HÓA HỌC ACID NUCLEIC VÀ ACID NUCLEIC BS. HOÀNG HIẾU NGỌC BỘ MÔN SINH HÓA 9/26/2010 1 9/26/2010 2 1. Acid phosphoric 2. Pentose 3. Base nitơ (nitrogenous base) 9/26/2010 3 THÀNH PHẦN HÓA HỌC CỦA NUCLEOTID VÀ ACID NUCLEIC THÀNH PHẦN HÓA HỌC CỦA NUCLEOTID VÀ ACID NUCLEIC 9/26/2010 4 1. Acid phosphoric 9/26/2010 5 2. Đường pentose THÀNH PHẦN HÓA HỌC CỦA NUCLEOTID VÀ ACID NUCLEIC 9/26/2010 6 3. Base nitơ THÀNH PHẦN HÓA HỌC CỦA NUCLEOTID VÀ ACID NUCLEIC Tính chất vật lý – hóa học của base purin và pyrimidine • Tính đồng phân: enol (lactim) và ceton (lactam) • Tính hòa tan: Ở pH trung hòa, guanin ít hòa tan nhất 9/26/2010 7 Các base hiếm • Tỉ lệ thấp • Dẫn xuất của base lượng nhiều • Dạng methyl hóa, acetyl hóa, hydroxymethyl hóa • Vai trò điều hòa và bảo vệ thông tin di truyền. 9/26/2010 8 • N6, N6 – dimethyladenin • N7 – methylguanin • 5 – methylcytosin • 5 – hydroxy – methylcytosin • 5,6 - dihydrouracil So sánh thành phần hóa học giữa DNA và RNA Thành phần cấu tạo DNA RNA Base purin ADENIN (A) ADENIN (A) GUANIN (G) GUANIN (G) Base pyrimidine CYTOSIN (C) CYTOSIN (C) THYMIN (T) URACIL (U) Đường pentose Deoxyribose Ribose Acid phosphoric H 3 PO 4 H 3 PO 4 9/26/2010 9 NUCLEOSID VÀ NUCLEOTID HÓA HỌC ACID NUCLEIC VÀ ACID NUCLEIC 9/26/2010 10 [...]... của guanosin • GDP và GTP – Oxy hóa acid α – ketoglutaric thành acid succinic – GTP cần cho sự hoạt hóa adenyl cyclase – GTP: NL cần cho sự tổng hợp protein của ribosome – cGMP: tín hiệu nội tế bào hay chất truyền tin thứ 2 9/26/2010 20 9/26/2010 21 Các dẫn xuất khác • UTP, UDP: coenzym trong chuyển hóa glucid, hợp chất giàu NL • CTP, CDP: hợp chất giàu NL 9/26/2010 22 Acid deoxyribonucleic DNA 9/26/2010... không hoàn toàn của acid nucleic • Dễ bị thủy phân bởi nucleosidase • Gồm: base nitơ và pentose • -N-glycosid (C1’ pentose và N9 của base purin/N1 của pyrimidine) • (base): purin – nucleosid/pyrimidin – nucleosid • (pentose): ribonucleosid / deoxyribosenucleosid 9/26/2010 11 Liên kết glycoside giữa base nitơ và đường pentose -N-glycosid 9/26/2010 12 Liên kết glycoside giữa base nitơ và đường pentose... kết chính gồm đường pentose và gốc phosphat • Ưa nước • Các gốc OH của đường đều hình thành liên kết hydrogen với phân tử nước • Nhóm phosphat tích điện âm ở pH 7 9/26/2010 26 Đặc tính của base nitơ ảnh hưởng lên cấu trúc 3 chiều của acid nucleic • Purin và pyrimidine tự do là base yếu • Có đặc tính liên hợp cao  cấu trúc, phân bố ion, hấp thụ ánh sáng UV (260 nm) của acid nucleic • Cộng hưởng giữa... của base nitơ ảnh hưởng lên cấu trúc 3 chiều của acid nucleic • • • • Pyrimidine là phân tử có cấu trúc phẳng Purin thì hơi phẳng vì có 1 chút gấp khúc Base kị nước nên khó tan ở pH 7 tế bào Tăng, giảm pH thì acid nucleic tan trong nước dễ hơn 9/26/2010 28 Tương tác kị nước xếp chồng (hydrophobic stacking interaction) • Các base trong cấu trúc acid nucleic xếp chồng lên nhau như xếp chồng các đồng... interaction) • Các base trong cấu trúc acid nucleic xếp chồng lên nhau như xếp chồng các đồng xu • Các chồng base liên quan đến tương tác Van der Waals và tương tác lưỡng cực giữa các base • Xếp chồng  ít tiếp xúc với nước và ổn định cấu trúc 3 chiều của acid nucleic 9/26/2010 29 Các lực liên kết giúp hình thành DNA xoắn đôi • Trục liên kết phosphat • Tương tác xếp chồng (stacking interaction) • Tương tác... nóng chảy (Tm): nhiệt độ mà ở đó một nửa lượng DNA bị tách rời – Phương trình Marmur-Doty về tương quan nhiệt độ chảy và hàm lượng G, C và muối Tm=41.1 XG+C + 16.6 log[Na+] + 81.5 – G, C, muối cao thì Tm càng cao 9/26/2010 http://www.siumed.edu/~bbartholomew/course_material /nucleic_ acids.html 33 Rãnh lớn – rãnh nhỏ Rộng 12Ao Rộng 22Ao  vị trí gắn của các protein điều hòa bằng các liên kết hydro để... 9/26/2010 15 NHỮNG NUCLEOTID TRONG TỰ NHIÊN • Dự trữ và vận chuyển năng lượng sinh học • Coenzym: – NAD+: nicotinamid adenin dinucleotid – NADP+: nicotinamid adenin dinucleotid phosphat – FAD+: flavin adenin dinucleotid • Yếu tố truyền thông tin nội bào 9/26/2010 16 Dẫn xuất của Adenosin • Adenosin diphosphat (ADP) • Adenosin triphosphat (ATP) – ATP-ADP: tích trữ và vận chuyển năng lượng – ATP: nguồn NL chính... phân cực • Liên kết hydro: duy trì khoảng cách giữa hai trục đường phosphat • Liên kết ion: muối giúp ổn định cấu trúc duplex của DNA 9/26/2010 http://www.siumed.edu/~bbartholomew/course_material /nucleic_ acids.html 30 DNA • Gồm 2 chuỗi polynucleotid xoắn đôi theo hướng ngược chiều nhau • Đầu 5’: thiếu 1 nucleotid ở vị trí 5’ • Đầu 3’ : thiếu 1 nucleotid ở vị trí 3’ 9/26/2010 31 Sự biến tính DNA 9/26/2010 . NUCLEOTID VÀ ACID NUCLEIC THÀNH PHẦN HÓA HỌC CỦA NUCLEOTID VÀ ACID NUCLEIC 9/26/2010 4 1. Acid phosphoric 9/26/2010 5 2. Đường pentose THÀNH PHẦN HÓA HỌC CỦA NUCLEOTID VÀ ACID NUCLEIC 9/26/2010. HÓA HỌC ACID NUCLEIC VÀ ACID NUCLEIC BS. HOÀNG HIẾU NGỌC BỘ MÔN SINH HÓA 9/26/2010 1 9/26/2010 2 1. Acid phosphoric 2. Pentose 3. Base nitơ (nitrogenous base) 9/26/2010 3 THÀNH PHẦN HÓA HỌC. pentose Deoxyribose Ribose Acid phosphoric H 3 PO 4 H 3 PO 4 9/26/2010 9 NUCLEOSID VÀ NUCLEOTID HÓA HỌC ACID NUCLEIC VÀ ACID NUCLEIC 9/26/2010 10 Nucleoside • Sản phẩm thủy phân không hoàn toàn của acid nucleic.