TIỂU LUẬN HÓA - TIN SỬ DỤNG PHẦN MỀM HYPERCHEM KHẢO SÁT CẤU TRẠNG BÁN LỆCH VÀ ĐỐI LỆCH CỦA MỘT SỐ CHẤT

110 1.5K 7
TIỂU LUẬN HÓA - TIN SỬ DỤNG PHẦN MỀM HYPERCHEM KHẢO SÁT CẤU TRẠNG BÁN LỆCH VÀ ĐỐI LỆCH CỦA MỘT SỐ CHẤT

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

TRƯỜNG ĐẠI HỌC SƯ PHẠM TP HỒ CHÍ MINH -oOo - TIỂU LUẬN Đề tài SỬ DỤNG PHẦN MỀM HYPERCHEM KHẢO SÁT CẤU TRẠNG BÁN LỆCH VÀ ĐỐI LỆCH CỦA MỘT SỐ CHẤT Giáo viên hướng dẫn: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Học viên thực hiện: Thái Ngọc Triển Chun ngành: LL&PPDH Mơn Hóa Học- K23 TP.Hồ Chí Minh Tháng 3/2013 Trang MỤC LỤC MỞ ĐẦU CHƯƠNG GIỚI THIỆU PHẦN MỀM HYPERCHEM GIỚI THIỆU Những tính .4 Một số từ ngữ thông dụng để tham khảo .5 HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG HYPERCHEM 1.2.1 Vẽ công thức hai chiều .6 1.2.2 Chuyển từ công thức hai chiều sang công thức ba chiều 1.2.3 Ghi công thức dạng file 1.2.4 Sơ lược phương pháp bán thực nghiệm 1.2.5 Tối thiểu hóa lượng 17 Một số thông số sau tính tốn 20 1.2.6 Tính phổ electron 20 CHƯƠNG SỬ DỤNG PHẦN MỀM HYPERCHEM 22 KHẢO SÁT HIỆU ỨNG BÁN LỆCH 22 2.1 THỰC HIỆN KHẢO SÁT TRÊN MỘT SỐ PHÂN TỬ .22 2.1.1 Butan 22 2.1.2 Pentan 38 2.1.3 Hexan 43 2.1.4 1,2-đifloetan 48 2.1.5 1,2-đicloetan .53 2.1.6 1,2-đibrometan 58 2.1.7 1-clo-2-flotetan 63 2.1.8 1-brom-2-flotetan 68 2.1.9 1,2-etanđiol .73 2.1.10 etanhidroxiamin (NH2-CH2-CH2-OH) 79 2.1.11 2-floetanol .85 2.1.12 2-cloetanol 91 2.1.13 2-brometanol 97 2.2 XỬ LÍ SỐ LIỆU 103 2.2.1 Bảng tóm tắt số liệu thu 103 2.2.2 Bảng so sánh số liệu cấu dạng bán lệch đối lệch chất 104 2.2.3 Nhận xét 105 KẾT LUẬN 107 107 GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang MỞ ĐẦU Sự phát triển không ngừng khoa học kỹ thuật mang lại cho người ngày nhiều công cụ, phương tiện mặt đời sống xã hội có q trình dạy học Việc sử dụng cơng cụ, phương tiện khoa học kỹ thuật giúp cho người có thêm nhiều khả việc cải tạo chinh phục giới mà giúp cho người hiểu sâu sắc chất giới Việc ứng dụng phần mềm hỗ trợ q trình dạy học Hóa học cần thiết, phần mềm HyperChem công cụ hỗ trợ tốt để mô công thức cấu tạo phân tử theo không gian ba chiều, thí nghiệm hóa học, khảo sát số tính chất mô chúng Nhờ phần mềm này, ta nghiên cứu nhiều tính chất chất khơng qua phịng thí nghiệm ảo, tính tốn máy, từ kết luận hay dự báo tính chất số hợp chất Một ứng dụng ta khảo sát hiệu ứng bán lệch số hợp chất, so sánh với giá trị thực nghiệm, đánh giá định tính giải thích độ bền số hợp chất Vì lý nên tơi chọn đề tài “Sử dụng phần mềm HyperChem khảo sát cấu trạng bán lệch đối lệch số chất” GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang CHƯƠNG GIỚI THIỆU PHẦN MỀM HYPERCHEM GIỚI THIỆU Phần mềm HyperChem phần mềm chuyên dụng mơn Hóa Tính Tốn (Ứng dụng tin học Hóa học) Mơ cấu trúc 3D hợp chất, tối ưu hóa cấu trúc, tính tốn thông số liên quan đến hợp chất như: lượng bề mặt, phổ IR, UV,…, dao động nhiệt, độ dài lượng liên kết… Đây phiên bảng HyperChem 8.0.10 Những tính - HyperChem biểu diễn phân tử khác hệ, bạn thay đổi hình thức biễu diễn kiểu que, kiểu hình cầu, kiểu hình cầu chồng lên nhau, kiểu chấm, kiểu chấm-gạch - Bạn đặt màu cho trang làm việc, đặt màu khác cho liên kết phân tử, màu sắc nguyên tố (ví dụ ngầm định màu Cacbon màu lục, Oxy đỏ, Flo vàng, Fe đỏ, Cu xanh lá…) - Bạn lấy hình ảnh HyperChem chuyển qua ứng dụng khác Word, PhotoShop… cách đặt chế độ copy hình ảnh GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang - HyperChem giúp bạn vẽ hiệu chỉnh phân tử không gian chiều(2D) chiều(3D) - Trong HyperChem có hệ tọa độ người quan sát tọa độ phân tử, bạn dịch chuyển, quay biểu diễn hệ phân tử theo tỷ lệ hình làm việc - Xem thuộc tính cấu trúc phân tử, đo độ dài liên kết, góc liên kết, biểu diễn momen lưỡng cực… - Cơ sở liệu rộng lớn, bạn tạo biểu diễn chuỗi polypeptide, hay lựa chọn amino acid, acid nucleic, polyme… - Tính tốn obital phân tử, cực tiểu hóa lượng hệ, tối ưu hóa cấu trúc… - Cịn rất nhiều ưu điểm chờ bạn khám phá Một số từ ngữ thơng dụng để tham khảo • Ab Inito: phương pháp tính tốn học lượng tử cho kết xác • AM1: phương pháp bán kinh nghiệm xác • ALL atom: phương pháp tính tốn học phân tử • AMBER: phương pháp trường lực (force field) • Atom type: kiểu biểu diễn nguyên tử • Backbone: liên kết khung • Bio+: bổ sung cho trường lực CHARMM • Brookhaven Protein Data Bank(PDB): liệu cấu trúc Protein • Charge density: mật độ điện tích • CNDO: dùng tính tốn thuộc tính điện tử bỏ qua xen phủ vi phân • Connectivity: kết nối liên kết cộng hóa trị • Constraint: ràng buộc giá trị lý thuyết với thực tế gần • Convergence: tiêu chuẩn kết thúc tính tốn hóa học • Coordinate system: hệ tọa độ • Correlation Energy: lượng tương quan tính theo vị trí cụ thể electron • Chirality: R S • RMS Gadient: vectơ mô tả trường lực nguyên tử • Sequence: thứ tự hợp phần từ hợp phần đuôi N GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang • Bond Length: độ dài liên kết nguyên tử • Bond Order: thứ tự liên kết tính tốn theo học lượng tử HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG HYPERCHEM 1.2.1 Vẽ công thức hai chiều 1.2.1.1 Các công cụ sử dụng Draw: Nhắp vào cho phép ta thực vẽ nguyên tử liên kết Nếu nhắp đúp bảng element table cho phép ta lựa chọn nguyên tố biểu diễn Select: Nhắp vào cho phép ta chọn nguyên tử, liên kết, góc, góc xoắn, phân tử Rotate out of plane: Nhắp vào cho phép ta quay phân tử mặt phẳng cửa sổ phần mềm Rotate in plane: Nhắp vào cho phép thực phép quay mặt phẳng cửa sổ phần mềm Translate: Cho phép ta di chuyển phân tử mặt phẳng cửa sổ phần mềm Z-Translate: Cho phép ta di chuyển phân tử dọc theo trục vng góc với cửa sổ phần mềm Magnify/Shrink: Cho phép ta phóng to thu nhỏ phân tử hay phần lựa chọn Z-Clipping planes: Biểu diễn phân tử theo mặt cắt tạo hai mặt phẳng vng góc với trục vng góc với cửa sổ phần mềm Lưu ý: Khi chọn cơng cụ biểu tượng cơng cụ lên ta rà chuột vào cửa sổ phần mềm 1.2.1.2 Thực vẽ Trong menu Build chọn Default element (Hoặc nhắp đúp chuột trái vào biểu tượng Draw) Bảng nguyên tố sau: GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang Để lựa chọn nguyên tố nào, ta cần nhắp chuột trái vào nguyên tố Muốn biết thuộc tính nguyên tố ta cần nhắp trái chuột vào thẻ Properties thoại, bảng thuộc tính nguyên tố xuất Sau lựa chọn nguyên tố muốn vẽ, cần nhắp trái chuột lên hình ta thu nguyên tố cần vẽ Có thể thực phép vẽ hai cách: Vẽ nguyên tử trước rê chuột từ nguyên tử đến nguyên tử khác để vẽ liên kết Vẽ thẳng liên kết nguyên tử cách vẽ nguyên tử rê chuột đến vị trí khác tạo liên kết Tạo liên kết đôi, liên kết ba cách nhắp trái chuột vào liên kết Tạo vịng liên hợp cách nhấp hai lần chuột trái vào liên kết vịng GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang Nếu có liên kết hay nguyên tử không phù hợp xóa cách nhắp phải chuột vào liên kết hay nguyên tử Lưu ý: Nguyên tử Hidro vẽ khơng vẽ 1.2.2 Chuyển từ công thức hai chiều sang công thức ba chiều Sau vẽ cơng thức hai chiều xong chọn Add H & Model Build menu Build để chuyển từ công thức hai chiều sang công thức ba chiều Thực xong, ta thu công thức ba chiều GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 1.2.3 Ghi công thức dạng file Trong menu File, chọn Save, đường dẫn vào khu vực muốn lưu, đặt tên chọn Save Đuôi tập tin mặc định HIN 1.2.4 Sơ lược phương pháp bán thực nghiệm Các tính tốn bán thực nghiệm giải phương trình Schrodinger, với xấp xỉ đó, nhằm mơ tả thuộc tính nguyên tử phân tử Để tính nhanh đơn giản, phương pháp bán thực nghiệm thực đơn giản hóa sau: tính cho electron hóa trị; bỏ qua số tích phân tương tác; sử dụng hàm orbital điện tử chuẩn, không tối ưu; dùng tham số xác định từ thực nghiệm Các tham số thực nghiệm loại bỏ lượng tính tốn cần thiết sửa lỗi kết thu từ gần Quan trọng: Các phương pháp bán thực nghiệm Hyperchem xử lý tất nguyên tố nhóm chính, tham số hóa file tham số để xử lý đến xenon Extended Huckel, ZINDO/1, ZINDO/S xử lý hai hàng kim loại chuyển tiếp GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 10 Tất phương pháp bán thực nghiệm hành thiết lập nhằm loại bỏ tính tốn tốn nhiều thời gian tích phân xen phủ Phương pháp bỏ qua xen phủ vi phân khơng tính tích phân đẩy có giá trị nhỏ Để lựa chọn phương pháp, ta chọn thẻ Semi-epirical menu Set up Lúc đó, xuất hộp thoại: Extended Huckel: Sử dụng để tính tốn orbital phân tử phân tử Khơng có giá trị để tối ưu hình học tính tốn động lực học phân tử Dùng giản hóa “một electron” quy cho khơng có tương tác rõ ràng electron Đây phương pháp trường tự hợp (SCF) CNDO: Bỏ qua hoàn toàn xen phủ vi phân Đây phương pháp trường tự hợp đơn giản Nó có giá trị để tính tốn thuộc tính electron trạng thái hệ vỏ hở hệ vỏ kín, dùng để tối ưu hóa hình học, tính lượng tồn phần INDO: Gián tiếp bỏ qua xen phủ vi phân Cải tiến từ CNDO cách tính đến lực đẩy tâm electron nguyên tử Dùng để tính thuộc tính electron trạng thái hệ vỏ hở vỏ kín, dùng để tối ưu hình học, tính lượng toàn phần, phương pháp SCF MINDO3: Là phương pháp mở rộng từ INDO cách sử dụng tham số, thay tính tốn nhiều tương tác Sử dụng cho phân tử hữu lớn, tính tốn thuộc tính điện tử, tối ưu hình