Nghiên cứu cơ chế phản ứng giữa một số kháng sinh β-Lactam và Enzym PBP2a bằng các phương pháp hóa tin

175 838 0
Nghiên cứu cơ chế phản ứng giữa một số kháng sinh β-Lactam và Enzym PBP2a bằng các phương pháp hóa tin

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Từ khóa liên quan

Mục lục

  • MỤC LỤC

  • DANH MỤC CÁC BẢNG

  • DANH MỤC CÁC HÌNH

  • CÁC KÝ HIỆU VIẾT TẮT TRONG LUẬN ÁN

  • MỞ ĐẦU

  • CHƯƠNG 1: TỔNG QUAN

  • CHƯƠNG 2: CƠ SỞ Ý THUYẾT VÀ PHƯƠNG PHÁP TÍNH

  • 2.1. MÔ PHỎNG ĐỘNG ỰC CƠ HỌC PHÂN TỬ (MM/MD)5-9

  • 2.1.1. Mẫu cơ học phân tử (MM)

  • 2.1.2 Phương pháp động lực phân tử MD

  • 2.2.2. Cơ sở của các phương pháp tính gần đúng lượng tử

  • 2.3. PHƯƠNG PHÁP QM/MM (HYBRID QUANTUM MECHANICS/MOLECULAR MECHANICS)11,12,15,22,25,40

  • 2.3.1. Phương pháp lai hóa QM/MM trong ONIOM

  • CHƯƠNG 3: CHUẨN BỊ INPUT VÀ CÁC ĐIỀU KIỆN NGHIÊN CỨU CHO HỆ CỤ THỂ

  • 3.1. ĐIỀU KIỆN TÍNH VỚI PHƯƠNG PHÁP MM/MD

  • 3.1.1. Nghiên cứu đặc điểm của tâm hoạt động và khe hẹp g n tâm hoạt động SER403 của PBP2a

  • 3.1.2. Nghiên cứu tính linh động của protein và phối tử

  • 3.1.3. Tính năng lượng tự do gắn kết của methicillin và nitrocefin lên các cấu trúc khác nhau của protein PBP2a*

  • 3.2. ĐIỀU KIỆN TÍNH VỚI PHƯƠNG PHÁP QM/MM (ONIOM)

  • 3.2.1. Các mô hình tâm hoạt hóa

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan