Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

36 487 0
Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

[...]... hiện tất cả các vi khuẩn gây bệnh/có lợi/nhiễm tạp có thể có trong mẫu nghiên cứu [36] Kỹ thuật microarray mới ra đời vào đầu những năm 1990, thực sự phát triển từ năm 1995 và mới được ứng dụng trong lĩnh vực môi trường chỉ vài năm gần đây [6] nhưng đã phát triển rất mạnh mẽ Một trong các ứng dụng nổi bất nhất của microarray trong quản lý môi trường là xác định vi sinh vật (bảng 1) Các microarray này... nếu so sánh với các kỹ thuật trước đây thì những hạn chế của microarray không đáng kể và hoàn toàn có thể bù đắp bởi lợi ích của nó mang lại Hơn nữa, các hạn chế này đa phần đều có thể khắc phục bằng những cải tiến, phát triển mới trong kỹ thuật PHẦN II_ KHẢ NĂNG PHÁT TRIỂN KỸ THUẬT DNA ARRAY TRONG QUẢN LÝ MÔI TRƯỜNG PHẦN II_ KHẢ NĂNG PHÁT TRIỂN KỸ THUẬT DNA ARRAY TRONG QUẢN LÝ MÔI TRƯỜNG Vi sinh vật... array khi áp dụng trong lĩnh vực môi trường 3 Các vấn đề tồn tại trong kỹ thuật DNA array khi áp dụng trong lĩnh vực môi trường Mặc dù microarray ra đời mở ra một kỷ nguyên mới trong rất nhiều lĩnh vực, song khi ứng dụng trong môi trường nó gặp phải một số vấn đề Vấn đề kỹ thuật Tồn tại cố hữu của phương pháp microarray là các điều kiện lai (nhiệt độ, nồng độ muối…) không bao giờ tối ưu cho mọi phân tử,... trong môi trường tự nhiên [59] Bảng 2: Ứng dụng microarray để xác định các tập hợp gene chức năng trong môi trường Hầu hết các nghiên cứu đều hướng tới việc giải quyết độ nhạy và tính đặc hiệu của microarray để áp dụng trực tiếp với mẫu môi trường Một vấn đề khác là khả năng di động của thiết bị để có thể mang tới hiện trường phân tích [62] Các mối quan tâm này đặc biệt quan trọng trong các ứng dụng. .. một số kỹ thuật tôi trình bày ở đây vì quá mới nên cho đến nay chưa được ứng dụng nhiều trong lĩnh vực môi trường Tuy nhiên, khả năng giải quyết các vấn đề môi trường phức tạp và đa dạng của nó trong tương lai là không thể phủ nhận Có thể nhận định rằng, chỉ vài năm nữa thôi, tốc độ phát triển và tính khả dụng của microarray sẽ không thua kém sự phát triển và khả năng ứng dụng thần kỹ của kỹ thuật PCR... phát hiện sớm các yếu tố biến đổi không biết trước bằng cách phân tích biến thiên quần thể hay nói cách khác, có thể sử dụng vi sinh vật để giám sát trạng thái và các biến đổi môi trường [34] Tuy nhiên, để có thể quản lý môi trường trên diện rộng, cần phân tích một lượng mẫu sinh học khổng lồ, điều này không thể đạt được với các kỹ thuật trước đây [35] Ngày nay, trong lĩnh vực quản lý môi trường cần phát... (i) Các trình tự được chọn dựa ngân hàng gene nên có thể phải chỉnh sửa (ii) Mẫu dò ngắn làm giảm độ nhạy và tính đặc hiệu (iii) Không thể so sánh đồng thời sự biểu hiện gene của hai mẫu thí nghiệm liên quan trên cùng một mảng [21; 23] ▲Hình 15: Sơ đồ nguyên lý hệ thống MM/PM [Theo 14] 3 Các vấn đề tồn tại trong kỹ thuật DNA array khi áp dụng trong lĩnh vực môi trường 3 Các vấn đề tồn tại trong kỹ thuật. .. 1: Các ứng dụng nổi bất nhất của microarray trong xác định vi sinh vật Bên cạnh việc xác định vi khuẩn, DNA array còn có tác dụng đánh giá phân bố gene chức năng trong môi trường tự nhiên Gene mã hoá các enzyme chức năng trong chu trình sinh địa hoá học (như C, S, N, các kim loại) là dấu hiệu rất hữu ích để giám sát trạng thái sinh lý và hoạt tính chức năng của các quần thể và quần xã vi sinh vật trong. .. đặc hiệu cao [88] Trong một ví dụ thú vị khác, Gao và cộng sự (2003) đã sử dụng peptide array để xác định các phối tử gắn chọn lọc với muối Pb(II), mở ra hướng sử dụng peptide array làm điện cực kiểm soát các kim loại độc trong môi trường [86] 2.4 Glycan array Với trên 50% protein mang các chuỗi glycan (olygosaccharide), glycomics và proteomics cùng nổi lên với vai trò là hai lĩnh vực nghiên cứu phát... lý môi trường [80] 2.2 Nanowire array Một trong những vấn đề rất quan trọng trong lĩnh vực quản lý môi trường là cần phát hiện nhanh, nhạy và có chọn lọc các loại virus gây bệnh Các dây nano silicon được tổng hợp và gắn trên bề mặt giá thể silicon bằng phương pháp in quang hoạt Sau đó gắn cộng hoá trị các thụ thể kháng thể trên dây nano bằng xử lý hoá học Mẫu virus được phân phối tới thiết bị qua các 123doc.vn