học, tính lượng tồn phần Đây phương pháp SCF MNDO: Sử dụng cho nhiều loại phân tử hữu khác có chứa nguyên tố thuộc hàng bảng tuần hồn, khơng có giá trị cho kim loại chuyển tiếp Loại bỏ GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 96  Xem giá trị lượng HOMO: Sau tối ưu hóa cấu trúc 2-cloetanol đối lệch ta thu kết đáng lưu ý sau: • • • • • Total Energy = -21329.6875269 (kcal/mol) Heat of Formation = -60.0884449 (kcal/mol) Khoảng cách nhóm OH Cl: 3,92361 Ao Góc nhị diện: 180o Năng lượng HOMO thấp = -10,51022 (eV) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 97 2.1.13.2-brometanol 2.1.13.1.Cấu dạng bán lệch  Khoảng cách nhóm OH Br:  Khoảng cách nguyên tử Br với H nhóm OH: GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 98  Góc nhị diện:  Các giá trị lượng: ENERGIES AND GRADIENT GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 99 Total Energy = -22176.9200552 (kcal/mol) Total Energy = -35.341167317 (a.u.) Binding Energy = -736.9469282 (kcal/mol) Isolated Atomic Energy = -21439.9731270 (kcal/mol) Electronic Energy = -61262.3347553 (kcal/mol) Core-Core Interaction = 39085.4147000 (kcal/mol) Heat of Formation = -48.3579282 (kcal/mol) Gradient = 0.0000095 (kcal/mol/Ang) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 100  Xem giá trị lượng HOMO: Sau tối ưu hóa cấu trúc 2-brometanol bán lệch ta thu kết đáng lưu ý sau: • • • • • Total Energy = -22176.9200552 (kcal/mol) Heat of Formation = -48.3579282 (kcal/mol) Khoảng cách nhóm OH BrCl: 12,82397 Ao Góc nhị diện: 53,7788o Năng lượng HOMO thấp = -10,66319 (eV) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 101 2.1.13.2.Cấu dạng đối lệch  Khoảng cách nhóm OH Br:  Các giá trị lượng: ENERGIES AND GRADIENT Total Energy = -22177.7366157 (kcal/mol) Total Energy = -35.342468589 (a.u.) Binding Energy = -737.7634887 (kcal/mol) Isolated Atomic Energy = -21439.9731270 (kcal/mol) Electronic Energy = -60071.7145436 (kcal/mol) Core-Core Interaction = 37893.9779279 (kcal/mol) Heat of Formation = -49.1744887 (kcal/mol) Gradient = 0.0000073 (kcal/mol/Ang) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 102  Xem giá trị lượng HOMO: Sau tối ưu hóa cấu trúc 2-brometanol đối lệch ta thu kết đáng lưu ý sau: • • • • • Total Energy = -22177.7366 (kcal/mol) Heat of Formation = -49.1744887 (kcal/mol) Khoảng cách nhóm OH Br: 4,0264 Ao Góc nhị diện: 180o Năng lượng HOMO thấp = -11,05161 (eV) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 103 2.2 XỬ LÍ SỐ LIỆU 2.2.1 Bảng tóm tắt số liệu thu Total Energy Heat of Formation Khoảng cách nguyên tử Góc nhị diện Năng lượng HOMO -14508.3640305 -28.7193805 3,03123 Ao 64,5121 -11,31514 -14508.8829751 -29.2383251 3,85174 180 -11,35117 -17957.1083398 -34.3417538 3,04045 64,9686 -11,21453 -17957.4634563 -34.6968703 3,85784 180 -11,29605 -21405.3809509 -39.4924289 3,069 68,6919 -11,05461 -21405.6882 -39.7997102 3,86288 180 -11,15806 -27205.1882751 -102.0053291 2,79121 57,3168 -12,59085 -27203.8026393 -100.6196933 3,56516 180 -12,30331 -21505.8034371 -24.1557751 