TRƢỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ KHOA NÔNG NGHIỆP & SINH HỌC ỨNG DỤNG BỘ MÔN THÚ Y NGUYỄN HUỲNH ĐẢM KHẢO SÁT SỰ HIỆN DIỆN CỦA VI KHUẨN ESCHERICHIA COLI SINH BETA-LACTAMASES PHỔ RỘNG TRÊN GÀ KHỎE TẠI HUYỆN LONG HỒ TỈNH VĨNH LONG LUẬN VĂN TỐT NGHIỆP NGÀNH THÚ Y Cần Thơ, 2014 TRƢỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ KHOA NÔNG NGHIỆP & SINH HỌC ỨNG DỤNG BỘ MÔN THÚ Y LUẬN VĂN TỐT NGHIỆP NGÀNH THÚ Y KHẢO SÁT SỰ HIỆN DIỆN CỦA VI KHUẨN ESCHERICHIA COLI SINH BETA-LACTAMASES PHỔ RỘNG TRÊN GÀ KHỎE TẠI HUYỆN LONG HỒ TỈNH VĨNH LONG Giảng viên hƣớng dẫn Sinh viên thực ThS. BÙI THỊ LÊ MINH NGUYỄN HUỲNH ĐẢM MSSV: 3103014 Lớp: CN10Y4A1 – Khóa 36 Cần Thơ, 2014 i TRƢỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ KHOA NÔNG NGHIỆP & SINH HỌC ỨNG DỤNG BỘ MÔN THÚ Y Đề tài “Khảo sát diện vi khuẩn Escherichia coli sinh beta – lactamases phổ rộng gà khỏe huyện Long Hồ tỉnh Vĩnh Long” sinh viên Nguyễn Huỳnh Đảm thực Bộ môn Thú Y, Khoa Nông Nghiệp & Sinh Học Ứng Dụng, Trƣờng Đại Học Cần Thơ từ tháng năm 2014 đến tháng 12 năm 2014. Cần Thơ, ngày….tháng… năm 2014 Cần Thơ, ngày….tháng… năm 2014 Duyệt Bộ Môn Giảng viên hƣớng dẫn ThS. Bùi Thị Lê Minh Cần Thơ, ngày….tháng… năm 2014 Duyệt Khoa Nông Nghiệp Sinh Học Ứng Dụng ii LỜI CẢM ƠN Trải qua năm tháng học tập trƣờng ngày tháng làm luận văn tốt nghiệp, xin: Thành kính biết ơn! Sự dạy dỗ, động viên lo lắng cha mẹ ngƣời thân gia đình nguồn động lực thúc đẩy nổ lực phấn đấu. Trong tận đáy lòng xin chân thành cám ơn ngƣời thân yêu kính dâng lên cha mẹ lòng biết ơn sâu sắc, ngƣời dành đời cho cất bƣớc đến trƣờng. Xin chân thành biết ơn! Cô Bùi Thị Lê Minh dành thời gian quý báo, hết lòng bảo, giúp đỡ động viên hoàn thành luận văn tốt nghiệp. Cô Châu Thị Huyền Trang, cố vấn học tập nhắc nhở động viên suốt thời gian học tập trƣờng. Quý Thầy, Cô Bộ môn Thú y Bộ môn Chăn nuôi tận tình truyền đạt kiến thức kinh nghiệm vô quý báu với suốt thời gian qua. Chân thành cám ơn! Xin cám ơn anh chị Cao học Thú Y khóa 19, bạn Dƣợc Thú Y khóa 36 em sinh viên Dƣợc Thú Y khóa 37 học việc phòng thí nghiệm động viên giúp đỡ trình thực đề tài. iii TÓM LƢỢC Đề tài thực từ tháng năm 2014 đến tháng 12 năm 2014 nhằm mục tiêu xác định tỷ lệ diện E. coli sinh beta - lactamases gà khỏe xuất thịt từ số trại gà công nghiệp huyện Long Hồ tỉnh Vĩnh Long phương pháp đĩa kết hợp. Qua khảo sát 440 mẫu gồm 110 mẫu phân, 110 mẫu gan, 110 mẫu phổi 110 mẫu thịt 110 gà khỏe gồm 55 gà thịt 55 gà đẻ từ 20 trại gà công nghiệp, kết cho thấy tỷ lệ diện E. coli ESBL gà 62,7% gà thịt có tỷ lệ diện E. coli ESBL (85,5%) cao gà đẻ (40%). Sự diện E. coli ESBL mẫu thịt, gan, phổi phân 13,6%; 7,3%; 19,1% 62,7%. iv MỤC LỤC TRANG TỰA i TRANG DUYỆT ii LỜI CẢM ƠN iii TÓM LƢỢC iv MỤC LỤC v DANH MỤC VIẾT TẮT vii DANH MỤC BẢNG . viii DANH MỤC HÌNH ix CHƢƠNG ĐẶT VẤN ĐỀ . CHƢƠNG CƠ SỞ LÝ LUẬN . 2.1 Giới thiệu vi khuẩn E. coli 2.1.1 Đặc điểm hình thái E. coli 2.1.2 Đặc điểm nuôi cấy E. coli . 2.1.3 Đặc tính sinh hóa 2.1.4 Cấu trúc kháng nguyên . 2.1.5 Sức đề kháng . 2.1.6 Độc tố vi khuẩn . 2.1.7 Tính gây bệnh . 2.2 Giới thiệu vi khuẩn sinh ESBL 2.3 Giới thiệu số phƣơng pháp phát vi khuẩn sinh ESBL . 2.3.1 Phƣơng pháp ChromID ESBL agar 2.3.2 Phƣơng pháp đĩa đôi . 2.3.3 Băng giấy E-test ESBL . 2.3.4 Phƣơng pháp đĩa kết hợp 10 v CHƢƠNG PHƢƠNG TIỆN VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 11 3.1 Phƣơng tiện nghiên cứu 11 3.1.1 Thời gian, địa điểm, đối tƣợng nghiên cứu 11 3.1.2 Hóa chất 11 3.1.3 Thiết bị dụng cụ . 11 3.2 Phƣơng pháp nghiên cứu . 11 3.2.1 Phƣơng pháp lấy mẫu . 11 3.2.2 Phƣơng pháp phân lập E. coli ESBL . 12 3.2.3 Phƣơng pháp xử lý số liệu 14 CHƢƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 15 4.1 Kết khảo sát diện E. coli ESBL gà thịt khỏe . 15 4.2 Kết khảo sát diện E. coli ESBL gà đẻ khỏe . 16 4.3 Kết khảo sát diện E. coli ESBL gà công nghiệp 18 CHƢƠNG KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ . 21 5.1. Kết luận 21 5.2. Đề nghị . 21 TÀI LIỆU THAM KHẢO 22 PHỤ CHƢƠNG 24 1. Một số hình ảnh thu thập đƣợc thời gian nghiên cứu . 24 2. Kết xử lí thống kê 26 vi DANH MỤC VIẾT TẮT Chữ viết tắt Chữ viết đầy đủ APEC Avian Pathogenic E. coli CFU Colony Forming Unit CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute E. coli Escherichia coli EMB Eosin Methyl Blue ESBL Extended-spectrum beta-lactamases EPEC Enteropathogenic E. coli ETEC Enterotoxigenic E. coli EIEC Enteroinvasive E. coli EAEC Enteroaggregative E. coli EHEC Enterohaemorrhagic E. coli MC MacConkey Agar MHA Mueller Hinton Agar MR Methyl Red NA Nutrient Agar VP Voges Proskauer vii DANH MỤC BẢNG Bảng Tựa bảng 2.1 Đặc tính sinh hóa vi khuẩn E. coli 3.1 Dung lƣợng mẫu khảo sát 12 4.1 Tỷ lệ E. coli ESBL dƣơng tính gà thịt 15 4.2 Tỷ lệ E. coli ESBL dƣơng tính gà đẻ 16 4.3 Tỷ lệ diện E. coli ESBL gà thịt gà đẻ 18 viii Trang DANH MỤC HÌNH Hình Tựa hình 2.1 Khuẩn lạc E. coli môi trƣờng MC 3.1 Quy trình nuôi cấy phân lập vi khuẩn E. coli ESBL 13 4.1 So sánh diện E. coli ESBL gà thịt 15 4.2 So sánh diện E. coli ESBL gà đẻ 17 4.3 So sánh diện E. coli ESBL gà thịt gà đẻ 18 ix Trang 4.3 Kết khảo sát diện E. coli ESBL gà công nghiệp huyện Long Hồ tỉnh Vĩnh Long Qua khảo sát diện E. coli ESBL từ 110 gà khỏe (55 gà thịt 55 gà đẻ) trại gà công nghiệp thuộc huyện Long Hồ tỉnh Vĩnh Long phƣơng pháp đĩa kết hợp, kết đƣợc trình bày bảng 4.3 hình 4.3: Bảng 4.3: Tỷ lệ diện E. coli ESBL gà thịt gà đẻ Loại mẫu Gà thịt Gà đẻ (n=55) (n=55) Tỷ lệ chung P- Value Số mẫu dƣơng tính Tỷ lệ dƣơng tính ( %) Số mẫu dƣơng tính Tỷ lệ dƣơng tính ( %) Thịt 15 27,3 13,6 Gan 12,7a 1,8b 7,3 0,04 Phổi 19 34,5a 3,6b 19,1 0,00 Phân 47 85,5a 22 40b 62,7 0,00 Những chữ số a, b, c hàng giống khác ý nghĩa thống kê (P>0,05). Những chữ khác khác có ý nghĩa thống kê (P[...]... trong vi c điều trị bệnh nhiễm khuẩn bằng kháng sinh do vi khuẩn tiết ra men beta - lactamases phổ rộng làm bất hoạt kháng sinh nhóm beta – lactam và một số nhóm kháng sinh khác Vì vậy, vi c nghiên cứu về vi khuẩn E coli sinh men beta – lactamases là rất cần thiết nên đề tài Khảo sát sự hiện diện của vi khuẩn Echerichia coli sinh beta – lactamases phổ rộng trên gà khỏe tại huyện Long Hồ tỉnh Vĩnh Long ... (55 gà thịt và 55 gà đẻ) ở một số trại gà công nghiệp tại huyện Long Hồ tỉnh Vĩnh Long, đề tài ghi nhận những kết quả sau: - Sự hiện diện của vi khuẩn E coli ESBL trên gà là 62,7% - Sự hiện diện của vi khuẩn E coli ESBL trong gan, thịt, phổi, phân của gà thịt cao hơn của gà đẻ - Sự hiện diện của vi khuẩn E coli ESBL trên mẫu phân gà là cao nhất 5.2 Đề nghị - Cần nghiên cứu trên diện rộng hơn ở các địa... So sánh sự hiện diện của E coli ESBL trên gà đẻ khỏe Kết quả ở bảng 4.2 cho thấy tỷ lệ gà đẻ khỏe dƣơng tính với E coli ESBL ở một số trại gà công nghiệp thuộc huyện Long Hồ, tỉnh Vĩnh Long trên mẫu phân là cao nhất 40%, tiếp đến là mẫu phổi 3,6%, mẫu gan 1,8% và không phát hiện sự hiện diện của vi khuẩn E coli ESBL trên mẫu thịt Qua phân tích thống kê cho thấy tỷ lệ hiện diện E coli ESBL trên mẫu... thịt gà ở Hà Lan cho thấy có 209 mẫu E coli ESBL dƣơng tính, chiếm tỷ lệ là 79,8% Kết quả phân lập E coli ESBL trên gan gà khỏe tại huyện Long Hồ, tỉnh Vĩnh Long có tỷ lệ là 7,3% thấp hơn kết quả nghiên cứu của Li Yuan et al (2009) khảo sát sự hiện diện của vi khuẩn E coli ESBL trên gan gà bệnh tại 14 trại gà ở tỉnh Hà Nam, Trung Quốc với tỷ lệ dƣơng tính là 60,8% Kết quả phân lập trên phổi gà khỏe. .. ESBL trên gà công nghiệp ở huyện Long Hồ tỉnh Vĩnh Long Qua khảo sát sự hiện diện của E coli ESBL từ 110 con gà khỏe (55 gà thịt và 55 gà đẻ) ở trại gà công nghiệp thuộc huyện Long Hồ tỉnh Vĩnh Long bằng phƣơng pháp đĩa kết hợp, kết quả đƣợc trình bày ở bảng 4.3 và hình 4.3: Bảng 4.3: Tỷ lệ sự hiện diện của E coli ESBL trên gà thịt và gà đẻ Gà thịt (n=55) Loại mẫu Gà đẻ (n=55) Tỷ lệ chung P- Value Số mẫu... chọn lọc do vi c dùng kháng