PCR sequencing

pcr sequencing protocols

pcr sequencing protocols
... Purification of PCR Products from Agarose Gels for Direct Sequencing Frank C Brosius III, Lawrence B Holzman, and Xinan Cao Introduction The advent of direct sequencing of polymerase chain reaction (PCR) ... (e.g., 1-4) Many of these protocols are described in detail in this volume An unrelated, but equally frustrating obstacleto the sequencing of PCR products ariseswhen multiple PCR products are obtained ... phenol-chloroform extraction, the products are ready for DNA sequencing using either of the PCR oligonucleotides as a sequencing primer A few PCR products cannot be sequencedby this method, but can...
  • 218
  • 91
  • 0

Báo cáo khoa học: " Identification and prevalence of Ehrlichia chaffeensis infection in Haemaphysalis longicornis ticks from Korea by PCR, sequencing and phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene" docx

Báo cáo khoa học:
... predominant species of tick and often found in association with humans and animals in Korea [18] The prevalence of E chaffeensis infection in 4.3% ticks observed in this study indicate that H longicornis ... study showing the genetic analysis of E chaffenesis in H longicornis ticks collected in Korea Our findings suggests that E chaffeensis may be widespread among H longicornis ticks in Korea More ... species-specific (E chaffeensis) PCR based on amplification of 16S rRNA gene fragments In all, 611 (47.4%) ticks tested positive for genus-specific amplification of 116 bp fragment of 16S rRNA of Ehrlichia...
  • 5
  • 90
  • 0

Analysis, sequencing and in vitro expression of PCR products

Analysis, sequencing and in vitro expression of PCR products
... numbers of samples are involved (Section 5.4) Analysis, sequencing and in vitro expression of PCR products 93 5.4 Direct DNA sequencing of PCR products Once a PCR product has been cloned into a ... primer in excess continues to allow linear accumulation of one strand of DNA suitable for subsequent DNA sequencing Analysis, sequencing and in vitro expression of PCR products 99 Template DNA PCR ... radioactive Analysis, sequencing and in vitro expression of PCR products 101 or fluorescent detection A standard procedure is used for all templates in cycle sequencing and is superior to other PCR sequencing...
  • 24
  • 116
  • 0

Báo cáo sinh học: " A general method for nested RT-PCR amplification and sequencing the complete HCV genotype 1 open reading frame" potx

Báo cáo sinh học:
... amplicon Table (see additional file 1: HCVMethodPaperTable1.xls) and Table (see additional file 2: HCVMethodPaperTable2.xls) list amplification and sequencing primers for genotypes 1a and 1b Table ... in the same set Primer "A1 L3. 2" is a sequencing primer for genotype 1a, amplicon 1, of sense polarity, "3 " indicates it is the third sequencing primer for the strand, and the final "2 " indicates ... designed The AP suffix stands for "amplification primer" and indicates the primer is suitable for PCR, and the final "3 " means it is the innermost primer compared to the other PCR primers for the amplicon...
  • 9
  • 122
  • 0

báo cáo hóa học:" A general method for nested RT-PCR amplification and sequencing the complete HCV genotype 1 open reading frame" pdf

báo cáo hóa học:
... amplicon Table (see additional file 1: HCVMethodPaperTable1.xls) and Table (see additional file 2: HCVMethodPaperTable2.xls) list amplification and sequencing primers for genotypes 1a and 1b Table ... 7: Amplification efficiency for patients' amplicons Genotype 1a Amplicon Amplification efficiency Average efficiency A1 9 5a A2 A3 98 93 96.2 A4 x 10 0 A4 y 95 A2 A3 93 93 97.7 A4 x 10 0 A4 y 10 0 Genotype ... was therefore partitioned into amplicons 1, 2, 3, 4x and 4y for genotype 1a and amplicons 1x, 1y, 2, 3, 4x and 4y for genotype 1b Figure shows the amplicon partition for genotype 1b Page of (page...
  • 9
  • 138
  • 0

Báo cáo y học: "Analysis of bacterial DNA in synovial tissue of Tunisian patients with reactive and undifferentiated arthritis by broad-range PCR, cloning and sequencing" pps

Báo cáo y học:
... using broad-range PCR and/ or reverse transcription PCR systems to search for bacterial DNA and RNA in synovial samples from patients with various forms of arthritis, including ReA [12,14,17] By ... bacterial DNA in synovial samples We extracted DNA from ST samples from 28 patients with arthritis We found bacterial DNA in 21 (75%) of these patients, using stringent sterility and anti-contamination ... studies, using PCR assays with universal 16S rDNA primers, identified lower proportions of human synovial samples containing bacterial DNA: 42% of synovial fluid and ST samples in one study [18], and...
  • 14
  • 106
  • 0

Báo cáo y học: "Broad-range PCR, cloning and sequencing of the full 16S rRNA gene for detection of bacterial DNA in synovial fluid samples of Tunisian" pps

Báo cáo y học:
... PCR positivity by the broad-range PCR amplification system PCR was positive in 20 of the 27 (74.10%) patients indicating the presence of bacterial 16S rDNA within the synovial samples Of note, PCR ... between the presence of a particular bacterial DNA and clinical symptoms Discussion In the present study we used broad-range PCR amplification, cloning, and sequencing of the full- length 16S rDNA ... aspects regarding prevention of contamination during sampling have recently been published in detail [15] We previously used the broad-range PCR, cloning and sequencing the entire 16S rDNA and demonstrated...
  • 11
  • 156
  • 0

Báo cáo y học: "Analyzing and minimizing PCR amplification bias in Illumina sequencing libraries" pps

Báo cáo y học:
... PCR enzymes and chemical ingredients in amplification reactions Finally, we validated the qPCR results by Illumina sequencing Our optimized protocol amplifies sequencing libraries more evenly ... during library preparation does not necessarily yield unbiased Illumina sequencing reads, presumably due to bias introduced further downstream in the sequencing process Discussion In this study, ... base-composition bias and can supply input DNA of sufficient quality and quantity Conclusions qPCR is an inexpensive and quick assay for representational bias in Illumina fragment libraries Our optimized PCR...
  • 14
  • 122
  • 0

Báo cáo y học: " Comparative evaluation of INNO-LiPA HBV assay, direct DNA sequencing and subtractive PCR-RFLP for genotyping of clinical HBV isolates" pot

Báo cáo y học:
... Ali et al., Comparative evaluation of INNO-LiPA HBV assay, direct DNA sequencing and subtractive PCR-RFLP for genotyping of clinical HBV isolates Virology Journal 2010, 7:111 Page of ... Genotype A in all 13 mixed Genotype A and D strains of HBV On the other hand, despite being costly or technically demanding, LiPA and direct DNA sequencing yielded accurate identification of all ... 63 and four HBV strains as belonging to genotype D and genotype A, respectively Thirteen HBV strains yielded amplicons that hybridized to probe primers specific for both, genotype A and genotype...
  • 5
  • 60
  • 0

Kỹ thuật PCR:

Kỹ thuật PCR:
... Dùng kỹ thuật PCR cho ribotyping: Kỹ thuật PCR ribotyping ứng dụng cặp mồi đặc hiệu để nhân vùng gene ARN (thuộc ribosom hay ARN vận chuyển) Tuy nhiên, thực tế kỹ thuật yêu cầu kinh nghiệm, kỹ thuật ... dịch khung xảy với số lượng tương ứng khoảng 40 000 nucleotid + Một số kỹ thuật PCR khác: Một số kỹ thuật phát triển sở kỹ thuật PCR có ý nghĩa quan trọng cho định danh định typ vi sinh vật nested ... phép phân tích thực nhờ kỹ thuật PCR nhân sản phẩm cDNA dùng cho phát Helicobacter spp Độ nhạy phương pháp phát tăng 50 lần so với phương pháp truyền thống + Kỹ thuật rep -PCR: Một phương pháp trực...
  • 25
  • 936
  • 14

Kỹ thuật PCR

Kỹ thuật PCR
... nucleotid + Một số kỹ thuật PCR khác: Một số kỹ thuật phát triển sở kỹ thuật PCR có ý nghĩa quan trọng cho định danh định typ vi sinh vật nested PCR (PCR lồng), revert transtriptase PCR (sao chép ... Dùng kỹ thuật PCR cho ribotyping: Kỹ thuật PCR ribotyping ứng dụng cặp mồi đặc hiệu để nhân vùng gene ARN (thuộc ribosom hay ARN vận chuyển) Tuy nhiên, thực tế kỹ thuật yêu cầu kinh nghiệm, kỹ thuật ... có tác dụng phát ARN thời điểm định mẫu Kỹ thuật PCR chiều ứng dụng phương pháp giải trình tự ADN trực tiếp từ sản phẩm PCR. phẩm PCR + Sử dụng kỹ thuật PCR cho xác định typ vi sinh vật: Như trình...
  • 25
  • 457
  • 6

Luận văn :Định lượng kháng nguyên Cyfra 21-1 bằng kỹ thuật Real-time PCR

 Luận văn :Định lượng kháng nguyên Cyfra 21-1 bằng kỹ thuật Real-time PCR
... xây dựng phương pháp định lượng kháng nguyên kỹ thuật - Real-time PCR kỹ thuật phage display - Đã ứng dụng kỹ thuật định lượng kháng nguyên để xác định nồng độ Cyfra2 1-1 số mẫu huyết nhận từ ... dòng lực với kháng nguyên Cyfra 21-1 giếng Do đó, giá trị OD có ý nghĩa xác định bán định lượng nồng độ kháng nguyên Cyfra 21-1 Như vậy, giếng khay ELISA có nồng độ kháng nguyên Cyfra 21-1 ban đầu ... định lượng kháng nguyên Cyfra 21-1 kỹ thuật Real-time PCR để chẩn đoán ung thư phổi cho kết hoàn toàn xác Tuy nhiên, mẫu huyết cho giá trị nồng độ Cyfra 21-1 cao nhiều so với nồng độ Cyfra 21-1...
  • 46
  • 348
  • 0

Phương pháp PCR

Phương pháp PCR
... tốc độ nhanh chưa thấy độ xác cao thực máy chu kỳ nhiệt (máy PCR) Kỹ thuật PCR Karry Mullis phát minh 1985 Các yêu cầu cần thiết cho PCR mồi (primer) tổng hợp oligonucleotide ( mồi có khong ... nhiều loài sinh vật tồn cách hàng chục triệu nm PCR for Cloning PCR for Medical Diagnostics Diagnosis of Sickle-Cell Anemia (hồng cầu liềm) by PCR ... PCR Khuụn ADN c bin i thnh si n (94 0C, phỳt) Bin i tỏch si ADN mi thnh n (94 0C, 30 giõy) Gn primer vo u on ADN (55 0C, 30 giõy) Tng hp chui ADN mi (65-75 0C, 2-5 phỳt) Thit k primer cho PCR...
  • 18
  • 290
  • 6

Ứng dụng kỹ thuật PCR - RFLP xác định các kiểu gen thụ thể prolactin trên giống heo Yorkshire

Ứng dụng kỹ thuật PCR - RFLP xác định các kiểu gen thụ thể prolactin trên giống heo Yorkshire
... tăng khối lƣợng ngày cá thể heo có diện gen thụ thể prolactin cao cá thể diện gen Các nghiên cứu gen thụ thể prolactin dừng lại mức xác định mối tƣơng quan diện gen thụ thể prolactin với tăng suất ... gen thụ thể prolactin Cả ba kiểu gen thụ thể prolactin xuất giống Yorkshire Tần số kiểu gen BB chiếm tỉ lệ cao (50 %), kiểu gen AB chiếm tỉ lệ 23,3 %, kiểu gen AA chiếm tỉ lệ thấp (3,33 %) Các heo ... - 12 3.4.2.4.2 Ứng dụng PCR phát gen thụ thể prolactin xác định tần số kiểu gen PRLR mẫu phân tích Chọn qui trình PCR qui trình cắt enzyme giới hạn thích hợp để phát gen thụ thể prolactin Yêu...
  • 52
  • 613
  • 1

Xem thêm

Từ khóa: pcr pcr amplification and manual sequencingextraction reverse transcriptase pcr and cycle sequencingextraction rt pcr and sequencingpcr cloning and sequencingextraction rt pcr and sequencing of f genespcr gene sequencing and analysisisolation rt pcr and gene sequencingisolation pcr amplification and dna sequencingpcr direct sequencing and sequence analysisisolation pcr and sequencingextraction pcr amplification cloning and sequencingisolation pcr amplification and sequencingextraction pcr amplification and sequencingisolation pcr and nucleotide sequencingkỹ thuật pcrBUSINESS RESEARCH METHODS 8th ed ZIKMUND BABIN CARR GRIFFINNghiên cứu xây dựng hồ sơ địa chính dạng số cho xã phúc chu, huyện định hóa, tỉnh thái nguyênstrategic management concept and caseResearch methods and statistics beins and maureen mccarthyResearch methods for business students summaryResearch methods for business students 5th edition mark saundersResearch methods for the behavioral charles stangor wadsworthStrategic management 9e hitte ireland and hoskissonUNIT3 LANGUAGE FOCUS CLASS 10 (15 16Giáo án bồi dưỡng học sinh giỏi tiếng anh lớp 9Nâng cao năng lực chế tạo và sử dụng các thí nghiệm đơn giản cho sinh viên cao đẳng sư phạm nước cộng hòa dân chủ nhân dân lào khi dạy học phần điện học (khoa học tự nhiên lớp 8)Những đặc điểm tâm lý của khách du lịch theo độ tuổi và tình hình sức khỏeBài 9 thứ tự kể trong văn tự sựBài 8 ngôi kể trong văn tự sựBài 1 con rồng cháu tiênunit 5 leson 5 anh 7Tuần 8 kì diệu rừng xanhTuần 9 điều ước của vua mi đátTuần 11 ông trạng thả diềubài giảng điện tử Unit 6 places
Nạp tiền Tải lên
Đăng ký
Đăng nhập