3,26104 67,3507 -10,47176 -21506.4146075 -24.7669455 4,27713 180 -10,67624 -23204.3525088 -4.7787568 43,342 -10,02805 -23203.0624535 -3.4887015 4,50038 180 -11,22225 -24354.9141635 -62.4988595 3,01245 61,2857 -10,55643 -24354.8778478 -62.4625438 3,90978 180 -10,70373 1-brom-2-floetan (bl) -25202.7961744 -51.4178254 2,81751 49,1796 -11,02957 1-brom-2-floetan (đl) -25202.6289353 -51.2505863 4,00565 -21156.2343741 -98.6838721 3,030 1,2-etanđiol (đl) -21152.8946367 -95.3441347 3,57772 10.etanhidoroxiami n (bl) -18477.7347092 -50.9441622 2,95844 Phân tử Butan (bl) Butan (đl) Pentan (bl) Pentan (đl) Hexan (bl) Hexan (đl) 1,2-điflloetan (bl) 1,2-điflloetan (đl) 1,2-đicloetan (bl) 1,2-đicloetan (đl) 1,2-đibrometan (bl) 1,2-đibrometan(đl) 1-clo-2-floetan (bl) 1-clo-2-floetan (đl) 1,2-etanđiol (bl) GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh 2,769 180 11,22582 71,2717 -11,03996 180 -10,82119 54,8595 -9,500033 HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 104 Etanhidoroxiamin (đl) 11 2-floetanol (bl) 2-floetanol (đl) 12 2-cloetanol (bl) 2-cloetanol (đl) 13 2-brometanol bl) 2-brometanol (đl) -18476.5132420 -49.7226950 3,67329 180 -9,49948 -24181.4144992 -101.0477752 2,91411 65,0096 -11,44644 -24178.5590888 -98.1923648 3,56846 180 -11,26832 -21332.2371410 -62.6380590 3,09269 64,5584 -10,71835 -21329.6875269 -60.0884449 3,92361 180 -10,51022 -22176.9200552 -48.3579282 12,82397 53,7788 -10,66319 -22177.7366 -49.1744887 4,0264 180 -11,05161 2.2.2 Bảng so sánh số liệu cấu dạng bán lệch đối lệch chất Phân tử Butan Pentan Hexan 1,2-điflloetan 1,2-đicloetan 1,2-đibrometan 1-clo-2-floetan 1-brom-2-floetan ETOT bán lệch/đối lệch EHOMO bán lệch/đối lệch Sinh nhiệt bán lệch/đối lệch -14508.3640305/-14508.8829751 -11,31514/-11,35117 -28.7193805/-29.2383251 -17957.1083398/-17957.4634563 -11,21453/-11,29605 -34.3417538 /-34.6968703 -21405.3809509/-21405.6882 -11,05461/-11,15806 -39.4924289/-39.7997102 -27205.1882751/-27203.8026393 -12,59085/-12,30331 -102.0053291/-100.6196933 -21505.8034371/-21506.4146075 -10,47176/-10,67624 -24.1557751/-24.7669455 -23204.3525088/-23203.0624535 -10,02805/-11,22225 -4.7787568/-3.4887015 -24354.9141635/-24354.8778478 -10,55643/-10,70373 -62.4988595/-62.4625438 -25202.7961744/-25202.6289353 -11,02957/-11,225826 GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh Góc nhị diện (o) cấu dạng bán lệch Cấu dạng bán lệch có liên kết H nội phân tử 64,5121 64,9686 68,6919 57,3168 67,35072 43,342 61,2857 49,1796 HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 105 -51.4178254/-51.2505863 1,2-etanđiol 10 etanhidoroxiamin 11 2-floetanol 12 2-cloetanol 13 2-brometanol -21156.2343741/-21152.8946367 -11,039/-10,82119 -98.6838721/-95.3441347 -18477.7347092/-18476.5132420 -9,500033/-9,49948 -50.9441622/-49.7226950 -24181.4144992/-24178.5590888 -11,44644/-11,26832 -101.0477752/-98.1923648 -21332.2371410/-21329.6875269 -10,71835/10,51022 -62.6380590/-60.0884449 -22176.9200552/-22177.7366 -10,66319/-11,05161 -48.3579282/-49.1744887 71,2717 54,8595 65,0096 64,5584 Có liên kết H Có liên kết H Có liên kết H Có liên kết H 53,7788 2.2.3 Nhận xét Dựa số liệu thu từ kết tính tốn sau khảo sát dạng cấu trạng bán lệch đối lệch số chất trên, ta có số nhận xét sau: - Đa số chất bền cấu dạng đối lệch Hiệu ứng bán lệch gây ra tương tác nguyên tử hay nhóm nhóm nguyên tử gần làm cho - chất cao lên, bền Các nhóm nguyên tử lớn tương tác mạnh, cấu dạng đối lệch bền dạng bán lệch Đối với trường hợp butan, pentan hexan - Tuy nhiên, số trường hợp cấu dạng bán lệch lại bền dạng đối lệch - số nguyên nhân khác Ví dụ trường hợp trên, có tạo thành liên kết H nội phân tử nhóm nguyên tử cấu dạng bán lệch làm giảm - hệ xuống Ngoài ta thấy điều xảy với trường hợp có gắn nguyên tử F vào phân tử Nhưng chưa có lí thuyết để giải thích rõ điều khác biệt Vậy với việc sử dụng phần mềm HyperChem, ta khảo sát hiệu ứng bán lệch chất tương đối tốt, chứng minh tính tốn cho số giải thích định tính trước GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 106 đó, từ dự đốn hiệu ứng bán lệch nguyên tử hay nhóm ngun tử khác thơng qua tính tốn Tuy nhiên, nguyên tử lớn hay nhóm nguyên tử có kích thước cồng kềnh việc tính tốn cịn gặp nhiều khó khăn, với nhiều hợp chất phức tạp khó kiểm chứng tính đắn thực nghiệm kết tính tốn GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 107 KẾT LUẬN Việc ứng dụng phần mềm hỗ trợ trình dạy học Hóa học cần thiết, phần mềm HyperChem cơng cụ hỗ trợ tốt để mô công thức cấu tạo phân tử theo khơng gian ba chiều, thí nghiệm hóa học, khảo sát số tính chất mơ chúng Nhờ phần mềm này, ta nghiên cứu nhiều tính chất chất khơng qua phịng thí nghiệm ảo, tính tốn máy, từ kết luận hay dự báo tính chất số hợp chất Một ứng dụng ta khảo sát hiệu ứng bán lệch số hợp chất, so sánh với giá trị thực nghiệm, đánh giá định tính giải thích độ bền số hợp chất Đây tiện ích hố học sinh học tuyệt đỉnh thiết kế để đáp ứng nhu cầu nhà hoá học, cho phép nhà nghiên cứu theo dõi công việc hiệu quả, hiểu sâu cơng trình, cấu trúc hố học tương quan, cho hoàn thành báo cáo chuyên nghiệp hiệu hết GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang 108 TÀI LIỆU THAM KHẢO Bùi Thọ Thanh (2013), Giáo trình tin học ứng dụng hóa học, ĐHSP TPHCM http://www.hyper.com/ Tài liệu hướng dẫn sử dụng HyperChem Computational Chemistry and Molecular Modeling Principles and Applications GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển ... số hợp chất Vì lý nên tơi chọn đề tài ? ?Sử dụng phần mềm HyperChem khảo sát cấu trạng bán lệch đối lệch số chất? ?? GVHD: PGS.TS Bùi Thọ Thanh HVTH: Thái Ngọc Triển Trang CHƯƠNG GIỚI THIỆU PHẦN MỀM... MỀM HYPERCHEM GIỚI THIỆU Phần mềm HyperChem phần mềm chuyên dụng môn Hóa Tính Tốn (Ứng dụng tin học Hóa học) Mô cấu trúc 3D hợp chất, tối ưu hóa cấu trúc, tính tốn thơng số liên quan đến hợp chất. .. Nhờ phần mềm này, ta nghiên cứu nhiều tính chất chất khơng qua phịng thí nghiệm ảo, tính tốn máy, từ kết luận hay dự báo tính chất số hợp chất Một ứng dụng ta khảo sát hiệu ứng bán lệch số hợp chất,

Ngày đăng: 29/03/2015, 22:18

Từ khóa liên quan

Mục lục

  • MỞ ĐẦU

    • CHƯƠNG 1. GIỚI THIỆU PHẦN MỀM HYPERCHEM

      • GIỚI THIỆU

        • Những tính năng cơ bản

        • Một số từ ngữ thông dụng để tham khảo

        • HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG HYPERCHEM

          • 1.2.1. Vẽ công thức hai chiều

            • 1.2.1.1. Các công cụ sử dụng

            • 1.2.1.2. Thực hiện vẽ

            • 1.2.2. Chuyển từ công thức hai chiều sang công thức ba chiều

            • 1.2.3. Ghi công thức dưới dạng file

            • 1.2.4. Sơ lược về các phương pháp bán thực nghiệm

              • 1.2.4.1. Phương pháp áp dụng cho các nguyên tố

              • 1.2.4.2. Lựa chọn bán thực nghiệm cho phương pháp Huckel

              • 1.2.4.3. Hộp thoại lựa chọn cho các phương pháp bán thực nghiệm khác

              • 1.2.4.4. Lựa chọn tương tác cấu hình

              • 1.2.5. Tối thiểu hóa năng lượng

              • Một số thông số sau khi tính toán

              • 1.2.6. Tính phổ electron

              • CHƯƠNG 2. SỬ DỤNG PHẦN MỀM HYPERCHEM

              • KHẢO SÁT HIỆU ỨNG BÁN LỆCH

                • 2.1. THỰC HIỆN KHẢO SÁT TRÊN MỘT SỐ PHÂN TỬ

                  • 2.1.1. Butan

                    • 2.1.1.1. Cấu dạng bán lệch

                    • 2.1.1.2. Cấu dạng đối lệch

                    • 2.1.2. Pentan

                      • 2.1.2.1. Cấu dạng bán lệch

                      • 2.1.2.2. Cấu dạng đối lệch

                      • 2.1.3. Hexan

                        • 2.1.3.1. Cấu dạng bán lệch

                        • 2.1.3.2. Cấu dạng đối lệch

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan