Đang tải... (xem toàn văn)
báo cáo thực tập vi sinh lâm sàng
TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI KHOA KỸ THUẬT Y HỌC BÁO CÁO THỰC TẬP VI SINH LÂM SÀNG Hà Nội, Tháng 12 năm 2014 TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI KHOA KỸ THUẬT Y HỌC BÁO CÁO THỰC TẬP HÓA SINH LÂM SÀNG Địa điểm thực tập :Khoa xét nghiệm – Bệnh viện Nhiệt đới Trung Ương Địa chỉ : Số 78, Giải Phóng, Đống Đa, Hà Nội Hà Nội, Tháng 12 năm 2014 ĐẶT VẤN ĐỀ Được sự phân công của bộ môn Vi Sinh trường Đại học Y Hà Nội, em đã vinh dự được thực hành học phần Vi sinh lâm sàng năm 4 tại khoa xét nghiệm bệnh viện Nhiệt Đới Trung ương. Sau 4 tuần thực hành (thời gian từ 17/11/2014 đến 12/12/2014) em đã được các cô, anh chị trong khoa xét nghiệm cung cấp cho em những kiến thức cơ bản về vi sinh lâm sàng. Sau đây em xin trình bày báo cáo về những gì em đã học được tại khoa. MỤC TIÊU: Nắm được cách thức tổ chức quản lý một phòng XN vi sinh bệnh viện. Nắm được các công việc xét nghiệm trong khoa (các loại XN, chủng loại XN, số lượng bệnh phẩm từng loại/ ngày và chung cả đợt) Một số căn nguyên vi sinh vật thường gặp Quy trình một số XN thông thường trên vi sinh lâm sàng Tham gia 1 số công việc của phòng xét nghiệm, tự đánh giá khả năng của mình và chất lượng sau khi hoàn thiện công việc Viết báo cáo thu hoạch sau khi đi thực hành bệnh viện. PHƯƠNG PHÁP HOC TẬP Kiến tập, thực tập tại khoa xét nghiệm bệnh viện Nhiệt Đới Trung Ương 3 PHẦN A Tổ chức phòng xét nghiệm BV Nhiệt Đới Trung Ương. 1. Nguồn nhân lực:Gồm 49 cán bộ y tế Khoa xét nghiệm được chia thành 1 phòng chức năng quản lý chất lượng và 5 phòng chuyên môn: Vi khuẩn- Lao- Môi trường- Hấp rửa, kí sinh trùng, sinh học phân tử, miễn dịch. Được bố trí như sau: Trưởng khoa: PGS. TS Nguyễn Vũ Trung Phó trưởng khoa 2: Ths,bs Nguyễn Thanh Bình Phó trưởng khoa 1: PGS. TS Nguyễn Văn Ca Ths Đào Tuyết Trinh Phòng QLCL: Ths Nguyễn Thị Thúy Hằng; CN Nguyễn Thị Hòa. KTV trưởng: CN. Nguyễn Thị Thu Hà Phòng hóa sinh Ths.Bs Nguyễn Thanh Bình KTV.Hoàng thị Hạnh CN.Trần Văn Thịnh CN.Dương Thu Thúy BS. Nguyễn Thị Xuân KTV.Nguyễn Hoàng Phương CN Dương Thị Thu Thủy, KTV Nguyễn Thị Luyên KTV Nguyễn Minh Hải KTV Hoàng Phương Dung Phòng ký sinh trùng CN. Nguyễn Thị Lan CN. Đỗ Thị Lê Na CN. Nguyễn Thị Huyền Trang, Phòng Miễn dịch- HIV Ths. Nguyễn Thị Như Hà KTV. Nguyễn Thị Hà KTV.Vương khánh Hoan CN. Nguyễn Thị Hòa Ths.Ngô Mai Khanh KTV. Phạm Đức Quý CN Nguyễn Thị Thu Hà CN Bùi Thị Thu trang Phòng sinh học phân tử TS.Lê Văn Duyệt Ths.Nguyễn Thị Mỹ Hạnh CN.Vũ Thị Liên CN. Vũ Thị Ngọc KTV.Phạm Thị Phượng, Ts Lê Thị Hội, CN Vũ Ngọc Liên CN Trần Thị Mai Hoa KTV Nguyễn Thị Hồng Phòng Vi khuẩn- Lao- Môi trường- Hấp rửa Ths Đào Tuyết Trinh, Ths Văn Đinh Tráng, CN Trần Thị Vân Dung, Ktv Nguyễn Thị Hà, CN Nguyễn Thị Tho, Ths Nguyễn Thị Hằng, Ktv Lê Trung Toàn, Yc Đặng Hồng Yến, Yc Đoàn Thị Hằng, Ktv Nguy n ễ Th T i, CN Ngô Th ị ươ ị Thu H ngằ 4 Khoa Xét nghiệm là khoa cận lâm sàng, có chức năng: Thực hiện các kỹ thuật xét nghiệm về huyết học, sinh hóa, vi sinh, ký sinh trùng, sinh học phân tử, miễn dịch phục vụ cho việc chẩn đoán, xác định nguyên nhân gây bệnh, theo dõi diễn tiến của bệnh nhân trong quá trình điều trị. Khoa xét nghiệm hoạt động dưới sự lãnh đạo của trưởng khoa, người giám sát toàn bộ hoạt động của khoa cùng với một đội ngũ cán bộ có chuyên môn, với sự trợ giúp của phó trưởng khoa. Khoa xét nghiệm đã bổ sung hai nhân viên Quản lý chất lượng(QLCL) Quản lý kỹ thuật(QLKT) có trách nhiệm đảm bảo mọi hoạt động của khoa. Khoa xét nghiệm thực hiện nhiệm vụ trong Quy chế khoa cận lâm sàng do Bộ Y tế ban hành. Cán bộ, viên chức của khoa phải có đủ tiêu chuẩn về trình độ chuyên môn, năng lực, phẩm chất của người cán bộ y tế. 2. Trang thiết bị, dụng cụ, vật tư tiêu hao: Khoa xét nghiệm đã xây dựng và duy trì các quy trình thích hợp cho việc lựa chọn, sử dụng và bảo quản các thiết bị thuộc xét nghiệm bao gồm các dụng cụ, vật tư tiêu hao, hệ thống phân tích gồm cả phần cứng và phần mềm của máy vi tính. Phòng vi khuẩn Phòng ký sinh trùng Phòng miễn dịch Phòng sinh học phân tử Trang thiết bị -Máy Vitel 2- Compact -Tủ an toàn sinh học -Nồi hốp Tomy -tủ nuôi cấy VK hiếu khí -Máy đo độ đục -Kính hiển vi -Cân điện tử -Tủ sấy, tủ ấm -Máy đo pH -Tủ 25-ROWSEN -Máy ly tâm -Tủ 80- VIP -kính hiển vi -máy ly tâm Hitachi -Bốc vô trùng -Tủ ấm memmert -Tủ lạnh -dàn ELISA -Máy facscount -máy cobas 6000 -máy ly tâm, tủ lạnh, tủ âm sâu, máy lắc, nhiệt kế… -bốc vô trùng, -máy PCR, -thiết bị điện di -RT PCR -tủ lạnh, tủ âm sâu -máy vortex, spindown -máy ly tâm 5 Dụng cụ, vật tư tiêu hao -Que cấy, đèn cồn, đĩa, dụng cụ lấy máu, lấy bệnh phẩm khác (tuýp vô trùng, tăm bông vô trùng, hộp nhựa vô trùng…), dụng cụ giữ chủng, chai cấý máu, -Que cấy, đèn cồn, đĩa, dụng cụ lấy máu, tuýp vô trùng, tăm bông vô trùng, hộp nhựa vô trùng…), dụng cụ giữ chủng, chai cấý máu, -thùng đựng kim, ống lấy máu, pipet,… -pipet, tip, tube, giá đựng mẫu, dụng cụ thủy tinh Sinh phẩm, hóa chất -Bột môi trường nuôi cấy, môi trường xác định tcsvhh -Cồn, nước cất, NaCl…. -Bộ thuốc nhuộm: Gram, ziehl neelsen, … -test miễn dịch sốt rét, card định danh nấm AST -bộ nhuộm gram, giêmsa, mực tàu, lao -thang định danh nấm, KSĐ nấm -hóa chất đếm CD4, dụng dịch đệm, dd rửa, hóa chất đối chứng, -nước cất, cồn, buffer làm test -nước cất, master mix, buffer, hóa chất PCR, Hóa chất điện di… 3. Chú ý về cách bố trí, sắp xếp: - Khoa XN được bố trí ở tầng 5, tách biệt với khu khám bệnh, bệnh phòng. - Cửa ra vào: được lắp kính và có chốt/khóa an toàn - Bố trí thiết bị: các thiết bị được đặt ở vị trí vững chắc, máy ly tâm nên đặt ở vị trí tách biệt tránh ảnh hưởng đến năng lực hoạt động của các thiết bị khác (cân, máy đọc…) -Bố trí khu vực xét nghiệm: phòng SHPT có các khu vực riêng cho thao tác phân tách DNA, chạy máy luân nhiệt , điện di ;đảm bảo khu vực nhuộm, lấy mẫu BP luôn thông và thoáng gió; phòng ăn nghỉ tách biệt, điều hành tách biệt với khu xét nghiệm… 6 PHẦN B: Công việc xét nghiệm của khoa 1. Tiếp nhận mẫu bệnh phẩm -Kiểm tra thông tin bệnh phẩm và phiếu yêu cầu xét nghiệm -Ghi vào sổ nhận bệnh phẩm các thông tin về mẫu bệnh phẩm và các yêu cầu xét nghiệm -Ghi ngày, giờ nhận nhận bệnh phẩm và kí giao nhận 2. Chuyển bệnh phẩm tới phòng xét nghiệm -Mẫu bệnh phẩm sẽ được chuyển kèm theo các phiếu yêu cầu tới phòng xét nghiệm 3. Soát xét các mẫu bệnh phẩm - Cán bộ kỹ thuật kiểm tra lại các thông tin trên phiếu yêu cầu và số lượng, chất lượng các mẫu bệnh phẩm trước khi thực hiện xét nghiệm -Nếu phát hiện sai sót phải phản hồi lại cho cán bộ tiếp nhận hoặc người gửi mẫu dể giải quyết kịp thời 4.Xử lý bệnh phẩm - Tiến hành xử lý các mẫu bệnh phẩm theo yêu cầu của từng loại bệnh phẩm (ly tâm,bảo quản, lưu trữ ) 5. Tiến hành kỹ thuật xét nghiệm - Tùy theo yêu cầu xét nghiệm phân công cán bộ thực hiện quy trình xét nghiệm theo đúng quy trình 7 6. Đọc kết quả - Đọc và phiên giải kết quả theo các chỉ tiêu kỹ thuật. - Xác nhận kết quả, ký trước khi trình lãnh đạo khoa ký xác nhận. - Nếu kết quả bất thường hoặc có lỗi phải tiến hành lại xét nghiệm và có thông báo lại lịch trả kết quả cho người gửi yêu cầu xét nghiệm 7.Xác nhận kết quả của lãnh đạo khoa. -Lãnh đạo khoa hoặc người được uỷ quyền xem xét và ký xác nhận kết quả -Chuyển kết quả xét nghiệm tới bộ phận trả kết quả 8.Trả kết quả xét nghiệm -Sau khi được lãnh đạo khoa xác nhận, bộ phận trả kết quả tiến hành phân loại theo đơn vị gửi yêu cầu xét nghiệm. -Vào sổ trả kết quả -Chuyển tới nơi yêu cầu xét nghiệm và giao nhận kết quả xét nghiệm 9. Tiếp thu phản hồi -Lãnh đạo khoa và các bộ phận chuyên môn sẽ tiếp thu các phản hồi từ phía yêu cầu xét nghiệm về cá kết quả xét nghiệm 10. Xử lý thông tin phản hồi -Lãnh đạo khoa và các bộ phận chuyên môn sẽ có ý kiến phản hồi về các kết quả xét nghiệm. -Lãnh đạo khoa xét nghiệm giao các bộ phận chuyên môn xem xét và có hành động khắc phục các kết quả sai sót. 8 Bảng tổng kết về công việc xét nghiệm của khoa: Tên xét nghiệm Yêu cầu bệnh phẩm Phòn g vi khuẩ n 1. Nuôi cấy, phân lập các VK từ dịch não tủy 2. Nuôi cấy, phân lập các VK từ máu 3. Nuôi cấy lao từ máu 4. Nuôi cấy, phân lập các VK từ đường hô hấp 5. Nuôi cấy, phân lập các Vk từ đường tiết niệu 6. Nuôi cấy, phân lập các VK từ da, niêm mạc 7. Nuôi cấy MGIT từ các loại BP 8. Nuôi cấy, phân lâp VK từ các BP khác 9. Định danh VK bằng kỹ thuật thông thường và bằng máy tự động 10. Xác định mức độ nhạy cảm với kháng sinh bằng KT kirby-Bauer, E-test, máy tự động 11. Nuôi cấy, phân lập, xác định VK kỵ khí 12. Nghiên cứu các tác dụng ức chế, diệt khuẩn của hóa chất, đông y. - Bệnh phòng lấy mẫu trong ống vô trùng. - Nhân viên phòng xét ngiệm lấy máu tại giường. -Bệnh phòng lấy mẫu để trong ống vô trùng có nắp đậy. -Dựa vào chỉ định vủa BS, KTV lấy đúng vị trí. -Bệnh phòng lấy mẫu. -Bệnh phòng lấy mẫu. -Tùy loại bệnh phẩm. -Chủng thuần, phân lập từ bệnh nhân. -Bệnh phòng lấy mẫu để trong ống MTVC có nắp. Phòn g sinh học phân tử 1. Định lượng HBV (Cobas) 2. Định lượng HBV (Realtime) 3. Định lượng HIV (Cobas) 4. Định lượng HCV (Cobas) 5. Định lượng HIV (Realtime) 6. Định lượng HCV (Realtime) 7. PCR lao 8. PCR-CMV 9. PCR Herpes -2 ống chống đông EDTA, 2ml/ống. -Đủ 3ml máu không chống đông. -2 ống chống đông EDTA, 2ml/ống. -Đủ 3ml máu không đông. -Dịch não tủy, màng phổi, màng bụng, màng tim: 3-5ml (vô trùng, có nắp đậy). -Dịch rửa phế quản, dịch khớp, đờm: tối thiểu 3ml (vô trùng, có nắp). -4ml máu chống đông. -2-3ml dịch não tủy. 9 10. PCR-EV và EV 71 11. PCR cúm A,B và subtype A 12. Định type HCV -Bệnh phẩm dịch họng, hầu họng (lấy ở bệnh phòng). -Đủ 3ml máu không chống đông Phòn g ký sinh trùng 1. Cấy nấm 2. Cấy tổn thương da 3. Nhuộm soi và làm test miễn dịch kst sốt rét. 4. Soi tìm KST đường ruột 5. Nhuộm soi tìm nấm 6. Soi tìm ấu trùng giun chỉ 7. Kháng sinh đồ nấm -Bp lấy mẫu để trong ống nghiệm vô trùng có nắp đậy. -Dựa vào chỉ định, lấy đúng vị trí. -2ml máu chống đông EDTA. -Bp lấy mẫu -Bp lấy mẫu -Lấy máu tĩnh mạch 2ml máu chống đông EDTA. -Bệnh phẩm cấy nấm dương tính. Phòn g miễn dịch 1. HIV 3 phương pháp, HbsAg, A-HBs, Hbe/A-Hbe, A-HBc total/A-HBc IgM, A- HAV/A-HAV IgM, A-HCV, Rubella định lượng, giang mai 2. VNNB, EV-71, HIV test nhanh, Leptospira IgM, Dengue, Chikungunia, Rubella định tính, Rickttsia, sởi, EBV, HEV, Sán lá gan lớn 3. CD4 -3ml máu không chống đông. -3ml máu không chống đông. -2ml máu chống đông bằng EDTA. 10 [...]... thuyết và lâm sàng Em tự nhận thấy đợt học Vi sinh lâm sàng thực sự rất quan trọng và cần thiết với đối tượng Cử 29 nhân kỹ thuật y học như chúng em, vừa giúp củng cố kiến thức thực hành đã được học ở trường, vừa bổ sung nhiều kiến thức lâm sàng mà thực tế mới có được để chúng em tránh được bỡ ngỡ khi ra trường Tuy không được tiến hành nhiều kỹ thuật nhưng qua các hoạt động kiến tập và học tập các anh... tính thì khuyến cáo bệnh nhân 6 tuần sau nên đi xét nghiệm lại 2 Quy trình xét nghiệm chẩn đoán VGB: - Mục đích để phát hiện dấu ấn của virus vi m gan B giúp cho vi c chẩn đoán bệnh nhân là người lành mang virus hay bệnh nhân đang bị vi m gan virus B cấp, mãn hoặc đã nhiễm virus trong qúa khứ Kỹ thuật được thực hiện cho những người theo dõi vi m gan B , phụ nữ có thai 26 trước sinh , sàng lọc người... được Sau đợt thực tập ở khoa xét nghiệm bệnh vi n bệnh Nhiệt đới trung ương, bản thân em tự thấy đã thu được những kết quả đáng kể bao gồm cả 2 mảng lý thuyết và thực hành Trong phần này, em sẽ trình bày 1 cách ngắn gọn về những gì em đã thu được trong phòng vi khuẩn và phòng miễn dịch-virus Phòng vi khuẩn Phòng miễn dịch- virus Củng cố - Các xét nghiệm đc thực hiện trên LS -Các xét nghiệm đc thực hiện... kháng sinh với nồng độ nhất định được đặt lên đĩa môi trường nuôi cấy vi khuẩn Sau khi ủ ấm ở nhiệt độ và khí trường thích hợp, vi khuẩn chỉ mọc được ở nơi có nồng độ kháng sinh thấp hoặc không có Tuỳ theo khả năng ức chế sự phát triển của vi khuẩn mà tạo ra vòng ức chế xung quanh khoanh giấy kháng sinh c Tiến hành kĩ thuật • Pha huyền dịch vi khuẩn - Pha huyền dịch vi khuẩn trong nước muối sinh lý... nhiều kinh nghiệm khi làm vi c trong môi trường bệnh vi n, nhất là khi làm vi c trực tiếp với bệnh phẩm của người bệnh, đòi hỏi sự chính xác rất cao.Trong quá trình học và thực tập chúng em không được học về mảng kĩ thuật xét nghiệm vi khuẩn kị khí do điều kiện phức tạp ,đắt tiền về trang thiết bị , kĩ thuật Em rất mong muốn bộ môn vi sinh và nhà trường nếu có điều kiện có thể thực hiện giảng dạy cho... thanh E- test khả năng ức chế vi khuẩn cũng giảm Tới một vị trí nào đó trên thanh E- test mà nồng độ kháng sinh quá thấp không thể ức chế vi khuẩn thì đó chính là MIC c Quy trình tiến hành • Pha huyền dịch vi khuẩn - Pha huyền dịch vi khuẩn trong nước muối sinh lý trực tiếp từ các khuẩn lạc vi khuẩn mọc trên mặt thạch nuôi cấy đã ủ 18 đến 24 giờ Điều chỉnh huyền dịch vi khuẩn đạt độ đục chuẩn McFaland... 87 − Elisa:16 phòng sinh học phân tử ngày 18/11/2014 − Định lượng HBV (Cobas) :30 − Định lượng HBV (Realtime):35 − Định lượng HIV (Cobas):10 − Định lượng HCV (Cobas):21 − Định lượng HIV (Realtime):3 − Định lượng HCV (Realtime):4 − PCR lao:4 12 PHẦN C: Quy trình của 1 số xét nghiệm thông thường trên vi sinh lâm sàng Một số quy trình phân lập, xác định vi khuẩn gây bệnh: 1 Ria cấy vi khuẩn trên đĩa thạch:...Bảng tổng kết về số lượng bênh phẩm trong đợt thực tập: 1 Phòng vi khuẩn Theo dõi thực trạng xét nghiệm vi khuẩn ngày/tuần/tháng Thời gian Ngày 16/11 Tuần từ 15-22/11 Tháng 11 Cấy máu 16 133 549 Nước tiểu Phân 4 2 30 19 128 70 Đờm 4 22 104 Mủ 1 9 39 Làm BK 9 94 319 Dịch khác 2 12 39 Bệnh phẩm 2 Phòng ký sinh trùng từ ngày 17/11/2014 đến 21/11/2014 - Cấy máu : 25 bệnh phẩm -... - Ria vi khuẩn từ que tăm bông lên mặt thạch Mueller- Hinton đã để tủ ấm trước đó 30 phút bằng máy tự tạo: Đặt ngửa đĩa thạch vào vị trí để đĩa trên máy, đặt tăm bông từ tâm đĩa thạch, bật máy, kéo từ từ tăm bông từ tâm ra ngoài rìa đĩa thạch, vừa kéo vừa xoay đều tăm bông 22 • Đặt khoanh giấy kháng sinh lên mặt thạch đã ria vi khuẩn - Tuỳ theo chủng vi khuẩn làm kháng sinh đồ, chọn bộ kháng sinh thích... kháng sinh phải để sấp hộp thạch trong tủ ấm 35ºC ► Chú ý: Không ủ hộp thạch ở khí trường quá 5% CO2.(thay đổi pH MT) Kĩ thuật làm kháng sinh đồ xác định MIC bằng E- test Bệnh phẩm 7.2 a - Chủng vi khuẩn tươi đã được định danh, nuôi cấy qua đêm (18-24 giờ) b Nguyên lý - Kháng sinh tẩm trong thanh E- test sẽ khuếch tán vào trong môi trường thạch và ức chế sự phát triển của vi khuẩn Do nồng độ kháng sinh