Ngày đăng: 20/03/2013, 14:41

Hình ảnh liên quan

▲Hình 1: Sơ đồ thực hiện kỹ thuật microarray. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 1.

Sơ đồ thực hiện kỹ thuật microarray Xem tại trang 4 của tài liệu.
▲Hình 3: Sản xuất DNA array sử dụng micro-contact printing [Theo 7]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 3.

Sản xuất DNA array sử dụng micro-contact printing [Theo 7] Xem tại trang 5 của tài liệu.
▲Hình 2: Sản xuất DNA microarray sử dụng contact tip deposition printing [Theo 7]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 2.

Sản xuất DNA microarray sử dụng contact tip deposition printing [Theo 7] Xem tại trang 5 của tài liệu.
▲Hình 5: In mạ [Theo 7]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 5.

In mạ [Theo 7] Xem tại trang 6 của tài liệu.
▲Hình 4: Sản xuất mảng bằng kỹ thuật µFN [Theo 7]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 4.

Sản xuất mảng bằng kỹ thuật µFN [Theo 7] Xem tại trang 6 của tài liệu.
▲Hình 6: Sơ đồ chip electric silicon. (A) Sơ đồ chip có 25 điện cực platin, chiều dài mỗi cạnh 1 cm - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 6.

Sơ đồ chip electric silicon. (A) Sơ đồ chip có 25 điện cực platin, chiều dài mỗi cạnh 1 cm Xem tại trang 7 của tài liệu.
▲Hình 7: Sơ đồ phương pháp in quang hoạt [Theo 16]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 7.

Sơ đồ phương pháp in quang hoạt [Theo 16] Xem tại trang 8 của tài liệu.
▲Hình 8: Sơ đồ ống phun áp điện. Đơn vị sử dụng trong hình.|U|: giá trị tuyệt đối của điện áp [Theo 7] - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 8.

Sơ đồ ống phun áp điện. Đơn vị sử dụng trong hình.|U|: giá trị tuyệt đối của điện áp [Theo 7] Xem tại trang 9 của tài liệu.
▲Hình 9: Tổng hợp oligonucleotide in situ sử dụng ống phân phối áp điện. Thủ tục nhiều ống phun - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 9.

Tổng hợp oligonucleotide in situ sử dụng ống phân phối áp điện. Thủ tục nhiều ống phun Xem tại trang 9 của tài liệu.
▲Hình 10: Sơ đồ nguyên lý của kỹ thuật in vi lỏng [Theo 7]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 10.

Sơ đồ nguyên lý của kỹ thuật in vi lỏng [Theo 7] Xem tại trang 10 của tài liệu.
▲Hình 12: Hiệu quả lai khác nhau tạo ra các tín hiệu màu khác nhau trên mảng. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 12.

Hiệu quả lai khác nhau tạo ra các tín hiệu màu khác nhau trên mảng Xem tại trang 11 của tài liệu.
▲Hình 11: Sơ đồ đánh dấu mẫu dò dùng Cy3/Cy5 [Theo Yu et al., 2002]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 11.

Sơ đồ đánh dấu mẫu dò dùng Cy3/Cy5 [Theo Yu et al., 2002] Xem tại trang 11 của tài liệu.
▲Hình 13: Thủ tục lai sử dụng mẫu dò cDNA. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 13.

Thủ tục lai sử dụng mẫu dò cDNA Xem tại trang 12 của tài liệu.
▲Hình 14: Thủ tục lai dùng mẫu dò tổng hợp in situ. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 14.

Thủ tục lai dùng mẫu dò tổng hợp in situ Xem tại trang 13 của tài liệu.
▲Hình 15: Sơ đồ nguyên lý hệ thống MM/PM [Theo 14]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 15.

Sơ đồ nguyên lý hệ thống MM/PM [Theo 14] Xem tại trang 14 của tài liệu.
Bảng 2: Ứng dụng microarray để xác định các tập hợp gene chức năng trong môi trường. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Bảng 2.

Ứng dụng microarray để xác định các tập hợp gene chức năng trong môi trường Xem tại trang 18 của tài liệu.
▲Hình 16: Phương pháp ứng dụng mẫu dò phát hiện chaperone [Theo 6]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 16.

Phương pháp ứng dụng mẫu dò phát hiện chaperone [Theo 6] Xem tại trang 20 của tài liệu.
▲Hình 17: Sơ đồ chế tạo Flow-ThruChipTM [http://www.infineon.com]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 17.

Sơ đồ chế tạo Flow-ThruChipTM [http://www.infineon.com] Xem tại trang 21 của tài liệu.
▲Hình 18: Sơ đồ MAGIChip [Theo 72] - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 18.

Sơ đồ MAGIChip [Theo 72] Xem tại trang 22 của tài liệu.
▲Hình 19: Sơ đồ chip răng lược [Theo 74]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 19.

Sơ đồ chip răng lược [Theo 74] Xem tại trang 23 của tài liệu.
◄Hình 20: Cấu trúc phân tử PNA. Ở đó nhóm phosphate và liên kết phospho-diester của DNA được thay bằng nhóm N-(2-amino-ethyl)-glycine và liên kết amide - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 20.

Cấu trúc phân tử PNA. Ở đó nhóm phosphate và liên kết phospho-diester của DNA được thay bằng nhóm N-(2-amino-ethyl)-glycine và liên kết amide Xem tại trang 24 của tài liệu.
►Hình 21: Sơ đồ thiết bị mảng dây nano dùng để phát hiện các virus đơn lẻ. Bên trái là sơ đồ thiết bị gồm 2 dây nano - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 21.

Sơ đồ thiết bị mảng dây nano dùng để phát hiện các virus đơn lẻ. Bên trái là sơ đồ thiết bị gồm 2 dây nano Xem tại trang 25 của tài liệu.
▲Hình 22: Sơ đồ nguyên lý peptide array [Theo [87]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 22.

Sơ đồ nguyên lý peptide array [Theo [87] Xem tại trang 26 của tài liệu.
▲Hình 23: Sơ đồ quá trình chế tạo và sử dụng glycan array [Theo 89]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 23.

Sơ đồ quá trình chế tạo và sử dụng glycan array [Theo 89] Xem tại trang 28 của tài liệu.
▲Hình 25: Gắn protein lên giá thể [Theo 11]. - Ứng dụng các kỹ thuật array trong lĩnh vực môi trường

Hình 25.

Gắn protein lên giá thể [Theo 11] Xem tại trang 30 của tài liệu.

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan