HỌC C VIỆN VIỆ NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM - - ĐỖ HẢI QUỲNH ĐẶC ĐIỂM M VÀ SỰ S BIẾN ĐỔI DI TRUYỀN N CỦA CÁC CHỦNG NG VIRUS GÂY HỘI H CHỨNG RỐ ỐI LOẠN SINH SẢN N VÀ HÔ HẤP H Ở LỢN TẠI VIỆT T NAM LUẬ ẬN VĂN THẠC SĨĨ HÀ NỘI, NĂM 2015 HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM - - ĐỖ HẢI QUỲNH ĐẶC ĐIỂM VÀ SỰ BIẾN ĐỔI DI TRUYỀN CỦA CÁC CHỦNG VIRUS GÂY HỘI CHỨNG RỐI LOẠN SINH SẢN VÀ HÔ HẤP Ở LỢN TẠI VIỆT NAM CHUYÊN NGÀNH MÃ SỐ : CÔNG NGHỆ SINH HỌC : 60420201 NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS LÊ VĂN PHAN HÀ NỘI, NĂM 2015 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan công trình nghiên cứu riêng tôi, số liệu, kết nêu luận văn trung thực chưa đượccông bố công trình khác Tôi xin cam đoan thông tin trích dẫn luận văn rõ nguồn gốc Tôi xin chân thành cảm ơn! Hà Nội, ngày tháng năm 2015 Tác giả luận văn Đỗ Hải Quỳnh Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page i LỜI CẢM ƠN Trong suốt trình học tập hoàn thành luận văn, nhận nhiều quan tâm, giúp đỡ quý báu quý thầy cô, anh chị bạn Với lòng biết ơn sâu sắc, xin gửi lời cám ơn chân thành tới thầy cô giáo khoa Công nghệ Sinh học, thầy cô giáo Học viện Nông nghiệp Việt Nam chia sẻ tri thức tâm huyết để truyền đạt vốn kiến thức quý báu cho suốt thời gian học tập trường Đặc biệt xin gửi lời cảm ơn sâu sắc tới người thầy kính mến TS.Lê Văn Phan, Bộ môn Vi sinh vật - Truyền nhiễm, Khoa Thú y, Học viện Nông nghiệp Việt Nam tận tình bảo, giúp đỡ hướng dẫn suốt trình nghiên cứu thực khóa luận Tôi xin gửi lời cảm ơn tới Ban lãnh đạo toàn thể anh chị, bạn Công ty cổ phần phát triển công nghệ nông thôn (RTD), đặc biệt anh chị phòng R&D Lab nơi công tác tận tình hướng dẫn bảo, chia sẻ giúp đỡ suốt thời gian thực tập Cuối xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới gia đình, bạn bè, bạn tập thể lớp CH22 CNSHC, người động viên, giúp đỡ vượt qua khó khăn trình học tập, nghiên cứu để hoàn thành tốt luận văn Hà Nội, ngày tháng năm 2015 Học viên Đỗ Hải Quỳnh Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page ii MỤC LỤC Lời cam đoan i Lời cảm ơn ii Mục lục iii Danh sách chữ viết tắt vi Danh mục bảng vii Danh mục hình viii Tóm tắt ix Abstract x Phần Mở đầu 1.1 Tính cấp thiết đề tài 1.2 Mục tiêu nghiên cứu 1.3 Phạm vi nghiên cứu 1.4 Ý nghĩa khoa học ý nghĩa thực tiễn .2 Phần Tổng quan tài liệu 2.1 Hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn 2.1.1 Lịch sử địa dư bệnh .4 2.1.2 Triệu chứng – bệnh tích 2.1.3 Con đường truyền lây 2.1.4 Tác hại 2.1.5 Phòng chống – điều trị .8 2.2 Virus gây hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn 2.2.1 Đặc điểm virus 2.2.2 Hình thái cấu trúc hạt virut 2.2.3 Tổ chức gene 12 2.3 Sự biến đổi đặc điểm di truyền virus gây hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn 13 2.4 Tình hình nghiên cứu nước giới 15 2.4.1 Tình hình nghiên cứu nước 15 2.4.2 Tình hình nghiên cứu giới 15 Phần Vật liệu phương pháp .17 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page iii 3.1 Địa điểm nghiên cứu 17 3.2 Thời gian nghiên cứu .17 3.3 Đối tượng – vật liệu nghiên cứu .17 3.3.1 Đối tượng nghiên cứu 17 3.3.2 Vật liệu 18 3.4 Nội dung nghiên cứu 20 3.5 Phương pháp nghiên cứu .20 3.5.1 Phương pháp nuôi cấy virus dòng tế bào Marc-145 20 3.5.2 Phương pháp chuẩn độ virus 20 3.5.3 Phương pháp tách chiết RNA virus PRRS .22 3.5.4 Phương pháp tổng hợp cDNA 22 3.5.5 Phương pháp PCR giải trình tự gen (sequencing) .22 3.5.6 Phương pháp xác định trình tự amino acid suy biến .22 3.5.7 Phương pháp trình tự .23 3.5.8 Phương pháp xây dựng phả hệ nhằm định genotype chủng Việt Nam 23 3.5.9 Phương pháp phân tích vị trí N-glycosyl hóa 23 3.5.10 Phương pháp đánh giá thay đổi đặc điểm di truyền chủng virus PRRS Việt Nam .23 3.5.11 Phương pháp đánh giá vị trí chịu áp lực chọn lọc 24 Phẩn Kết thảo luận 25 4.1 Kết 25 4.1.1 Kết phân lập chủng virus PRRS từ thực địa .25 4.1.2 Kết chuẩn độ chủng virus PRRS phân lập 27 4.1.3 Kết khuếch đại giải trình tự gene ORF5 chủng virus thu thập .28 4.1.4 Kết phân tích trình tự vùng gene ORF5 chủng virus PRRS lưu hành Việt Nam .29 4.1.5 Kết phân tích phả hệ (phylogenetic tree) .32 4.1.6 Kết nghiên cứu biến đổi đặc điểm di truyền chủng PRRSV lưu hành Việt Nam .33 4.1.7 Kết phân tích vị trí N-glycosyl hóa trình tự protein GP5 36 4.1.8 Nghiên cứu vị trí chịu áp lực chọn lọc đa dạng chủng PRRSV Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page iv Việt Nam .38 4.2 Thảo luận .40 4.2.1 Vấn đề phân lập virus PRRS dòng tế bào Marc-145 40 4.2.2 Mức độ đa dạng di truyển chủng PRRSV Việt Nam dựa trình tự gene ORF5 41 4.2.3 Phân tích mối quan hệ di truyền chủng PRRSV Việt Nam 41 4.2.4 Sự thay đổi đặc điểm di truyền chủng PRRSV Việt Nam 43 Phần Kết luận kiến nghị 47 5.1 Kết luận 47 5.2 Kiến nghị .47 Danh mục công trình công bố 48 Danh mục tài liệu tham khảo .49 Phụ lục 59 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page v DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT µl Microlit µm Micromet cDNA sợi DNA bổ sung CPE Bệnh tích tế bào FBS Fetal Bovine Serum GP Glycoprotein HP-PRRSV Virus gây hội chứng rối loạn sinh sản lợn chủng độc lực cao mRNA RNA thông tin NSP Protein phi cấu trúc OIE Tổ chức Thú y giới ORF Khung đọc mở PAM Tế bào đại thực bào phế nang lợn PBS Phosphate Buffered Saline PCV2 Virus gây hội chứng còi cọc sau cai sữa type PEARS Hội chứng hô hấp sảy thai lợn PRRS Hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn PRRSV Virus gây hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn RNA Ribonucleic acid RT-PCR Reverse transcriptase Polymerase chain reaction TCID50 Liều lây nhiễm 50% tế bào Type Dòng Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page vi DANH MỤC BẢNG Bảng 2.1 Tình hình nhiễm bệnh tai xanh nước giai đoạn 2007 – 2013 Bảng 3.1 Thông tin chủng virus PRRS sử dụng đề tài .17 Bảng 3.2 Trình tự cặp mồi dùng sử dụng đề tài .19 Bảng 4.1 Kết biểu bệnh tích tế bào sau đời cấy truyền chủng virus 27 Bảng 4.2 Mức độ tương đồng trình tự nucleotide chủng virus PRRS qua năm 30 Bảng 4.3 Mức độ tương đồng trình tự amino acid chủng virus PRRS qua năm 31 Bảng 4.4 Kết dự đoán vị trí N-glycosyl hóa trình tự protein GP5 chủng PRRSV lưu hành Việt Nam giai đoạn 2007 - 2014 36 Bảng 4.5 Kết dự đoán vị trí N-glycosyl hóa trình tự protein GP5 chủng PRRSV nhóm lưu hành Việt Nam giai đoạn 2007 - 2014 .37 Bảng 4.6 Kết dự đoán vị trí N-glycosyl hóa trình tự protein GP5 chủng PRRSV nhóm lưu hành Việt Nam giai đoạn 2010 - 2013 .37 Bảng 4.7 Vị trí dự đoán chịu áp lực chọn lọc đa dạng dựa trình tự gene ORF5 38 Bảng 4.8 Vị trí dự đoán chịu áp lực chọn lọc dựa trình tự gene ORF5 .39 Bảng 4.10 Vị trí dự đoán chịu áp lực chọn lọc dựa trình tự gene ORF5 nhóm 45 Bảng 4.11 Vị trí dự đoán chịu áp lực chọn lọc đa dạng dựa trình tự gene ORF5 nhóm 45 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page vii DANH MỤC HÌNH Hình 2.1 Triệu chứng hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn .6 Hình 2.2 Triệu chứng hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn .7 Hình 2.3 Cấu trúc hạt virion PRRSV 10 Hình 2.4 Tương tác protein cấu trúc virus với thụ thể tế bào kí chủ 11 Hình 2.5 Sơ đồ tổ chức genome trình dịch mã PRRSV .13 Hình 4.1 Hình ảnh bệnh tích tế bào số chủng phân lập .25 Hình 4.2 Kết điện di kiểm tra có mặt virus PRRS tế bào Marc-145 .26 Hình 4.3 Kết chuẩn độ chủng virus PRRS sau đời cấy truyền môi trường tế bào Marc-145 .28 Hình 4.4 Kết điện di kiểm tra sản phẩm khuếch đại vùng gene ORF5 29 Hình 4.5 Cây phả hệ thể mối quan hệ di truyền chủng PRRSV Việt Nam chủng tham chiếu giới 32 Hình 4.6 Mối quan hệ di truyền chủng HP-PRRSV lưu hành Việt Nam 33 Hình 4.7 Mối quan hệ di truyền chủng PRRSV Việt Nam .35 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page viii PHẦN 5.KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 5.1 KẾT LUẬN Với kết trình bày, xin đưa số kết luận sau: - Hầu hết chủng virus PRRS lưu hành Việt Nam giai đoạn từ năm 2007 đến năm 2014đều thuộc type Bắc Mỹ, có mối quan hệ gần gũi với chủng độc lực cao, lưu hành Trung Quốc nước Đông Nam Á thời gian gần - Kết phân tích mối quan hệ di truyền chủng có nhóm HP-PRRSV lưu hành Việt Nam, ghi nhận xuất trở lại chủng có mối quan hệ với nhóm độc lực cao JXA1 Trung Quốc - Các vị trí glycosyl hóa protein cấu trúc GP5 chủng virus PRRS lưu hành Việt Nam thay đổi đa dạng, đó, mức độ biến động vị trí glycosyl hóa nhóm có khác biệt - Trên trình tự protein cấu trúc GP5 chủng virus PRRS Việt Nam có vị trí chịu áp lực chọn lọc đa dạng, vị trí 33, 34, 35 104 ảnh hưởng tới hiệu lực vaccine Đồng thời 21 vị trí chịu áp lực chọn lọc ghi nhận, tập trung chủ yếu vùng xuyên màng vùng endo domain 5.2 KIẾN NGHỊ Đồng thời, sau trình thực đề tài, xin có kiến nghị sau: - Cần thu thập mẫu bệnh phẩm lợn nghi nhiễm PRRSVở không gian thời gian khác để đánh giá cách tổng thể đặc điểm dịch tễ học phân tử chủng PRRSV lưu hành Việt Nam - Tiếp tục sử dụng ứng dụng tin sinh học để giám sát đặc điểm dịch tễ học phân tử tiến hóa chủng PRRSV lưu hành Việt Nam - Mở rộng nghiên cứu thêm gene khác PRRSV nhằm có nhìn tổng đặc điểm sinh học virus Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 47 DANH MỤC CÁC CÔNG TRÌNH ĐÃ CÔNG BỐ Đỗ Hải Quỳnh, Nguyễn Bá Hiên, Lê Văn Phan, Vũ Thị Thu Hằng, Thân Đức Dương Đa dạng di truyền gene ORF5 số chủng virus PRRS phân lập từ năm 2011 đến năm 2013 miền Bắc Việt Nam Tạp chí Khoa học Kỹ thuật Thú y (Đã nhận đăng) Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 48 DANH MỤC TÀI LIỆU THAM KHẢO Tài liệu tiếng Việt Tiêu Quang An, Nguyễn Hữu Nam (2011) Một số đặc điểm bệnh lý đại thể vi thể lợn bị hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp (PRRS) Khoa học kỹ thuật Thú y, XVIII(6) Đỗ Hữu Dũng, Nguyễn Viết Không (2014) Đặc tính sinh học phân tử virus gây Hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn (PRRS) phân lập từ ổ dịch năm 2013 Tạp Chí Khoa Học Kỹ Thuật Thú Y, Đỗ Hữu Dũng, Nguyễn Văn Long, Phan Quang Minh, Hoàng Văn Năm, Nguyễn Viết Không (2013) Đặc điểm dịch tễ không gian thời gian hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn (PRRS) Việt Nam, giai đoạn 2007 - 2012 Tạp Chí Khoa Học Kỹ Thuật Thú Y, XX(5), 5-15 Trần Thị Thanh Hà, K Inui, Phạm Thị Nga, Đặng Xuân Sinh, Trịnh Quang Đại, Trương Anh Đức, Nguyễn Viết Không (2012) Phản ứng trung hoà virut PRRS nuôi cấy tế bào ứng dụng Khoa học kỹ thuật Thú y, 19(1) Nguyễn Ngọc Hải, Võ Khánh Hưng (2012) Tính đa dạng kiểu gen virut PRRS nhiễm số đàn heo nuôi Tạp Chí Khoa Học Kỹ Thuật Thú Y, Nguyễn Ngọc Hải, Trần Thị Bích Liên, Trần Thị Dân, Nguyễn Ngọc Tuân (2008) Chẩn đoán virus gây hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp heo (PRRS) kĩ thuật RT-PCR Tạp Chí Khoa Học Kỹ Thuật Thú Y, XV(4) Nguyễn Bá Hiên, Lê Văn Lãnh, Huỳnh Thị Mỹ Lệ, Đỗ Ngọc Thúy, Bạch Quốc Thắng, Lê Văn Phan, Nguyễn Viết Không, Đặng Hữu Anh (2013) Bệnh truyền nhiễm động vật nuôi biện pháp khống chế Hà Nội: Nhà xuất Nông nghiệp Nguyễn Bá Hiên, Nguyễn Thị Lan, Nguyễn Hữu Nam (2013) Nghiên cứu chọn chủng virut gây hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp (PRRS) để sản xuất vacxin phòng bệnh Việt Nam Khoa học kỹ thuật Thú y, XX(1) Võ Khánh Hưng, Nguyễn Văn Chi, Lê Nguyễn Ngọc Hạnh, Trần Thị Dân, Trần Thị Bích Liên, Nguyễn ĐÌnh Quát (2012) Xác định quy trình realtime RT-PCR với chất nhuộm evagreen định lượng định chủng virut gây hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp heo Tạp Chí Khoa Học Kỹ Thuật Thú Y, XIX(1) 10 Văn Đăng Kỳ (2012) Hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn (PRRS) kinh Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 49 nghiệm phòng chống Tạp Chí Khoa Học Kỹ Thuật Thú Y, XIX(2), 78-82 11 Tô Long Thành (2007) Hội chứng rối loạn sinh sản hô hấp lợn Tạp Chí Khoa Học Kỹ Thuật Thú Y, XIV(3), 81-87 12 Cao Văn Thật, Trần Thị Dân, Trần Thị Bích Liên, Thái Quốc Hiếu, Nguyễn Văn Hân, Hồ Huỳnh Mai, Nguyễn Thị Mến (2012) Mức độ nhiễm PRRS ảnh hưởng nhiễm ghép PRRSV - Leptospira lên suất sinh sản heo nái tỉnh Tiền Giang Tạp Chí Khoa Học Kỹ Thuật Thú Y, XIX(6) Tài liệu tiếng Anh 13 Allende R., G Kutish, W Laegreid, Z Lu, T Lewis, D Rock, J Friesen, J Galeota, A Doster, and F Osorio (2000) Mutations in the genome of porcine reproductive and respiratory syndrome virus responsible for the attenuation phenotype Archives of virology, 145(6), 1149-1161 14 Ansari I H., B Kwon, F A Osorio, and A K Pattnaik (2006) Influence of Nlinked glycosylation of porcine reproductive and respiratory syndrome virus GP5 on virus infectivity, antigenicity, and ability to induce neutralizing antibodies J Virol, 80(8), 3994-4004 doi: 10.1128/JVI.80.8.3994-4004.2006Baele G., P Lemey, T Bedford, A Rambaut, M A Suchard, and A V Alekseyenko (2012) Improving the accuracy of demographic and molecular clock model comparison while accommodating phylogenetic uncertainty Molecular biology and evolution, 29(9), 2157-2167 15 Bálint Á., G Balka, P Horváth, S Kecskeméti, Á Dán, A Farsang, L Szeredi, K Bányai, D Bartha, and F Olasz (2015) Full-length genome sequence analysis of a Hungarian porcine reproductive and respiratory syndrome virus isolated from a pig with severe respiratory disease Archives of virology, 160(2), 417-422 16 Chang C C., K J Yoon, J J Zimmerman, K M Harmon, P M Dixon, C M Dvorak, and M P Murtaugh (2002) Evolution of porcine reproductive and respiratory syndrome virus during sequential passages in pigs J Virol, 76(10), 47504763 17 Christianson W T., and H Joo (1994) Porcine reproductive and respiratory syndrome: a review Swine health and production: the official journal of the American Association of Swine Practitioners (USA) Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 50 18 Collins J E., D A Benfield, W T Christianson, L Harris, J C Hennings, D P Shaw, S M Goyal, S McCullough, R B Morrison, H S Joo, and et al (1992) Isolation of swine infertility and respiratory syndrome virus (isolate ATCC VR2332) in North America and experimental reproduction of the disease in gnotobiotic pigs J Vet Diagn Invest, 4(2), 117-126 19 Conzelmann K K., N Visser, P Van Woensel, and H J Thiel (1993) Molecular characterization of porcine reproductive and respiratory syndrome virus, a member of the arterivirus group Virology, 193(1), 329-339 doi: 10.1006/viro.1993.1129 20 Dea S., C A Gagnon, H Mardassi, B Pirzadeh, and D Rogan (2000) Current knowledge on the structural proteins of porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus: comparison of the North American and European isolates Arch Virol, 145(4), 659-688 21 Delisle B., C A Gagnon, M E Lambert, and S D'Allaire (2012) Porcine reproductive and respiratory syndrome virus diversity of Eastern Canada swine herds in a large sequence dataset reveals two hypervariable regions under positive selection Infect Genet Evol, 12(5), 1111-1119 doi: 10.1016/j.meegid.2012.03.015 22 Delputte P L., S Costers, and H J Nauwynck (2005) Analysis of porcine reproductive and respiratory syndrome virus attachment and internalization: distinctive roles for heparan sulphate and sialoadhesin J Gen Virol, 86(Pt 5), 14411445 doi: 10.1099/vir.0.80675-0 23 Delputte P L., P Meerts, S Costers, and H J Nauwynck (2004) Effect of virusspecific antibodies on attachment, internalization and infection of porcine reproductive and respiratory syndrome virus in primary macrophages Vet Immunol Immunopathol, 102(3), 179-188 doi: 10.1016/j.vetimm.2004.09.007 24 Do T D., C Park, K Choi, J Jeong, T T Nguyen, D Q Nguyen, T H Le, and C Chae (2015) Comparison of experimental infection with northern and southern Vietnamese strains of highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus J Comp Pathol, 152(2-3), 227-237 doi: 10.1016/j.jcpa.2014.12.002 25 Dokland T (2010) The structural biology of PRRSV Virus Res, 154(1-2), 86-97 doi: 10.1016/j.virusres.2010.07.029 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 51 26 Drummond A J., and A Rambaut (2007) BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees BMC Evol Biol, 7(1), 214 doi: 10.1186/1471-2148-7-214 27 Drummond A J., M A Suchard, D Xie, and A Rambaut (2012) Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7 Mol Biol Evol, 29(8), 1969-1973 doi: 10.1093/molbev/mss075 28 Faaberg K S., J D Hocker, M M Erdman, D L Harris, E A Nelson, M Torremorell, and P G Plagemann (2006) Neutralizing antibody responses of pigs infected with natural GP5 N-glycan mutants of porcine reproductive and respiratory syndrome virus Viral Immunol, 19(2), 294-304 doi: 10.1089/vim.2006.19.294 29 Fan B., X Liu, J Bai, T Zhang, Q Zhang, and P Jiang (2015) The amino acid residues at 102 and 104 in GP5 of porcine reproductive and respiratory syndrome virus regulate viral neutralization susceptibility to the porcine serum neutralizing antibody Virus research, 204, 21-30 30 Feng Y., T Zhao, T Nguyen, K Inui, Y Ma, T H Nguyen, V C Nguyen, D Liu, Q A Bui, L T To, C Wang, K Tian, and G F Gao (2008) Porcine respiratory and reproductive syndrome virus variants, Vietnam and China, 2007 Emerg Infect Dis, 14(11), 1774-1776 doi: 10.3201/eid1411.071676 31 Gonin P., B Pirzadeh, C A Gagnon, and S Dea (1999) Seroneutralization of porcine reproductive and respiratory syndrome virus correlates with antibody response to the GP5 major envelope glycoprotein J Vet Diagn Invest, 11(1), 20-26 32 Han M., and D Yoo (2014) Engineering the PRRS virus genome: updates and perspectives Vet Microbiol, 174(3-4), 279-295 33 Han W., J J Wu, X Y Deng, Z Cao, X L Yu, C B Wang, T Z Zhao, N H Chen, H H Hu, W Bin, L L Hou, L L Wang, K G Tian, and Z Q Zhang (2009) Molecular mutations associated with the in vitro passage of virulent porcine reproductive and respiratory syndrome virus Virus Genes, 38(2), 276-284 doi: 10.1007/s11262-008-0322-1 34 Hanada K., Y Suzuki, T Nakane, O Hirose, and T Gojobori (2005) The origin and evolution of porcine reproductive and respiratory syndrome viruses Molecular biology and evolution, 22(4), 1024-1031 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 52 35 Hanada K., Y Suzuki, T Nakane, O Hirose, and T Gojobori (2005) The origin and evolution of porcine reproductive and respiratory syndrome viruses Mol Biol Evol, 22(4), 1024-1031 doi: 10.1093/molbev/msi089 36 Holtkamp D J., J B Kliebenstein, J J Zimmerman, E Neumann, H Rotto, T K Yoder, C Wang, P Yeske, C L Mowrer, and C Haley (2012) Economic impact of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus on US pork producers Animal Industry Report, 658(1), 37 Johnson C R., T F Griggs, J Gnanandarajah, and M P Murtaugh (2011) Novel structural protein in porcine reproductive and respiratory syndrome virus encoded by an alternative ORF5 present in all arteriviruses Journal of general virology, 92(5), 1107-1116 38 Kim H K., J S Yang, H J Moon, S J Park, Y Luo, C S Lee, D S Song, B K Kang, S K Ann, C H Jun, and B K Park (2009) Genetic analysis of ORF5 of recent Korean porcine reproductive and respiratory syndrome viruses (PRRSVs) in viremic sera collected from MLV-vaccinating or non-vaccinating farms J Vet Sci, 10(2), 121-130 39 Kim H S., J Kwang, I J Yoon, H S Joo, and M L Frey (1993) Enhanced replication of porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) virus in a homogeneous subpopulation of MA-104 cell line Arch Virol, 133(3-4), 477-483 40 Kim W.-I., J.-J Kim, S.-H Cha, W.-H Wu, V Cooper, R Evans, E.-J Choi, and K.-J Yoon (2013) Significance of genetic variation of PRRSV ORF5 in virus neutralization and molecular determinants corresponding to cross neutralization among PRRS viruses Veterinary microbiology, 162(1), 10-22 41 Kvisgaard L K., C K Hjulsager, C S Kristensen, K T Lauritsen, and L E Larsen (2013) Genetic and antigenic characterization of complete genomes of Type Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome viruses (PRRSV) isolated in Denmark over a period of 10 years Virus research, 178(2), 197-205 42 Lager K M., and P G Halbur (1996) Gross and microscopic lesions in porcine fetuses infected with porcine reproductive and respiratory syndrome virus J Vet Diagn Invest, 8(3), 275-282 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 53 43 Lazić S., and T Petrović (2007) Exploring possibilities of diagnosing, control and eradication of porcine respiratory and reproductive syndrome (PRRS) Biotechnology in Animal Husbandry, 23(5-6-1), 391-401 44 Lee C., and D Yoo (2006) The small envelope protein of porcine reproductive and respiratory syndrome virus possesses ion channel protein-like properties Virology, 355(1), 30-43 doi: 10.1016/j.virol.2006.07.013 45 Lee J A., B Kwon, F A Osorio, A K Pattnaik, N H Lee, S W Lee, S Y Park, C S Song, I S Choi, and J B Lee (2014) Protective humoral immune response induced by an inactivated porcine reproductive and respiratory syndrome virus expressing the hypo-glycosylated glycoprotein Vaccine, 32(29), 3617-3622 doi: 10.1016/j.vaccine.2014.04.083 46 Li J., S Tao, R Orlando, and M P Murtaugh (2015) N-glycosylation profiling of porcine reproductive and respiratory syndrome virus envelope glycoprotein Virology, 478, 86-98 doi: 10.1016/j.virol.2015.02.013 47 Liu J.-K., C.-H Wei, X.-Y Yang, X.-L Hou, A.-L Dai, X.-H Li, M.-K Wei, and X.-Z Pan (2013) Genetic diversity and evolutionary characterization of Chinese porcine reproductive and respiratory syndrome viruses based on NSP2 and ORF5 Archives of virology, 158(8), 1811-1816 48 Lopez O J., and F A Osorio (2004) Role of neutralizing antibodies in PRRSV protective immunity Vet Immunol Immunopathol, 102(3), 155-163 doi: 10.1016/j.vetimm.2004.09.005 49 Martín-Valls G., L K Kvisgaard, M Tello, L Darwich, M Cortey, A BurgaraEstrella, J Hernández, L E Larsen, and E Mateu (2014) Analysis of ORF5 and full-length genome sequences of porcine reproductive and respiratory syndrome virus isolates of genotypes and retrieved worldwide provides evidence that recombination is a common phenomenon and may produce mosaic isolates Journal of virology, 88(6), 3170-3181 50 Mateu E., M Martín, and D Vidal (2003) Genetic diversity and phylogenetic analysis of glycoprotein of European-type porcine reproductive and respiratory virus strains in Spain Journal of general virology, 84(3), 529-534 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 54 51 Metwally S., F Mohamed, K Faaberg, T Burrage, M Prarat, K Moran, A Bracht, G Mayr, M Berninger, L Koster, T L To, V L Nguyen, M Reising, J Landgraf, L Cox, J Lubroth, and C Carrillo (2010) Pathogenicity and molecular characterization of emerging porcine reproductive and respiratory syndrome virus in Vietnam in 2007 Transbound Emerg Dis, 57(5), 315-329 doi: 10.1111/j.18651682.2010.01152.x 52 Meulenberg J J (2000) PRRSV, the virus Vet Res, 31(1), 11-21 doi: 10.1051/vetres:2000103 53 Minh B Q., M A Nguyen, and A von Haeseler (2013) Ultrafast approximation for phylogenetic bootstrap Mol Biol Evol, 30(5), 1188-1195 doi: 10.1093/molbev/mst024 54 Misra A (2012) Effect of Variation in N-linked Glycosylation on Antibody Mediated Neutralization in PRRSV (Master), University of Illinois, Urbana, Illinois 55 Mu C., X Lu, E Duan, J Chen, W Li, F Zhang, D P Martin, M Yang, P Xia, and B Cui (2013) Molecular evolution of porcine reproductive and respiratory syndrome virus isolates from central China Res Vet Sci, 95(3), 908-912 doi: 10.1016/j.rvsc.2013.07.029 56 Nguyen L T., H A Schmidt, A von Haeseler, and B Q Minh (2015) IQ-TREE: a fast and effective stochastic algorithm for estimating maximum-likelihood phylogenies Mol Biol Evol, 32(1), 268-274 doi: 10.1093/molbev/msu300 57 Nguyen T D T., N Thi Thu, N G Son, L T T Ha, V K Hung, N T Nguyen, and D V A Khoa (2013) Genetic analysis of ORF5 porcine reproductive and respiratory syndrome virus isolated in Vietnam Microbiology and immunology, 57(7), 518-526 58 Nguyen V G., H K Kim, H J Moon, S J Park, H C Chung, M K Choi, and B K Park (2014) A Bayesian phylogeographical analysis of type porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) Transbound Emerg Dis, 61(6), 537-545 doi: 10.1111/tbed.12058 59 Nguyen V G., H K Kim, H J Moon, S J Park, H C Chung, M K Choi, and B K Park (2015) Evolutionary Dynamics of a Highly Pathogenic Type Porcine Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 55 Reproductive and Respiratory Syndrome Virus: Analyses of Envelope ProteinCoding Genes Transbound Emerg Dis, 62(4), 411-420 doi: 10.1111/tbed.12154 60 Nilubol D., T Tripipat, T Hoonsuwan, P Tipsombatboon, and J Piriyapongsa (2013) Genetic diversity of the ORF5 gene of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) genotypes I and II in Thailand Arch Virol, 158(5), 943953 doi: 10.1007/s00705-012-1573-7 61 Plagemann P G (2004) GP5 ectodomain epitope of porcine reproductive and respiratory syndrome virus, strain Lelystad virus Virus Res, 102(2), 225-230 doi: 10.1016/j.virusres.2004.01.031 62 Shi M., T T Lam, C C Hon, R K Hui, K S Faaberg, T Wennblom, M P Murtaugh, T Stadejek, and F C Leung (2010) Molecular epidemiology of PRRSV: a phylogenetic perspective Virus Res, 154(1-2), 7-17 doi: 10.1016/j.virusres.2010.08.014 63 Shi M., T T Lam, C C Hon, M P Murtaugh, P R Davies, R K Hui, J Li, L T Wong, C W Yip, J W Jiang, and F C Leung (2010) Phylogeny-based evolutionary, demographical, and geographical dissection of North American type porcine reproductive and respiratory syndrome viruses J Virol, 84(17), 8700-8711 doi: 10.1128/JVI.02551-09 64 Snijder E J., and J J Meulenberg (1998) The molecular biology of arteriviruses J Gen Virol, 79 ( Pt 5)(5), 961-979 doi: 10.1099/0022-1317-79-5-961 65 Song J., D Shen, J Cui, and B Zhao (2010) Accelerated evolution of PRRSV during recent outbreaks in China Virus genes, 41(2), 241-245 doi: 10.1007/s11262010-0507-2 66 Storgaard T., M Oleksiewicz, and A Botner (1999) Examination of the selective pressures on a live PRRS vaccine virus Arch Virol, 144(12), 2389-2401 67 Sun L., Y Li, R Liu, X Wang, F Gao, T Lin, T Huang, H Yao, G Tong, and H Fan (2013) Porcine reproductive and respiratory syndrome virus ORF5a protein is essential for virus viability Virus research, 171(1), 178-185 68 Trible B R., L N Popescu, N Monday, J G Calvert, and R R Rowland (2015) A single amino acid deletion in the matrix protein of porcine reproductive and respiratory syndrome virus confers resistance to a polyclonal swine antibody with Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 56 broadly neutralizing activity J Virol, 89(12), 6515-6520 doi: 10.1128/JVI.0328714 69 Tung N., N H Dang, D T Vui, N D Tho, and K Inui (2011) Molecular epidemiology of highly pathogenic PRRS in Vietnam in 2010 Paper presented at the proceeding on 5th Asian Pig Veterinary Society Congress O 70 Vu H L., B Kwon, K.-J Yoon, W W Laegreid, A K Pattnaik, and F A Osorio (2011) Immune evasion of porcine reproductive and respiratory syndrome virus through glycan shielding involves both glycoprotein as well as glycoprotein Journal of virology 71 Wensvoort G (1993) Lelystad virus and the porcine epidemic abortion and respiratory syndrome Vet Res, 24(2), 117-124 72 Wensvoort G., C Terpstra, J M Pol, E A ter Laak, M Bloemraad, E P de Kluyver, C Kragten, L van Buiten, A den Besten, F Wagenaar, and et al (1991) Mystery swine disease in The Netherlands: the isolation of Lelystad virus Vet Q, 13(3), 121-130 doi: 10.1080/01652176.1991.9694296 73 Wissink E H., M V Kroese, H A van Wijk, F A Rijsewijk, J J Meulenberg, and P J Rottier (2005) Envelope protein requirements for the assembly of infectious virions of porcine reproductive and respiratory syndrome virus J Virol, 79(19), 12495-12506 doi: 10.1128/JVI.79.19.12495-12506.2005 74 Wu J., N Chen, W Han, Z Cao, X Deng, L Wang, X Yu, Z Zhou, X Li, and J Shi (2012) Complete genome sequence of an overattenuated highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus Journal of virology, 86(11), 6381-6382 75 Wu J., J Li, F Tian, S Ren, M Yu, J Chen, Z Lan, X Zhang, D Yoo, and J Wang (2009) Genetic variation and pathogenicity of highly virulent porcine reproductive and respiratory syndrome virus emerging in China Arch Virol, 154(10), 1589-1597 doi: 10.1007/s00705-009-0478-6 76 Wu J., J Wang, Y Liu, W Wang, X Zhang, and D Yoo (2008) Relationship between herd size and the prevalence of PRRS in pig herds in China Veterinary Record, 163(3), 90-91 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 57 77 Xu Z., X Chang, S Xiao, H Chen, and R Zhou (2010) Evidence for the adaptive evolution of ORF gene of Porcine reproductive and respiratory syndrome virus isolated in China Acta virologica, 54(4), 281-285 78 Yang L., M L Frey, K J Yoon, J J Zimmerman, and K B Platt (2000) Categorization of North American porcine reproductive and respiratory syndrome viruses: epitopic profiles of the N, M, GP5 and GP3 proteins and susceptibility to neutralization Arch Virol, 145(8), 1599-1619 79 Yoon S H., H Kim, J Kim, H.-K Lee, B Park, and H Kim (2013) Complete genome sequences of porcine reproductive and respiratory syndrome viruses: perspectives on their temporal and spatial dynamics Molecular biology reports, 40(12), 6843-6853 80 Yoon S H., H Kim, B Park, and H Kim (2012) Tracing the genetic history of porcine reproductive and respiratory syndrome viruses derived from the complete ORF 5-7 sequences: a Bayesian coalescent approach Arch Virol, 157(11), 21432151 doi: 10.1007/s00705-012-1408-6 81 Yun S I., and Y M Lee (2013) Overview: Replication of porcine reproductive and respiratory syndrome virus J Microbiol, 51(6), 711-723 doi: 10.1007/s12275013-3431-z 82 Zhang H., and H Kono (2012) Economic impacts of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome (PRRS) outbreak in Vietnam pig production Tropical Agricultural Research, 23(2), 152-159 83 Zhao P., C Ma, X Dong, and Z Cui (2012) Evolution of quasispecies diversity for porcine reproductive and respiratory syndrome virus under antibody selective pressure Sci China Life Sci, 55(9), 788-792 doi: 10.1007/s11427-012-4364-1 84 Zimmerman J (2003) Historical Overview of PRRS virus PRRS Compendium Producer Edition National Pork Board Des Moines, Iowa, USA, section, Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 58 PHỤ LỤC Phụ lục Danh sách trình tự chủng PRRSV thu thập ngân hàng gen Stt Tên chủng Địa phương Năm Mã số truy cập MN1 không xác định 2013 KM244763.1 CT.C1 Cần Thơ 2012 JQ860382.1 CT.C2 Cần Thơ 2012 JQ860383.1 CT.HS1 Cần Thơ 2012 JQ860384.1 CT.HS2 Cần Thơ 2012 JQ860385.1 CT.HS3 Cần Thơ 2012 JQ860386.1 DT7 Đồng Tháp 2012 JQ860387.1 DT8 Đồng Tháp 2012 JQ860388.1 DT9 Đồng Tháp 2012 JQ860389.1 Hậu Giang 2012 JQ860390.1 10 HG.RV1 Hậu Giang 2012 JQ860391.1 11 HG.RV2 không xác định 2012 AB856285.1 12 HUA.Vet.lab.PRRS3 không xác định 2012 AB856286.1 13 HUA.Vet.lab.PRRS4 không xác định 2011 AB856283.1 14 HUA.Vet.lab.PRRS1 không xác định 2011 AB856284.1 15 HUA.Vet.lab.PRRS2 Quảng Ninh 2010 KF523297.1 16 10.QuNi Bạc Liêu 2010 KF523295.1 17 10Bali Hưng Yên 2010 KF523293.1 18 10HuY Nghệ An 2010 KF523296.1 19 10NgAn Tiền Giang 2010 KF523294.1 20 10TiGi không xác định 2010 AB588638.1 21 171.NA không xác định 2010 AB588637.1 22 347.KS không xác định 2010 AB588636.1 23 347.T.KS TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700874.1 24 4793.TG TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700875.1 25 5076.HCM TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700876.1 26 5077.HCM TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700877.1 27 5111.HCM TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700878.1 28 5112.HCM TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700879.1 29 5172.HCM TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700880.1 30 5215.HCM TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700881.1 31 5251.HCM TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700882.1 32 5280.DAKN TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700883.1 33 5321.HCM TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700884.1 34 5339.HCM TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700885.1 35 5386.BT Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 59 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 5402.BD TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700886.1 5445.HCM TP Hồ Chí Minh 2010 HQ700887.1 BD.R1 Bình Dương 2010 JQ860381.1 DN1 Đồng Nai 2010 JQ860375.1 DN11 Đồng Nai 2010 JQ860378.1 DN4 Đồng Nai 2010 JQ860376.1 DN5.2 Đồng Nai 2010 JQ860377.1 HCM.3416 Bình Dương 2010 HQ540650.1 HCM.CC3 TP Hồ Chí Minh 2010 JQ860379.1 HCM.D06 TP Hồ Chí Minh 2010 JQ860380.1 HCMC.2394 TP Hồ Chí Minh 2010 HQ540653.1 HCMC.3336 An Giang 2010 HQ540646.1 HCMC.3341 TP Hồ Chí Minh 2010 HQ540647.1 HCMC.3374 TP Hồ Chí Minh 2010 HQ540648.1 HCMC.3411 Bình Dương 2010 HQ540649.1 HCMC.3440 Bình Dương 2010 HQ540651.1 HCMC.3703 Bình Dương 2010 HQ540652.1 MB6 không xác định 2010 KM244761.1 NA/VIE/V001/2010 không xác định 2010 KF698650.1 NA/VIE/V056/2010 không xác định 2010 KF698651.1 DN1107 Đồng Nai 2009 JQ860373.1 DN1155 Đồng Nai 2009 JQ860374.1 DN292 Đồng Nai 2009 JQ860372.1 DN42 Đồng Nai 2009 JQ860367.1 DN44 Đồng Nai 2009 JQ860368.1 DN59 Đồng Nai 2009 JQ860369.1 DN88 Đồng Nai 2009 JQ860370.1 3BRVTVN không xác định 2009 GU187017.1 T3SGVN không xác định 2009 GU187013.1 82DNVN không xác định 2009 GU187015.1 DN153 Đồng Nai 2008 JQ860371.1 DN444 Đồng Nai 2008 JQ860362.1 DN452 Đồng Nai 2008 JQ860363.1 DN460 Đồng Nai 2008 JQ860364.1 DN499 Đồng Nai 2008 JQ860365.1 DN649 Đồng Nai 2008 JQ860366.1 07QN Quảng Nam 2007 FJ394029.1 SRV07 không xác định 2007 JX512910.1 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 60 Anova: Single Factor Phụ lục Xử lý thống kê kết chuẩn độ virus SUMMARY Groups CLHD1 CLHD2 2P 4P 5P A8 C1-1 C1-2 C3 C4-1 HUA/ HP1 HUA/ HP2 HUA/ HP3 HUA/ HP4 P1 P2 A1 A2196 A3 A5 HUA/HP2228 HUA/HP1963 ANOVA Source of Variation Count 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 SS Sum 21.26 21.27 16.89 14.14 13.39 21.38 17.14 13.38 13.14 17.14 21.51 20.76 17.27 20.89 17.14 12.64 21.5 12.64 20.8 17.14 21.38 22.26 df Between Groups Within Groups 63.48871 1.05505 21 66 Total 64.54376 87 Average 5.315 5.3175 4.2225 3.535 3.3475 5.345 4.285 3.345 3.285 4.285 5.3775 5.19 4.3175 5.2225 4.285 3.16 5.375 3.16 5.2 4.285 5.345 5.565 Variance 0.005633 0.015625 0.014225 0.014433 0.004225 0.014433 0.034433 0.034433 0.014433 0.034433 0.010425 0.0048 0.015625 0.034225 0.014433 0.0036 0.020833 0.0036 0.003333 0.014433 0.014433 0.025633 MS F 3.023272 0.015986 189.1246 Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp P-value 8.85E51 F crit 1.718143 Page 61 [...]... nghiên cứu: Đặc điểm và sự biến đổi di truyền của các chủng virus gây hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn tại Việt Nam 1.2 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU - Phân lập được các chủng virus PRRS từ các mẫu bệnh phẩm của lợn nghi mắc bệnh PRRS thu thập được ở Việt Nam trong giai đoạn từ 2011- 2014 - Giải mã,phân tích gen ORF5, và xác định được nguồn gốc tiến hóa, sự biến đổi di truyền của các chủng virus PRRS... nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 3 PHẦN 2.TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 HỘI CHỨNG RỐI LOẠN SINH SẢN VÀ HÔ HẤP Ở LỢN 2.1.1.Lịch sử và địa dư bệnh 2.1.1.1.Lịch sử hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn trên thế giới Vào những năm cuối thập kỉ 80 của thế kỉ 20, ở Mỹ xuất hiệndịch bệnh gây hội chứng suy giảm khả năng sinh sản và gây bệnh đường hô hấp ở các đàn lợn mà không xác... của vật nuôi, điều trị triệu chứng và hạn chế các bệnh kế phát Các biện pháp thông thường bao gồm: - Loại bỏ các con lợn bị bệnh năng Không nhập lợn khỏe vào khu vực lợn bệnh, giãn mật độ nuôi tối đa Điều trị kháng sinh phổ rộng để hạn chế nhiễm trùng kế phát Hạ sốt đối với lợn bị sốt cao 2.2 .VIRUS GÂY HỘI CHỨNG RỐI LOẠN SINH SẢN VÀ HÔ HẤP Ở LỢN 2.2.1 Đặc điểm của virus Tác nhân gây hội chứng rối loạn. .. truyền và đặc điểm tiến hóa của các chủng virus PRRS đã và đang lưu hành tại Việt Nam trong những năm vừa qua Đồng thời, vị trí chịu áp lực chọn lọc và sự thay đổi các vị trí glycosyl hóa của các chủng lưu hành tại Việt Nam sẽ đóng góp thông tin quan Học viện Nông nghiệp Việt Nam – Luận văn Thạc sỹ Khoa học Nông nghiệp Page 2 trọng trong nghiên cứu sự biến đổi theo thời gian của virus PRRS nói riêng và các. .. thành nên hạt virion hoàn chỉnh 2.3 SỰ BIẾN ĐỔI CÁC ĐẶC ĐIỂM DI TRUYỀN CỦA VIRUS GÂY HỘI CHỨNG RỐI LOẠN SINH SẢN VÀ HÔ HẤP Ở LỢN Tuy mới chỉ xuất hiện và gây hại kể từ những năm cuối thập kỉ 80 của thế kỉ XX, các nghiên cứu về di truyền và tiến hóa bằng các công cụ tin sinh học đã cho thấy PRRSV đã xuất hiện từ trước đó khá lâu Phần lớn các nghiên cứu về sự tiến hóa của PRRSV đều tập trung trên trình... tượng teo ống sinh tinh Ngoài ra còn có hiện tượng gan, lách sưng, tụ huyết, thận xuất huyết… Hình 2.2 Triệu chứng hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn A: Thận xuất huyết, B: Phổi xuất huyết, Mũi tên chỉ vị trí xuất huyết Nguồn (Feng và cộng sự, 2008) b, Bệnh tích vi thể Kết quảquan sát bệnh tích vi thể ở lợn bị nhiễm hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp của Tiêu Quang An và Nguyễn Hữu Nam (2011)cho...TÓM TẮT Hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn (Porcine reproductive and respiratory syndrome) là một trong những bệnh truyền nhiễm nguy hiểm gây thiệt hại kinh tế nghiêm trọng cho ngành chăn nuôi lợn ở Việt Nam Việc đánh giá đặc điểm và sự biến đổi về di truyền của các chủng virusPRRS đóng vai trò quan trọng trong việc xây dựng chiến lược phòng chống bệnh Trong nghiên cứu này, 22 chủng virus PRRSđã... lợn thì hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp lợn (PRRS), còn được gọi là bệnh “tai xanh”,đã và đang gây thiệt hại kinh tế nghiêm trọng đối với ngành chăn nuôi lợncông nghiệp Bệnh PRRS đã được xếp vào bảng B danh mục các bệnh thú y nguy hiểm của Tổ chức Thú y thế giới Theo số liệu chính thức của Cục Thú y – Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn,trong giai đoạn từ 2007 – 2013số lợn mắc hội chứng rối. .. Lào, v.v (Thông cáo của OIE, 2015) 2.1.1.2 Lịch sử hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn tại Việt Nam Bằng chứng huyết thanh học cho thấy sự phơi nhiễm đối với virus PRRS ở Việt Nam đã xuất hiện muộn nhất kể từ năm 1997, khi kết quả kiểm tra huyết thanh học cho thấy 10/51 lợn giống nhập khẩu từ Mỹ đã cho kết quả dương tính với PRRS.Theo báo cáo của cục thú y (2007), đã có một tỉ lệ lợn giống nhất... loạn động dục, mất sữa, v.v Đối với lợn con theo mẹ, tỷ lệ chết cao, từ 10 – 40%, đa số lợn con chết trong tuần đầu sau khi sinh, số còn lại mắc các triệu chứng như khó thở, tiêu chảy, gầy còm, sưng mí mắt và kết mạc Hình 2.1 Triệu chứng hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp ở lợn A :Lợn bị sảy thai, đẻ non, B :Biến màu ở tai, C :Lợn sơ sinh chết hoặc yếu, D, E, F, G: lợn sau cai sữa chết, loại (Nguồn: