CHƯƠNG 1: MỞ ĐẦU 1.Đặc tính tế bào: -Đươc bao bọc tb chất,cấu trúc côt lỗi nhân,chứa thông tin di truyền DNA -Ngoài có:protein,nucleic acid,lipid,polysacharidà Tế bào hệ thống mở 2.Các đặc điểm chung hệ thống sống: -Biến dưỡng:thu nhân chất từ môi trường,chuyển hóa thành power -Sinh sản -Phân hóa(differentiation): -Communication,đáp ứng kích thích -Evolution(tiến hóa) -Di động 3.Thông thường đột biến có hại làm chết tế bào 4.Hai dạng tế bào: Prokaryote(tiền nhân) eukaryote(nhân thật):phức tap chứu nhân,ti thể,lục lạp… 5.Ba giới sinh vật:Archaea(vi khuẩn cổ),Bacteria(vi khuẩn),Eukarya(tế bào nhân thực) 6.Vai trò vi sinh vật: -Một số loài vi sinh vật gây bệnh cho người(bệnh truyền nhiễm),phần lớn có lợi cho người -Nhóm vi khuẩn quang dưỡng trở thành nguồn lượng thay sinh khối tạo từ ánh sánh mặt trời cacbodioxidàchuyển hóa thành Methane Ethanol 7.Lịch sử vi sinh vật: -Antoni.v Leeuwennhoek phát vi sinh vât đầu tiên( 1684) -Pasteur: bác bỏ thuyết phát sinh ngẫu nhiên(VSV tạo cách ngẫu nhiên từ vật không sống)-Lên men lactic-Vai trò nấm men lên men cồn -Kock:Chứng minh Mycobacterium tuberculosis nguyên nhân gây bệnh lao cách lập,nuôi cấy chuẩn môi trường rắn có agar +Quy tắc Knock: VSV gây bệnh phải diện bệnh,không có vinh vật khỏe Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ .Cần nuôi cấy VSV đối tượng môi trường vô trùng.tách khỏi thể động vật Tế bào từ dịch nuôi cấy VSV đối tượng gây triệu chứng bệnh tương tự với sinh vật khỏe Phân lập VSV gây bệnh,phải giống với VSV ban đầu -Bejerinck Winogradsky: phương pháp nuôi tích lũy(use môi trường điều kiên nuôi cấy chuyên biệt nhằm tạo ưu tăng trưởng vi sinh vật mong muốn,hạn chế không mông muốn)à hình môn vi sinh học đại cương CHƯƠNG 2:TẾ BÀO VI SINH VẬT 1.Các liên kệt hóa học hệ thông sinh học: -Cộng hóa trị:hai nguyên tửu cho nhân điện tíchàliên kêt bền vững -Liên kết hydrogen(hydrogen bond):hình hút ngtu manh điện tích dương nhẹ với âm nhẹ phân tử.(một liên kêt hydrogen riêng lẽ yếu so với công hóa trị,nhưng số lượng lớn mạnh -Tương tác kị nước:các phân tử kị nước tương tác nhau( protein-protein) -Lưc wan der Waals: tương tác yếu đại phân tử sinh học(hình thành ngtu cách khoang3-4A,khi khoảng cách nhỏ chúng đẩy nhau)àvai trò gắn chất vào emzyme,tương tắc protein,nucleid acid CHTàKị nước Ion Hydrogene Wan der waals 2.Các đại phân tử sinh học quan trọng : -Protein(55%):cấu trúc tế bào,emzyme,bảo vệ,… -Lipid(9,1%): -Nucleic acid( DNA 3,1%, RNA 20,5%: thành phần Ribosome)àRN bền DNA nhóm OH vị trí C2’ -Polisacharide: 5% : àMỗi đại phân tử sinh học tạo thành từ đơn phân(monomer )àliên kết CHTàảnh hưởng đến cấu trúc chức 3.Vai trò nước -Chiếm tỷ trọng lớn tế bào (70-90%) Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -Dung môi cho phản ứng -Nước có tính phân cực 4.Polysaccharide -Các đơn phân liên kết liên kết glycoside There are S,N,C-glycoside bond -Liên kết a-1,4- phân tử glucose àdự trữ lượng dự trữ cacbon qtrong (tinh bôt,glycogen ) -Liên kết B-1,4- àthành phần vách tế bào (cellulose) -Polysaccharide liên kết với đại phân tử khác protein,lipid 5.Lipid -Thành phần quan trọng màng tế bào -Lớp đôi phospholipid: lớp ưa nước(đầu phosphate) + lớp kị nước bên trong(đầu CH-) àngăn cản thẩm thấu chọn lọc qua màng Có dạng: +Dạng lipid đơn giản: Tryglyceride(1 phân tử glycerol liên kết với acid béo) +Dạng lipid phức tạp:là lipid đơn giản có thểm phân tử khác :N,P,S,or nhóm ưa nước như:đường,serine,choline,ethanolamine 6.Các loại kính hiển vi Kính hiển vi quang học,nền tối,nền sáng,huỳnh quang,đối pha àđộ giới hạn phân giải 0,2micromet -Kính hiển vi sáng: +USE thuốc nhuộm điện tích dương để nhuộm VSV: methynene blue,crystal violet,Safranin(thường use chúng có khả gắn chặt vào thành phần điện tích âm bề mặt tế bào) àNhược điểm:để làm cell die biến dạng -Kính hiển vi tối: quan sát di động VSV -Kính hiển vi huỳnh quang:Chuẩn đoán bệnh sinh thái hoc VSV Note:Kính hiển vi điện tử use electron proton làm nguồn sáng.Có loại: +Xuyên thấu(TEM): quan sát bên tế bào VSV) +Quét(SEM) Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ giới hạn phân giải 0,2nanomet 7.Tổng quan cấu trúc tế bào ý nghĩa size nhỏ prokaryote -Các bào quan quang trọng gồm:màng tế bào chất,ribosome(thành phần lớn khoảng 10.000 ribosome/tế bào) gene(DNA dạng kết tụ gọi thể nhân) -Size 0,1-0,2 um,tỉ lệ bề mặt so với dung tích tế bào lớnàtrao đổi chất hiệu quả,tăng trưởng size tế bào 7.Cấu trúc chức màng tế bào chất a.Cấu trúc -Lớp đôi phospholipid: Kị nước(bên trong) ưa nước(các glycerol) -Thành phần lipid màng thay đổi tùy vào giới sinh vật: +Vi khuẩn Eukarya:liên kết glycerol mạch kỵ nước liên kết ester +Giới vi khuẩn cổ Archeae:liên kết ether mạch kỵ nước acid béo mà mạch trùng ngưng phân tử isoprene phân nhánh b.Chức -Ngăn cản phếch tán thành phần tế bào chất vào khỏi tế bào -Nơi lưu trú protein àchức emzyme,vận chuyển -Dự trữ lượng cho tế bào( nhân thực ATP tổng hợp ti thể) -Lớp mạng:vận chuyển chất dinh dưỡng + Lớp trong:truyền điện tử -Các kiểu vận chuyển màng tế bào: +Protein vận chuyển đơn chiều(Unipoter):vận chuyeent chất từ phía sang phía màng +Protein vận chuyển kép chiều(Sympoter):vận chuyển chất chiều +Protetin vận chuyển kép đối chiều(Antipoter): vận chuyển chất vào chất khác khỏi tế bào -Ba hệ thống vận chuyển chất qua màng: +Hệ thống đơn giản:không làm thay đổi cấu trúc chất: K+ : vào bên tích điện âm Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ .Na+ proton vào bên trong: antipoter Anion proton vận chyển vào:Sympoter +Hệ thống chuyển vị nhóm:làm thay đổi cấu trúc chất (ví dụ Pyruvate àGlucose :có use emzyme) +Hệ thống vận chuyển ABC:phức hợp thành phần,không làm thay đổi cấu trúc chất,use ATP có vi khuẩn gram âm) 8.Vách tế bào -Bảo vệ tế bào có thay đổi mạnh áp suất(nếu dùng emzyme lysozyme thủy phân petidoglycanàtế bào phồng lên vỡ raàđặt dung dịch sucrose àtế bào ổn định,tăng trưởng được) -Vách tế bào prokaryote:có petidoglycan dày(Gram dương),mỏng,có chu chất Periplasm có màng Gram âmàĐiểm khác biệt so với Eukaryote -Thành phần petidoglycan: +Đơn phân đường N-acetylglucosamin N-acetylmuramic acidàđược tổng hợp tế bào chất,được vận chuyển qua màng để tổng hợp vách +Amino acid ngắn nối đơn phân này( B-(1,4) : cầu nối nhạy cảm với Lysozyme) -Quá trình tổng hợp vách tế bào + N-acetylglucosamin N-acetylmuramic acidàđược tổng hợp tế bào chất,được vận chuyển qua màng để tổng hợp vách +Các pentapeptid mạch glycan kế cận kết nối chéo phản ứng transpeptidation àKhi tế bào phân chia àbị sử lý penicillin àhình thành vách tế bào bị ức chếàtan die Note: -Peptidoglycan có all vi khuẩn có vách tế bào(trừ mycoplasma vách)àkhông có vi khuẩn cổ(một số vi khuẩn cổ thuộc nhóm sinh methan có vách vách từ polysaccharide tương tự peptidoglycan àPseudopeptidoglycan nhân thực 8.Màng vi khuẩn Gram âm -Thành phần:protein lipopolysaccharide (thành phần gây đọc với người động vật) -Tính gây bệnh vi khuẩn gram âm do: Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ +Độc với người động vật +Có nhiều chủng khác -Có tính thẩm thấu cao màng tế bào chất -Chứa protein porin có vai trò: +Thủy phân hơp chất cao phân tử (bước thủy phân thức ăn) +Vận chuyển chất dinh dưỡng +Thụ quan hóa họcàđáp ứng hướng hóa 9.Tiêm mao đặc tính di động vi khuẩn -Prokaryote:di chuyển nhờ Tiêm mao + Eukaryote:Các lông chuyển động roi đẩy tê bào -Cấu tạo tiêm mao: protein flagetin -Hai kiểu chuyển động vi khuẩn: +Tiến or lùi theo đường thẳng:phụ thuộc vào hướng quay tim mao (thuận or ngược chiều kim đồng hồ) +Ngưng bơi chuyển hướng:bung chùm tim mao -Sự di động có tính hướng hóa hướng quan phụ thuộc vùng chu chất -Sự định hướng di chuyển nhờ vào Mot protein Fli protein +Che Y :là protein kiểm soát hướng quay tim mau +MCP: truyền tín hiệu cho Che Y + Có vai trò lài nhớ methyl hóa 10.Các cấu trúc khác bề mặt tế bào -Sợi Pili tua viền(fimbriae):là cấu trúc giúp vi khuẩn bám bề mặt mô chật chủ or gắn vào vỉut -Lớp S:là lớp protein kép có vai trò cho phép thấm phân tử nhỏ phân cực giữ không cho phân tử lớn di quaàỞ vi khuẩn gây bệnh chống lại hệ thống phòng vệ tế bào chủ -Glycolax:là polisaccharide ngoại bàoàhelp vi khuẩn gây bệnh gắp vào tế bào chủ,mô chủ +chống lại hệ thống bảo vệ tế bào chủ -Cấu trúc có vai trò dụ trữ:dụ trữ polymer cacbon(glycogen,poly-alkannoic) phosphate, hạt S,các túi gas… 11.Nội bào tử Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -Được phân hóa từ tế bào sinh dưỡng môi trường không thuận lợi -Tính bền nhiệt cao do:Dipicolinic acid calcium -Có thể hưu miên trạng đến vài chục chí vài trăm năm 12.Bộ gen vi khuẩn -Là phân tử DNA dạng vòng gấp khúc or tự xoắn ànằm tế bào chất(phiêm mã dịch mã điều diễn đâyà prokaryote:RNA tổng hợp nhân +Dịch mã diễn ribosome) -Chiều dai 1mm gấp khúc để nằm có đường kính 2-3um CHƯƠNG 3:SINH LÝ VI SINH VẬT 1.Các dạng biến dưỡng vi sinh vật -Vi sinh vật quang -Vinh sinh vật hóa năng: Hóa vô hữu 2.Nhu cầu dinh dưỡng vi sinh vật -Các vi sinh vật dị dưỡng cần cung cấp hợp chất corbon hữu để làm nguồn carbon lượng -Nitrogen:thành phần quang trọng protein acid nucleicàhấp thụ dạng N2 NH3(chủ yếu) -Phosphate: làm nguồn cung cấp phospho cần cho tổng hợp nucleic acid phospholipid -sulfate:tổng hợp cystine methionine -+ Nhóm đa lượng: C(50%), O(17%), N(13%), H(8,2%), P, S, K, Mg, Na, Ca Fe + Nhóm vi lượng: Cr, Co, Cu, Mn, Mo, Ni, Se, W, V Zn 3.Năng lượng tế bào -Cơ chế thu lượng tế bào:năng lượng thu từ trình oxi hóa – oxi hóa khử chất trình dị hóa +Thu lượng từ khử e- trình dị hóa -NAD,NADP,FMN,FAD:là chất mang điện tử trung gian phản ứng oxh khử - Hai đường tạo ATP: Phosphoryl hóa chất(lên men) + phosphoryl oxh(hô hấp) +Hô hấp:điện tử từ chất chuôi truyền điện tửàchất nhận điện tử cuối : 02 N03 +Lên men:Chất hữu bị oxh sản phẩm hữu trung gian bị khử để cân bằn oxh khử àEnergy hô hấp tạo ta nhiều lên menàlên men C hữu bị oxh hoàn toàn CO2 Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ 4.Cơ sở sinh hóa lên men -Cơ đường phân -Gồm bước: Bước chuẩn bị + Bước oxh + Bước khử +Bước chuẩn bị: Glucose hoạt hóa cần ATP ( Production of glyceraldehyde-3-P) +Bước oxh :(Making ATP and Pyruvate) :Glyceraldehyde-3-P chuyển cho NAD,xảy xa oxh chấtà Pyruvate àchỉ tạo 2-4 ATP àbước quang trọng có lượng nhỏ NAD làm chất nhận điện tử trung gian +Bước khử: making fermentation products(sp lên men) àpyruvate nhận điện tử từ NADH để tái tọa lại NAD 5.Hô hấp hiếu khí -Glucose àpyruvate -PyruvateàCO2 (TCA Cycle) : điện tử chuyển đến NAD NADH FADH2à chuổi truyền điện tử C hữu bị oxh hoàn toàn thành C02 38 ATP -Chất mang điện tử trung gian: cytochrome,quinone,flavoprotein :nằm màng tế bào chất 6.Các phương thức tạo lượng khác -Hô hấp kị khí:hô hấp dùng nitrate,sulfate,conbonate… làm chất nhận điện tử cuối -Năng lượng từ ánh sáng:quang -Hóa vô cơ:dùng chất vô làm chất cho điện tử 7.Sự thu energy biến dưỡng carbon -Nguồn lượng : +Ánh sáng: quang +Hợp chất hóa học: Hóa vơ hữu -Nguồn C: +C02:tự dưỡng +Hợp chất hữu cơ:dị dưỡng 8.Quang tự dưỡng không sinh oxi Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -NL :ánh sáng -Quang hợp không sinh oxi,anoxygenic,photosynthesis -Chấ nhận điện tử khử C02: không nước(H2S,Fe2+,H2…) 9.Quang tự dưỡng sinh oxi -NL: ánh sáng -Quang hợp sinh oxi,anoxygenic,photosynthesis -Chấ nhận điện tử khử C02: nước 10.Điểm khác quang tự dưỡng dị dưỡng nguồn Carbon -Quang tự dưỡng(quang hợp) : C02 -Quang dị dưỡng: chất hữu -Quang tổng hợp không sinh oxi: vi khuẩn quang lục tía -Quang tổng hợp sinh oxi:Tảo,vi khuẩn lam 11.Hô hấp kị khí: -ATP tạo hô hấp hiếu khí -Vi khuẩn phản nitrate hóa( NO3- Denitrifying bacteria) -Vi khuẩn khử sulfate(SO42-,sulfate reducer) -Vi khuẩn sinh methane(CO2,methanogen) -Vi khuẩn sinh acetate đồng hình(CO2,homoacetogen) 12.Biến dưỡng nitrogen -Sinh vật use đạm dạng:NH3,N03,N2 -Khi nồng độ NH3 thấp: glutamine synthetase chuyển NH3 a-ketoglutarate Glutamate -Khi NH3 nhiều: glutamate dehydrogenase xúc tác gắn NH3vào hợp chất hữu -Cố định đạm N2 thành NH3 xúc nitrogenaseàbị bất hoạt oxi 12.Sự tổng hợp nucleotide -Purine(A,G) :được tổng hợp cách thêm nguyên tử vào khung đường- phosphate Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -Pyrimidine(C,T,U): tổng hợp trước gắn vào 13.Nuôi cấy Mẻ: -VSV nuôi cấy môi trường dinh dưỡng định,Gồm pha: +Pha lag hay tiềm tàng:tế bào tiết emzyme để use chất dinh dưỡngàkéo dài +Pha hàm mũ:Tế bào nhân đôi +Pha ổn định:tạo sản phẩm thứ cấp +Pha suy tàn 14.Nuôi cấy liên tục -Chất dinh dưỡng bổ sung liên tục vào hệ thống -Pha hàm mũ kéo dài àTrong nuôi cấy mẻ liên tục pha hàm mũ ổn địnhàquần thể cân 15.Khử trùng phương pháp lọc -Bảo vệ phân tử có hoạt tính bất hoạt nhiệt 16.Bốn yếu tố lý hóa ảnh hưởng đến tăng trưởng VSV: -Nhiệt độ,Ph,áp suất thẩm thấu,Oxi **Trắc nghiệm Tại oxy hóa hợp chất hữu oxy để tạo CO2 nước giải phóng lượng? A) Các cầu nối cộng hóa trị hợp chất hữu oxy có nhiều động nối cộng hóa trị nước CO2 B) Các electron di chuyển từ nguyên tử có lực thấp electron (như C) đến nguyên tử có lực cao electron (như oxy) C) Sự oxy hóa hợp chất hữu sử dụng để tạo ATP D) Các electron có lượng cao tương tác với nước CO2 so với hợp chất hữu E) Nối cộng hóa trị oxy không bền dễ bị bẻ gãy electron từ hợp chất hữu Phân tử có chức chất khử (chất cho điện tử) phản ứng oxy hóa khử sẽ: A) nhận electron nhận lượng (potential energy) Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 10 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ B) electron lượng C) nhận electron lượng D) electron nhận E) không thu không nhận electron, nhận lượng Phân tử có chức chất khử (chất cho điện tử) phản ứng oxy hóa khử sẽ: A) nhận electron nhận lượng (potential energy) B) electron lượng C) nhận electron lượng D) electron nhận E) không thu không nhận electron, nhận lượng Tại ATP phân tử quan trọng biến dưỡng? A) Sự thủy phân cung cấp lượng tự cho phản ứng thải nhiệt B) Nó cung cấp lượng kết hợp (energy coupling) phản ứng thải nhiệt thu nhiệt C) Nhóm phosphate tận chứa nối cộng hóa trị mạnh mà thủy phân giải phóng lượng D) Nối phosphate tận có lượng cao hai nối lại E) Nó bốn nguyên liệu cho tổng hợp DNA Điều sau liên quan đến đường biến dưỡng đúng? A) Chúng kết hợp phân tử thành phân tử giàu lượng B) Chúng cung cấp lượng, dạng ATP, cho hoạt động tế bào C) Chúng thu lượng D) Chúng ngẫu nghiên không cần xúc tác enzyme E) Chúng hình thành phân tử phức tạp protein từ phức hợp đơn giản Chất sau sản phẩm phản ứng sáng sử dụng chu trình Calvin? A) CO2 glucose Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 11 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ B) H2O O2 C) ADP, Pi NADP+ D) Electrons H+ ATP NADPH ATP tạo trình đường phần (glycolysis) tạo bởi: A) phosphoryl hóa chất (substrate-level phosphorylation) B) chuyển electron (electron transport) C) quang phosphoryl hóa (photophosphorylation) D) chemiosmosis E) osự oxy hóa NADH thành NAD+ Campbell – Biology 9th – Chaper Nếu cung cấp CO2 tạo với 18O cho tảo lục quang hợp, phân tích cho thấy tất hợp chất tạo sau tảo chứa 18O ngoại trừ: A) 3-phosphoglycerate B) glyceraldehyde 3-phosphate (G3P) C) glucose D) ribulose bisphosphate (RuBP) E) O2 Ở vi khuẩn tự dưỡng, enzyme thực việc cố định carbon nằm đâu? A) màng chloroplast B) chất chloroplast C) tế bào chất D) thể nhân (nucleoid) E) màng nguyên sinh chất Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 12 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ Các emzyme tham giai trình phiên mã dịch mã a/ Vi khuẩn có ba nhóm DNA polymerase: * Pol I: Đóng vai trò sửa chữa DNA ,hủy mồi * Pol II: Hoạt động 5'->3' exonuclease (có thể loại bỏ primer), sau tiếp tục kéo dài phân tử DNA để lấp vào chỗ khuyết * Pol III: Là polymerase chủ yếu vi khuẩn (tham gia nhân đôi phân tử DNA), có hoạt tính đọc sửa (proofreading) b/ Eukaryote: * Pol α: có vai trò primase (để tổng hợp RNA primer), sau thực hiên việc kéo dại phân tử DNA từ primer cách gắn nucleotid vào Sau vài trăm nucleotid kéo dài cắt bỏ Pol δ ε * Pol β: có chức sửa chữa DNA * Pol γ: chép DNA ty thể * Pol δ: với Pol ε polymerase tế bào eukaryote, lấp khoảng trông sau cắt bỏ primer đặc tính men 5'->3' * Pol ε: tương tự Pol δ Retrictase: cắt phân tử DNA vị trí xác định Ligase: nối đoạn DNA Gyrase, Topoisomerase: tháo xoắn mạch RNA Proprimosome: tổng hợp đoạn mồi RNA Helicase: tháo xoắn mạch kép DNA ==> chạc chữ Y SSB (single - strand binding protein): giữ vững trạng thái chữ Y Glycosylase: nhận biết loại trừ base sai hỏng A Pendonuclease: cắt sợi đơn DNA vị trí base 10 R Nase H: phân hủy mồi RNA kéo dài mạch kết thúc.[i] Tỉ lệ sai sót trình tự nhân đôi tổng hợp mạch người 10^-9 CHƯƠNG 4:DI TRUYỀN HỌC VI SINH VẬT 1.Đặc điểm virut : -Không tế bào gồm acid nucleic bao bọc vỏ protein -Size nhỏ : 0,02-0,03um Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 13 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -Khi diện bên virut hoạt động biến dưỡng àVirion àCần xâm nhiễm vào tế bào chủ dùng hệ thống emzyme,ribosome,nguồm vật chất,NL để tự nhân đôi 2.Đặc điểm cấu trúc NST prokaryote -Xoắn kép:khe nhỏ,khe lớn,DNA-binding protein gắn vào khe lớn -Cấu trúc bậc 2:thân-vòng(sterm-loop) hay kẹp tóc(hair spin)ànơi nhận diện protein điều hòa -Cấu trúc siêu xoắn: Topoisopmerase II àhình thành cấu trúc siêu xoắn + Topoisomerase I àtháo xoắn 3.Đặc điểm cấu trúc NST Euk: -Size :big -Nuleosome,chromatin,NST -Ba nhóm DNA: +DNA sao:mã hóa protein +DNA lặp lại trung bình: mã hóa histon,rRNA,tRNA,immunoglobin +DNA vệ tinh: 20% tổng DNA àchưa rõ chức 4.Các yếu tố di truyền -Các yếu tố di truyền NST như: +Bộ gen virut : DNA or RNA + Plasmid:chủ yếu có Pro,small size,nằm nhân,dạng vòng,mạch kép +Gen nhảy:có khả di chuyển từ vị trí sang vị trí khác NST +Bộ gene ti thể,lạp thể 5.Sao chép DNA -Bước 1:DNA mạch kép tháo xoắn :emzyme topoisomerase -Bước 2:hai mạch tách tạo chẻ 3: emzyme Heligase -Bước tiến hành sau chép: +Ở đầu 3’ – 5’: mạch tổng hợp liên tục,hướng vào chẻ ba (emzyme polymerase III) Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 14 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ + Ở đầu 5’ – 3’ : tổng hợp đoạn Ozaki (gián đoạn),hướng chẻ ba,(Đầu tiên RNA mồi tổng hợp emzyme primase,mồi để DNA polymerase tổng hợp đoạn OzakiàMồi bị thủy phânàemzyme polymerase I lắp đầy khoản trống àcác đoạn Ozaki nối nhờ DNA ligase 6.Qúa trình phiên mã * Đặc điểm: -Chỉ có loại emzyme tham giai phiên mã RNA-pol có thành phần : phần lõi để tổng hợp RNA + Sigma : start transcription -Quá trình phiên mã xãy đồng thời với dịch mã * Có giai đoạn phiên mã : Khởi đầu- kéo dài- kết thúc Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 15 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ a.Khởi đầu: -Promoter: RNA nhận diện gắn vào trình tự bảo tồn -10 ( TATAAT), -35(TTGACA) mạch mang mã( 3’-5’)àphiên mã diễn -Sự tổng hợp start point phía sau Pribnow box b.Kéo dài -Khi phân tử RNA đạt chiều dài khoảng 10Nu Sigma sequence tách khỏi RNA pol -RNA-pol liên túc tháo xoắn DNA chiều dài khoảng 18Nu theo tiến trình phiên mã -Sợi RNA tách khỏi mạch khuôn phần DNA tháo xoắn RND-pol đóng xoán trở lại c.Kết thúc Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 16 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -Khi RNA-pol đạt tới điểm tận chuỗi RNA emzyme tách -Có kiểu kết thúc: Tự kết thúc +Trên mạch khuôn xuất trình tự Palindrome(một đoạn chứa A liên tiếp) +Đoạn cuối phân tử RNA bị gấp khúc tạo thành cấu trúc kẹp tóc(do bắt cặp bù trừ bên RNAàUUUUU) Kiểu kết thúc cần diện loại protein +Ở E.coli kết thúc phiên mã cần giúp đỡ nhân tố p(Rho) +Sigma Rho bám vào phân tử RNA tổng hợpàđi theo RNA-pol đến gặp cấu trúc kẹp tóc àRNA-pol tạm dừng Sigma p làm phân rã liên kết DNA-RNA àRNA tách khỏi mạch Note: Nêu cấu trúc palindrome, Trình tự Pribnow box? -Ở Euk: +Pre-mRNA chứa exon intron(không mang thông tin) +Intron: 5’ – G U…A….A G-3’ +RNA splicesome(Ribozyme) cắt đầu 5’,3’ nối đầu 7.Mã di truyền -64 ba -Mã khởi đầu: AUG -Mã kết thúc: UAA,UAG,UGA -Có ngoại lệ -Trên intron có trình tự bảo tồn GU đầu 5’ AG đầu 3’,bên intron cần có vị trí A làm điểm uốn 8.Transfer RNA -Cấu trúc bậc 2:đầu mang đối mã(anticodon),đầu mang aminoacid -Mỗi tRNA tương tác với aminoacyl-tRNA synthetase riêng 9.Translation Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 17 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -Ribosome:tiểu phân 30S 50S( Pro),40S 60S(Euk) -Proryote: + Tiểu phân 30S gắn vào phần đầu mRNA (AUG) -Eur: +E-site(exit site):chứa tRNA không gắn amino acid +P-site: chứa tRNA mang chuỗi peptide +A-site: chứa tRNA mang amino acid -Gen gối đầu: gen có khung đọc có vị trí bắt đầu khác (fX174) -Tần suất sai sót dịch mã: 10-3 – 10-4 -Biến đổi sau dịch mã,hai phương thức: +Cộng hóa trị:gắn thêm nhóm phosphate,methyl,đường vào protein liên kết cộng hóa trị +Không cộng hóa trị:gắn với chất có phân tử lượng nhỏ,tương tác với pholypeptide khác,tương tác với chaperone phân tử 10.Đặc điểm cấu trúc DNA binding protein Có cấu trúc thường gặp: -Xoắn-gập-Xoắn:xoắn a-helix có vai trò nhận diện trình tự chuyên biệt DNAàđược nối Tripeptide với a-helix khácàthường trường hợp Lac,Trp repressor E.coli -Zine finger:thường gặp protein điều hòa cell of Euk:gồm a-Helix có vai trò nhận diện ổn định ion Zn gắn vào thông qua amino acid C H(histidine) -Cấu trúc dây kéo leucine: đặc điểm leucine cách amino acid àkhông tương tác trục tiếp với DNA,tạo không gian cho xoắn a-helix nhậ diện DNA 11.Điều hòa phiên mã kiễm soát âm -Liên quan đến DNA-binding protein repressor(chất ức chế) operator -Khi repressor gắn vào operator àkhông phiên mã -Repressor biến đổi sau phiên mã thông qua kiểm soát âm biểu gene -Ví dụ: Repressor hoạt hóa Effector àgắn vào operatorà ức chế phiên mã -Ví dụ:Repressor bị bất hoạt Effector (Inducer) àkhông gắn vào operatoràTransciption điễn Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 18 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ 12.Điề hòa phiên mã Dương (positive control) -Liên quan đến DNA-binding protein activator activator-blinding site(vị trí gắn) hay enhancer -Khi activator gắn vào activator-bindung site àtăng cường phiên mã -Activator biến đổi sau dịch mã thông qua kiểm soát dương biểu gene -Ví dụ emzyme cần cho biến dưỡng maltose E.coli: +Các emzyme tổng hợp môi trường có Mal +Mal đóng vai trò effectorà biến đổi cấu hình Activatorà gắn vào Activator binding site(activator protein gắn vào DNA tổng hợp RNA polimerase -Vị trí gắn activator xa promotor àDNA uốn công 12.Điều hòa giảm số lượng -Hiện diện chủ yểu prokaryote:là chế điều hòa cần bắt cặp phiên mã dịch mã,liên quan đến sinh tổng hợp amino acidàví dụ điều hòa Tryptophan E.coli -Khi thừa Trptophan: mRNA hình thành cấu trúc kẹp tócàphiên mã locked -Thiếu Tryptophan: ribosome dừng lại àphiên mã diễn -Sự dịch mã gene tiên phong điều hòa phiên mã gene lại operon: +Các vùng mRNA tạo stem-loop với +Môi trường nhiều amino acid mục tiêu: àngừng dịch mã +Môi trường amino acid àphiên mã diễn Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 19 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ 13.Điều hòa toàn cục -Điều hòa toàn cục chế điều hòa môi tường chuyển hai trạng thái hiếu khí kị khí,sự đói nitrogen,các shock nhiệt stress oxi hóa -Khi tế bào có nhiều glucose,nồng độ cAMP tế bào thấp,cAMP không gắn vào CAP protein bất hoạt -Ở E.coli operon phiên mã cần có hai điều kiện:Lượng cAMP đủ lớn để gắn vào CAP+ Có chất cảm ứng Lactose 13.Điều hòa mật độ tế bào -Liên quan đến mật độ tế vào xylated homonserine lactone (AHL) -Mật độ tế bào cao tạo nồng độ cao AHL -AHL hoạt hóa activatior -Ví dụ:điều hòa lux opreon(chứa gen mã hóa luciferase) phát sáng Vibrio fischeri Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 20 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌˆVi]ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ°ˆVi˜ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ [...]... tổng hợp trong nhân +Dịch mã diễn ra ở ribosome) -Chiều dai 1mm nhưng gấp khúc để nằm có đường kính 2-3um CHƯƠNG 3 :SINH LÝ VI SINH VẬT 1.Các dạng biến dưỡng ở vi sinh vật -Vi sinh vật quang năng -Vinh sinh vật hóa năng: Hóa năng vô cơ và hữu cơ 2.Nhu cầu dinh dưỡng của vi sinh vật -Các vi sinh vật dị dưỡng cần được cung cấp hợp chất corbon hữu cơ để làm nguồn carbon và năng lượng -Nitrogen:thành phần... chất hữu cơ -Quang tổng hợp không sinh oxi: vi khuẩn quang năng lục tía -Quang tổng hợp sinh oxi:Tảo ,vi khuẩn lam 11.Hô hấp kị khí: -ATP tạo ít hơn hô hấp hiếu khí -Vi khuẩn phản nitrate hóa( NO3- Denitrifying bacteria) -Vi khuẩn khử sulfate(SO42-,sulfate reducer) -Vi khuẩn sinh methane(CO2,methanogen) -Vi khuẩn sinh acetate đồng hình(CO2,homoacetogen) 12.Biến dưỡng nitrogen -Sinh vật use đạm ở dạng:NH3,N03,N2... hữu cơ:dị dưỡng 8.Quang năng tự dưỡng không sinh oxi Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 8 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌ Vi] ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ° Vi ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -NL :ánh sáng -Quang hợp không sinh oxi,anoxygenic,photosynthesis -Chấ nhận điện tử khử C02: không là nước(H2S,Fe2+,H2…) 9.Quang năng tự dưỡng sinh oxi -NL: ánh sáng -Quang hợp sinh oxi,anoxygenic,photosynthesis -Chấ... mới ở người là 10^-9 CHƯƠNG 4:DI TRUYỀN HỌC VI SINH VẬT 1.Đặc điểm của virut : -Không tế bào chỉ gồm acid nucleic được bao bọc bởi vỏ protein -Size nhỏ : 0,02-0,03um Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 13 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌ Vi] ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ° Vi ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -Khi hiện diện bên ngoài virut không có hoạt động biến dưỡng àVirion àCần xâm nhiễm vào tế bào chủ và dùng... O2 9 Ở vi khuẩn tự dưỡng, các enzyme thực hiện vi c cố định carbon nằm ở đâu? A) trong màng chloroplast B) trong chất nền chloroplast C) trong tế bào chất D) trong thể nhân (nucleoid) E) trong màng nguyên sinh chất Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 12 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌ Vi] ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ° Vi ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ Các emzyme tham giai quá trình phiên mã dịch mã a/ Vi khuẩn... Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 6 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌ Vi] ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ° Vi ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -Được phân hóa từ tế bào sinh dưỡng khi môi trường không thuận lợi -Tính bền nhiệt cao là do:Dipicolinic acid và calcium -Có thể hưu miên trạng đến vài chục thậm chí vài trăm năm 12.Bộ gen của vi khuẩn -Là phân tử DNA dạng vòng gấp khúc or tự xoắn ànằm trong tế bào chất(phiêm mã... trúc khác trên bề mặt tế bào -Sợi Pili và tua vi n(fimbriae):là những cấu trúc giúp vi khuẩn bám bề mặt mô chật chủ or gắn vào vỉut -Lớp S:là một lớp protein kép có vai trò cho phép thấm các phân tử nhỏ phân cực nhưng giữ không cho phân tử lớn di quaàỞ các vi khuẩn gây bệnh nó chống lại hệ thống phòng vệ tế bào chủ -Glycolax:là polisaccharide ngoại bàoàhelp vi khuẩn gây bệnh gắp vào tế bào chủ,mô chủ... vào thông qua 2 amino acid C và H(histidine) -Cấu trúc dây kéo leucine: đặc điểm là các leucine cách nhau 7 amino acid àkhông tương tác trục tiếp với DNA,tạo không gian cho xoắn a-helix nhậ diện DNA 11.Điều hòa phiên mã kiễm soát âm -Liên quan đến DNA-binding protein là repressor(chất ức chế) và operator -Khi repressor gắn vào operator àkhông phiên mã -Repressor được biến đổi sau phiên mã thông qua... phiên mã -Sợi RNA tách khỏi mạch khuôn à phần DNA được tháo xoắn sẽ được RND-pol đóng xoán trở lại c.Kết thúc Tai Huynh Ssim Nul `ˆÌi`Ê܈̅Ê̅iÊ`i“œÊÛiÀȜ˜ÊœvÊ 16 ˜vˆÝÊ*ÀœÊ*Ê `ˆÌœÀÊ /œÊÀi“œÛiÊ̅ˆÃʘœÌ Vi] ÊۈÈÌ\Ê ÜÜÜ° Vi ˆ°Vœ“É՘œVŽ°…Ì“ -Khi RNA-pol đạt tới điểm tận cùng của chuỗi thì cả RNA và emzyme đều được tách ra -Có 2 kiểu kết thúc: Tự kết thúc +Trên mạch khuôn xuất hiện trình tự Palindrome(một... mất electron và nhận năng E) không thu và cũng không nhận electron, nhưng nhận hoặc mất năng lượng 2 Phân tử có chức năng như một chất khử (chất cho điện tử) trong một phản ứng oxy hóa khử sẽ: A) nhận electron và nhận năng lượng (potential energy) B) mất electron và mất năng lượng C) nhận electron và mất năng lượng D) mất electron và nhận năng E) không thu và cũng không nhận electron, nhưng nhận hoặc ... kính 2-3um CHƯƠNG 3 :SINH LÝ VI SINH VẬT 1.Các dạng biến dưỡng vi sinh vật -Vi sinh vật quang -Vinh sinh vật hóa năng: Hóa vô hữu 2.Nhu cầu dinh dưỡng vi sinh vật -Các vi sinh vật dị dưỡng cần... biệt nhằm tạo ưu tăng trưởng vi sinh vật mong muốn,hạn chế không mông muốn)à hình môn vi sinh học đại cương CHƯƠNG 2:TẾ BÀO VI SINH VẬT 1.Các liên kệt hóa học hệ thông sinh học: -Cộng hóa trị:hai... hợp không sinh oxi: vi khuẩn quang lục tía -Quang tổng hợp sinh oxi:Tảo ,vi khuẩn lam 11.Hô hấp kị khí: -ATP tạo hô hấp hiếu khí -Vi khuẩn phản nitrate hóa( NO3- Denitrifying bacteria) -Vi khuẩn