Pcr và giải trình tự

NGHIÊN CỨU MỘT SỐ VIRUS TRÊN KHOAI TÂY (PVX, PVY, PLRV) TẠI ĐÀ LẠT BẰNG KỸ THUẬT ELISA, RT-PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ

... số virus khoai tây (PVX, PVY, PLRV) Đà Lạt kỹ thuật ELISA, RT-PCR giải trình tự 1.2 Mục đích - Phát loại virus (PVX, PVY, PLRV) khoai tây thành phố Đà Lạt kỹ thuật ELISA - Phát virus PLRV kỹ thuật ... DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP HỒ CHÍ MINH BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC ….  … KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP NGHIÊN CỨU MỘT SỐ VIRUS TRÊN KHOAI TÂY (PVX, PVY, PLRV) TẠI ĐÀ LẠT BẰNG KỸ THUẬT ELISA, ... HỒ VŨ, Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh Tháng / 2005 Nghiên cứu số virus khoai tây (PVX, PVY, PLRV) Đà Lạt kỹ thuật ELISA, RTPCR giải trình tự đƣợc thực từ tháng đến tháng năm 2005 Trung tâm...

49
1,214
9

PHÂN LẬP VÀ ĐỊNH DANH TÁC NHÂN GÂY BỆNH ĐỐM LÁ CÂY CẢI NGỌT TẠI TP. HCM BẰNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG 16S – 23S rDNA docx

... DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP HCM BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC ***000*** PHÂN LẬP VÀ ĐỊNH DANH TÁC NHÂN GÂY BỆNH ĐỐM LÁ CÂY CẢI NGỌT TẠI TP HCM BẰNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG 16S ... chọn thực đề tài: Phân lập định danh tác nhân gây bệnh đốm cải Tp HCM phƣơng pháp PCR giải trình tự vùng 16S – 23S rDNA Đề tài phần chƣơng trình nghiên cứu bệnh vi khuẩn họ thập tự Bộ môn Bảo Vệ ... + (+) – + ND + V + – – – V + + V– V+ – + V + – V– – V V Begoniae – V – V+ + Manihotis – – V + V malvacearum – – (+) – oryzae – V pelamgonii vesicatoria + + V– V + + V – V– V pruni + (+) – + V...

Luận văn : PHÂN LẬP VÀ ĐỊNH DANH TÁC NHÂN GÂY BỆNH ĐỐM LÁ CÂY CẢI NGỌT TẠI TP. HCM BẰNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG 16S – 23S rDNA part 3 pdf

... đại vùng 16S – 23S rDNA 1: CC1, 2: CC2, 3: CC3, 4: Ladder 1,5kb, 5: HM1, 6: HM2, 7: Q12-1, 8: DC Sản phẩm PCR đƣợc tinh đọc trình tự Trình tự DNA có đƣợc so sánh với liệu ngân hàng gen để định danh ... kết luận định danh dòng vi khuẩn 33 kb 535 bp Hình 4.10 Kết khuếch đại đoạn DNA vùng hrpF 1: HM1, 2: HM2, 3: CC1, 4: Ladder 1kb, 5: CC2, 6: Q12 – 1, 7: DC Chƣơng KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 5.1 Kết luận ... Kết thúc đề tài, thiết lập đƣợc quy trình phân lập định danh vi khuẩn gây bệnh đốm cải Tp HCM Quy trình đƣợc thực nhƣ sau: Thu thập mẫu bệnh vùng trồng rau trọng điểm Tp HCM: Tiến hành khảo sát...

Luận văn : PHÂN LẬP VÀ ĐỊNH DANH TÁC NHÂN GÂY BỆNH ĐỐM LÁ CÂY CẢI NGỌT TẠI TP. HCM BẰNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG 16S – 23S rDNA part 2 doc

... + (+) – + ND + V + – – – V + + V– V+ – + V + – V– – V V Begoniae – V – V+ + Manihotis – – V + V malvacearum – – (+) – oryzae – V pelamgonii vesicatoria + + V– V + + V – V– V pruni + (+) – + V ... dùng kỹ thuật PCR sử dụng cặp primer Xan 1330 5’ – GTT CCC GGG CCT TGT ACA CAC – 3’ Xan 322 5’ – GGT TCT TTT CAC CTT TCC CTC – 3’ thiết kế dựa vùng rDNA 16S 23 S để khuếch đại vùng 16S – 23 S rDNA ... (+) – + V + + + V– + V– + – + V– (+) – – V– V+ V– – + phaseoli – + – carotae + Translucens campestris 2. 1.7 Những nghiên cứu phát dịnh danh tác nhân gây bệnh phƣơng pháp sinh học phân tử Để đánh...

Luận văn : PHÂN LẬP VÀ ĐỊNH DANH TÁC NHÂN GÂY BỆNH ĐỐM LÁ CÂY CẢI NGỌT TẠI TP. HCM BẰNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG 16S – 23S rDNA part 1 ppt

... DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP HCM BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC ***000*** PHÂN LẬP VÀ ĐỊNH DANH TÁC NHÂN GÂY BỆNH ĐỐM LÁ CÂY CẢI NGỌT TẠI TP HCM BẰNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ VÙNG 16 S ... chọn thực đề tài: Phân lập định danh tác nhân gây bệnh đốm cải Tp HCM phƣơng pháp PCR giải trình tự vùng 16 S – 23S rDNA Đề tài phần chƣơng trình nghiên cứu bệnh vi khuẩn họ thập tự Bộ môn Bảo ... Dùng kỹ thuật PCR giải trình tự gen nhằm định danh tác nhân gây bệnh Kết thu đƣợc nhƣ sau: Phân lập đƣợc dòng vi khuẩn gây bệnh đốm vùng trồng rau thuộc huyện Củ Chi, Hóc Môn quận 12 , Tp HCM Sử...

Luận văn : NGHIÊN CỨU MỘT SỐ VIRUS TRÊN KHOAI TÂY (PVX, PVY, PLRV) TẠI ĐÀ LẠT BẰNG KỸ THUẬT ELISA, RT-PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ part 4 pdf

... đƣợc trình tự giải đƣợc có phải virus PLRV không biết đƣợc mức độ tƣơng đồng trình tự ta có với trình tự ngân hàng gene 27 PHẦN KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 4. 1 Tình hình canh tác khoai tây Thành phố Đà ... Tổn Số Tỷ g số mẫu lệ mẫu nhiễm (%) 51 50 98,0 44 44 28 28 100 100 PLRV Tổn Số Tỷ g số mẫu lệ mẫu nhiễm (%) 54 53 98,1 44 44 6 100 100 Tỷ lệ (%) Từ bảng ta có biểu đồ 100 90 80 70 60 50 40 30 ... tự Bƣớc 4: Đọc kết Kết giải trình tự dạng peak (mỗi peak đại diện cho nucleotide) dạng ký tự (A, T, G, C) Sau có trình tự ta tiến hành kiểm tra cách so sánh trình tự giải đƣợc với trình tự có sẵn...

Luận văn : NGHIÊN CỨU MỘT SỐ VIRUS TRÊN KHOAI TÂY (PVX, PVY, PLRV) TẠI ĐÀ LẠT BẰNG KỸ THUẬT ELISA, RT-PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ part 3 pptx

... 13 - Các kỹ thuật RT-PCR, giải trình tự chƣa đƣợc áp dụng phổ biến công tác chẩn đoán virus PLRV 2.4.2 Nghiên cứu nƣớc virus PVX, PVY, PLRV - Nie Singh (2002) dùng kỹ thuật RT-PCR việc ... (ladder) 100bp (Bio – Rad) - TAE 0,5X 3. 3 Phƣơng pháp nghiên cứu 3. 3.1 Nội dung nghiên cứu - Điều tra tình hình nhiễm loại virus PVX, PVY PLRV khoai tây thành phố Đà Lạt thông qua việc thực phản ứng ... 18 18 0 10 10 Phƣờng 12 23 23 0 13 10 11 12 150 22 128 20 24 31 10 66 70 57 24 Tổng cộng T: tháng 3. 3 .3 Phƣơng pháp phát PVX, PVY PLRV 3. 3 .3. 1 Phát PVX, PVY PLRV kĩ thuật ELISA Sử dụng phƣơng...

Luận văn : NGHIÊN CỨU MỘT SỐ VIRUS TRÊN KHOAI TÂY (PVX, PVY, PLRV) TẠI ĐÀ LẠT BẰNG KỸ THUẬT ELISA, RT-PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ part 2 pot

... chế lây nhiễm virus PVX Hình 2. 1 Hình thái virus PVX Hình 2. 2 Khoai tây bị nhiễm virus PVX 2. 2 .2 Sơ lƣợc virus PVY (Potato virus Y) - Virus PVY thuộc họ Potyviridae, giống Potyvirus, gồm có ba ... triển khoai tây bệnh hại, đặc biệt bệnh virus gây Khoai tây bị đơn nhiễm tạp nhiễm khoảng 30 loại virus, chủ yếu Luteoviruses (PLRV), Potyviruses (PVY, PVA, PVV), Potexviruses (PVX) Carlaviruses ... nghiên cứu cho thấy có khoảng 20 loài rệp côn trùng vectơ truyền bệnh virus khoai tây, chủ yếu loại rệp Myzus persicae (Watson, 1956) 2. 2 Giới thiệu virus PVX, PVY PLRV gây bệnh khoai tây 2. 2.1...

Luận văn : NGHIÊN CỨU MỘT SỐ VIRUS TRÊN KHOAI TÂY (PVX, PVY, PLRV) TẠI ĐÀ LẠT BẰNG KỸ THUẬT ELISA, RT-PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ part 1 ppt

... nhƣ sau: - Phƣờng 5: PVX: 56,25%, PVY: 90, 91% , PLRV: 96,97% - Phƣờng 8: PVX: 17 ,39%, PVY: 10 0%, PLRV: 10 0% - Phƣờng 9: PVX: 21, 21% , PVY: 96,97%, PLRV: 96,97% - Phƣờng 1 1: PVX: 41, 18%, PVY: 10 0%, ... DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP HỒ CHÍ MINH BỘ MÔN CÔNG NGHỆ SINH HỌC ….  … KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP NGHIÊN CỨU MỘT SỐ VIRUS TRÊN KHOAI TÂY (PVX, PVY, PLRV) TẠI ĐÀ LẠT BẰNG KỸ THUẬT ELISA, ... 11 2.4 Nghiên cứu nƣớc PVX, PVY PLRV khoai tây 12 2.4 .1 Nghiên cứu nƣớc virus PVX, PVY PLRV 12 2.4.2 Nghiên cứu nƣớc virus PVX, PVY, PLRV 13 VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 14 ...

Phát hiện đột biến gen COL1A1 trên bệnh nhân tạo xương bất toàn bằng kỹ thuật PCR và giải trình tự gen

... bệnh tạo xương bất toàn thực nhằm mục tiêu: Phát đột biến gen COL1A1 bệnh nhân tạo xương bất toàn kỹ thuật PCR giải trình tự gen 8 CHƯƠNG I TỔNG QUAN 1.1 Lịch sử phát tình hình nghiên cứu bệnh ... 1.4 Các kỹ thuật sinh học phân tử phát đột biến gen COL1A1 Các đột biến gen COL1A1 chủ yếu đột biến điểm kỹ thuật PCR giải trình tự trực tiếp sử dụng để phát đột biến Trong trường hợp đột biến nằm ... collagen týp I (da, xương) Như để phát đột biến gen COL1A1 cần ý tới kỹ thuật là: PCR, RT -PCR giải trình tự gen 1.4.1 Kỹ thuật Polymerase Chain Reaction (PCR) : PCR kỹ thuật nhân DNA ống nghiệm...

Giới thiệu kỹ thuật giải trình tự gen và Real - Time PCR pot

... FliC - a 1458: TCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA 1488 FliC - b 1458: TCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA 1488 FliC - c 1474: - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1474 FliC - d ... AAGATGGCTATTATGAAGTTTCCGTTGATAAGACGAACGGTGA - GGT 770 * * * ** FliC - a 769: GCAGTCACAATGAC - - T - GCGGCTACCAC - CAAAGAGGCT - ACAAC - TCCTACAGGTATT 822 FliC - b 769: GCAAATAAAGCAACAGT - - - AACTGGGGCTAGT - - - - - - - - - - - - - ... GAGGATGTGAAAAATGTACAAG - - - TTGCAAATGCTGATTTGACAGAGGCTAA - - - - - - A 879 * * FliC - a 873: GGCTCAGTTGACTGCTGCCCATGTGACCGGCGCTGATACTG - - - - - - CTGAAATGGTTAA 926 FliC - b 865: ACTGCA - TTGACCAATGCAGGTGTGACAGGTGC...

Xác định kiểu gen của HCV bằng kỹ thuật giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR thu nhận được từ thử nghiệm RT real-time PCR dùng mồi và taqman probe đặc hiệu vùng 5’ NC pdf

... sàng cho định xác định genotype HCV dễ dàng hơn, việc tìm kiếm kỹ thu t xác định genotype HCV mà sử dụng kỹ thu t giải trình tự Trugene kỹ thu t InoLIPA với giá thành thấp mà đạt độ xác nhạy ... 200bp sản phẩm PCR dài khỏang 240250bp, kết từ thử nghiệm RT real-time PCR dùng mồi taqman probe đặc hiệu đọan đích tương tự Trugene InoLIPA vùng 5 NC Chính điều đảm bảo tính xác kết định genotype ... luận Định genotype HCV kỹ thu t giải trình tự Trugene hay kỹ thu t InoLIPA lai vạch Bayer dựa đọan nucleotide đặc hiệu vùng 5 NC Đây hai phương pháp FDA y học chấp nhận để dùng phòng thí nghiệm...

Kỹ thuật giải trình tự trực tiếp sản phẩm pcr

... kỹ thuật giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR, kết tốt có sản phẩm PCR nhất, không bị sản phẩm phụ Các kết điện di sản phẩm PCR sau tinh rõ nét, dù nồng độ HCV số mẫu thấp Điều chứng tỏ qui trình ... IQ5 Biorad Sản phẩm real-time PCR cho kết real-time PCR (+) làm tinh để thu nhận sản phẩm PCR với thử nghiệm tinh sản phẩm PCR (PCR clean-up kit) Promega sản xuất (Cat #A9281) Sản phẩm PCR sau tinh ... taqman probe đặc hiệu 5’-NC theo qui trình Tất 2000 mẫu HCV-RNA dương tính đồng thời xác định genotype HCV giải trình tự trực tiếp sản phẩm PCR qui trình qPCR Kết định lượng tương ứng với kết...

nghiên cứu giải trình tự gen kháng nguyên GP5 của virus gây hội chứng rối loạn sinh sản và hô hấp lợn việt nam và so sánh với một số chủng của thế giới

... chu i gen GP5 c a virus gây H i ch ng sinh s n hô h p (PRRSV) l n phân l p t i Vi t Nam v i ch ng c a th gi i So sánh thành ph n amino acid chu i gen GP5 c a virus gây H i ch ng sinh s n hô h ... h c, ti n hành th c hi n ñ tài: Nghiên c u gi i trình t gen kháng nguyên GP5 c a virus gây h i ch ng r i lo n sinh s n hô h p l n (PRRS, tai xanh) Vi t Nam so sánh v i m t s ch ng c a th gi i” ... Arterivirus ch a t t c b n thành viên virus gây viêm ñ ng m ch ng a (EAV), virus gây h i ch ng r i lo n sinh s n hô h p l n (PRRSV), virus gây tăng ho t enzyme lactase dehydrogenase (LDV) virus...

Khóa luận nghiên cứu tách dòng, giải trình tự và thiết kế vecto biểu hiện gene novw tham gia sinh tổng hợp kháng sinh novobiocin

... Hc M H Ni NGHIÊN CứU TáCH DòNG, GIảI TRìNH Tự Và THIếT Kế VECTOR BIểU HIệN GEN NOVW THAM GIA SINH TổNG HợP KHáNG SINH NOVOBIOCIN Giáo viên hớng dẫn: TS Tạ Thị Thu Thủy Sinh viên thực hiện: Vũ ... Gii thiu v gen novW Gen novW nhúm gen tham gia vo ng sinh tng hp gc ng kh noviose cu trỳc khỏng sinh novobiocin uc d oỏn l gen cú tờn 3,5 epimerase hay gen ny cú chc nnng l tham gia xỳc tỏc cho ... thuc nhanh hn 1.3.3 Con ng sinh tng hp gc ng kh t bo vi sinh vt - Hu ht ng kh cu trỳc khỏng sinh c sinh t vi sinh vt l ng 6- deoxyhexose Tin cht u tiờn tham gia quỏ trỡnh sinh tng hp cỏc gc ng ny...

Xem thêm