị trí trình tự nhận biết đặc biệt • Ưu điểm: kỹ thuật REA không phức tạp, tương đối dễ tiến hành và có thể lặp lại cho kết quả giống nhau, bảo đảm độ chính xác và đáng tin cậy • Nhược điểm: khó phân tích và so sánh kết quả vì số lượng sản phẩm cắt lớn, phổ băng điện di nhiều khó phân biệt... gian thích hợp các cấu tử điện di (các phần tử tích điện) sẽ di chuyển trên giá thể điện di hay bản gel điện di với tốc độ khác nhau, tạo thành phổ băng điện di • Sau khi bản gel được nhuộm màu bằng thuốc nhuộm thích hợp, ta có thể quan sát phổ băng điện di dưới kính hiển vi quang học, hoặc chụp ảnh với độ phóng đại cần thiết • Kết quả phân tích cuối cùng... gen khác nhau của sinh vật nhờ phương pháp lai DNA • Mức độ lai của những đoạn DNA sợi đơn từ những nguồn khác nhau biểu thị mức độ giống nhau của các sinh vật mang các nguồn gen đó • Phương pháp này chỉ có thể áp dụng để so sánh và phân biệt với những sinh vật có quan hệ gần • Phản ứng lai của những đoạn DNA sợi đơn của 2 nguồn gene khác nhau có thể xảy ra ngay cả khi trình tự nucleotide của 2 nguồn... đặc trưng dễ phân tích • Thủ pháp cơ bản: trong quá trình phản ứng tổng hợp DNA, khi chuỗi đang tiếp tục kéo dài, đưa ddNTP gắn vào chuỗi DNA ở đầu mà phản ứng đang tiếp tục, thế chỗ cho deoxynucleotide làm ngừng phản ứng xúc tác của DNA polymerase Phương pháp Sanger sử dụng mồi oligonucleotide tổng hợp nhân tạo có thể tiến hành thủ công hoặc bằng máy phân tích tự động Phương pháp thủ công Phân tích . NGUYÊN TẮC PHÂN LOẠI SINH VẬT SEMINAR NGUYÊN TẮC PHÂN LOẠI SINH VẬT LỚP K53A - SINH HỌC PHÂN LOẠI PHÂN LOẠI SINH HỌC PHÂN TỬ SINH HỌC PHÂN TỬ Giáo viên. quan về phân loại Sinh học phân tử I. Tổng quan về phân loại Sinh học phân tử II. Các phương pháp cơ bản của phân loại Sinh học phân tử II. Các