Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

33 683 0
Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

1 nh tên mt s loài thuc chi tre (Bambusa Schreb.) do bii hình thái  Vit Nam bng k thut phân tích AND Nguyn Th Thúy Hng i hc Khoa hc T nhiên Luchuyên ngành: Di truyn hc; Mã s: 60 42 70 ng dn:  Phòng o v: 2012 Abstract: Nghiên cu dng bii hình thái gia các mu trong loài có phi là ca cùng mt loài tre Bng pht hoc tre Vàng sc ho Bng pht và tre Vàng sc có ph           ventricosa) có phi là s bin danh ca loài Hóp nh (B. tuldoides) hay không ? Gii trình t nucleotide 01 vùng gen nhân (PIF) và 03 vùng gen lc lp (trnL-trnF, psbA-trnH và matK) cho 19 mu ca ba loài tre Bng pht (Bambusa vulgaris Schr. cv Wamin McClure), tre Vàng sc (Bambusa vulgaris Schr. ex Wendland. cv sa McClure )        Vit Nam. Keywords: Sinh hc; Di truyn hc; Phân loi thc vt; ADN Content MỞ ĐẦU T  i nay cây trehình nh rt quen thuc trong tâm trí c i Vit Nam. Tre có mt hu khp các nc và gn bó vi cng dân tc Vit c bit trong tâm thi Vit, cây tre chim v trí sâu sc và lâu b và ng ci Vit Nam. Tre là loi cây d trng nhanh, sm khai thác, d ch bin và có nhic tính phù hp vi các m dng khác nhau. Tre trúc phân b  nhiu châu lc, tr     ng loài nhiu nht vi 65 chi và 900 loài. Vit Nam nm  vùng nhii châu Á, vi 25 chi và 216 loài tBambusa Schreb.) có 67 loài [51], có th nói tre  Vit Nam rt 2 ng. Nhng nghiên cu v c bu t c phân loi nh loi tên loài cho chi tre vng nht gia các tác gi  áp dng ch yu da trên  . Tuy nhiên i mu vt ph m phân loc bin mà i vi tre thì các mu vt ch ng, hu hm v sinh sn (hoa và qu) vì chu k ra hoa ti vài ch, nng ch mt ln ri cht vì vy vic phân loi ba, trong mt s ng hp   i bng hình thái khó thc hin hoc d b nhm ln do mu không còn nguyên vn hoc b bii trong nhu kin sinh thái khác nhau. Hai loài tre Bng pht (Bambusa vulgaris Schr.cv Wamin McClure) và tre Vàng sc (Bambusa vulgaris Schr. ex Wendland.cv Vittata McClure) có chung tên khoa hc là Bambusa vulgaris [15], bi s gin  nhi th trng khác nhau nên gia hai loài có mt s u cao thân khí sinh (13-i vi tre Vàng sc, 4  i vi tre Bng pht) dài lóng thân (tre Vàng sc dài 20  30 cm, tre Bng pht dài 4  10 cm), tre Bng pht có dng lóng phng, lóng thng và lóng phng thi phng, ½ thân phía trên thng), còn tre Vàng sc thì ch có dng lóng thu. Theo các tác gi Nguyn Khc Khôi (2007), Nguy [15, 51] ng ý các dng này ch là bin th ca mt loài da trên mt s n thiu tính xác thc vì không có  i v71), Nguyn Hoàng  [16, 51] cho rc là Bambusa ventricosa McClure n Khc Khôi (2007), V0), Dransfield và Widjaja (1995) [15, 4, 34] cho r bin danh ca loài Bambusa tuldoides (tên Vit Nam là Hóp nh  Vit Nam mà ngay c trên th gii. Vì vy vinh loi tên loàichi tre vn còn rt nan gii, cn có s h tr ca k thut phân tích ADN. i hc phân t (Molecular taxonomy)   loi ch yu da trên các k thung kt qu khá chính xác, giúp cho vic phát hin loài mi, gii quyt các mi nghi ng v v trí phân lo  v ng di truyn, chng loi phát sinh và s tin hóa ca nhing vt, thc vt và vi sinh vt. So vi ch th hình thái thì ch th  chính xác cao mà không l thuc vào các yu t   i vi thc vt, hai nhóm gen chính 3 c s dng là vùng gen nhân và h gen lc lp (cpADN) là nhng gen rt bao th trong tin hóa. Hi d li gi 16542 trình t nucleotide cho phân loi H ph tre (Bambuso ideae trình t nucleotide cho chi Bambusa Schreb. trong s này rt nhi  Vit n d liu có giá tr  chúng ta có th khai thác và ng dng cho nghiên cn nay,  Vit Nam có khá nhiu công trình công b v hiu qu ca vic gii trình t mt s vùng gen giúp cho vinh loi tên loài  nhing sinh vt [12, 22, i vi các loài tre mi ch có Nguyn Minh Tâm (2006) [21]  dng mt s ch th  nhn dng cho hai loài tre ca Vit Nam. Mc dù các kt qu thu nhc nhi  ng d phn làm sáng t tên khoa hc cho mt s loài thuc chi tre (Bambusa Schreb.) do có s bii hình thái  Vit Nam. Xut phát t  trên, chúng tôi tin hành nghiên c tài: “Xác định tên một số loài thuộc chi tre (Bambusa Schreb.) do biến đổi hình thái Việt Nam bằng kỹ thuật phân tích ADN”. Vi các mc tiêu và ni dung nghiên cu sau: - Gii trình t nucleotide 01 vùng gen nhân (PIF) và 03 vùng gen lc lp (trnL- trnF, psbA-trnH và matK) cho 19 mu ca ba loài tre Bng pht (Bambusa vulgaris Schr. cv Wamin McClure), tre Vàng sc (Bambusa vulgaris Schr. ex Wendland. cv Vittata  Bambusa ventricosa McClure ) có          Vit Nam. - Các dng bii hình thái gia các mu trong loài có phi là ca cùng mt loài tre Bng pht hoc tre Vàng sc ho không ? - Tre Bng pht và tre Vàng sc có phi là cùng loài B. vulgaris ? -    B. ventricosa) có phi là s bin danh ca loài Hóp nh (B. tuldoides) hay không ? 4 CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1. Giới thiệu tổng quát về một số loài thuộc chi tre (Bambusa Schreb.) 1.1.1. Vị trí phân loại của chi Bambusa Schreb. c phân b rng rãi trên nhiu vùng  c ta. Tre rt quen thuc i vi i Vic s dng rt nhiu trong tt c i sp, công nghi p, th công m nghi c n, tre thuc: Gii (regnum) : Plantae Ngành (division) : Magnoliophyta Lp (classic) : Liliopsida B (ordo) : Poales H (familia) : Poaceae Chi ( genus) : Bambusa Schreb. 1.1.2. Một số đặc điểm sinh học chính và giá trị sử dụng một số loài tre 1.1.2.1. Tre Bụng phật Tên khoa hc: Bambusa vulgaris Schr.cv Wamin McClure Tên khác: Bambusa wanin Camus Thân ngm: mc c 20cm. Thân khí sinh: cao 4  6m Mo thân: b mo hình thang, mt ngoài ph lông mm, màu hung. Lá: Phin lá i mác hay ngn giáo, dài 24  26,5cm, rng 2,2  3cm Phân b: Nhic và th gii. Giá trp, lóng có hình dc bit, thân có th un thành các hình dng con vt và to cnh theo ý mun. Vì v c trng làm cnh trong công n nhà.  th công m ngh. A B C 5 Hình 1.1. Loài tre Bng pht dng lóng thng (Bambusa vulgaris) s hiu K.3005 (A: n thân; B: lá và C: mo) Hình 1.2. Loài tre Bng pht dng lóng phng (Bambusa vulgaris) s hiu K.3005 (A: n thân; B: lá và C: mo) 1.1.2.2. Tre Vàng sọc Tên khoa hc: Bambusa vulgaris Schr. ex Wendland. cvVittata McClure (1961) Thân ngm: Mc c 30cm. Thân khí sinh: Cao 8  ng kính 8  12cm. Mo thân: B mo hình thang, khi non màu lc c dc màu vàng, mt c dày lông gai màu nâu thm, d rng. Lá: Phii mác hay ngn giáo, dài 22  30cm, rng 2,3  3,6cm Phân b: Hu hu trng. Loài nhp ni. Giá tr: Cây trng làm cnh vì thân nhc dc màu xanh  các lóng rc nhing trn nhà, chu cnh. Thân có th un to dáng rt có giá tr, ngoài ra còn làm mt s công dng trong xây dng nhà ca. u nht là tháng 5, 6. Tre Vàng sc là mt th trng (cultivar) ca tre M [15]. Do hình thái d bii ng sng nên tre M o thành nhiu th trng tr tre Vàng sc, tre Bng ph khoa hc ca hin gc chng minh vng chc. C  vn có c 3 dng khác nhau). A B C A B C 6 Hình 1.3. Loài tre Vàng sc (Bambusa vulgaris) s hin thân; B: lá và C: mo) 1.1.2.3. Tre Đùi gà Tên khoa hc: Bambusa ventricosa McClure Thân ngm: Mc cc. Thân khí sinh: Khi mc trong t nhiên cao 9  ng kính 4  6,2cm Mo thân: B mo hình thang. Tai mo phát trin, mép ph lông dài 2mm. Lá: Phin lá hình trng hay ngn giáo, dài 22  24cm, rng 2,1  2,7cm Phân b: Mc t nhiên  Qung Ninh (Móng Cái), L Trng  Phú Th i (Ba Vì). Trên th gii: phân b  vùng nam Trung Quc. Giá tr: Cây trng làm cp vì có lng trng trong công n nhà, chu cây Thân còn dùng làm gy chng. Loài rt him gp trong t   ng trt. Khi trng làm cnh ng có 2 loi thân trong mt bi cây: Mt loi thân có lóng phi gà  phía i (1/4 thân), phía trên có lóng thng (3/4 thân) và mt loi thân có lóng thu trên toàn b chiu cao. T l loi lóng thng ti 70  80% trong mt bi, lo 20  30%. Trong t nhiên cây to cao và hoàn toàn ch có cây mang lóng thu, có th cùng loài vi Hóp nh (Bambusa tuldoides) [15]. Hình 1.4. ng lóng thng (Bambusa ventricosa) s hin thân; B: lá và C: mo) A B C 7 Hình 1.5.    ng lóng phng (Bambusa ventricosa) s hiu K.3006 (A: n thân; B: lá và C: mo) 1.1.3. Sự biến đổi hình thái do điều kiện sống của ba loài tre nghiên cứu Tre Bng pht và tre Vàng sc cùng có tên khoa hc là Bambusa vulgaris [15] có mt s m ging nhau m mc cng kính 4  c lá 22  30cm x 2,2  t có mt cành chính và mt s cành nh 1,7cm). Mt s m gn gi thân (hình dc ). Mt s c m phân bit nhau gia chúng là chiu cao thân khí sinh: tre Vàng su (8  15m) so vi tre Bng pht (4  6 dài lóng thân: tre Vàng su ln (20  30cm) so vi tre Bng pht  lóng phng (4  10cm). Lóng tre Vàng sc thnu; lóng tre Bng pht phình to và ngn (tr na phía trên thân và nhng thân cây lóng thng hoàn toàn). Ngoài ra, nhng chi tit khác có th ging và khác nhau không nhic ca b mo, phii mo, b m v lông, màu sc ). Theo các tác gi Nguyn Khc Khôi (2007), Nguy  [15, 51] u ng ý các dng này ch là bin th ca mt loài da trên mt s m hình thái,  vn thiu tính xác thn có kt qu phân tích ADN  làm sáng t. Hóp nh (Bambusa tuldoidesBambusa ventricosa) dng lóng phng có mt s m hình thái gim mc cng kính thân (3   dài lóng (28  33cm, tr lóng  sát gc cu  cc lá (Hóp nh 10  18cm x 1,8  2cm;  24cm x 2,1  2,7cm). Phân bin ci Hóp nh là có các lóng phía gc thân phng lên dng phía trên. Nh lá, phin lá, tai lá, thìa lìa coàn khác nhau nhiu.  nhng thân  A B C 8 gà có c 2 d bi toàn thân có lóng không phng, chi  Hóp nhc t u lóng thng và có l gi nh [15]. Theo Nguyn Kh     ), S.Drasfield và E.A. Widjaja (1995), But & Chia (1995), Ohrnberger (1999) [15, 4, 35, 32, 52] cho rng B. ventricosa Mc Clure (1938) (  ) là s bin danh ca loài B. tuldoides Munro (1868) (Hóp nh) bi s ging nhau  nhi  trng m khác nhau u kin trng trt. Trái li, mt s tác gi  McClure (1938), Lê Nguyên (1971), Nguy [46, 16, 51] vc lp nhau. Vì không có hoa qu  nh nên có th còn nghi vn chúng cùng loài hay không. C nh d phng và thân thi Hóp nh v mt phân loi. 1.1.4. Tình hình phân bố tre trên thế giới và Việt Nam 1.1.4.1. Trên thế giới Bảng 1. 1. Phân b ca các loài tre trúc trên th gii [54] N ƣ ớc Số chi Số loài Diện tích (ha) (ha) Nƣớc-Vùng lãnh thổ thổ Số chi Số loài Diện tích (ha) (ha) Trung Quc 26 300 2.900.000 Singapore 6 23 Nht Bn 13 237 825.000  8 20 6.000.000  23 125 9.600.000 Papua New Guinea 26 Vit Nam 16 92* 1.942.000 Srilanka 7 14 Myanma 20 90 2.200.000 Hàn Quc 10 13 Indonexia 10 65 50.000  40 140.000 Phillipnines 8 54 Madagaxca 11 40 Malaysia 7 44 Châu M 20 45 Thai Lan 12 41 1.000.000 Ôxtralia 4 4 Ghi chú *: Nay khong hn 200 loài 1.1.4.2. Việt Nam c nm  trong vùng nhii gió mùa châu Á, Vit Nam có mt h thc vt rng  Vit Nam có th gp tre t  cao ngang m c bin  các làng xóm thuc vùng Tây Nam Bo thuc Vnh H Long  cao g [33, 44]. Theo Biswas (1995) [31] thì Vit Nam có khong 92 loài tre trúc ca 16 chi (Bng 1.1). Nhng nghiên cu gn y s ng loài tre trúc phân b  Vit Nam lt nhiu. Theo Lê Vit 9 Lâm (2005) [42] thì Vit Nam có trên 140 loài ca 29 chi và có th còn tìm thy các loài mt qu nghiên cu v phân loi tre trúc  Vit Nam kt hp vi mt s nghiên cu, kho sát  th ca 216 loài thuc 25 chi tre trúc phân b t nhiên  Vit Nam [51]. Bảng 1.2. Hin trng tre trúc Vit Nam tính ti tháng 12/2004 [2] Các loại rừng tre trúc Din tích (ha) Phân chia theo chức năng (ha) Rừng đặc chủng Rừng phòng hộ Rừng sản xuất Rng tre trúc t nhiên thun loài 799.130 82.409 343.035 373.686 Rng tre trúc t nhiên hn loài 682.642 113.850 319.266 249.526 Rng tre trúc trng 81.484 285 10.186 71.013 Tng cng 1.563.256 196.544 672.487 694.225 1.2. Giới thiệu một số phƣơng pháp phân loại thực vật 1.2.1. Phƣơng pháp hình thái học (phân loại học truyền thống) 1.2.2. Phƣơng pháp giải phẫu so sánh 1.2.3. Phƣơng pháp hoá học 1.2.4. Phƣơng pháp phân loại phân tử Phân loi hc phân t i s dng s khác bit các cu trúc phân t  c các thông tin v mi quan h tin hóa gia các loài. Các bii phân t u so vi bii hình thái, vì vt cht di truyn ADN ch cu thành t 4 loi nucleotide (adenine, guanine, thymine và cytosine). Mt khác các bii phân t ít b ng bu king. Vì v ln nht ca phân loi hc phân t là có th phân bing v [30, 53]. 1.3. Một số thành tựu nghiên cứu về phân loại học phân tử Ngoài nƣớc Tre trúc là loc trng ph bin  Trung Quc, Nht Bn, Vit Nam  có nhiu công dng phc v i si nên rc quan tâm nghiên cu. Vì th n nay trong  d liu  khong 16.542 trình t nucleotide cho phân loi H ph tre (Bambusoideae    khong 607 trình t nucleotide cho chi Bambusa, trong s này rt nhi Vii vi thc 10 v  c s dng là gen nhân và h gen lc lp (cpADN). Chng hn, Sun và cng s (2005) [61]  dng trình t nucleotide ADN vùng ITS nhân  nghiên cu 21 loài tre thuc các chi Bambusa, Dendrocalamopsis, Dendrocalamus, Guadua, Leleba và Lingnania i quyc mi quan h di truyn ca mt s loài thuc chi Bambusa (B. subaequalis, B. multiplex, B. emeiensis, B. chungii, B. contracta, B. hainanensis, B. flexuosa, B. sinospinosa, B. tuldoides, B. surrecta, B. intermedia và B. valida), Yang và cng s (2008) [67]   dng trình t ADN vùng ITS và vùng trnL- nghiên cu ngun gc phát sinh chng loi ca 53 loài thuc phân h Bambusoideae. Kt qu nh mi quan h di truyn ca mt s chi khác vi chi Bambusa.    Goh và cng s [37]   nh trình t nucleotide vùng gen nhân GBSSI và bn vùng gen lc lp: rps16-trnQ; trnC-rpoB; trnH- psbA; trnD-T  nghiên cu mi quan h di truyn gia các loài tre (climbing bamboos)  i các loài trong chi Bambusa010, Zhou và cng s [68]  dng trình t ADN c làm rõ mi quan h di truyn các loài thuc phân h Bambusoideae. ng s [66]  trình t genome lc l ca hai loài tre là Dendrocalamus latiflorus và Bambusa oldhamii, vng là 139.350bp và 139.365bp. n d liu có giá tr  chúng ta có th khai thác ng dng cho nghiên cu chi này ca Vit Nam. Trong nƣớc Các nghiên cu v ng di truyn phc v công tác bo tng sinh hc và tái to nguc th gii quan tâm và phát tring này, các nhà nghiên cu trong nc tip cn. Gc ng dng các k thut sinh hc phân t trong nghiên cng di truyn, phân loi và nhn dng mu sinh vt  Vic nhiu kt qu có giá tri vi mt s ng, thc vt là nhóm nghiên cu ci [25 dùng gen ty th  nghiên cu ph h nh ADN mt s loài lan Hài, cây Bình vôi, gà Lôi, cá Bc má, cá Chim trng, cá H, cá Nc sò, cá S hin ra m tin hóa ca chúng. Hay nhóm tác gi cng Tt Th (2003 - s d phân tích s tin hóa phân t và phát sinh chng loi ca mt s loài thú, bò sát quý him ca Vit Nam [26]. Nhóm tác gi  Thu Hin (2009) [12]   dng vùng gen tRNA-  phân loi cho hai loài g quý thuc chi Dalbergia.i vi các loài tre, Vit Nam mi ch có tác gi Nguyn Minh [...]... (200 4), Phân tích gen ty thể giả voọc vá Việt Nam , Tạp chí Sinh học, 2( 1), tr 25-32 27 Đặng Tất Thế (200 5), Phân loại voọc (colobinae) Việt Nam trên cơ sở tiến hóa phân tử, Luận án tiến sĩ, Viện Sinh thái và tài nguyên sinh vật, Hà Nội 28 Viện Khoa học Lâm nghiệp Việt Nam (200 8), Báo cáo tóm tắt kết quả các nghiên cứu về tre trúc Việt Nam, Hà Nội 29 ́ TIÊNG ANH 29 Alvarez I, Wendel JF (200 3), ... Nxb khoa học và kỹ thuật, Hà Nội 2 Nguyễn Ngọc Bình, Phạm Đức Tuấn (200 7), Các loại rừng tre trúc chủ yếu Việt Nam NXB Nông nghiệp, Hà Nội 3 Lê Văn Cao (201 0), Ứng dụng kỹ thuật phân tích trình tự ADN để định loại một số loài cây gỗ quý thuộc chi trắc (Dalbergia), Khóa luận tốt nghiệp đại học, Trường Đại học Khoa học tự nhiên Hà Nội 4 Vũ Văn Dũng (200 0), “Bambusa”, Tên cây rừng Việt Nam, NXB Nông nghiệp,... Minh Tâm (200 6), Đa dạng di truyền của hai loài tre có giá trị kinh tế cao ở Việt Nam, Báo cáo tổng kết dự án hợp tác với Nhật (IPGRI), Hà Nội 22 Dương Văn Tăng (201 0), Ứng dụng phương pháp phân tích ADN góp phần vào việc phân loại một số loài gỗ quý thuộc chi Dalbergia của Việt Nam, Luận văn thạc sỹ sinh học, Viện Sinh thái và tài nguyên sinh vật, Hà Nội 23 Khuất Hữu Thanh (200 6), Kỹ thuật gen nguyên... nhỏ (B tuldoides) 26 KIẾN NGHỊ 1 Tre Vàng sọc và tre Bụng phật cùng thuộc loài Bambusa vulgaris Có thể thống nhất hai loài này bằng một tên Việt Nam chung 2 Tiế p tu ̣c sử du ̣ng các vùng gen khác để có thể khẳ ng đinh chắ c chắ n sự nghi ngờ giữa ̣ tre Bu ̣ng phâ ̣t với tre Vàng so ̣c , tre Đùi gà với loài Hóp nhỏ References TIẾNG VIỆT 1 Kiều Hữu Ảnh (200 7), Nguyên tắc phân loại... Cây cỏ miền Nam Việt Nam, Bộ giáo dục, trung tâm học liệu, Sài Gòn, ( 2), tr 844-869 10 Phạm Hoàng Hộ (199 3), “Bambusoideae”, Cây cỏ Việt Nam, ( 3), tr 742-774 27 11 Phạm Hoàng Hộ (200 0), “Bambusoideae”, Cây cỏ Việt Nam, NXB Trẻ, Tp Hồ Chí Minh, ( 3), tr 600-627 12 Vũ Thị Thu Hiền, Lưu Đàm Cư, Đinh Thị Phòng (200 9), Xác định trình tự đoạn gen tRNA –Leu cho hai loài D tonkinensis và D conchinchinensis phục... nhân (PIF) và 3094 nucleotide thuộc vùng gen lục lạp (gen matK, gen psbA-trnH và gen trnL-trnF) cho ba loài thuộc chi Bambusa là tre Bụng phật, tre Vàng sọc và tre Đùi gà Đây là những nghiên cứu phân tử đầu tiên cho ba loài thuộc chi Bambusa ở Việt Nam Phần lớn các vị trí nucleotide thu được có đỉnh huỳnh quang rõ nét, cường độ mạnh, nên kết quả đọc trình tự mang tính chính xác cao, mức độ sai sót thấp... mã hiệu trong ngân hàng GenBank: B vugaris (GU06309 7)) 3.6 Kết quả so sánh trình tự nucleotide giữa loài tre Đùi gà với loài B ventricosa và loài B tuldoides đã công bố trình tự trên Genbank Bảng 3.6 Mức độ tương đồng nucleotide phân tích với cặp mồi psbA3’f/trnH của loài tre Đùi gà với loài B ventricosa (mã số GU06307 4) TT 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Tên loài K3006/1 K3006/2 K3006/5 K3006/6 K3006/7 K3006/11... việc phân loại mẫu vật tại Bảo tàng Thiên nhiên Việt Nam , Tạp chí Công nghệ sinh học, ( 4), tr 471-477 13 Nguyễn Khắc Khôi, Nguyễn Thị Đỏ (200 5), “Bambusoideae”, Danh lục các loài thực vật Việt Nam, NXB Nông Nghiệp, Hà Nội, tr 750-773 14 Nguyễn Khắc Khôi (199 6), “Bambusoideae”, Sách đỏ Việt Nam, NXB Khoa học và Kỹ thuật, Hà Nội, tr 306-365 15 Nguyễn Khắc Khôi (200 7), “Bambusoideae”, Danh lục đỏ Việt Nam, ... trong cùng 1 loài tre giống nhau 100 % khi so sánh trình tự nucleotide Như vậy cho phép kết luận sự khác nhau về mặt hình thái giữa các dạng mẫu trong cùng một loài chỉdo sự biến thái theo điều kiện sống từng địa phương 3 Mức độ tương đồng nucleotide giữa tre Bụng phật, tre Vàng sọc và loài B vulgaris trên Genbank là 98,1 % đối với vùng gen trnL-trnF (khi so sánh với loài B vulgaris có mã số EF137524... giữa tre Bụng phật và tre Vàng sọc với tre Đùi gà thì tại vị trí nucleotide thứ 22, 438 và 441 (ACT) được thay bằng (CTA), tương ứng Tại vị trí 444, tre Đùi gà đã không có nucleotide (A) 3.3.2 Kết quả giải trình tự vùng psbA - trnH Trình tự vùng psbA - trnH được xác định bằng cặp mồi psbA3’f/trnHf thu được chi u dài 620 nucleotide đối với hai loài tre Bụng phật, tre Đùi gà và 615 nucleotide đối với loài . nghiên c tài: Xác định tên một số loài thuộc chi tre (Bambusa Schreb. ) do biến đổi hình thái ở Việt Nam bằng kỹ thuật phân tích ADN”. Vi các mc. 1 nh tên mt s loài thuc chi tre (Bambusa Schreb. ) do bii hình thái  Vit Nam bng k thut phân tích AND Nguyn Th Thúy

Ngày đăng: 10/02/2014, 20:55

Hình ảnh liên quan

Mo thân: bẹ mo hình thang, mặt ngoài phủ lông mềm, màu hung. - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

o.

thân: bẹ mo hình thang, mặt ngoài phủ lông mềm, màu hung Xem tại trang 4 của tài liệu.
Hình 1.1. Loài tre Bụng phật dạng lóng thẳng (Bambusa vulgaris) số hiệu K.3005 (A: đoạn thân; B: lá và C: mo)  - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Hình 1.1..

Loài tre Bụng phật dạng lóng thẳng (Bambusa vulgaris) số hiệu K.3005 (A: đoạn thân; B: lá và C: mo) Xem tại trang 5 của tài liệu.
Hình 1.2. Loài tre Bụng phật dạng lóng phồng (Bambusa vulgaris) số hiệu K.3005 (A: đoạn thân; B: lá và C: mo)  - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Hình 1.2..

Loài tre Bụng phật dạng lóng phồng (Bambusa vulgaris) số hiệu K.3005 (A: đoạn thân; B: lá và C: mo) Xem tại trang 5 của tài liệu.
Hình 1.3. Loài tre Vàng sọc (Bambusa vulgaris) số hiệu K.3011 (A: đoạn thân; B: lá và C: mo)   - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Hình 1.3..

Loài tre Vàng sọc (Bambusa vulgaris) số hiệu K.3011 (A: đoạn thân; B: lá và C: mo) Xem tại trang 6 của tài liệu.
Hình 1.5. Loài tre Đùi gà dạng lóng phồng (Bambusa ventricosa) số hiệu K.3006 (A: đoạn thân; B: lá và C: mo)   - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Hình 1.5..

Loài tre Đùi gà dạng lóng phồng (Bambusa ventricosa) số hiệu K.3006 (A: đoạn thân; B: lá và C: mo) Xem tại trang 7 của tài liệu.
(1868) (Hóp nhỏ) bởi sự giống nhau ở nhiều đặc điểm hình thái nhưng là các thứ trồng khác nhau nên hai loài cũng có những đặc điểm khác nhau do điều kiện trồng trọt - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

1868.

(Hóp nhỏ) bởi sự giống nhau ở nhiều đặc điểm hình thái nhưng là các thứ trồng khác nhau nên hai loài cũng có những đặc điểm khác nhau do điều kiện trồng trọt Xem tại trang 8 của tài liệu.
1.1.4. Tình hình phân bố tre trên thế giới và Việt Nam 1.1.4.1. Trên thế giới  - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

1.1.4..

Tình hình phân bố tre trên thế giới và Việt Nam 1.1.4.1. Trên thế giới Xem tại trang 8 của tài liệu.
Bảng 1.2. Hiện trạng tre trúc Việt Nam tính tới tháng 12/2004 [2] - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Bảng 1.2..

Hiện trạng tre trúc Việt Nam tính tới tháng 12/2004 [2] Xem tại trang 9 của tài liệu.
Hình 1.6. Hệ gen lục lạp của hoa Nhài Jasminum nudiflorum [45] - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Hình 1.6..

Hệ gen lục lạp của hoa Nhài Jasminum nudiflorum [45] Xem tại trang 11 của tài liệu.
Bảng 2.1. Nguồn gốc và ký hiệu mẫu của 3 loài sử dụng trong nghiên cứu - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Bảng 2.1..

Nguồn gốc và ký hiệu mẫu của 3 loài sử dụng trong nghiên cứu Xem tại trang 13 của tài liệu.
Bảng 2.2. Thông tin của bốn cặp mồi dùng trong nghiên cứu - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Bảng 2.2..

Thông tin của bốn cặp mồi dùng trong nghiên cứu Xem tại trang 14 của tài liệu.
2.2.3. Thiết bị và dụng cụ - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

2.2.3..

Thiết bị và dụng cụ Xem tại trang 14 của tài liệu.
Bảng 2.3. Pha đệm rửa (Washing buffer) - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Bảng 2.3..

Pha đệm rửa (Washing buffer) Xem tại trang 15 của tài liệu.
Hình 3.1. Kết quả kiểm tra ADN tổng số đại diện của một số mẫu tre trên gel agarose 0,9% (Giếng 1 – 6: tre Bụng phật; giếng 7 - 9: tre Vàng sọc; giếng 10-15: tre Đùi gà) - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Hình 3.1..

Kết quả kiểm tra ADN tổng số đại diện của một số mẫu tre trên gel agarose 0,9% (Giếng 1 – 6: tre Bụng phật; giếng 7 - 9: tre Vàng sọc; giếng 10-15: tre Đùi gà) Xem tại trang 17 của tài liệu.
Hình 3.2 là kết quả đại diện cho một số mẫu nghiên cứu của ba loài Bambusa, sản phẩm PCR có kích thước khoảng 450 bp (đúng như  kích thước lý thuyết  dự đoán) - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Hình 3.2.

là kết quả đại diện cho một số mẫu nghiên cứu của ba loài Bambusa, sản phẩm PCR có kích thước khoảng 450 bp (đúng như kích thước lý thuyết dự đoán) Xem tại trang 17 của tài liệu.
3.2.2. Kết quả nhân bản gen psbA-trnH - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

3.2.2..

Kết quả nhân bản gen psbA-trnH Xem tại trang 18 của tài liệu.
Hình 3.3. Sản phẩm PCR đại diện của một số mẫu tre phân tích với cặp mồi psbA3’f/trnH điện di trên  gel agarose 0,9% - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Hình 3.3..

Sản phẩm PCR đại diện của một số mẫu tre phân tích với cặp mồi psbA3’f/trnH điện di trên gel agarose 0,9% Xem tại trang 18 của tài liệu.
Hình 3.4. Sản phẩm PCR đại diện của một số mẫu tre phân tích với cặp mồi - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Hình 3.4..

Sản phẩm PCR đại diện của một số mẫu tre phân tích với cặp mồi Xem tại trang 19 của tài liệu.
thay thế nucleotide ở các vị trí 790, 821 và 822 (hình 3.9). So sánh giữa loài tre Đùi gà với tre Bụng phật và tre Vàng sọc thì tại vị trí nucleotide 790 (G) được thay bằng (A) - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

thay.

thế nucleotide ở các vị trí 790, 821 và 822 (hình 3.9). So sánh giữa loài tre Đùi gà với tre Bụng phật và tre Vàng sọc thì tại vị trí nucleotide 790 (G) được thay bằng (A) Xem tại trang 21 của tài liệu.
Bảng 3.2. Mức độ tương đồng nucleotide của loài tre Bụng phật và tre Đùi gà phân tích với 2 vùng gen trnL-trnF và psbA-trnH - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Bảng 3.2..

Mức độ tương đồng nucleotide của loài tre Bụng phật và tre Đùi gà phân tích với 2 vùng gen trnL-trnF và psbA-trnH Xem tại trang 22 của tài liệu.
Bảng 3.3. Mức độ tương đồng nucleotide của loài tre Bụng phật và tre Đùi gà phân tích với 2 vùng gen matK và PIF - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Bảng 3.3..

Mức độ tương đồng nucleotide của loài tre Bụng phật và tre Đùi gà phân tích với 2 vùng gen matK và PIF Xem tại trang 23 của tài liệu.
Bảng 3.4. Mức độ tương đồng nucleotide phân tích với cặp mồi trnLF/trnFR giữa loài tre Bụng phật, tre Vàng sọc và  loài B - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Bảng 3.4..

Mức độ tương đồng nucleotide phân tích với cặp mồi trnLF/trnFR giữa loài tre Bụng phật, tre Vàng sọc và loài B Xem tại trang 24 của tài liệu.
Bảng 3.5. Mức độ tương đồng nucleotide phân tích với cặp mồi psbA3’f/trnH giữa loài tre Bụng phật, tre Vàng sọc và  loài B - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Bảng 3.5..

Mức độ tương đồng nucleotide phân tích với cặp mồi psbA3’f/trnH giữa loài tre Bụng phật, tre Vàng sọc và loài B Xem tại trang 24 của tài liệu.
Hình 3.10. Mối quan hệ di truyền được xây dựng bằng phương pháp Neighbor-Joining giữa hai loài tre Bụng phật và tre Vàng sọc vơ ́ i loài Bambusa vulgaris trên ngân hàng Genbank phân tích  với vùng gen trnL-trnF (A) và vù ng gen  psbA-trnH (B) ( - Xác định tên một số loài thuộc chi tre (bambusa schreb ) do biến đổi hình thái ở việt nam bằng kỹ thuật phân tích AND

Hình 3.10..

Mối quan hệ di truyền được xây dựng bằng phương pháp Neighbor-Joining giữa hai loài tre Bụng phật và tre Vàng sọc vơ ́ i loài Bambusa vulgaris trên ngân hàng Genbank phân tích với vùng gen trnL-trnF (A) và vù ng gen psbA-trnH (B) ( Xem tại trang 25 của tài liệu.

Từ khóa liên quan

Tài liệu cùng người dùng

Tài liệu liên quan