sinh (Paterson, 2005) Một số nghiên cứu E coli ESBL trên gà ở nƣớc ngoài cho thấy: Theo Li Yuan et al (2009), khảo sát sự hiện diện của vi khuẩn E coli ESBL trên 51 mẫu gan gà thịt bệnh tại 14 trại gà ở tỉnh Hà Nam, Trung Quốc với tỷ lệ dƣơng tính là 60,8% Kết quả nghiên cứu của Sunday Akidarju Mamza et al (2010), khảo sát sự hiện diện của vi khuẩn E coli ESBL tại Nigeria... phân lập vi khuẩn E coli ESBL 13 3.2.3 Phƣơng pháp xử lý số liệu So sánh sự khác nhau giữa các tỷ lệ E coli sinh men beta – lactamases phổ rộng bằng phép thử Chi bình phƣơng sử dụng phần mềm Minitab version 16 và Chi square yates 14 CHƢƠNG 4 KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 4.1 Kết quả khảo sát sự hiện diện của E coli ESBL trên gà thịt khỏe Qua khảo sát sự hiện diện của E coli ESBL từ 55 gà thịt khỏe ở trại gà công... tỷ lệ E coli ESBL dƣơng tính là 19,1% gần giống với kết quả nghiên cứu của Sunday Akidarju Mamza (2010) khảo sát sự hiện diện của vi khuẩn E coli ESBL tại Nigeria ở 400 con gà trên phổi là 16,9% Kết quả phân lập E coli ESBl trên phân gà khỏe tại huyện Long Hồ, tỉnh Vĩnh Long cho thấy tỷ lệ dƣơng tính là 62,7% cao hơn kết quả nghiên cứu của Annemieke Smet (2008) phân tích 498 mẫu phân từ 5 trại gà thịt... phân lập E coli ESBL trên gà đẻ khỏe có tỷ lệ dƣơng tính trên mẫu gan là 1,8%, mẫu phổi là 3,6%, mẫu phân là 40% và mẫu thịt không phát hiện sự hiện diện của vi khuẩn E coli ESBL Kết quả trên cho thấy gà thịt có tỷ lệ E coli ESBL dƣơng tính trên mẫu thịt, gan, phổi và phân cao hơn 19 so với các mẫu thịt, gan, phổi và phân của gà đẻ Qua phân tích thống kê cho thấy tỷ lệ hiện diện E coli ESBL trên các... 4.1: So sánh sự hiện diện của E coli ESBL trên gà thịt khỏe 15 Kết quả ở bảng 4.1 cho thấy tỷ lệ vi khuẩn E coli ESBL dƣơng tính trên gà thịt khỏe ở một số trại gà thịt thuộc huyện Long Hồ tỉnh Vĩnh Long là tƣơng đối cao, cụ thể ở mẫu phân có tỷ lệ dƣơng tính là 85,5%, mẫu phổi là 34,5%, mẫu thịt là 27,3% và mẫu gan là 12,7% Qua phân tích thống kê cho thấy tỷ lệ hiện diện E coli ESBL trên mẫu phân . vi khuẩn E. coli sinh men beta – lactamases là rất cần thiết nên đề tài Khảo sát sự hiện diện của vi khuẩn Echerichia coli sinh beta – lactamases phổ rộng trên gà khỏe tại huyện Long Hồ tỉnh. & SINH HỌC ỨNG DỤNG BỘ MÔN THÚ Y NGUYỄN HUỲNH ĐẢM KHẢO SÁT SỰ HIỆN DIỆN CỦA VI KHUẨN ESCHERICHIA COLI SINH BETA- LACTAMASES PHỔ RỘNG TRÊN GÀ KHỎE TẠI HUYỆN LONG HỒ TỈNH VĨNH LONG. khuẩn Escherichia coli sinh beta – lactamases phổ rộng trên gà khỏe tại huyện Long Hồ tỉnh Vĩnh Long do sinh vi n Nguyễn Huỳnh Đảm thực hiện tại Bộ môn Thú Y, Khoa Nông Nghiệp & Sinh Học